6665 research outputs found
Sort by
Uzun kısa vadeli bellek ağları ile sayısal yazı tipi üretimi
Thesis (Master)--Izmir Institute of Technology, Computer Engineering, Izmir, 2019Includes bibliographical references (leaves: 51-55)Text in English; Abstract: Turkish and EnglishLong Short-Term Memory (LSTM) Networks are powerful models to solve sequential problems in machine learning. Apart from their use on sequence classification, LSTMs are also used for sequence prediction. Predictive features of LSTMs have been used extensively to generate handwriting, music and several other types of sequences. Configuration and training of LSTM networks are relatively more arduous than non-sequential models, especially when input data is complex. In this research, the aim is to train LSTM networks and its different variations, use their generative features on a relatively obscure and complex type of sequences in machine learning; digital fonts. Controlled experiments have been performed to find the effects of different model parameters, input encodings or network architectures on learning font based sequences. All in all, in this document; the procedure of creating a dataset from digital fonts are provided, training strategies are demonstrated and the generative results are discussed.Uzun Kısa Süreli Bellek Ağları, makine öğrenmesi alanında, dizisel veri içeren problemlerde başarıyla kullanılmaktadır. Dizi sınıflandırma alanındaki yaygın kullanımlarına ek olarak, Uzun Kısa Süreli Bellek Ağları'ndan, dizi öngörüsü alanında da yararlanılmaktadır. Bu ağların tahmin yetenekleri, el yazısı üretimi, müzik üretimi, ve diğer diziler üzerinde üretim için de geniş çapta tercih edilmektedir. Ancak, diğer makine öğrenmesi yöntemleri ile karşılaştırıldıklarında; Uzun Kısa Süreli Bellek Ağlarının konfigürasyonları ve eğitim aşamaları, eğitilecek veri karmaşıklaştıkça daha fazla zorlaşmaktadır. Bu araştırmanın hedefi, Uzun Kısa Süreli Bellek Ağlarının ve türevlerinin, göreceli olarak karmaşık bir veri olan sayısal yazıtipleri üzerinde denemektir. Bu amaçla kontrollü deneyler yapılmış, Uzun Kısa Süreli Bellek Ağlarının farklı konfigürasyonlardaki başarıları ölçülmüş ve karşılaştırılmıştır. Bu dökümanda, sayısal yazıtipleri kullanılarak bir makine öğrenmesi veri tabanı oluşturulma süreci, makine eğitimi aşamaları ve stratejileri açıklanmış, Sayısal yazıtipi üretim sonuçları gösterilmiş ve incelenmiştir
Tohum taraması için yonga-üstü-bitki aygıtları
Thesis (Master)--Izmir Institute of Technology, Biotechnology and Bioengineering, Izmir, 2019Includes bibliographical references (leaves: 28-31)Text in English; Abstract: Turkish and EnglishThanks to their roots, plants take the required molecules from the soil, therefore their research is important. The fact that absorption takes place from the root hair makes the observations necessary. The inadequacy of traditional methods requires the development of new methods to ensure their observations, especially during root studies. The fact that chip systems have the features that can overcome the problems has caused plant researches by using this method.
The fact that environmental factors can be imitated in chip systems paves the way for abiotic stresses to work. Although abiotic stresses have been studied extensively on plants, seed germination and subsequent root extension and root hair formation have not been studied in detail except for the model organism (Arabidopsis thaliana).
The use of chip system for plant studies of scientists have begun the 21st century is also reveals the need to do more work in this area. Researchers show that they are excited about the advantages they bring to the system and that necessary studies will be carried out in other side branches. It is thought that more research will be done by using chip systems after a short time.
By using chip systems, a suitable environment for seed growth can be provided and environmental conditions can be simulated. By creating the desired controlled environment, it is possible to create a system which results in less time and less cost in order to replace the inconvenient and expensive method.Bitkiler kökleri sayesinde gerekli molekülleri topraktan alırlar, bundan dolayı araştırmaları önemlidir. Özellikle emilimin kök kıllarından gerçekleşiyor olması bunların gözlemlerini gerekli hale getirir. Geleneksel yöntemlerle yapılan çalışmaların yetersiz olması, özellikle kök çalışmaları sırasında onlara zarar vermeden gözlemlerini sağlayacak yeni yöntemlerin geliştirilmesini gerektirmektedir. Yonga sistemlerinin sorunların üstesinden gelebilecek özelliklere sahip olması, bu yöntemi kullanarak bitki araştırmalarının yapılmasına neden olmuştur.
