Alberto Sols Biomedical Research Institute
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Unveiling emerging trends and gaps in scientific research on vertebrate biodiversity in tropical savannahs
No full textSavannahs are among the most threatened ecosystems in the world due to the rapid change in their land use for forestry, soybean cultivation, and pasture. However, savannahs are less studied than tropical forest ecosystems despite this intense anthropogenic pressure. As such, here we investigate the gaps and trends in scientific research on terrestrial vertebrates in tropical savannahs, via a systematic search for scientific articles on the Web of Science platform. Subsequently, to identify the geographic distribution of the studies, we divided the total number of articles by the area of the Savannah biome (in km2) that occurs in each country. Our results show that Africa has a deficit in scientific research on terrestrial vertebrates compared to Oceania and South America, and that this global trend in the distribution of studies is closely related to the Human Development Index. We also identified land use change and fire dynamics as the most studied drivers of biodiversity loss, while invasive species and climate change were the least well studied. Finally, our research revealed that about 80% of the articles focused on mammals and birds, and that phylogenetic and functional diversity were the least studied dimensions of vertebrate biodiversity in tropical savannahs. These results are concerning for conservation efforts, as they reveal not only a substantial geographic gap but also a limited and biased understanding of savannah biodiversityThis work was supported by the Fundação de Amparo à Pesquisa doEstado do Amazonas (01.02.016301.005462/2024-32); Coordenação deAperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (88881.934045/2024-01); Ministerio de Ciencia, Innovación y Universidades (BG22/00121,CA3/RSUE/2021- 00197, and RYC2023- 045231-I); and the NationalGeographic Society (NGS-96963R-22
TAF1-dependent transcriptional dysregulation underlies multiple sclerosis
No full textTesis Doctoral inédita leída en la Universidad Autónoma de Madrid, Facultad de Medicina, Departamento de Biología Molecular. Fecha de Lectura: 20-06-2025Esta Tesis tiene embargado el acceso al texto completo hasta el 20-12-2026La esclerosis múltiple (EM) es una enfermedad discapacitante caracterizada por neuroinflamación y desmielinización del sistema nervioso central (SNC). Las variantes genéticas de riesgo para desarrollar EM afectan a genes relacionados con funciones inmunológicas, mientras que las variantes asociadas con la severidad inciden en genes expresados en el SNC. Aunque los tratamientos actuales previenen los brotes, no existen terapias eficaces para frenar la progresión de la enfermedad, que parece depender de procesos intrínsecos del SNC. En este trabajo, se explora el papel de TAF1 (la subunidad de andamiaje del factor general de transcripción TFIID, necesario para la transcripción de todos los genes codificantes de proteínas) en la EM progresiva, debido a su función reguladora en la pausa y liberación de la RNA polimerasa II (RNAPII), un mecanismo patogénico en oligodendroglía en EM.
El primer objetivo de la tesis fue analizar el estado de TAF1 en tejido cerebral aparentemente normal de individuos con EM progresiva. Encontramos una infradetección selectiva del extremo C-terminal de TAF1 codificado por el último exón (exón 38), sin cambios en los niveles totales de la proteína. A continuación, estudiamos la causa de este desbalance hallando evidencias que apuntaron a un corte proteolítico en esta región por catepsina B extralisosomal, que se encontró aumentada en tejido cerebral aparentemente normal de individuos con EM progresiva.
El siguiente objetivo fue generar y caracterizar un modelo de ratón que porta la deleción del exón 38 de TAF1, forzando así la disminución del extremo C-terminal de TAF1 observada en EM progresiva. Los ratones mostraron un fenotipo motor progresivo con desmielinización masiva y neuroinflamación en la sustancia blanca mediada por células residentes del SNC, así como una firma transcripcional cerebral muy similar a la de la EM progresiva, siendo la oligodendroglía y la microglía los tipos celulares más afectados transcripcionalmente.
