Alberto Sols Biomedical Research Institute
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Reduced serially improved GTOs for molecular applications from H to Ar: Efficient diffuse functions in augmented basis sets
No full textA new family of Serially Improved Gaussian-type Orbitals for Molecular Applications (SIGMA) has been developed for hydrogen to argon and is available in both standard and augmented versions. This new basis set features a reduced number of primitive functions compared to the original SIGMA set and eliminates the constraint of shared exponents across different angular momentum shells. Its composition is similar to that of the
Dunning correlation-consistent basis sets. In the augmented version of this novel SIGMA family, termed reduced SIGMA, the diffuse
primitive functions are contracted with others bearing higher exponents, unlike in the corresponding Dunning sets, where they
are added to the set without contraction. This feature makes the reduced SIGMA basis sets less susceptible to linear dependencies in large and compact systems, which is reflected in better convergence of the minimization process and has a positive impact on energy optimization procedures. The improved performance of the augmented reduced SIGMA basis sets over Dunning and other commonly used basis sets is demonstrated through atomic and molecular calculations at various computational levels across a broad set of systemsFinancial support from the Ministerio de Ciencia, Innovación y Universidades (Spain), under the Plan Estatal de Investigación Científica, Técnica y de Innovación 2024−2027, ref. PID2024156686NB-I00, is gratefully acknowledge
Memoria de investigación 2021. Facultad de Medicina, UAM
No full textDifusión y análisis de la actividad investigadora realizada anualmente por los investigadores de los departamentos de la Facultad de Medicina. Recoge publicaciones, grupos de investigación, proyectos I+D+I y tesis doctorale
Violence as an instrument of domination by the nobility: the case of Urraca de Moscoso
No full textA pesar de la importancia que el uso de la violencia posee en una sociedad intrínsecamente
violenta como la medieval, la violencia en sí no ha sido objeto de
demasiados estudios. El objetivo del presente trabajo es analizar la cotidianeidad
de la violencia en el universo nobiliario de finales de la Edad Media a través de un
pleito conservado en el Archivo de la Chancillería que tiene como protagonista
a una mujer de la nobleza gallega, concretamente Urraca de Moscoso, viuda de
don Pedro Osorio, hijo del conde de Trastámara, como tutora y curadora de sus
hijos menores de edad, que a lo largo de las décadas de los ochenta y noventa del
siglo XV reclama los derechos, rentas y bienes solariegos de las Pueblas de Burón
y Navia, que se resisten alegando ser behetría de mar a mar desde que memoria de
omes non es en contrario. Dicho pleito nos permitirá analizar la violencia nobiliaria
desde una perspectiva doble, como sujeto y objeto de la misma, como víctima y
victimaria, pues esta mujer de la nobleza fue protagonista como consorte y «en
solitario» de diversas «malfetrías», demostrando así que la violencia impregna
en la Edad Media el sentir de hombres y mujeres, y, a su vez, fue también objeto
de «violencia linajística» en el seno de su propia familiaDespite its central role in medieval society, violence itself has received little
thorough scholarly attention. The aim of this study is to analyse the everyday
nature of violence in the world of the nobility in the late Middle Ages through
a lawsuit preserved in the Archivo de Chancillería (Archive of the Chancellery).
It features a Galician noblewoman, Urraca de Moscoso, widow of Pedro Osorio,
son of the Count of Trastámara, who acts as guardian and caretaker of her minor
children. Throughout the 1480s and 1490s, she claimed the rights, revenues and
ancestral properties of the villages of Puebla de Burón and Puebla de Navia, which
resisted by arguing that they were «behetría de mar a mar» (a domain with the
right to choose their own lord) since «memoria de omes non es en contrario»
(time immemorial). This lawsuit will allow us to analyse aristocratic violence
from a dual perspective, as both the subject and the object of violence, and as
both the victim and the perpetrator. This noblewoman was involved in various
«malfetrías» (violent abuses), both as a spouse and independently, demonstrating
that violence permeated the medieval mindset of both men and women, while
also being the target of ‘lineage violence’ within her own familyEste trabajo ha sido realizado en el marco del siguiente proyecto de investigación: «Más allá de la palabra.
