Repositorio Digital - Academia Colombiana de Ciencias Exactas, Fisicas y Naturales
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    Dos hombres de ciencia

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    Evolutionary history of the group formerly known as protists using a phylogenomics approach

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    La falta de organización en linajes discretos en la filogenia y la taxonomía del grupo anteriormente llamado protistas ha retrasado la comprensión de la historia evolutiva del grupo y la comparación de rasgos entre los miembros del mismo. En este estudio usamos una aproximación filogenómica para plantear hipótesis filogenéticas del grupo mencionado. Usamos una estrategia basada en el agrupamiento automático de ortólogos (OrthoMCL) para recuperar 72 grupos de ortólogos de 73 especies. Un árbol obtenido con el método de maxima verosimilitud fue estimado a partir de una supermatriz de datos. De manera general obtuvimos inferencias filogenéticas consistentes con publicaciones previas pero se observaron algunos patrones de ramificación inesperados con valores bajos de soporte. A pesar de la gran cantidad de genes de los grupos Opisthokonta, este clado aparece polifilético. No pudimos demostrar la monofilia de Excavata, muy probablemente debido a artefactos de atracción de ramas largas. Un segundo conjunto de datos fue construido luego de eliminar los sitios de rápida evolución/saturados. El test de Shimodaira-Hasegawa se calculó con el fin de verificar si nuestros datos e inferencias filogenéticas controvertían patrones de ramificación reportados previamente. Los resultados de los tests sugieren que las topologías propuestas en estudios previos no son significativamente mejores que las topologías propuestas en este estudio. Nuevas relaciones fueron encontradas dentro de los Opisthokonta, para dos especies, Thecamonas trahens y Capsaspora owczarzaki. Adicionalmente, algunas posiciones filogenéticas controversiales se encontraron para varios grupos eucariotas con nuestra aproximación filogenómica. En el estudio se discuten las relaciones de los grupos Alveolata y Stramenopila, siendo este ultimo grupo de especial interés para nuestro grupo de investigación.The lack of organisation of monophyletic lineages in the phylogeny and taxonomy of the group formerly known as protists has precluded the understanding of the group’s evolutionary history and trait comparison among members of the group. We used a phylogenomic approach to establish phylogenetic hypotheses of this group of organisms. We used an automatic orthologous clustering (OrthoMCL)-based strategy to recover 72 clusters of orthologues from 73 eukaryotic species. A maximum likelihood tree was inferred from the supermatrix. Overall, we obtained consistent inferences with previous published ones, but some unexpected phylogenetic relationships were poorly supported. Despite the large quantity of genes from the Opisthokonta groups, this clade was recovered as polyphyletic. We failed to recover a monophyletic Excavata group, most likely because of longbranch attraction artefacts. A second dataset was constructed after removing the fast-evolving/saturated sites, and a Shimodaira-Hasegawa test was performed to verify whether our data allowed us to reject relationships in previous hypotheses. The results of these tests suggested that the competing tree topologies were not significantly better than our recovered topologies. Novel relationships were shown inside the Opisthokonta, for two species, Thecamonas trahens and Capsaspora owczarzaki. Additionally, some controversial phylogenetic positions among several eukaryotic groups were found. We discuss the relative positions of the Alveolata and Stramenopila groups, the latter being of special interest in our research group

    Sobre la dinámica de una partícula en rotación usando el concepto de invariancia gauge

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    Se hace una descripción del movimiento de una partícula en rotación haciendo uso del plano complejo y utilizando procedimientos similares al de la construcción de una teoría gauge local. El análisis permite describir el comportamiento de la partícula partiendo de la exigencia de la invariancia gauge de la ecuación de posición. Invariancia que al ser exigida conduce a la introducción de un parámetro compensatorio que se interpreta como la velocidad angular de la partícula. A partir del análisis se obtienen los efectos dinámicos que determinan su movimiento, los cuales son equivalentes a los obtenidos desde una descripción hecha respecto a un sistema de referencia en rotación haciendo uso de coordenadas polares. Este análisis presenta una manera novedosa de deducir las ecuaciones dinámicas de una partícula en rotación, lo cual representa un aporte original y pedagógico para la enseñanza de la física.A description is performed on the dynamics of a particle in rotational motion, using a complex plane and similar procedures to those implemented in the construction of a local gauge theory. The analysis allows the description of the behavior of the particle, by requiring gauge invariance in its equation of position. Requiring gauge invariance leads to the addition of an extra term in the equation, which is interpreted as the angular velocity of the particle. From this analysis, the dynamical effects that determine the motion of the particle are obtained, which are equivalent to those obtained by describing the rotating system using polar coordinates. This kind of analysis is important since it presents a new method to obtain the equations that describe the dynamics of a particle in rotational motion

