Repositorio Digital - Academia Colombiana de Ciencias Exactas, Fisicas y Naturales
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Suplemento Conexión de Biología y Química vía Síntesis Orgánica dirigida a la Diversidad molecular
El enorme progreso en el entendimiento de los sistemas biológicos y del funcionamiento de los fármacos dentro del cuerpo humano se debe a la unión de la química y la biología y a la aplicación inteligente de los principios y técnicas de la química orgánica. Ésta juega el papel de iniciador en el descubrimiento biológico impulsando el diseño y desarrollo de nuevos fármacos. Utilizando tácticas sintéticas modernas de la química orgánica, la síntesis dirigida a la diversidad permite preparar diversas moléculas (fármacos, agentes biológicos) que son valiosos modelos para el estudio de las complejas interacciones biológicas de los organismos vivos. Los resultados y logros del LQOBio se discuten en esta revisión prestando atención al desarrollo de algunos aspectos de la síntesis verde y la biología química que ha venido haciendo el LQOBio estos últimos años.The enormous progress in the understanding of biological systems and the functioning of the drugs within the human body is due to the union of chemistry and biology and the intelligent application of the principles and techniques of organic chemistry. This plays the role of initiator in biological discovery driving the design and development of
new drugs. Using tactics of modern synthetic organic chemistry, diversity-directed synthesis allows preparation of various molecules (drugs, biological agents) that are valuable models for the study of complex biological interactions of living organisms. The results and achievements of the LQOBio are discussed in this review with attention to the development of some aspects of green synthesis and chemical biology that has been doing the LQOBio recent years
Optimización de la extracción de antioxidantes de Salvia officinalis L. con CO2 supercrítico
Se aplicó un diseño factorial fraccionado 27-2 para seleccionar las variables con mayor efecto sobre la capacidad antioxidante, el contenido de fenoles y el rendimiento de la extracción utilizando CO2 supercrítico como solvente sobre hojas y tallos de Salvia officinalis L. El tiempo de extracción, el flujo de CO2, la presión de la cámara de extracción y la temperatura de separación se modificaron según el procedimiento simplex para hallar empíricamente las condiciones que produjeran extractos de salvia con el valor más alto de la combinación lineal de rendimiento de extracción, capacidad antioxidante y contenido total de fenoles.A 27-2 fractional factorial design was used to select the variables with the greatest effect on the antioxidant capacity, the total phenolic content and the extraction yield using supercritical carbon dioxide as a solvent on Salvia officinalis L. leaves and stems. The extraction time, the CO2 flow, the extraction chamber pressure and the collector temperature were modified according to the simplex method in order to empirically find the conditions resulting in salvia extracts with the highest value of the linear combination of extraction yield, antioxidant capacity and total phenolic content
New records of Macrobrachium digueti (Bouvier, 1895)for Colombia (Crustacea: Decapoda: Palaemonidae)
New records of Macrobrachium digueti (Bouvier, 1895) from Acandí, corregimiento Sapzurro and inspección Capurganá, department of Chocó, Colombia, are presented. The diagnosis, description and illustrations of this species, based on the morphology of the rostrum, the telson and the second pair of pereopods, are included. The geographical distribution of M. digueti is analyzed taking into account that the new records extend the distribution from the Pacific to the Caribbean region.Se presentan nuevos registros de Macrobrachium digueti (Bouvier, 1895) de Acandí, corregimiento de Sapzurro e inspección de Capurganá, departamento de Chocó, Colombia. Se incluye la diagnosis, la descripción e ilustraciones de la especie con base en la morfología del rostro, el telson y el segundo par de pereopodos. Se analiza la distribución geográfica de M. digueti, teniendo en cuenta que los nuevos registros extienden su distribución desde la región Pacífica a la región Caribe
Remoción de atenuación y dispersión en registros preapilados mediante filtro inverso con factor de calidad estimado en espectro instantáneo
