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Evaluación biológica in vitro e in silico de tetrahidroquinolinas como agentes contra la enfermedad de Alzheimer
61 p.La enfermedad de Alzheimer (EA) es el tipo de demencia más común a nivel
mundial, produce un deterioro cognitivo progresivo, cada vez sus incidencia
aumenta debido al envejecimiento de la población, a pesar de ser cada vez más
común esta enfermedad aún es de causa de desconocida y por la misma razón
aún no se cuenta con un tratamiento efectivo que logre frenar o revertir los efectos
de esta por esto es que desde su descubrimiento se han planteado diferentes
hipótesis sobre la patogenia de la EA y a partir de estas se han generados
fármacos para combatir la enfermedad, de los cuales ninguno ha logrado detener
el deterioro cognitivo, y los que mejores resultados han dado solo logran hacer
más lento la aparición de la sintomatología, dentro de los medicamentos que mejor
rendimiento han tenido se encuentran los inhibidores de la acetilcolinesterasa
(AchE), que basándose en la hipótesis colinérgica, alargan la vida del
neurotransmisor acetilcolina, dando como resultado un deterioro cognitivo más
lento. Dentro de los inhibidores se ha probado diversos medicamentos que
pudieran lograr un mejor efecto que los ya aprobados y reduzcan los efectos
adversos en las personas que padecen de EA, dentro de esta búsqueda aparecen
las quinolinas y sus derivados tetrahidroquinolinas, que ya han servido de andamio
químico para la síntesis de otros medicamentos como lo son antipalúdicos, estos
compuestos son fácil síntesis y su estructura se puede modificar, lo que va a
permitir modificar su actividad ya sea potenciándola o disminuyéndola, además
por su estructura estos compuestos representa un potencial antioxidante, por lo
que también estaría cubriendo la hipótesis oxidativa de la EA. Para este estudio se
probaron 6 de estos compuestos ya sintetizados y se puso a prueba su actividad
antioxidante, su capacidad de inhibir la enzima AchE, la selectividad que tienen
por esta enzima por sobre otra colinesterasa como lo es la butirilcolinesterasa
(Buche), todos estos ensayos in vitro, además los compuestos se sometieron a
estudios in silico para evaluar su potencial farmacológico. De todos los
compuestos analizados el que presentó un mejor rendimiento fue el compuesto C
que tiene una buena capacidad antioxidante, tiene la capacidad e inhibir la AchE,
aunque no es comparable con el fármaco inhibidor de referencia galantamina,
también presentó muy buenas propiedades farmacológicas y en teoría no
presentaría ningún efecto tóxico, por lo que puede sentar las bases para realizar
futuros ensayos bilógicos en cultivos celulares para evaluarlo y desarrollar a partir de él posible fármaco que ampliaría la gama de medicamentos anti- Alzheimer
Encapsulación de bacterias ácido lácticas en polímeros de alginato mediante técnica de extrusión
66 p.Los probióticos son un grupo de bacterias acido lácticas, Gram positivo, inmóviles
y no formadoras de esporas, que se utilizan como tratamiento preventivo para
algunos malestares del aparato gastrointestinal tales como estreñimiento, diarrea,
acidez gástrica y reflujos gastroesofágicos. Son componentes exógenos del
organismo que al colonizar el intestino grueso y mantener la microbiota traen
beneficios para el ser humano. Se ha demostrado que para cumplir este rol deben
ser consumidos en concentraciones específicas, según la normativa atingente
chilena, esta corresponde a 107 UFC por gramo de producto terminado. Debido a
su naturaleza, la viabilidad de los probióticos se ve amenazada por los distintos
mecanismos de defensa presentes en el tracto gastrointestinal, como la variación
extrema de pH, que alcanza un valor cercano a 1 en el estómago, y las
secreciones biliares, incluidas en el duodeno. Bajo esta problemática se han
realizado estudios que demuestran que la encapsulación con polímeros, como el
alginato que es de origen natural e inocuo para el organismo, otorgan un mayor
nivel de protección y ayudan a mantener la viabilidad general de los probióticos.