Finalmente, exploramos los mecanismos moleculares afectados por la ausencia de la región C-terminal de TAF1. Encontramos un defecto en la interacción de TAF1 carente del extremo C-terminal con factores que participan en la liberación de la RNAPII, algunos de los cuales mostraron asociación genética con EM, como TFIIB y TFIIH. Además, en el cerebro de individuos con EM progresiva, se constató una menor colocalización de dichos factores con TAF1. En el modelo animal, se constató un déficit en la liberación de la RNAPII que afectaba especialmente a genes oligodendrogliales relacionados con la mielinización.
En conclusión, nuestro estudio revela un papel fundamental de TAF1 en la EM progresiva, que converge con la susceptibilidad genética para inducir una desregulación transcripcional en los tipos celulares del SNC como la oligodendroglí
Characterization of electrophysiological mechanisms underlying ventricular fibrillation through spatio-temporal and spectral analyses of electrical and optical cardiac potentials
No full textTesis Doctoral inédita leída en la Universidad Autónoma de Madrid, Facultad de Medicina, Departamento de Bioquímica. Fecha de Lectura: 16-06-2025Esta Tesis tiene embargado el acceso al texto completo hasta el 16-12-2026La fibrilación ventricular (FV) es la arritmia cardíaca más grave y la principal causa de parada cardíaca. En apenas segundos, la desorganizada actividad eléctrica de los ventrículos impide el bombeo efectivo de sangre, provocando isquemia global y, en última instancia, la muerte. A pesar de sus críticas consecuencias, la caracterización del sustrato arritmogénico que conduce a FV y de los mecanismos responsables de su mantenimiento temprano y su progresión permanecen poco comprendidos. Mediante el uso de novedosos modelos experimentales y de un modelo porcino con infarto de miocardio establecido, esta tesis tiene como objetivo mejorar el entendimiento del sustrato arritmogénico que desencadena la FV y posteriormente explorar los mecanismos electrofisiológicos subyacentes al mantenimiento de la FV.
Muchos episodios de FV se inician como degeneración de un episodio de taquicardia ventricular (TV), alguna de ellas monomórficas, en las que la conducción lenta en el istmo protegido es clave para su mantenimiento. Dada la complejidad de identificar este istmo protegido durante TV, durante la primera sección de esta tesis desarrollamos una estrategia de latido único durante estimulación ventricular programada usando catéteres multipolares globales para identificar regiones con alta heterogeneidad en los tiempos de activación que estén asociadas con el istmo protegido de la TV. Esta estrategia se basaba en la cuantificación de un novedoso índice de dispersión del tiempo de activación local. Las regiones con un alto índice de dispersión en el tiempo de activación co-localizaron con el sustrato relacionado con el mantenimiento de la TV. Además, algunos de estos episodios desencadenaron en FV.
A continuación, una vez iniciada la FV, en la segunda parte de esta tesis buscamos estudiar la dinámica fibrilatoria que se organiza durante los primeros segundos de FV (FV temprana). Mediante el análisis de registros endocárdicos en ambos ventrículos, demostramos que el mantenimiento temprano de la FV es independiente del sustrato relacionado con el infarto. Tanto los animales sanos (control) como en aquellos con infarto previo exhibieron consistentemente tasas de activación más altas en el ventrículo derecho, un patrón reproducible en episodios sucesivos de FV. Después, durante episodios de larga duración (>8 minutos), el gradiente de derecha a izquierda en tasa de activación se exacerbó y emergió un gradiente de epicardio a endocardio. De manera notable, estos gradientes precedieron la aparición más temprana de depresión eléctrica en el ventrículo izquierdo.
Las diferencias electrofisiológicas basales se descartaron como responsables de favorecer estos gradientes en tasas de activación. En su lugar, las diferencias en la respuesta metabólica a la isquemia global se identificaron como los factores críticos, con el ventrículo derecho demostrando una resistencia metabólica a la isquemia y la FV significativamente superior. Esto permite al ventrículo derecho activarse a una mayor tasa de activación que el ventrículo izquierdo durante durante FV de corta y larga duración.