Çevresel faktörlerin yonga sistemlerinde taklit edilebiliyor olması abiyotik streslerin çalışabilmesinin önünü açmaktadır. Abiyotik stresler bitkiler üzerinde yoğun bir şekilde çalışılmış olmasına rağmen tohum çimlenmesi ve bundan sonra meydana gelen kök uzaması ve kök kılı oluşumları model organizma (Arabidopsis thaliana) dışında detaylı olarak çalışılmamıştır.
Bitki çalışmaları için yonga sistemlerin kullanılması 21. yy da başlamış olup bilim insanlarının bu alanda daha çok çalışma yapılmasının gerekliliğini ortaya koymaktadır. Araştırmacılar sistemin getirdikleri avantajlar konusunda heyecanlı olmaları diğer yan dallarda da gerekli çalışmaların yapılacağını göstermektedir. Kısa süre sonra yonga sistemleri kullanarak daha çok araştırmalar gerçekleştirileceği düşünülmektedir.
Yonga sistemleri kullanarak tohumun büyümesi için gereken uygun ortam sağlanabilir ve çevre koşulların taklidi sağlanabilir. İstenilen kontrollü ortam yaratılarak normalde zahmetli ve pahalı olan yöntemin yerini daha kısa sürede ve az maliyetle sonuç veren bir sistemin oluşturulması mümkündür
Fenolik asitlerin varlığında patojen bakterilerin moleküler incelemesi
Thesis (Doctoral)--Izmir Institute of Technology, Molecular Biology and Genetics, Izmir, 2019Includes bibliographical references (leaves: 176-198)Text in English; Abstract: Turkish and EnglishPathogenic bacteria, including P. aeruginosa, are serious threats for human
health with their antibiotic resistance and virulence factors. Since phenolic acids,
secondary metabolites of plants, can be good candidates as antimicrobial agents, their
mode of action should be investigated. Proteomics is one of the main approaches for
elucidating the mode of action of such compounds. In addition, in order to enhance the
antimicrobial effects and stabilities of phenolics, they can be encapsulated into
nanoparticles. The nanoparticles can be produced from chitosan and alginate which are
biocompatible polymers. In this study, the antimicrobial effects of 3-HPAA and 4-HBA
were presented with MIC values of 2.1 and 1.9 mg/ml, respectively. The bacteriocidal
effects of them were also shown as 2.3 mg/ml for 3-HPAA and 2.1 mg/ml for 4-HBA.
The morphological changes of bacteria were determined after phenolic acid exposure
via SEM. The LC-ESI-MS/MS technique was used to show changes in the protein
profile of bacteria arose from antimicrobial effects. Both phenolic exposures resulted in
various protein changes especially in membrane-related proteins as well as ribosome
and protein synthesis related-proteins. In addition, they caused serious oxidative stress
depending on the protein profile changes related to redox proteins. Alginate-chitosan
nanoparticles resulted increased antimicrobial effects of the phenolics which were
produced, characterized and tested on various pathogenic bacteria via agar diffussion
and spectrophotometric measurements. Hence, free or encapsulated forms of phenolic
acids were demonstrated as effective antimicrobial agents and based on proteomic
results, the effect of phenolic acids may be multi targetted.P. aeruginosa’nın da içinde bulunduğu patojen bakteriler antibiyotik
dirençlilikleri ve virülans faktörleri nedeniyle insan sağlığı için önemli bir tehdit
oluşturmaktadır. Bitkilerin sekonder metabolitleri olan fenolik asitler antimikrobiyal
madde olmak için iyi adaylar olduklarından, etki mekanizmalarının çalışılması
gereklidir. Proteomik çalışmalar, böyle maddelerin etki mekanizmalarının
araştırılmasındaki önemli yaklaşımlardan biridir. Bunun yanısıra, kararlılıklarının ve
antimikrobiyal etkilerinin arttırılması için, fenolik asitler nanopartiküller içerisine
hapsedilebilirler. Nanopartiküller, biyo-uyumlu polimerler olan kitosan ve aljinattan
sentezlenebilirler. Bu çalışmada, 3-HPAA ve 4-HBA’nın antimikrobiyal etkileri,
sırasıyla 2.1 and 1.9 mg/ml olan minimum inhibe edici konsantrasyon değerleri ile
sunulmuştur. Aynı zamanda bakterisidal etkiye sahip oldukları ise 3-HPAA için 2.3
mg/ml ve 4-HBA için 2.1 mg/ml minimum bakterisidal konsantrasyon değerleri ile