Comunicación y discurso políticos en la Castilla Trastámara (1367-1504) / Beyond the word. Political Communication and
Discourse in Trastámara Castile (1367-1504) (PID2021-125571NB-I00), financiado por MCIN/AEI /10.13039/501100011033
/ FEDER, UE «Una manera de hacer Europa» y dirigido por José Antonio Jara Fuent
Defect identification in monolayer MoTe2 through tunneling tip-induced charging and theoretical analysis
No full textDefects in transition metal dichalcogenides (TMDs) are pivotal in modulating their electronic, optical, and catalytic properties. Investigating these defects is essential for advancing both fundamental knowledge and practical applications. In this study, we examine the individual defects in a monolayer of MoTe2 supported on graphene grown on an Ir(111) substrate by means of scanning tunneling microscopy (STM). Charging rings appear at distinct bias voltages, revealing ionization levels of doping centers located
either below or above the Fermi level. Although direct STM visualization of point defects was not achieved, the combination of scanning tunneling spectroscopy (STS) and density functional theory (DFT) calculations enabled the identification of the structural origins of the charge states. Our results demonstrate a powerful tool for uncovering the electronic and structural characteristics of atomic-scale defects in MoTe2, contributing to the understanding of defect-driven electronic properties in transition metal dichalcogenidesThe authors acknowledge support by the Spanish Ministry of Science and Innovation and by the “European Union” (Grant no. PID2021-123776NB-C21, PGC2018-096955-B-C44 and PID2021-128011NB-I00, PID2022-138288NB-C31, PID2022-138288NB-C33). IMDEA Nanociencia and IFIMAC acknowledge financial support from the Spanish Ministry of Science and Innovation ‘Severo Ochoa’ (Grant CEX2020-001039-S) and ‘María de Maeztu’ (Grant CEX2018-000805-M) Programme for Centres of Excellence in R&D, respectively. Financial support through the (MAD2D-CM)-MRR MATERIALES AVANZADOSIMDEA-NC and (MAD2D-CM)-MRR MATERIALES AVANZADOS-UAM is acknowledged. M.G. has received financial support through the “Ramón y Cajal” Fellowship program (RYC2020-029317-I) and “Ayudas para Incentivar la Consolidación Investigadora” (CNS2022-135175). M. P. wishes to acknowledge partial support by Centro Nazionale di Ricerca in High-Performance Computing, Big Data and Quantum Computing, PNRR 4 2 1.4, CI CN00000013, CUP H23C22000360005. We acknowledge allocation of computing time at the Mare Nostrum Supercomputer of the Red Española de Supercomputaciín (BSC-RES) and the Centro de Computación Científica of the Universidad Autónoma de Madrid (CCC-UAM
La inteligencia artificial en las prácticas del Grado en Derecho. Nueva metodología de aprendizaje versus fraude académico
No full textDesde hace unos años, parte del profesorado de las Facultades de Derecho venimos reflexionando y debatiendo acerca del acierto o no en seguir pidiendo al alumnado que haga trabajos y prácticas en casa, puesto que cada vez es más frecuente que acabemos corrigiendo al chat GPT. Cada día son más quienes apoyan el uso de la Inteligencia Artificial (en adelante, IA) en las aulas y, posiblemente, lo que tenemos que hacer las y los profesores es cambiar nuestra metodología para que la IA sea nuestra aliada.En cualquier caso, nos hemos propuesto que el estudiantado comprenda que el uso de la IA tiene que hacerse también conforme a unos criterios éticos y de honradez científica. Por eso, hemos llevado a cabo un ejercicio con nuestro alumnado para hacerles ver que si usan la IA para realizar actividades evaluables y no la citan como fuente de información, cometen un fraude académic
Game theoretical asymptotic mean value properties for non-homogeneous p-Laplace problems
No full textWe extend the classical mean value property for the Laplacian operator to address a nonlinear and non-homogeneous problem related to the p-Laplacian operator for p > 2. Specifically, we characterize viscosity solutions to the p-Laplace equation pu := ∇· (|∇u|p−2∇u) = f with a nontrivial right-hand side f , through novel asymptotic mean value formulas. While asymptotic mean value formulas for the homogeneous case ( f = 0) have been previously
established, leveraging the normalization Npu := |∇u|2−p pu = 0, which yields the 1- homogeneous normalized p-Laplacian, such normalization is not applicable when f = 0.