Por ello, el objetivo de esta revisión fue analizar los estudios reportados sobre
gelificación de alginato, mediante la técnica de extrusión, para encapsular
bacterias ácido lácticas probióticas y analizar cómo se ve influenciada la
supervivencia celular. Los resultados de distintos trabajos experimentales
discutidos manifiestan un aumento en la viabilidad de células recubiertas con
alginato por sobre las células libres, bajo todas las condiciones a las cuales fueron
sometidas, sin embargo, la información sugiere que la utilización de otros
componentes adicionales, como una segunda capa polimérica, mantendría aún más la viabilidad celular
Regulación mitocondrial plaquetaria por compuestos bioactivos
61 p.La investigación de nuevas alternativas terapéuticas para la prevención de
eventos cardiovasculares asociados a trombosis ha cobrado gran relevancia en
los últimos años debido a su alta mortalidad prematura en este tipo de eventos. Si
bien, hay fármacos altamente utilizados y conocidos, como el Ácido Acetilsalicílico
(aspirina), no todos los pacientes que requieren este tipo de prevención pueden
utilizarlos, es por esto por lo que se encuentra actualmente investigando y
buscando nuevas drogas con efectos antiplaquetarios. Dentro de esta búsqueda,
la investigación de compuestos bioactivos que tienen como objetivo la regulación
de la actividad mitocondrial plaquetaria ha tomado fuerza, pues se ha visto que,
compuestos como las hidroquinonas, un tipo de fenol derivado del benceno
utilizada principalmente en la dermatología, tienen efectos antiplaquetarios
relacionados con la función mitocondrial frente al uso de diversos agonistas como
el ADP, colágeno, entre otros. En la misma línea, se ha visto otros compuestos
como el catión trifenilfosfonio que añadido a Mito-Quinona y Mito-TEMPO ejerce
actividad antiagregante al facilitar su acumulación al interior de la matriz
mitocondrial plaquetaria. En base a esto, el objetivo de este trabajo es describir como estos nuevos compuestos regulan la actividad mitocondrial en plaquetas
Diseño de un protocolo para llevar a cabo un levantamiento de información respecto a la generación de residuos y gasto energético en los laboratorios docentes de la escuela de tecnología médica de la Universidad de Talca
66 p.Dentro de la realidad universitaria en el proceso de formación a estudiantes del
área de la salud, conlleva en múltiples ocasiones, a realizar prácticas
experimentales para exponer el conocimiento teórico. Este proceso experimental
posee lugares determinados como los laboratorios docentes, en estos espacios se
trabaja con diversos materiales y utilización de recursos, como la electricidad,
estos elementos, por ejemplo: material cortopunzante, fluidos corporales,
reactivos, entre otros, luego de su uso pertinente son desechados generando un
impacto ambiental desconocido. Cabe destacar que dentro de estos desechos
existen elementos tóxicos, reactivos o líquidos biológicos. Es por ello que se
generó un protocolo para llevar a cabo un levantamiento de información respecto a
la generación de residuos y gasto energético en los laboratorios docentes de
especialidad de la Escuela de Tecnología Médica de la Universidad de Talca dado
que se espera sea un precedente para ejercer conciencia sobre el impacto
ambiental ejercido en esta área. Para efectuar este trabajo se revisó diversos
estudios y/o protocolos relacionados con la generación de residuos y la
determinación del gasto eléctrico en los laboratorios docentes de educación
superior con los cuales se diseñó un protocolo que fue sometido a la opinión de
expertos. Con este protocolo optimizado se podrá aplicar a futuro, en los laboratorios docentes de especialidad de la Escuela de Tecnología Médica para la obtención de datos fidedignos
Recopilación de información acerca de requisitos y procedimientos de toma de muestra de sangre venosa
76 p.El trabajo de laboratorio requiere de tres fases para realizar el procedimiento a
cabalidad: fase pre analítica, analítica y post analítica. De estas tres fases
mencionadas, la primera corresponde a la etapa a la cual se le atribuye el mayor
porcentaje de errores cometidos, representando el 70% aproximadamente del total
de errores que ocurren en el laboratorio clínico, debido principalmente a la mayor
intervención humana que se necesita en dicha fase para llevar a cabo todo el
procedimiento requerido. A partir de esta fase, existen distintos procesos que se