gösterilmiştir. Buna ek olarak, bakterilerin morfolojilerinde fenolik asit uygulamasından
sonra oluşan değişiklikler de taramalı elektron mikroskobu ile tespit edilmiştir. LC-ESIMS/
MS tekniği, antimikrobiyal etkiler nedeniyle protein profilinde oluşan değişiklikleri
göstermek için kullanılmıştır. İki fenolik muamelesi de bakterinin protein profilinde,
zarla ilgili proteinlerdeki, ribozom ve protein senteziyle ilgili proteinlerdeki değişimler
başta olmak üzere, birçok değişime neden olmuştur. Bunun yanında, redox
proteinlerindeki değişimler göz önüne alındığında, fenoliklerin bakterilerde ciddi
oksidatif strese yol açtığı görülmüştür. Fenolik asitlerin enkapsüle edilmesini sağlayan,
sentezlenen, tanımlanan ve antimikrobiyal etkileri birçok patojen bakteride agar
difüzyon ve spektrofotometrik ölçümlerle test edilen aljinat-kitosan nanopartiküller ise,
fenoliklerin antimikrobiyal etkilerinin artmasını sağlamıştır. Bu çalışmayla fenolik
asitlerin hem serbest, hem de enkapsüle edilmiş hallerinin etkili antimikrobiyal
maddeler oldukları sunulmuş ve proteomik çalışmanın sonuçlarına göre fenolik asitlerin
çoklu-hedefli etkiler gösteriyor olabildikleri sonucuna varılmıştır
Kültür rotalarının korunması: Manisa'nın tarihsel merkezi
Thesis (Master)--Izmir Institute of Technology, Architectural Restoration, Izmir, 2019Text in English; Abstract: Turkish and EnglishCultural routes help perceiving the heritage elements in a historic urban site as a
whole and transform their display into an enjoyable experience. Manisa historic center is
chosen as the study area. The site has housed many civilizations throughout history and
had been an important trade center on the historic silk road, but it has lost its integrity
with the fire of 1922 followed by modern urbanization on the historic site. It is aimed to
search the ways of presenting the isolated cultural and natural assets of the historic center
through establishment of a cultural route. The way followed includes literature review,
site survey, analysis, evaluation, proposal development and discussion. Features of
examples and Manisa cultural route, such as route type, length, form and assets, discussed
by comparison. As a result, a common vision for the cultural route of Manisa center with
four different sub-themes is determined as “On the Trail of the Silk Road, the Cultural
Network of Manisa.” The cultural route will revive the spirit of the caravan route, the
experiences of the old travelers, and the traditional way of life. Linear formed, short
length stages are suggested. Awareness of heritage protection can be improved by
increasing the visibility of the assets along the route stages. It is expected that tourism
activity in the region will increase. Proposing local-scale cultural routes in Manisa will
pave the way for Manisa to participate in larger cultural route networks by conducting
regional-scale route studies.Rotalar bir güzergâh üzerinde sunulan miras ögelerinin bir bütün olarak
algılanmasına yardımcı olmakta ve bunların sergilenmesini bir deneyime
dönüştürmektedir. Manisa tarihi kent merkezi çalışma alanı olarak seçilmiştir. Çalışma
alanı tarih boyunca birçok uygarlığa ev sahipliği yapmış ve tarihi İpek Yolu üzerinde
önemli bir ticaret merkezi olarak yer almıştır, ancak 1922’deki yangın sonrası
bütünlüğünü kaybetmesinin sonucu olarak tarihi doku üzerine modern kentleşme
görülmektedir. Çalışma alanında kültürel ve doğal miras varlıklarının, bütünsellik içinde,
kültürel rotalar yoluyla sunulması amaçlanmıştır. Çalışmada izlenen yol, literatür
taraması, saha araştırması, analiz, değerlendirme, kültürel rota önerisi oluşturulması ve
tartışma safhalarını içermektedir. Literatür taraması sırasında incelenen örnek rotaların,
uzunluk, tür, şekil gibi özellikleri, önerilen rota ile karşılaştırılarak tartışılmıştır. Sonuç
olarak, dört farklı etaba sahip Manisa Kültürel Rotası için ortak vizyon “İpek Yolunun
izinde, kültür ağı ören Manisa” olarak belirlenmiştir. Önerilen kültürel rota, kervan
yolunun ruhunu, tarihi gezginlerin deneyimlerini ve geleneksel yaşam biçimini
canlandıracaktır. Manisa Tarihi Kent Merkezi için önerilen etaplar ile kültürel ve doğal
