RepOD – Repository for Open Data (Open Science Platform - PON / Interdisciplinary Centre for Mathematical and Computational Modelling of the University of Warsaw - ICM UW)
Not a member yet
3312 research outputs found
Sort by
Honeybee gut microbiota in relation to Nosema ceranae infection
No full textZbiór zawiera dane powiązane z publikacją będącą obecnie w trakcie przygotowania. Dane dotyczą analiz składu mikrobioty jelitowej pszczoły miodnej w sytuacji infekcji pasożytem Nosema ceranae.</p
Bifunctional silk nanospheres for targeted delivery of oligonucleotide therapeutics to VEGFR-positive cells in the tumor microenvironment
No full textThis dataset contains experimental data supporting the publication “Bifunctional silk nanospheres for targeted delivery of oligonucleotide therapeutics to VEGFR-positive cells in the tumor microenvironment.” The study was conducted as part of a research project funded by the National Science Centre (grant no. 2021/43/D/NZ7/00622).The purpose of the study was to develop and evaluate a targeted drug delivery system based on functionalized silk nanospheres for the selective delivery of oligonucleotide therapeutics to vascular endothelial growth factor receptor (VEGFR)-overexpressing cells in the tumor microenvironment.The dataset includes data generated during the engineering and characterization of five hybrid silk proteins produced by fusing bioengineered MS1 silk with peptides targeting VEGFR-1 (VE1MS1, VE1bMS1, VE1cMS1) and VEGFR-2 (VE2bMS1, VE2cMS1). These constructs were assessed for receptor binding and cellular internalization in VEGFR-overexpressing cells, resulting in the selection of VE1MS1 and VE2bMS1 as lead candidates for drug delivery system development.Further data document the formation of bifunctional silk nanospheres obtained by blending VE1MS1 or VE2bMS1 with the nucleic acid–binding silk protein MS2KN. The dataset covers nanoparticle physicochemical characterization, nucleic acid-binding capacity, cytotoxicity, cellular uptake, selective interaction with VEGFR-overexpressing non-small-cell lung cancer cells, and therapeutic efficacy, including siRNA-mediated gene silencing.The dataset provides comprehensive experimental evidence demonstrating that incorporation of VEGFR-targeting enhances receptor-specific cellular interactions, and, in combination with MS2KN, enables efficient and targeted delivery of siRNA therapeutics to the VEGFR-overexpressing cells of the tumor microenvironment.</p
Investigation of energy harvesting efficiency in a magnetic rolling pendulum - report
No full textThe included data comprise output data for bifurcation diagrams and RMS voltage for modified and zero initial conditions, together with their graphical representations, as well as output data of the Lyapunov exponent for modified initial conditions and their graphical representations. High-resolution illustrations included in the article are also provided. For proper interpretation of the results, consultation with the author is recommended.</p
Metaboliczna stłuszczeniowa choroba wątroby u dzieci i młodzieży z otyłością olbrzymią
No full textOtyłość olbrzymia u dzieci i młodzieży stanowi szczególne obciążenie dla zdrowia ze względu na częste występowanie powikłań i chorób współistniejących, w tym metabolicznej stłuszczeniowej choroby wątroby związanej (MAFLD). MAFLD jest obecnie jedną z najczęstszych przewlekłych chorób wątroby u dzieci i jest porównywalna z rosnącą częstością występowania ciężkiej otyłości u dzieci. Badania przesiewowe z użyciem aminotransferazy alaninowej (ALT) jako badanie wstępne należy rozpocząć u wszystkich dzieci w wieku 9–11 lat chorych na otyłość, u dzieci z nadwagą i dodatkowymi czynnikami ryzyka oraz u dzieci z otyłością olbrzymią lub MAFLD w rodzinie. Nieinwazyjne techniki obrazowania wykazują istotne ograniczenia u dzieci ze zwiększoną ilością tkanki podskórnej, co wymaga ostrożnej interpretacji. Podstawą terapii pozostaje modyfikacja stylu życia, natomiast metody leczenia farmakologicznego mają charakter eksperymentalny. U młodzieży z otyłością olbrzymią i poważnymi chorobami współistniejącymi chirurgia bariatryczna stanowi skuteczną opcję terapeutyczną z trwałymi efektami metabolicznymi.Celem prac była przegląd aktualnych dowodów (2019–2025) i przełomowych badań dotyczących diagnostyki i leczenia MAFLD u dzieci, uwzględniając współczesne wytyczne i przyszłe kierunki oraz ocena częstości występowania MAFLD u polskich dzieci i młodzieży z otyłością olbrzymią i ocena jej związku z antropometrycznymi i metabolicznymi czynnikami ryzyka. Pacjenci i metody: U 212 dzieci i młodzieży z otyłością olbrzymią (w wieku 3–18 lat) przeprowadzono badanie fizykalne, skład ciała metodą bioimpedancji, badanie ultrasonograficzne