requieren realizar correctamente con la finalidad de aportar muestras de sangre
óptimas al profesional del laboratorio clínico para su posterior análisis, y en
consecuencia obtener resultados certeros sobre el estado de salud de los
pacientes. Dichos procesos pueden variar brevemente entre los protocolos de
distintos recintos hospitalarios de Chile. Con esta revisión bibliográfica se buscó
describir los principales errores y causas de rechazo asociados a la fase pre
analítica para la toma de muestra de sangre, así como también abordar los
principales aspectos del procedimiento de toma de muestra sanguínea
tradicionales y/o actuales según la evidencia científica existente en la literatura
como: sistemas de extracción, posibles efectos adversos asociados a la práctica
de flebotomía, contenedores de extracción de sangre, orden de llenado de tubos y
transporte de muestras sanguíneas. Dado lo anterior, se puede destacar que este
procedimiento se mantiene sin muchos avances en la mayoría de sus aspectos,
encontrando el mayor avance en los dispositivos de transiluminación que facilitan
la localización del sitio de punción. Sin embargo, las generalidades del procedimiento de toma de muestra sanguínea no presentan grandes modificaciones ni mejoras con el transcurso de los años
Plantas con actividad cardioprotectora
100 p.Por años las enfermedades cardiovasculares y los factores de riesgos que
conllevan a ella han sido bien estudiados por parte del área de la salud, siendo un
punto importante la prevención y la educación que se le ha dado a la población
chilena para evitar este problema de salud tan generalizado en el mundo. Los
costos de la salud primaria en el tratamiento dentro del área hospitalaria han sido
incalculables para la economía del país, además de las limitadas opciones para el
reemplazo de estas, lo que conlleva a la investigación de otras alternativas de
tratamiento como lo es la medicina natural (fitoterapia), que ha ganado un gran
espacio tanto en países desarrollados como en vías de desarrollo. Se han
descubierto compuestos activos eficientes para el mejoramiento de patologías
asociadas con las enfermedades cardiovasculares. El objetivo del presente
estudio es recopilar y exponer información actualizada sobre la actividad
cardioprotectora de las plantas de Chile en los distintos ámbitos de acción. Para
realizar lo anterior se utilizará una metodología de búsqueda bibliográfica en sitios
de interés científicos, esencialmente aquellos realizados en vivo e in vitro en
animales y seres humanos desde tiempos de antaño hasta la actualidad
Identificación de elementos transponibles como reguladores génicos durante el proceso de regeneración de la aleta caudal de Danio rerio
112 p.La regeneración es un proceso biológico en el cual se reparan células, tejidos, órganos o extremidades completas de un organismo tras sufrir una lesión en ellos. Ocurre naturalmente en todos los organismos, sin embargo, en la mayoría de ellos decae a medida que alcanzan su madurez reproductiva. Uno de los organismos modelos para estudiar la regeneración es el pez cebra (Danio rerio). Este organismo presenta a lo largo de toda su vida capacidades regenerativas de muchos de sus órganos, siendo una de las más estudiadas la aleta caudal. Pero ¿Cómo sucede este proceso? ¿Qué genes y/o elementos participan durante el evento regenerativo? En particular, esta investigación se centró en identificar los principales agentes participantes del evento de regeneración de la aleta caudal de Danio rerio, desde un punto de vista regulatorio, es decir, los genes relacionados a regeneración y los elementos reguladores que promueven o reprimen su transcripción. En la actualidad se conoce un diverso catálogo de genes y potenciadores que se activan durante la regeneración de la aleta caudal de Danio rerio. Muchos de los elementos reguladores de un genoma provienen de secuencias no codificantes y en muchos casos estas son aportados por elementos repetidos, en concreto los elementos transponibles (TEs). Diversos estudios han implicado TEs como elementos reguladores en tejidos somáticos y enfermedad. Aproximadamente la mitad del genoma de Danio rerio corresponde a TEs, por lo que se puede especular que en este organismo también haya regulación de genes mediada por TEs. Así, caracterizar su rol en el contexto del evento regenerativo, puede permitir identificar nuevos mecanismos moleculares asociados a regeneración. Además, tanto