Furthermore, the mean value formulas introduced here motivate, for the first time in the literature, a game-theoretical approach for non-homogeneous p-Laplace equations. We also
analyze the existence, uniqueness, and convergence of the game values, which are solutions to a dynamic programming principle derived from the mean value propertyF. del Teso was partially supported by the Spanish Government through RYC2020-029589-I, PID2021- 127105NB-I00, CNS2024-154515, and CEX2019-000904-S funded by the MICIN/AEI. J. D. Rossi was partially supported by CONICET PIP GI No 11220150100036CO (Argentina), PICT-03183 (Argentina)
and UBACyT 20020160100155BA (Argentina
Topology and cell identity: a multiscale approach to spatial coding in CA1
No full textTesis Doctoral inédita leída en la Universidad Autónoma de Madrid, Facultad de Ciencias, Departamento de Física de la Materia Condensada. Fecha de Lectura: 26-09-2025Comprender cómo el cerebro representa y organiza la información sigue siendo uno de los grandes retos de la neurociencia. En los últimos años, los estudios poblacionales, que analizan la actividad simultánea de cientos de neuronas, han contribuido significativamente al entendimiento de las representaciones cognitivas. No obstante, al centrarse en patrones colectivos, estos enfoques suelen pasar por alto la diversidad genética y funcional de los tipos celulares, especialmente en regiones como CA1 del hipocampo, que desempeña un papel clave en la memoria espacial y episódica. En esta región, las neuronas piramidales profundas y superficiales muestran diferencias marcadas en fisiología, conectividad y proyecciones, lo que convierte a CA1 en un modelo ideal para investigar cómo la heterogeneidad celular contribuye a los códigos poblacionales y qué se pierde al ignorar estas distinciones.
El objetivo general de esta tesis es desarrollar herramientas computacionales y aplicar enfoques experimentales que permitan entender cómo los circuitos de CA1 codifican el espacio, con especial atención a la segregación funcional entre poblaciones neuronales genéticamente definidas. Se busca así tender un puente entre los estudios centrados en la célula individual y aquellos enfocados en la dinámica poblacional, para avanzar en la comprensión de la representación cerebral de la información.
En la primera parte del trabajo, se introduce el Índice de Estructura (Structure Index, SI), una herramienta matemática basada en teoría de grafos que cuantifica la organización de variables dentro de distribuciones de datos en espacios de alta dimensión. Este índice evalúa la similitud local y global entre puntos vecinos, sin necesidad de reducir la dimensionalidad, lo que permite detectar estructuras subyacentes complejas en representaciones categóricas, escalares o vectoriales. Se valida su eficacia con datos sintéticos y registros experimentales del sistema de dirección de la cabeza, mostrando que el SI puede identificar de forma fiable estructuras coherentes y diferenciar entre representaciones ordenadas o aleatorias.
La segunda parte aplica estas herramientas al estudio de la codificación espacial en CA1. Mediante imágenes de calcio in vivo en ratones durante una tarea de alternancia forzada, se demuestra que las capas profundas y superficiales de células piramidales forman un manifold de baja dimensión, en forma de anillo, pero con geometrías distintas. Las neuronas superficiales codifican un marco espacial global, mientras que las profundas responden más a señales locales, evidenciando una división funcional estructurada entre ambas capas.
En la tercera parte, se emplean registros de dos colores y manipulación quimiogenética para demostrar que estas representaciones no solo coexisten en CA1, sino que también operan de forma relativamente independiente. Estos resultados cuestionan la idea de un código espacial unificado en CA1 y apoyan la existencia de marcos de referencia múltiples que se adaptan dinámicamente al contexto y a las demandas conductuales.
En conjunto, este trabajo no solo aporta nuevos métodos para el análisis de datos neuronales complejos, sino que también ofrece una visión más rica y matizada de cómo el cerebro representa el espacio. La combinación de enfoques geométricos y topológicos con el estudio de tipos celulares específicos permite revelar estructuras ocultas en los códigos poblacionales, ampliando las herramientas conceptuales y experimentales para estudiar la organización funcional del cerebroThis work was supported by ”la Caixa” Foundation (ID 100010434) under an INPhINIT Retaining Fellowship, with grant number CF/BQ/DR22/1195002
Corrigendum to “Model organisms for investigating the functional involvement of NRF2 in non-communicable diseases” [Redox Biol. 79 (2025) 103464]
No full textArtículo escrito por un elevado número de autores, sólo se referencian el que aparece en primer lugar, el nombre del grupo de colaboración, si lo hubiere, y los autores pertenecientes a la UAMEl texto del artículo original se encuentra disponible en https://hdl.handle.net/10486/72802