miras varlıkları, doğrusal ve kısa mesafeli rotalar üzerinde, bütünsellik içinde
sergilenebilecektir. Aynı zamanda, bu varlıkların görünürlüğünün artması ile miras
koruma farkındalığı geliştirilebileceği gibi bölgedeki turistik aktivitenin artması da
beklenmektedir. Manisa’da yerel ölçekli kültürel rotaların önerilmesi, bölgesel ölçekli
rota çalışmalarının yapılarak, Manisa’nın daha büyük kültür rotası ağlarına katılmasının
da önünü açacaktır
Etkin bir kentsel koruma planlaması için taşınmaz haklarının transferi: Tarihi Kemeraltı bölgesi, 1. Halka Konut Dokusu, İzmir örneği
Thesis (Master)--Izmir Institute of Technology, City and Regional Planning, Izmir, 2019Includes bibliographical references (leaves: 113-120)Text in English; Abstract: Turkish and EnglishThe efforts for conservation of cultural heritage in historical settlements are highly
problematic issue in Turkey. One of the main reasons for this is highly associated with
the limited fiscal compensation provided by the central ministries and local bodies for
those people who live and/or possess immobile property under restrictions of their
development rights. For this reason, it is indispensable to introduce new tools for the
effectiveness of the conservation activities of the heritage areas. On the other hand, with
the enactment of the regulations Transfer of Development Rights (Law no: 5226/2004) is
entered Turkish Planning System as a new and innovative solutions. However, there has
been any available application of the TDR and implementing regulation yet. The main
objective of the thesis is to discuss the applicability of the TDR as an instrument for the
ease of the conservation procedure in the 1st Ring Residential Area which is located in
Izmir’s Historic core areas, Kemeraltı region. In methodology, a bundle of techniques
such as survey analysis and depth questionnaires are used. We made a comparative study
based on a typical "what-if case" that if the case study area were not really under the status
of conservation then how it would be developed in accord with the Development Plan’s
right. Assumption that "If the Agora-Kemeraltı region were not really under the
conservation status, it would be similar to the Alsancak-Çankaya region which is 500
meters away." the comparison of the housing market value between the two areas realized
the restricted development right by the conservation plan.The Ministry of Culture and
Tourism grants only accounts for 48% of the total maintenance and restoration cost. Due
to financial deficiencies, it is not feasible to preserve the region with current planning
tools. Even though, the preservation of Historic Kemeraltı seems to be a difficult
challenge, there seems to be some positive clues for the future with the application of the
TDR.Türkiye’de tarihi yerleşimlerde kültürel mirasın korunmasına yönelik çabalar,
oldukça sorunludur. Bunun temel nedenlerinden biri taşınmazı üzerinde koruma amacıyla
imar kısıtlaması olan mülk sahipleri için, merkezi ve yerel yönetimler tarafından verilen
maddi kaynakların yetersiz olmasıdır. Bu nedenle kültürel miras alanlarında etkili koruma
faaliyetleri için yeni araçların gerekliliği kaçınılmazdır. Diğer taraftan, 2004 yılında
düzenlenen 5226 sayılı kanunun yürürlüğe girmesiyle birlikte İmar Haklarının Aktarımı,
“Yapılanma haklarının devri” Türk Planlama Sistemine yenilikçi bir çözüm olarak
girmiştir. Ancak kanunun düzenlendiği tarihten bugüne, İHA’nın mevcut bir
uygulamasının yanısıra uygulama yönetmeliği de henüz hazırlanmamıştır. Bu çalışmanın
amacı, İHA’nın İzmir’in tarihi kent merkezi Kemeraltı bölgesinde yer alan 1. Halka konut
dokusundan seçilen bir alanda koruma uygulamalarının etkinliği için bir araç olarak
uygulanabilirliğini ortaya koymaktır. Çalışmanın metodunda anket ve derin mülakat gibi
pek çok farklı teknikten yararlanılmıştır. Çalışmada varsayım / kıyaslama (what – if)
yöntemi kullanılmıştır. Bu yöntem için “Çalışma alanı eğer herhangi bir koruma alanı
statüsü içerisinde yer almasaydı nasıl bir gelişim gösterirdi?” sorusu sorulmuştur.