este como otros análisis, pueden ser considerados como puerta de entrada a potenciales terapias y/o herramientas biotecnológicas para tratar daños en órganos y tejidos de otros organismos. Considerando todo lo anterior, se planteó la pregunta ¿los TEs participan en la regulación de la expresión génica durante la regeneración de la aleta caudal? Y si es así, ¿qué tipos de TEs participan? ¿De qué manera están potencialmente regulando la expresión de los genes asociados a regeneración? En este trabajo se buscó analizar y explorar el rol regulatorio que podrían presentar estos elementos durante el evento regenerativo, utilizando datos de metodologías RNA-Seq, para generar un perfil transcriptómico de un momento determinado del proceso de genes y TEs cercanos y datos de ATAC-Seq para identificar regiones abiertas de cromatina donde participen y se unan al DNA factores de transcripción que regulen el evento regenerativo. Se encontraron TEs de tipo DNA y LTR que se estaban sobre-expresando posterior al proceso de amputación, en regiones intrónicas de genes relacionados a regeneración, como lo son anxa2a y hspa12b. A su vez, se identificaron un total de 184 TEs que estaban actuando como sitios de unión a 6 factores de transcripción distintos relacionados a regeneración. Estos resultados apoyan la hipótesis del rol regulatorio de estos elementos en procesos biológicos como el regenerativo, sin embargo, deben ser tomados con precaución y confirmarse con nuevos experimentos/metodologías biológicas que confirmen su rol en el evento. // ABSTRACT: Regeneration is a biological process in which cells, tissues, organs, or complete limbs of an organism are repaired after suffering an injury to them. It occurs naturally in all organisms, however, in most organisms it declines as they reach reproductive maturity. One of the model organisms to study regeneration is the zebrafish (Danio rerio). This organism presents throughout its life regenerative capacities of many of its organs, one of the most studied being the caudal fin. But how does this process take place? What genes and/or elements are involved during the regenerative event? This research focused on identifying the main agents involved in the regeneration event of the Danio rerio caudal fin, from a regulatory point of view, i.e., the genes related to regeneration and the regulatory elements that promote or repress their transcription. A diverse catalog of genes and enhancers that are activated during Danio rerio caudal fin regeneration is currently known. Many of the regulatory elements in a genome come from non-coding sequences and in many cases these are provided by repeated elements, in particular transposable elements (TEs). Several studies have implicated TEs as regulatory elements in somatic tissues and disease. Approximately half of the Danio rerio genome corresponds to TEs, so it can be speculated that TE-mediated gene regulation also occurs in this organism. Thus, characterizing their role in the context of the regenerative event may allow us to identify new molecular mechanisms associated with regeneration. Furthermore, both this and other analyses can be considered as a gateway to potential therapies and/or biotechnological tools to treat damage in organs and tissues of other organisms. Considering all of the above, the question was raised: Are TEs involved in the regulation of gene expression during caudal fin regeneration? And if so, what types of TEs are involved? In what way are they potentially regulating the expression of regeneration-associated genes? In this work we sought to analyze and explore the regulatory role that these elements could play during the regenerative event, using data from RNA-Seq methodologies to generate a transcriptomic profile of a specific moment of the process of nearby genes and TEs and ATAC-Seq data to identify open chromatin regions where transcription factors that regulate the regenerative event participate and bind to DNA. DNA and LTR TEs were found to be overexpressing after the amputation process, in intronic regions of genes related to regeneration, such as anxa2a and hspa12b. In turn, a total of 184 TEs were identified that were acting as binding sites for 6 different transcription factors related to regeneration. These results support the hypothesis of the regulatory role of these elements in biological processes such as regeneration, however, they should be taken with caution and confirmed with new biological experiments/methodologies to confirm their role in the event