No Mate, No Problem: Molecular Mechanisms Involved in Parthenogenesis in the Cosmopolitan Earthworm Aporrectodea trapezoides (Annelida, Clitellata)
No full textApproximately, 40% of earthworm species can reproduce by parthenogenesis. This is the case for the cosmopolitan species, Aporrectodea trapezoides, although sexual forms have been described sporadically. We analyse the genotypes and microbiomes of 30 individuals from four localities where both forms appear in order to understand the evolutionary mechanisms related to parthenogenesis. In all sites, heterozygosity values were approximately 30% higher in parthenogenetic individuals. However, we detected a stronger genomic structuring due to reproduction than to the geographical setting only in the Algerian population, underpinned by 195 loci that were related to gametogenesis, symbiont-like processes, and nitrate reduction. Similarly, statistical differences in the abundance of ZOTUs were only found between the Algerian sexual and parthenogenetic earthworms, with 754 ZOTUs that included the genus Romboutsia, which is involved in the production of nitric oxide, which enhances sperm motility. In summary, significant genomic and microbiome differences were found only between sexual and parthenogenetic lineages in a single locality. We hypothesise that obligate parthenogenesis evolved early, leaving traces at the genomic and microbiome levels in the Algerian parthenogens that were the earliest splitting lineage. Such obligate parthenogenesis was lost secondarily and individuals in the Iberian sites were facultative parthenogens, with the potential to copulate and therefore erase the genomic and microbial traces of obligate parthenogenesis. Our results indicate a hybrid origin of parthenogenesis in A. trapezoides and shed light on the complex interplay between genomic, microbiome, and reproductive mechanisms in A. trapezoidesI.S. was funded by the European Union-Next GenerationEU program through a Margarita Salas fellowship. M.T. was supported by a JdC (Juan de la Cierva Formación, 2020) personal grant (FJC2020-043677-I), MSCA Postdoctoral Fellowship (HORIZON-MSCA.2022-PF-01, Project 101105716). J.S. and A.P. were funded by the Spanish Ministry of Science, Innovation, and Universities through a predoctoral fellowship (JSPRE2020-095330 and PRE2022-103770, respectively). M.N. was supported by Grant PID2021-122243NB-I00 funded by MCIN/AEI/10.13039/501100011033 and by “ERDF A way of making Europe”. P.Á.C. was funded by MNCIN/AEI/10.13039/501100011033 and European Union “Next GenerationEU/PRTR” (CNS2023-145193). S.T. received funding from the grant PID2020-117115GA-I00 funded by MCIN/AEI/10.13039/501100011033 and from the grant CNS2023-144572 and by the Ramón y Cajal grant RYC2021-03152-I, funded by the MCIN/AEI/10.13039/501100011033 and the European Union «NextGenerationEU»/PRTR». A.R. acknowledges funding from three grants from the Spanish Ministry of Science and Innovation (RYC2018-024247-I, PID2019-105769GB-I00, and CNS2023-144571) in the framework of MCIN/AEI/10.13039/50110001103 and EI “FSE invierte en tu futuro” and an intramural grant from CSIC (PIE-202030E006). R.F. acknowledges support from the following sources of funding: the European Research Council (grant agreement no. 948281), the OSCARS project (funding from the European Commission's Horizon Europe Research and Innovation programme under grant agreement no. 101129751), grant CNS2023-144624 funded by MICIU/AEI/10.13039/501100011033, and by the “European Union NextGenerationEU/PRTR” and the Secretaria d'Universitats i Recerca del Departament d'Economia i Coneixement de la Generalitat de Catalunya (AGAUR 2021-SGR00420
Tracing childhood in Iberian Culture. What can we learn through Archaeology?
No full textEste artículo ofrece una revisión sobre la Arqueología de la Infancia en la Cultura
Ibérica, tomando como punto de partida el artículo publicado por Teresa Chapa en 2003. En
primer lugar, se analiza el texto mediante métodos de Humanidades Digitales. A continuación,
se presentan los avances más significativos en el estudio de la infancia en contextos funerarios,
domésticos y de santuarios, a través del registro material. Por último, se sugieren futuras líneas
de investigación, centrándose en estudios bioantropológicos y en el análisis de las actividades
de mantenimientoThis article provides a review of the Archaeology of Childhood in Iberian Culture,
based on Teresa Chapa’s 2003 paper. Firstly, the text is analysed using methods from the Digital
Humanities. Secondly, the main advances in the study of childhood in funerary, domestic, and
sanctuary contexts are discussed through the material record. Finally, future research avenues
are proposed, focusing on bioanthropological studies and the analysis of maintenance activitiesEste artículo se ha realizado dentro del proyecto Reinventando los museos de arqueología y antropología. La
visibilización de los grupos marginados por la historia. Construyendo una sociedad igualitaria, financiado por el
Ministerio español de Ciencia e Innovación, ref. PID2020-116732RB-l0