“Agora-Kemeraltı bölgesi herhangi bir koruma statüsü altında bulunmasaydı yapılaşma
düzeni 500 m yakınında yer alan Alsancak-Çankaya bölgesine benzerdi.” varsayımıyla
iki bölge arasında konut piyasa değeri üzerinden kıyaslama gerçekleştirilip koruma kararı
doğrultusunda kısıtlanan imar hakkı tespit edilmiştir. Devlet desteği ile koruma
maliyetinin %48’i karşılanabilmektedir. Bu durumda mevcut koşullar altında bölgede
korumanın sağlanabilmesi mümkün değildir. Tarihi Kemeraltı’nın korunmasında İHA
modelinin uygulanması koruma açısından gelecekte olumlu sonuçlar ortaya koymakta ve
etkin koruma uygulamaları için imkân sunmaktadır
Kişisel bakım ve temizlik ürünleri üretim süreçlerinin standardizasyonu ve ürün izlenebilirliği için moleküler spektroskopiye dayalı kemometrik metotların geliştirilmesi
Thesis (Master)--Izmir Institute of Technology, Chemistry, Izmir, 2019Includes bibliographical references (leaves: 53-55)Text in English; Abstract: Turkish and EnglishPersonal care and cleaning products are the main consumer goods. Changes in our
heath caused by all of the chemicals that we exposed to everyday if these products are not
produced according to the regulations and determined formulations. Because of this
reason, quality control of the product formulation quantitatively is very important. There
are some analytical methods for the determination of anion active matter, nonionic matter
and total active matter in the product mixture. However, these techniques are expensive
and do not give accurate results.
The purpose of this thesis principally based on development of rapid, accurate and
practical infrared spectroscopic technique based on multivariate chemometrics data
analysis methods for the standardization of production processes and product traceability
of personal care and cleaning products.
In this thesis, two different products are studied which are namely liquid soap and
shower gel. Fourier Transform Infrared spectroscopy coupled with Attenuated Total
Reflectance accessory based chemometrics multivariate calibration models were
developed for the quantitative determination of liquid soap and shower gel compounds.
Genetic Inverse Least Squares was used as the chemometrics method for the development
of multivariate calibration models in the quantitative determination of liquid soap and
shower gel compositions.
Standard error of cross validation and standard error of prediction values for
content of the liquid soap samples were found 0.26% and 0.21 % (w/w %), respectively.
Standard error of cross validation and standard error of prediction values for content of
the shower gel samples were found 0.27 % and 0.30 % (w/w %), respectively.Kişisel bakım ve temizlik ürünleri ana tüketim maddelerindendir. Eğer bu ürünler
regülasyonlara ve belirlenen formülasyonlara uygun üretilmezlerse her gün maruz
kaldığımız bu kimyasallar sağlık problemlerine yol açabilir. Bu sebeple ürün
formülasyonlarının kontrol edilebilmesi önemlidir. Ürün karışımındaki anyon aktif
madde, katyonik aktif madde, noniyonik aktif madde ve toplam aktif madde içeriğini
belirlemek için analitik metotlar bulunmaktadır. Ancak bu teknikler pahalıdır ve kesin
sonuçlar verememektedir.
Bu projenin esas amacı kişisel bakım ve temizlik ürünleri üretim süreçlerinin
standardizasyonu ve ürün izlenebilirliği için kızılötesi spektroskopiye dayalı çok
değişkenli kemometrik veri analizi ile hızlı, kesin ve pratik metotlar geliştirmektir.