Adicionalmente, se obtuvieron datos de pacientes con parada cardíaca y episodios de FV de larga duración. De forma similar, valores altos de tasa de activación medidos en los trazados de ECG de superficie durante FV demostraron ser un fuerte predictor de pronóstico neurológico favorable en pacientes con parada cardíaca extrahospitalaria debido a la FV. Todo ello corrobora la idea de que la tasa de activación durante FV actúa como un marcador directo, dinámico y robusto del estado del corazón, y como un marcador indirecto del potencial daño neurológico debido a la parada cardíac
Niveles de la actividad física, conducta sedentaria, antropometría y factores psicosociales de la población escolar paraguaya
No full textTesis Doctoral inédita leída en la Universidad Autónoma de Madrid, Facultad de Formación del Profesorado y Educación, Departamento de Educación Física, Deporte y Motricidad Humana. Fecha de Lectura: 27-06-2025Esta Tesis tiene embargado el acceso al texto completo hasta el 27-12-202
Review article: Classic bismuth quadruple therapy for helicobacter pylori infection—questions focused on clinical practice
No full textBackground: Classic bismuth quadruple therapy (BQT)—the combination of a proton pump inhibitor, bismuth, tetracycline, and metronidazole—is a standard regimen for treating Helicobacter pylori infection.
Aims: This review addresses practical questions regarding its current role in managing the infection.
Methods: A comprehensive bibliographic search was conducted to identify studies evaluating the efficacy, safety and optimiza-tion of BQT in different clinical contexts.
Results: BQT is a cornerstone of H. pylori eradication, combining agents with complementary mechanisms of action and main-taining high efficacy even in the presence of antibiotic resistance. Optimal acid suppression with a double proton pump inhibitor dose twice daily maximises therapeutic success. When tetracycline is unavailable, minocycline may serve as an alternative, whereas doxycycline is not recommended due to lower efficacy. Ten- day regimens achieve eradication rates comparable to 14- day courses, with similar or better tolerability. The three- in- one single- capsule formulation simplifies administration, enhances ad-herence, and maintains high efficacy (> 90%). BQT is endorsed as first- line therapy in most international guidelines, particularly in regions with clarithromycin resistance exceeding 15%, and remains the most reliable rescue option after failure of clarithro-mycin- or fluoroquinolone- based regimens. It is also the treatment of choice for patients with penicillin allergy. The regimen is generally well tolerated, with mostly mild, transient and gastrointestinal adverse events.
Conclusions: BQT remains the most effective, safe, and practical regimen for H. pylori eradication, ensuring high cure rates across diverse resistance patterns and clinical settings. Simplified formulations further improve convenience and adherence, reinforcing its role as a globally applicable therap
Micro-PIXE analysis of metal archaeological pieces from Torre Monreal necropolis
No full textIn 2019, the Torre Monreal necropolis was discovered in the urban centre of Tudela, in the north of Spain (Navarra). This Islamic necropolis has a great amount of graves with rich funeral's dowries, therefore it is of a high archaeological and historical interest. In this work, in order to determine the elemental concentration of different objects, mainly metallic pieces such as rings, earrings, necklaces, belt buckles, etc., have been analysed by Particle Induced X-ray Emission (PIXE) using the external microbeam line at CMAM (Centro de Microanálisis de Materiales in Madrid). Most of the metallic objects with a gilded look exhibit Au concentrations higher than 50 %, Ag and Hg levels close to 20 %, and low or trace concentrations of other elements such as Cu or Fe. The elemental concentration of these pieces has been compared with data from other Islamic piece from the Andalusian city, Qalat-Rabah (Calatrava la Vieja) collection which correspond to the same historic medieval period, 13th – 15th centuryThe authors would like to thank the technical staff of CMAM for operating the tandem ion-beam accelerator, and A. Redondo- Cubero for providing technical support on the experimental beam- line at the outset of the measurements. R. Rita Pestana grate- fully acknowledges the support of the Marie Sklodowska-Curie Fel- lowship Programme (MSCFP) from the IAEA and the COST Action ( CA17126 ) for their assistance during her periods at CMAM and for supporting her travel to CMA
Gender, honour and violence: instrumentalisation of women in the factional struggles in Navarre (1450-1508)
No full textEste trabajo tiene como objetivo aproximarse al estudio de la instrumentalización de las mujeres como una herramienta en
el contexto de las luchas de bandos entre agramonteses y beaumonteses (1450-1508). Para ello el artículo se centrará en una fuente