Análisis del microbioma oral y microbioma tumoral bacteriano en el carcinoma oral de células escamosas
139 p.El cáncer oral es un problema de salud altamente preocupante a nivel mundial. Se encuentra dentro de los 10 cánceres más comunes en el mundo, y se espera que sus casos para el 2040 aumenten en un 47%. El carcinoma de células escamosas orales (OSCC), es el tipo de cáncer oral más prevalente, el cual puede llegar a tener un gran impacto en el estilo de vida de los pacientes afectando funciones vitales tales como la respiración y la deglución. Actualmente se estima que del total de casos diagnosticados con OSCC en Chile en el año 2020, el 51,1% de los pacientes falleció. Los principales factores de riesgos de padecer cáncer oral son el consumo excesivo de tabaco, alcohol, nuez de areca, el Virus de Papiloma Humano (VPH) y el estado del microbioma oral bacteriano. En el caso del microbioma oral en cáncer, denominado microbioma tumoral, se ha reportado que la presencia de algunas bacterias en saliva induce inflamación, promueve la proliferación e invasión tumoral y también inhibe la apoptosis a través de alteraciones genómicas de la célula huésped. Sin embargo, existe poca evidencia de la composición del microbioma tumoral oral en pacientes chilenos. A partir de muestras de secretoma de biopsias de 5 pacientes con cáncer oral y 5 pacientes sanos como control, se analizó el microbioma tumoral mediante herramientas bioinformáticas de proteómica cuantitativa. El análisis de los resultados reveló la identificación de 1131 proteínas en las muestras de cáncer y 441 proteínas en las muestras control. Se identificaron las principales especies de bacterias en cada condición y Fusobacterium nucleatum fue la bacteria predominante en muestras de secretoma de cáncer. Se identificaron 537 proteínas de Fusobacterium nucleatum y mediante la herramienta STITCH se identificaron redes de interacción para dos subespecies de Fusobacterium nucleatum: Polymorphum y Nucleatum, las cuales presentan genes asociados a funciones biológicas vinculadas directamente con el desarrollo del cáncer. En conclusión, el microbioma oral de
pacientes chilenos con cáncer oral presenta mayor abundancia de proteinas bacterianas y un predominio de Fusobacterium nucleatum en comparación al microbioma oral de individuos sanos. // ABSTRACT: Oral cancer is a worldwide health problem of great concern. It is among the 10 most common cancers in the world, and its cases are expected to increase 47% by 2040. Oral squamous cell carcinoma (OSCC) is the most prevalent type of oral cancer, which can have a major impact on patient’s lifestyles, affecting vital functions such as breathing and swallowing. Currently, it is estimated that 51.1% of the total cases diagnosed with OSCC died in 2020. The main risk factors for oral cancer are excessive consumption of tobacco, alcohol, areca nut, Human Papilloma Virus (HPV) and the state of the oral microbiome. In the case of the oral microbiome in cancer or “oral tumor microbiome”, it has been reported that the presence of some bacteria in saliva induces inflammation, promotes tumor proliferation and invasion and inhibits apoptosis through genomic alterations of the host cell. However, there is little evidence of the composition of the oral tumor microbiome in Chilean patients. From biopsy secretome samples from 5 oral cancer patients and 5 healthy control patients, the tumor microbiome was analyzed using quantitative proteomics bioinformatics tools. Analysis of the results revealed the identification of 1131 proteins in the cancer samples and 441 proteins in the control samples. Then, the main bacterial species in each condition were identified and Fusobacterium nucleatum was the predominant bacterium in cancer secretome samples. A total of 537 Fusobacterium nucleatum proteins were identified and using the STITCH tool, interaction networks were identified for two subspecies of Fusobacterium nucleatum: Polymorphum and Nucleatum, which present genes associated with biological functions directly linked to cancer development. In conclusion, the oral microbiome of Chilean patients with oral cancer presents a higher abundance of bacterial proteins and a predominance of Fusobacterium nucleatum compared to the oral microbiome of healthy individuals