Bu projede, sıvı sabun ve duş jeli olarak 2 ayrı ürün çalışılmıştır. Sıvı sabun ve
duş jeli bileşenlerinin miktarsal tayini için Fourier dönüşümlü kızılötesi spektroskopisi
kullanılarak alınan spektral verilere kemometrik çok değişkenli kalibrasyon metotları
uygulanarak yeni bir analitik metot geliştirilmesi hedeflenmiştir. Çok değişkenli
kalibrasyon metotlerından biri olan genetik algoritma tabanlı ters en küçük kareler
yöntemi kullanılarak çok değişkenli kalibrasyon modelleri oluşturulmuş ve bu modeller
bağımsız kalibrasyon ve validasyon data seti ile test edilmiştir. Sıvı sabun bileşenine ait
kalibrasyon ve validasyon setlerine ait hata değerleri %0,26 ve %0,21 aralığında
tanımlanmıştır. Duş jeli bileşenine ait kalibrasyon ve validasyon setlerine ait hata
değerleri %0,27 ve %0,30 aralığında tanımlanmıştır
Geometrical analysis of a continuously variable transmission system designed for human-robot interfaces
New robotic systems are placed out of their constrained workspaces in order to work alongside humans. Consequently, these applications call for robots monitoring and regulating physical human-robot interaction. These robots’ mechanical compliance should be varied when they are in physical contact with the human or their changing environments. This compliance variation can be achieved in a variety of ways. However, one common idea is the variation of joint stiffness mechanically, electromechanically or by control. The solution presented in this paper is an electromechanical way of varying the joint stiffness. Among the electromechanical methods for varying the joint stiffness, continuously variable transmission (CVT) systems can be used in human-robot interfaces if a set of design criteria are met. These criteria include backdrivability, independent output position and stiffness variation, shock absorbing and low mass/inertia. In this paper, a novel two-cone CVT design with a double spherical transmission element is introduced by taking into account the abovementioned criteria. Additionally, design parameters are identified via carrying out a geometrical analysis of this new CVT system.This work is supported by The Scientific and Technological Research Council of Turkey via grant number 117M405
Fotokatalizör olarak Ni ve Zn temelli organik ağ yapılarının sentezi
Thesis (Master)--Izmir Institute of Technology, Chemical Engineering, Izmir, 2019Includes bibliographical references (leaves: 46-48)Text in English; Abstract: Turkish and EnglishNickel (Ni) and zinc (Zn) based organic frameworks were synthesized on the synthetic zeolite (5A and 13X), natural zeolite mineral clinoptilolite, -Alumina. Initially the zeolite surface was modified or seeded with metal organic framework (MOF). MOF-zeolite composite materials were characterized with XRD, SEM and ATR-IR to understand whether surface processes was achieved successfully or not. Additionally, band gap energies were evaluated to understand these composite materials were used as photocatalyst. Surface modification with APTES was not affect surface of the zeolites. In spite of that seeding created a layer on the surface of zeolite. Nickel based organic framework was coated onto the surface of modified 5A surface. Hydrothermal ZIF8 (ZIF8(1)) and solvothermal ZIF8 (ZIF8(2)) were synthesized successfully as MOF crystals. Besides ZIF8(2) was coated onto the surface of natural zeolite. Additionally, ZIF8/CuBTC sample were synthesized, seeded and coated onto the surface of natural zeolite. Band gap energies of the MOFs and composite materials were calculated with Tauc plot. Results showed that UV light can be used as light source for photocatalytic reactions of these photocatalysts. Also increasing photocatalyst amount increased dye degredation under UV light.Nikel ve çinko temelli organic ağ yapıları, zeolit 5A ve 13X, doğal zeolite ve alüminyum oksit’in yüzey işlemleri ve doğrudan sentez ve kaplama metotları ile yapılan metal organik ağ yapıları ile zeolitlerin oluşturduğu birleşik maddeler araştırılmıştır. Bu maddeler yüzey işlemlerinin başarılı olup olmadığını anlayabilmek için XRD, SEM ve ATR-IR ile analiz edilmiştir. Ayrıca bu birleşik maddelerin fotokatalizör olarak kullanılabileceği bant aralığı enerjileri incelenerek anlaşılmıştır. Yüzey modifikasyon işlemlerinden APTES isimli kimyasal ile yapılanın zeolite yüzeyine bir etkisi görülmemiştir. Buna karşın MOF kaplama işlemini kolaylaştırması için yapılan tutunma yüzeyi oluşturma