de una enorme riqueza, el memorial de agravios agramontés elaborado por los partidarios del rey Juan II en contra del Príncipe de
Viana. Este memorial, cuyo estudio íntegro abordamos aquí, se complementa con el estudio de otras fuentes del conflicto, así como
con un documento previo relativo al señorío de Escós. Estos ejemplos nos permitirán comprobar cómo la violencia contra las mujeres
y la pérdida de su honra ya sea mediante una agresión o mediante un matrimonio forzoso, formó parte, en diferentes momentos, de las
estrategias llevadas a cabo por algunos linajes para atacar a los enemigosThe aim of this paper is to consider the instrumentalisation of women as a tool in the framework of the factional conflicts
between the Agramonteses and the Beaumonteses (1450-1508). To this end, the article will focus on a source of enormous wealth,
the memorial of grievances of the Agramonteses drawn up by the supporters of King John II against the Prince of Viana. This memorial,
whose complete study will be addressed here, is complemented with the study of other sources for the conflict, as well as with a
previous document related to the lordship of Escós. These examples will allow us to see how violence against women and the loss of
their honour, either through aggression or forced marriage, formed part, at different times, of the strategies applied by some lineages
to attack their enemiesEste trabajo se enmarca en el proyecto de investigación «Más allá de la palabra.
Comunicación y discurso políticos en la Castilla Trastámara (1367-1504)», PID2021-125571NBI00,
financiado por MICIU/AEI /10.13039/501100011033 y por FEDER, UE. CORE. También en el
proyecto «Conflicto, rebelión y revuelta social en la Baja Edad Media. Las Coronas de Aragón y Castilla
(Siglos XIII-XV)», financiado por MICIU/AEI, PID2021-123286NB-C2
Understanding self-assembly across scales in BODIPY derivatives: from supramolecular aggregation in solution to optical-waveguiding crystalline materials
No full textMolecular self-assembly constitutes a useful tool to construct discrete and functional nanostructures with well-defined properties. Nevertheless, understanding supramolecular order in solution and its transmission to the solid state for the same scaffold remains challenging and the impact of this transition in the properties of the resulting supramolecular architectures is still underexplored, thus limiting the application of self-assembly in fields like organic electronics. Herein we explore the supramolecular aggregation process of a chiral BODIPY derivative in solution, its features in solid state, and its potential application as optical waveguide. In solution, this derivative follows a time-dependent self-assembly process, ultimately leading to aggregates of increasing dimensionality with propensity to precipitate, from which a certain degree of crystallinity can be inferred. The subsequent formation of single crystals confirms the preservation of key supramolecular features from solution to the solid state. Notably, the one-centimeter-long crystals obtained present active optical waveguiding behavior in the NIR with a remarkable optical loss coefficient, the first optical loss reported for BODIPY crystals. These results highlight the value of studying self-assembly across different scales and demonstrate the potential of BODIPY-based systems for the development of optical waveguides with remarkable performanceD. G.-R. acknowledges funding from MCIN/AEI and Next Generation EU through projects PID2020-116921GB-I00, TED2021-132602B-I00, PID2023-148548NB-I00 and SUPRAMAT Network (RED2024-153609-T). P. P. thanks the MICINN/AEI/10.13039/501100011033 and FEDER (project PID2023-152323NB-I00, PID2023-150022NB-I00, PID2021-128313OB-I00), SUPRAMAT Network (RED2024-153609-T), and Junta de Comunidades de Castilla-La Mancha (JCCM-FEDER) (project SBPLY/21/180501/000114) and by University of Castilla-La Mancha (project 2025-GRIN-38471). A. M. G. thanks the María Zambrano program under grant agreement UNI/551/2021 and the Ramón y Cajal program RYC2023-042600-I, and Junta de Comunidades de Castilla-La Mancha (JCCM-FEDER) (project SBPLY/21/180501/000088). J. S. V. is grateful to EU funding from MSCA-IEF actions (101150870-Lightheal). J. C. G. acknowledges the Spanish Ministry of Science and Innovation (PID2024-162801OB-I00) and the Regional Government of Madrid through project SYNMOLMA
Joint entropy search for multi-objective Bayesian optimization with constraints and multiple fidelities
No full textBayesian optimization (BO) methods can be used to solve efficiently problems with several objectives and constraints. Each objective and constraint is considered a black-box function that is expensive to evaluate, lacking a closed-form expression. BO methods use a model of each black-box to guide the search for the problem’s solution.