wątroby (USG) i ocenę biochemiczną. MAFLD rozpoznawano na podstawie obecności stłuszczenia w badaniu USG i/lub utrzymującego się podwyższonego stężenia aminotransferazy alaninowej. Wyniki: MAFLD stwierdzono u 125 (59,0%) chorych. Zespół metaboliczny (MetS) rozpoznano u 57,5% chorych bez MAFLD i u 66,5% chorych z MAFLD (p > 0,05). Nieprawidłowa glikemia na czczo, nieprawidłowa tolerancja glukozy i wysoki wskaźnik HOMA-IR występowały częściej u pacjentów z MAFLD niż u pacjentów bez MAFLD (p < 0,05). W grupie MAFLD zaobserwowano większą liczbę pacjentów z ≥4 składowymi MetS niż w grupie bez MAFLD (33,6% vs. 12,6%, p = 0,0004). Wnioski: Częstość występowania MAFLD wśród dzieci i młodzieży z otyłością olbrzymią wynosiła 59%. Pacjenci ci charakteryzują się wyższym stopniem insulinooporności i większą liczbą składowych MetS.Badania te zostały w całości sfinansowane przez Narodowe Centrum Nauki, Polska (2021/41/B/NZ5/01676).W załączonym pliku znajdują się surowe dane, użyte do analizy, powiązane z publikacją https://doi.org/10.3390/jcm14103565 oraz piśmiennictwo publikacji https://doi.org/10.3390/jcm15010137</p
Calorimetric data of liquid Cu-Mg-Ti alloys
No full textSince limited information is available in the literature regarding the thermodynamic properties of the Cu-Mg-Ti system, this work aims to determine the mixing enthalpy change for several liquid alloys from this system. To achieve the intended purpose, the methods used were divided into two phases. The first covered the high-temperature calorimetric measurement of enthalpy of mixing performed at 1123 K – 1402 K for liquid solutions in six measurement series (A-F).The obtained calorimetric results for the integral molar mixing enthalpy change show a negative deviation from ideal solutions over the entire concentration measurement range. The presented results enhance the existing knowledge concerning thermodynamic properties of the Cu-Mg-Ti system.The provided data set contains the results of the experimental part of the article, included in Appendix A of the article:• .txt files with column headers Index Time (h) Furnace Temperature (°C) Sample Temperature (°C) Heat Flow (µV) contain calorimetric data of the mixing enthalpy change measurement for liquid Cu-Mg-Ti alloys.This work is supported by the National Science Centre, Poland, for funding project no. 2021/43/O/ST8/01291 entitled “Thermodynamic properties and structure of Cu-Mg-Ti and Ag-Mg-Ti alloys and their potential to interact with hydrogen” in the years 2022–2027. </p
Dyplomacja miejska jako narzędzie do ożywienia międzynarodowej współpracy wielostronnej – część 1
No full textZbiór zawiera dane zebrane w ramach projektu OPUS28 nr 2024/55/B/HS5/01968 pt. Dyplomacja miejska jako narzędzie do ożywienia międzynarodowej współpracy wielostronnej (City diplomacy as a tool to reinvigorate international multilateral cooperation) finansowanego przez Narodowe Centrum Nauki.Badanie opiera się na informacjach zebranych za pomocą kwestionariusza, który został rozesłany do europejskich ministerstw spraw zagranicznych (MSZ) oraz do wybranych miast. Dobór próby objął 36 państw europejskich, aby uchwycić możliwie pełne spektrum systemów zarządzania w Europie – od federalnych po unitarnie zorganizowane oraz od struktur scentralizowanych po zdecentralizowane. Autorzy dążyli do zapewnienia zróżnicowania geograficznego i instytucjonalnego, obejmującego zarówno państwa członkowskie UE, jak i kraje spoza Unii, w celu identyfikacji wzorców metazarządzania (meta-governance) funkcjonujących w odmiennych tradycjach administracyjnych.</p
Experimental study of sustainable coatings for titanium implants
No full textFiles include the data presented in the manuscript entitled "Sustainable Plant-Derived Coatings for Titanium Implants: Dual Drug and Ion Release Capabilities" by M. Jakubowski et al.Data (.csv) includes:FTIR_Spectra - The tests were carried out in the reflection mode, a gold mirror was used as a background and a TE-MCT detector was used.DPPH - The DPPH assay is a simple spectrophotometric method used to evaluate antioxidant activity. Antioxidants present in the sample reduce the DPPH radical, causing a decrease in absorbance.Data (.tif) includes:SEM_SrTit - The VEGA3 scanning electron microscope (Tescan, Czech Republic) was utilized to analyze the morphology of the fabricated material.SEM_SrTitMint - The VEGA3 scanning electron microscope (Tescan, Czech Republic) was utilized to analyze the morphology of the fabricated material.SEM_SrTitMintCipro - The VEGA3 scanning electron microscope (Tescan, Czech Republic) was utilized to analyze the morphology of the fabricated material.SEM_SrTitNettleCipro - The VEGA3 scanning electron microscope (Tescan, Czech Republic) was