işlemi başarı ile sonuçlanmıştır. Nikel temelli metal organic ağ yapısı yüzeyine modifikasyon işlemi uygulanmış zeolite 5A’nın yüzeyine başarı ile kaplanmıştır. ZIF8 isimli metal organic ağ yapısı iki farklı metot ile sentezlenmiş olup sentez sırasında çözücü olarak metil alkol kullanılan ürün ayrıca doğal zeolite üzerine de kaplanmıştır. Kaplama işlemi başarı ile gerçekleştirilmiştir. Buna ek olarak, ZIF8 ve bakır içeren metal organic ağ yapısı kompozit ürün olarak sentezlenmiş olup, bu ürün doğal zeolitin üzerine de sentezlenmiştir. Bu fotokatalizörlerin bant aralığı enerjileri incelenmiş olup UV ışık kaynağı ile fotokataliz reaksiyonlarının gerçekleştirilebileceği görülmüştür. Ayrıca yapılan UV ışığı kaynaklı deneyler sonucunda artan fotokatalizör miktarının solüsyondaki Rhodamine-B isimli boyayı bozundurduğu gözlemlenmişti
Baklada (Vicia faba L.) moleküler genetik analizleri
Thesis (Doctoral)--Izmir Institute of Technology, Molecular Biology and Genetics, Izmir, 2019Includes bibliographical references (leaves: 70-82)Text in English; Abstract: Turkish and EnglishFaba bean (Vicia faba L.) is an important food legume crop with a huge genome. In this study, we used Next Generation Sequencing (NGS) technology for development of genomic simple sequence repeat (SSR) markers. A total of 14,027,500 sequence reads were obtained comprising 4,208 Mb. From these reads, 56,063 contigs were assembled (16,367 Mb) and 2138 SSRs were identified. Mono and dinucleotides were the most abundant, accounting for 57.5% and 20.9% of all SSR repeats, respectively. A total of 430 primer pairs were designed from contigs larger than 350 nucleotides and 50 primers pairs were tested for validation of SSR locus amplification. Nearly all (96%) of the markers were found to produce clear amplicons and to be reproducible. Thirty-nine SSR markers were then applied to 46 faba bean accessions from worldwide origins, resulting in 161 alleles with 87.5% polymorphism, and an average of 4.1 alleles per marker. Gene diversity (GD) of the markers ranged from 0.00 to 0.48 with an average of 0.27. Testing of the markers showed that they were useful in determining genetic relationships and population structure in faba bean accessions. In addition, 26 morphological and seven biochemical (phenolics content, flavonoids, protein, L-DOPA, tannins, vicine and convicine) characters of 61 landraces and 53 faba bean cultivars were analyzed. There was high diversity for the studied characters among the accessions. Association mapping for these morphological and biochemical characters with 59 SSR markers (442 fragments) was conducted using a general linear model based on the Q matrix. As a result, 48 significant loci were detected for 22 morphological characters, and 26 loci were detected for six biochemical traits. The range of LD (r2) was from 0.09 to 0.18, and from 0.06 to 0.13 for morphological and biochemical associations, respectively. This study can help breeding programs in selection and improvement of faba bean production.Bakla (Vicia faba L.) çok büyük genomu ile önemli bir baklagil türüdür. Bu çalışmada, genomik basit dizi tekrarı (BDT) markörlerinin geliştirilmesi için İleri Jenerasyon Dizi Analizi Teknolojisi kullanılmıştır. 4.208 Mb’lık genomu kapsayacak şekilde toplam 14.027.500 dizi okunmuştur. Bu okumalardan, 56.063 kontig elde edilmiş olup (16.367 Mb), 2138 adet BDT belirlenmiştir. Tüm BDT’ları içerisinde %57.5 ve %20.9 ile mono- ve di- nükleotid tekrarları, beklenildiği gibi en çok elde edilen tekrar dizileri olmuştur. 350 nükleotidden büyük kontigler için toplam 430 primer çifti tasarlanmış olup, bu primerlerin 50 tanesi BDT lokuslarının çoğaltımının test edilmesinde kullanılmıştır. Bu markörlerin neredeyse hepsi (%96) temiz fragmentler çoğaltmıştır ve tekrar çoğaltabilme özelliğine sahiptir. 