La atenuación diferencial de los armónicos de mayor frecuencia y la dispersión asociada a las distintas velocidades de fase deterioran la imagen sísmica del subsuelo y dificultan su interpretación e inversión. Para remover la atenuación y la dispersión de los registros sísmicos, y así mejorar la imagen del subsuelo, es necesario usar filtros inversos basados en modelos que incluyen el factor de calidad Q, por lo que la estimación de su valor requiere un método sólido que suministre valores confiables. La descomposición adaptativa en tiempo y frecuencia (Matching Pursuit Decomposition, MPD) genera un espectro de frecuencia para cada muestra de la traza (instantánea), donde se estiman valores de Q confiables, sin los inconvenientes propios de los análisis espectrales con ventanas basados en las transformadas de Fourier y de Gabor. Dado que el componente de fase del filtro es intrínsecamente estable, la compensación se aplica solo a la amplitud. Se desarrollaron algoritmos en MATLAB, los cuales implementan la técnica MPD, así como un filtro inverso estable para remover los efectos de la atenuación y la dispersión de los registros sísmicos preapilados y postapilados. La estimación del valor de Q en sismogramas sintéticos y su uso con el filtro inverso permitieron corregir la distorsión de la ondícula mediante la recuperación de los espectros de amplitud y de fase. La metodología se aplicó en registros preapilados de una línea sísmica marina PSTM, incrementando la relación entre señal y ruido y mejorando ostensiblemente la resolución temporal.Physical phenomena such as attenuation of high frequency components and velocity dispersion deteriorate seismic images hindering their interpretation and inversion. Removing the attenuation and dispersion of seismic records involves the use of inverse filters based on models that include the quality factor, Q, therefore, a robust method should be used to estimate Q and provide reliable values to improve the image of the subsurface value. The matching pursuit decomposition (MPD) generates a frequency spectrum for each sample of the trace (instantaneous), where reliable Q values are estimated without the inconveniences of spectral analysis with windows based on the Fourier and Gabor transforms. Since the phase component of the filter is inherently stable, compensation applies only to the amplitude. MATLAB algorithms that implement both the MPD and the stable inverse filter for removing the effects of attenuation and dispersion on pre and post-stack data were developed. The Q value estimated on synthetic seismograms and used with an inverse filter allowed correcting the distortion of the wavelet by retrieving the amplitude and phase spectra. The methodology was applied to a pre-stacked marine seismic line PSTM increasing the signal-noise ratio and significantly improving the temporal resolution records
Obtención de escopolamina en biorreactor a partir de cultivos de raíces de Brugmansia candida
Teniendo en cuenta la importancia farmacológica de los alcaloides del tropano y la posibilidad de producirlos a partir de cultivos de tejidos de vegetales de especies como la Brugmansia candida, en este trabajo se evaluó la producción de uno de estos alcaloides a partir del cultivo de raíces adventicias en biorreactor. Para ello se desarrolló un sistema de reacción compuesto por dos unidades, una de crecimiento y otra de acondicionamiento del medio, y se evaluó la producción de biomasa y de este alcaloide luego de 21 días de cultivo, obteniendo como resultado 9,5 mg de escopolamina/g de raíces secas, resultado mayor al obtenido anteriormente en cultivos de raíces de este tipo en matraces de Erlenmeyer (6 mg/g de raíces secas), e incluso superior a lo reportado para cultivos de raíces transformadas de B. candida mediante biorreactor. Respecto a la biomasa, se obtuvo un índice de crecimiento de 1,58, similar al de 1,4 obtenido en matraces de Erlenmeyer, lo que sugiere que el cambio de escala no afectó de manera negativa la producción de biomasa.Given the pharmacological importance of tropane alkaloids and the possibilityof producing them from plant tissue cultures of plant species such as Brugmansia candida, the main goal of the present paper was to evaluate the alkaloid production of root cultures developed ina bioreactor. We set up a bioreaction system consisting of two units, one forbiomass growth and the other one for liquid medium conditioning. After 21 days of culture, biomass and scopolamine production were evaluated, resulting in the extraction of 9.5 mg of scopolamine/g of dry roots. This value was higher than the one obtained in a previous culture in Erlenmeyer flasks (6mg/g of dry roots) and higher than the scopolamine extracted from hairy roots cultures using a bioreactor reported in other studies. Regarding biomass, the growth index (GI) was 1.58, similar to the GI obtained with cultures in Erlenmeyer flasks (GI 1.4), which suggests that scaling up the process did not affect biomass productionnegatively