Specifically, they make intelligent decisions about where each black-box function should be evaluated next with the goal of finding the solution using a few evaluations only. Sometimes, however, the black-boxes may be evaluated at different fidelity levels. A lower fidelity is simply a cheap proxy for the corresponding black-box. These lower fidelities correlate with the actual black-boxes to optimize and can, therefore, be used to reduce the overall cost of solving the optimization problem. Here, we propose Multi-fidelity Joint Entropy Search for Multi-objective
Bayesian Optimization with Constraints (MF-JESMOC), a BO method for solving the aforementioned problems.
MF-JESMOC chooses the next point, and fidelity level at which to evaluate the black-boxes, as the combination that is expected to reduce the most the joint entropy of the Pareto set and the Pareto front, normalized by the fidelity’s evaluation cost. We use Deep Gaussian processes to model each black-box and the dependencies between fidelities. These are powerful probabilistic models that can learn the dependency structure among fidelity levels of each black-box. Several experiments show that MF-JESMOC outperforms other state-of-the-art methods for multi-objective BO with constraints and different fidelity levels in both synthetic and real-world problem
Hydrogen production from solid food waste by combined hydrothermal pretreatment and aqueous phase catalytic reforming
No full textProduction of sustainable hydrogen will play a key role as the main energy vector for the transition to a decarbonized economy. Of particular interest is the conversion of biomass into hydrogen, adding value to streams that would otherwise go unused. This study demonstrates efficient hydrogen production from orange juice extraction waste using hydrothermal pretreatment and aqueous-phase reforming. Key parameters_temperature, time, initial pH, and biomass concentration_were optimized using Ptbased catalysts (3−5 wt %) on carbon black with enhanced stability. The highest hydrogen yields were achieved under mild hydrothermal conditions (100−120 °C, 1 h), with ca. 1.0 g/L initial total organic carbon (TOCo) and pH 4. Increasing Pt loading not only improved the hydrogen yield but also increased catalyst deactivation. Under optimal conditions, 84% TOC conversion, 77% carbon conversion to gas, and 69 mmol H2/gTOCo were obtained, with hydrogen comprising 54% of the product gas. This integrated approach is promising for converting agroindustrial residues into clean hydrogenThis work was supported by the Ministry of Science and
Innovation (Recovery, Transformation and Resilience Plan,
project HYDROCIRCLE, TED2021-130054B-I00) and the
Community of Madrid (Research Network BIO3, P2018/
EMT-4344). M.T. thanks Ministry of Science and Innovation
(Recovery, Transformation and Resilience Plan, project
HYDROCIRCLE, TED2021-130054B-I00) for support. J.J.
thanks Ministry of Science, Innovation and University (the
project WASTEVALOR (PID2019-108445RB-I00)) and Ministry
of Science and Innovation (Recovery, Transformation and
Resilience Plan, project HYDROCIRCLE, TED2021-
130054B-I00) for suppor