39 adet BDT markörü, dünya genelini kapsayan 46 bakla genotipine uygulanmış, sonuçta %87.5 polimorfizm ile 161 adet alel elde edilmiş olup, markör başına ortalama 4.1 alel elde edilmiştir. Markörlerin genetik çeşitlilik (GÇ) değerlerinin ortalaması 0.27 olup, 0.00 ile 0.48 arasında değişiklik göstermiştir. Markörlerin test edilmesi, bakla genotiplerinin genetik ilişkilerinin ve popülasyon yapısının belirlenmesi açısından yararlı olmuştur. Ek olarak, 26 morfolojik ve yedi adet biyokimyasal (fenolik içeriği, flavonoidler, protein, L-DOPA, tanninler, vicine ve convicine) karakter, 61 yerel tür ve 53 bakla çeşidinde analiz edilmiştir. Çalışılan karakterlerde çok yüksek çeşitlilik tespit edilmiştir. Bu morfolojik ve biyokimyasal karakterlerin, 59 BDT markörü ile ilişkilendirme haritası Q matrise bağlı genel doğrusal model kullanılarak oluşturulmuştur. Sonuç olarak, 22 morfolojik karakter için 48 önemli lokus tespit edilirken, 6 biyokimyasal özellik için ise 26 lokus ilişkili bulunmuştur. Bağlantı eşitsizliği (linkage disequilibrium – LD – r2) değerleri morfolojik özellikler için 0.09 ile 0.18 ve biyokimyasal ilişkiler için 0.06 ve 0.13 aralığında bulunmuştur. Bu çalışma, bakla çeşitlerinin ıslah programlarına ve bakla üretiminin arttırılmasında yardımcı olabilecektir.The Scientific and Technological Research Council of Turkey (grant 113E326) and The Republic of Turkey’s Ministry of Science, Industry and Technology (0424.STZ.2013-2
Dışarıda bırakılmış coğrafyalarda kırsal miras: Ahkis'ten Çevrecik'e, bir Bitlis köyü
Thesis (Master)--Izmir Institute of Technology, Architectural Restoration, Izmir, 2019Includes bibliographical references (leaves: 143-149)Text in English; Abstract: Turkish and EnglishBuilt environment and residential units as part of it have a significant role in terms of understanding cultural structure with its transformation in historical process through spatial aspects. While transformation of urban settlements presents information related to urban culture, settlements in rural sites provide narratives from different point of view in the same historical process. Differently from urban settlements that constructed independently of natural environment, rural sites that shaped by their nature present significant information with an approach considering their geographical formations and cultural landscape.
It can be stated that, studies related to rural heritage which rise in importance across the world also started to increase in number in academy of Turkey. This study focuses on the geographies that studies of rural heritage and vernacular architecture as a component of it do not include. Selecting Ahkis village in Hizan district of Bitlis, Eastern Anatolia, the study evaluates the built environment and the settlement with its transformation in time and daily life practices. Because of the limited sources related to the territory, mostly with the information that provided through oral historical sources and interviews made during field survey, it is aimed to approach the site as a whole with its historical background.
In addition to this, it is aimed to read the situation of being excluded which is not specific to Ahkis through historiography of vernacular architecture, designation process and representation of cultural heritage and affects of challenges incident to the territory in terms of literature studies.Yapılı çevre ve bunun bir parçası olan konut yapıları kültürel yapıyı ve bu yapının tarihsel süreç içerisinde geçirdiği değişimlerin mekânsal boyuttaki izleğini anlamada önemli role sahiptirler. Bu tarihsel süreç içerisinde kentlerde yer alan konutların fiziksel dönüşüm ve değişim süreçleri kente içkin veriler sunarken, kırsal alanlarda yer alan konutlar aynı tarihsel akış içerisinde başka bir yönden anlatılar çıkarırlar karşımıza. Bulunduğu çevrenin doğal yapısından bağımsız ve ona rağmen inşa edilen kentlerden farklı olarak kırsal alanlar doğal koşullara göre şekillenmiş ve bulunduğu coğrafyayla, yer şekilleri, su kaynakları kısacası kültürel peyzajı ile birlikte ele alındığında anlamlı veriler sunabilen yerleşimlerdir.
Son yıllarda dünya ölçeğinde önemi artan kırsal mirasa dair çalışmaların Türkiye akademisinde de sayıca artış gösterdiği bilinmektedir. Bu çalışma, kırsal miras ve bunun bir bileşeni olarak vernaküler mimari çalışmalarının kapsamadığı coğrafyalara odaklanmıştır. Çalışmada, Doğu Anadolu Bölgesi’nde yer alan Bitlis’in Hizan ilçesine bağlı Ahkis köyü ve çevresi bir kırsal miras alanı olarak ele alınmıştır. Alandaki yapılı çevre, geçmişten günümüze değişimler geçirmiş yerleşim dokusu ve gündelik hayat pratikleriyle değerlendirilmiş, sınırlı sayıda kaynak sebebiyle daha çok sözlü tarih bilgisiyle elde edilen verilerle tarihsel arka planı oluşturularak bütüncül bir şekilde değerlendirilmesi amaçlanmıştır. Çalışma aynı zamanda sadece Ahkis’e özgü olmayan bu dışarıda bırakılma durumunu, Türkiye’de vernaküler mimarinin tarihyazımı, kültürel miras alanlarının belirlenme ve temsil biçimleri ile bölgeye özgü zorlukların akademik çalışmalara etkisi üzerinden okumayı amaçlamıştır