Las especies del género Axonopus (Poaceae: Panicoideae: Paspaleae) de Colombia
Axonopus es un género nativo del continente americano del cual se conocen unas 71 especies, principalmente concentradas en el norte de Sudamérica, con algunos representantes aparentemente introducidos en el Viejo Mundo. Se presenta el estudio morfológico y taxonómico de las especies colombianas, sus sinónimos, su descripción e iconografía, su distribución geográfica y ecológica, sus nombres vernáculos, sus usos, y se comentan algunas particularidades morfológicas, así como las relaciones morfológicas de las especies. Se discuten las afinidades morfológicas y filogenéticas con Digitaria, Mesosetum, Paspalum, Spheneria y Streptostachys. Se propone un nuevo nombre para Axonopus sect. Cabrera. Dos binomios se reducen a la sinonimia Axonopus piccae (= Axonopus scoparius) y Axonopus poiophyllus (= Axonopus compressus). Se destaca que el ejemplar J. Cuatrecasas 3882 (US-1797918) corresponde claramente al holotipo de Axonopus cuatrecasasii, mientras que J. Cuatrecasas 3882 (US-2780372) corresponde, sin duda alguna, a un ejemplar más de Axonopus purpusii. Cuatro especies se excluyen de la flora colombiana (Axonopus laxiflorus, Axonopus longispicus, Axonopus pubivaginatus y Axonopus senescens). Así, Axonopus está representado en Colombia por 19 especies, de las cuales tres son endémicas (Axonopus orinocensis, Axonopus morronei y Axonopus zuloagae).Axonopus is an American genus with about 71 species, mainly distributed in northern South America, with some species apparently introduced to the Old World. A morphological and taxonomic treatment of the species in Colombia is provided, including synonyms, descriptions, illustrations, ecological and geographic distribution, common names, uses, comments on particular morphological features, and morphological relationships of the species. The morphological and phylogenetic relationships with Digitaria, Mesosetum, Paspalum, Spheneria, and Streptostachys are discussed. A new name for Axonopus sect. Cabrera is proposed. Two names are synonymized: Axonopus piccae (= Axonopus scoparius) and Axonopus poiophyllus (= Axonopus compressus). The identity of the vouchers J. Cuatrecasas 3882 (US-1797918) and J. Cuatrecasas 3882 (US-2780372) is discussed. Four species are excluded from the Colombian flora (Axonopus laxiflorus, Axonopus longispicus, Axonopus pubivaginatus, and Axonopus senescens). Thus, a total of 19 species of this genus are currently known in Colombia, of which three are endemic (Axonopus orinocensis, Axonopus morronei, and Axonopus zuloagae)
Propagación de especies nativas con potencial para restauración ecológica en la microcuenca río La Vega, Tunja-Boyacá
El objetivo de este trabajo fue identificar y propagar las especies nativas más importantes en restauración ecológica de la microcuenca del río La Vega. Para identificar estas especies se usó una matriz de criterios con la que fueron seleccionadas: Xylosma spiculifera, Croton purdiei, Baccharis macrantha, Verbesina centroboyacana, Duranta mutisii Lupinus bogotensis y Dodonaea viscosa, y con ellas probamos dos técnicas de propagación. La técnica de propagación sexual (semillas), donde se implementó un diseño en bloques completos al azar con dos tratamientos: control y T1: enfriamiento a 5°C por 15 días y la técnica por rescate de plántulas donde se utilizaron plántulas entre 20-40 cm de altura y se aplicaron tres tratamientos: T0: control sin poda, T1: con poda de raíces y T2: con poda foliar. En general, la propagación por rescate de plántulas con poda fue más efectiva que la propagación por semillas para las especies estudiadas.The main objetive of this paper was to identify and propagate the most important native species for ecological restoration in the basin of La Vega River. Species were identified and selected by using a criteria matrix through which we obtained the following species: Xylosma spiculifera, Croton purdiei, Baccharis macrantha, Verbesina centroboyacana, Duranta mutisii, Lupinus bogotensis and Dodonaea viscosa on which two techniques of propagation were assayed. The first, a sexual propagation technique (seeds) where we used a random blocks design with two treatments: seeds cooled at 5 °C for 15 days, and the second, rescue of seedlings employing 20 to 40-cm high seedlings and three treatments: T0, seedling without pruning; T1, seedlings with root pruning, and T2, seedlings with leave pruning. In general, propagation through seedling rescue with pruning proved to be more effective than the sexual propagation technique