Transporte de nicotinato y compuestos relacionados mediado por el transportador de monocarboxilatos acoplado a sodio (SMCT1)
63 p.Las proteínas de membrana tienen una gran importancia biológica, debido a que juegan un papel fundamental en distintos procesos que regulan una larga lista de enfermedades. Estas proteínas son cruciales para el transporte de sustratos en la célula, por lo que pueden actuar fácilmente como dianas biológicas, logrando desencadenar alguna respuesta farmacológica deseada. La familia SCL5, es una familia de cotransportadores de monocarboxilatos acoplado a sodio, que contempla 12 proteínas en el genoma humano. Existen varios estudios que reportan la importancia de esta familia en procesos de captación de azúcares, vitaminas y aminoácidos, sin embargo, los mecanismos estructurales asociados al transporte de solutos aún no son del todo caracterizados. Principalmente el gen SLC5A8, el cual codifica el transportador 1 de monocarboxilatos y cadenas cortas de ácidos grasos acoplado a sodio (SMCT1, del inglés Sodiumcoupled monocarboxylate transporter 1), ha sido asociado a la recaptación de monocarboxilatos en distintos órganos humanos. En este ámbito, investigaciones recientes a cerca del transporte de nicotinato, una vitamina del complejo B tipo monocarboxilato, han demostrado una reducción en el transporte de esta molécula debido a una mutación puntual en el residuo treonina 91 de SMCT1. En la presente investigación se utilizó una estrategia de modelado por homología de proteínas para generar un modelo del transportador SMCT1 en una conformación orientada hacia el medio externo. Acoplamiento molecular para la búsqueda de confórmeros que representaran el modo de unión de nicotinato y compuestos relacionados de variada afinidad para SMCT1, para finalmente aplicar metodologías de simulación molecular caracterizando estructuralmente los elementos claves que regulan la captación de estos compuestos, además de estudiar el efecto la mutación treonina 91 por glicina (T91G) y como esto incide en
el transporte de sustratos. Los resultados obtenidos a lo largo de esta investigación sugieren que los residuos F65, F85, F88, Y92 y W253 son residuos importantes en la captación de compuestos, por otro lado, el residuo treonina 91 presenta un rol estructural en donde su mutación por glicina, que termina provocando la distorsión en las cadenas laterales de Y92 y W253 produce la inestabilidad de estos complejos. // ABSTRACT: Membrane proteins are of great biological importance, since they play a fundamental role in different processes that regulate a long list of diseases. These proteins are crucial for the transport of substrates in the cell, so they can easily act as biological targets, triggering a desired pharmacological response. The SCL5 family is a family of sodium-coupled monocarboxylate cotransporters, which includes 12 proteins in the human genome. There are several studies that report the importance of this family in the uptake of sugars, vitamins and amino acids; however, the structural mechanisms associated with solute transport have not yet been fully characterized. Mainly the SLC5A8 gene, which encodes the sodium-coupled monocarboxylate and short-chain fatty acid transporter 1 (SMCT1), has been associated with the reuptake of monocarboxylates in different human organs. In this field, recent research on the transport of nicotinate, a monocarboxylate-type B-complex vitamin, has demonstrated a reduction in the transport of this molecule due to a point mutation in the threonine 91 residue of SMCT1. In the present investigation, a protein homology modeling strategy was used to generate a model of the SMCT1 transporter in an externally oriented conformation. Molecular docking to search for confomers representing the binding mode of nicotinate and related compounds of varying affinity for SMCT1, to finally apply molecular simulation methodologies to structurally characterize the key elements that regulate the uptake of these compounds, in addition to studying the effect of the threonine 91 by glycine (T91G) mutation and how this affects the transport of substrates. The results obtained throughout this research suggest that residues F65, F85, F88, Y92 and W253 are important residues in the uptake of compounds, on the other hand, residue threonine 91 presents a structural role where its mutation by glycine, which ends up causing the distortion in the side chains of Y92 and W253 produces the instability of these complexes