utilized to analyze the morphology of the fabricated material.SEM_SrTitSage - The VEGA3 scanning electron microscope (Tescan, Czech Republic) was utilized to analyze the morphology of the fabricated material.SEM_SrTitSageCipro - The VEGA3 scanning electron microscope (Tescan, Czech Republic) was utilized to analyze the morphology of the fabricated material.SEM_Tit - The VEGA3 scanning electron microscope (Tescan, Czech Republic) was utilized to analyze the morphology of the fabricated material. SEM-SrTitNettle - The VEGA3 scanning electron microscope (Tescan, Czech Republic) was utilized to analyze the morphology of the fabricated material.Data (.png) includes:AFM_SrTit_20x20.png - The analysis was performed on an area of 20 × 20 µm.AFM_SrTitMint_20x20.png - The analysis was performed on an area of 20 × 20 µm.AFM_SrTitMint-Cipro_20x20.png - The analysis was performed on an area of 20 × 20 µm.AFM_SrTitNettle_20x20.png - The analysis was performed on an area of 20 × 20 µm.AFM_SrTitNettle-Cipro_20x20.png - The analysis was performed on an area of 20 × 20 µm.AFM_SrTitSage_20x20.png - The analysis was performed on an area of 20 × 20 µm.AFM_SrTitSage-Cipro_20x20.png - The analysis was performed on an area of 20 × 20 µm.AFM_Tit_20x20.png - The analysis was performed on an area of 20 × 20 µm. List of abbreviations:SEM – scanning electron microscopy;FTIR – Fourier-transform infrared spectroscopy;AFM – Atomic Force Microscope;Tit - Titanium alloy Ti6Al4V;SrTit - Titanium alloy Ti6Al4V modified with strontium titanateCipro - Ciprofloxacin.</p
Binding constants of soluble ligands to membrane receptors obtained from coarse-grained molecular dynamics simulations
No full textData behind Figure 2 in the research article titled "Binding of Soluble Ligands to Membrane Receptors: A Molecular Dynamics Simulation Study" by Ruihan Hou, Jie Gao, Jingchun Chen, Rong Wang, Bartosz Różycki, and Jinglei Hu; J. Phys. Chem. B 129(29): 7475-7482 (2025); https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.jpcb.5c01197See readme file for more information.</p
Numerical and analytical results obtained within the framework of the tolerance modeling technique (LHM) of temperature distribution in a wall having a periodic and functionally graded structure
No full textThe dataset contains results of computer simulations performed using the Finite Element Method (FEM) and analytical calculations carried out within tolerance modeling (LHM model). The study concerns heat conduction phenomena in multilayer, two-component periodic structures. The data are presented in tabular and graphical form.</p
Opóźniona interwencja u dzieci i młodzieży z otyłością olbrzymią
No full textOtyłość u dzieci stanowi coraz większy globalny problem zdrowotny, a wśród małych dzieci występuje coraz większa częstość występowania ciężkiej otyłości. Celem pracy było określenie średniego wieku, w którym pojawia się otyłość olbrzymia u polskich dzieci oraz ocena czasu pomiędzy diagnozą a skierowaniem do specjalistycznej opieki. Metody: Analizę danych przeprowadzono w czterech polskich ośrodkach endokrynologii dziecięcej specjalizujących się w leczeniu otyłości u dzieci w okresie od lipca 2022 r. do listopada 2023 r. W badaniu wzięło udział 367 dzieci i młodzieży (186 chłopców, 181 dziewcząt) w wieku 0–18 lat, u których na podstawie kryteriów BMI dla wieku rozpoznano otyłość olbrzymią. Pomiary antropometryczne wykonano w trakcie włączania pacjenta do badania oraz na podstawie dotychczasowej dokumentacji medycznej. Dla wszystkich bieżących i przeszłych pomiarów obliczono wskaźniki BMI i BMI Z-score. Wyniki: Mediana wieku badanej populacji w momencie włączenia do badania wynosiła 13,7 ± 2,9 lat (zakres: 2,2-18 lat). Mediana BMI wyniosła 40,9 ± 5,1 kg/m2 (zakres: 30,1-65,8 kg/m2), a mediana BMI Z-score wyniosła 2,7 ± 0,4 (zakres: 2,3-6,2). Spośród 367 dzieci objętych badaniem 327 (89%) weszło w okres dojrzewania. Analiza wcześniejszych pomiarów wykazała, że u 83% dzieci otyłość występowała już w momencie najwcześniejszego zarejestrowanego pomiaru BMI, przy czym mediana wieku wystąpienia otyłości wynosiła 3,2 roku. Mediana wieku skierowania do opieki specjalistycznej wyniosła 10 ± 5,0 lat, co odzwierciedla opóźnienie od diagnozy do ukierunkowanej opieki medycznej wynoszące prawie 7 lat. Wnioski: Badanie to podkreśla znaczne opóźnienie pomiędzy wystąpieniem otyłości olbrzymiej a skierowaniem pacjenta do specjalistycznej opieki, podkreślając potrzebę wcześniejszego opracowania strategii interwencyjnych dostosowanych do wieku, płci i etapu rozwoju.Badania te zostały w całości sfinansowane przez Narodowe Centrum Nauki, Polska (2021/41/B/NZ5/01676).W załączonym pliku znajdują się surowe dane, użyte do analizy, powiązane z publikacją.</p