    Heterogeneidad de las células B de memoria IgM humanas

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    El origen, la función y el repertorio de las células B de memoria IgM humanas (caracterizadas por ser positivas para CD27 IgM e IgD) son controvertidos, y se ha propuesto que esta población es heterogénea. Aunque algunas veces contradictorias, las evidencias actuales apuntan a la existencia de por lo menos dos subpoblaciones de dichas células en sangre: por un lado, células B circulantes de la zona marginal del bazo, con algunas características similares a las células innatas y probablemente responsables de las respuestas de activación independiente de los linfocitos T, que protegen contra bacterias encapsuladas como Streptococcus sp, y, por otro lado, células B con indicios de haber pasado por centros germinales que se asemejan a las células B de la respuesta adaptativa, y que serían un reservorio de células B de larga vida a partir del cual se reconstituirían continuamente las células B de memoria conmutadas. Aunque se ha propuesto que la expresión diferencial de IgM e IgD en las células B de memoria IgM serviría para distinguir estas dos subpoblaciones de células B, se requieren más estudios fenotípicos y funcionales para sustentar esta clasificación.The origin, function and repertoire of human IgM memory B cells (IgM mBc, characterized by the expression of CD27+ IgM+ IgD+) are controversial, and it has been proposed that this population is heterogeneous. Although contradictory in some cases, available evidence suggests that at least two subpopulations of IgM mBc circulate in blood. On the one hand, circulating B cells from the marginal zone of the spleen with innate-like characteristics, probably responsible for protective responses against encapsulated bacteria like Streptococcus sp. On the other hand, B cells with markers that suggest they have undergone transit in germinal centers, typical of adaptive immunity, and that may represent a reservoir of long-lived mBc capable of reconstituting switched mBc. It has been proposed that the differential expression of IgM and IgD on circulating IgM mBc may be useful to distinguish these subpopulations, but more phenotypic and functional studies are needed for this purpose

    Flora del Oriente Antioqueño: Biodiversidad, ecología y estrategias de conservación

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    266 p.; il., fotografías;Cuando se habla de flora de una región o un país, llega a la mente un listado interminable e incomprensible de nombres de especies de plantas, escritos en un lenguaje desconocido. A la par, estos escritos van acompañados de dibujos de estructuras de hojas, flores y frutos cuyas formas no se reconocen en la naturaleza. Se admira este tipo de libros, sus bellas ilustraciones; nos imaginamos lo misteriosa que es la naturaleza y admiramos con respeto a quienes han dedicado mucho años de sus vidas a su estudio, convencidos de que estos conocimientos algún día serán reconocidos para bien de la humanidad. La presente obra se aleja de este modelo; lleva comprender que en la actualidad la tendencia mundial es la de entender la ecología de los ecosistemas, su funcionamiento, su fragilidad, la necesidad de conservarlos dentro de un concepto de economía ambiental y de los servicios ecosistémicos que prestan a la comunidad. El texto ayuda a comprender que los diferentes ecosistemas, desde los páramos hasta los bosques tropicales, son el producto de un proceso evolutivo de miles de años y que en solo poco tiempo el hombre los ha destruido, y ha dejado el suelo a merced de la erosión y de la pérdida de los recursos hídricos, alterando irreversiblemente el ciclo hidrológico. Esta obra presenta valiosas consideraciones sobre algunos ecosistemas del Oriente Antioqueño, dentro de los cuales se nombran el páramo de Sonsón, el estado de conservación de una isla en el embalse Peñol-Guatapé, el bosque pluvial en el municipio de Cocorná, el bosque húmedo tropical de San Luis y la categorización y análisis de la distribución de especies introducidas e invasoras en el Altiplano del Oriente Antioqueño. También se dedica un capítulo a las estrategias de conservación, recuperación y servicios ecosistémicos dentro de un concepto de programa integral de manejo. Los impactos de la deforestación, la minería y el cambio climático son considerados como amenazas para la diversidad y los servicios ecosistémicos en el Oriente Antioqueño. Se consideran los corredores biológicos como estrategia para la restauración de los bosques andinos. Finalmente, se dedica un capítulo a la dinámica de los bosques mediante la estimación de la pérdida de biomasa y carbono, debido a la deforestación y degradación de los bosques. Prólogo 10 Este es un novedoso planteamiento cuyo significado e importancia no lo entiende el común de la gente. Es de destacar, además, que no existen suficientes estudios que muestren los resultados de esta exploración en un contexto regional. Indiscutiblemente, el factor económico es uno de los propulsores del desarrollo en diferentes niveles, pero por lo general este entra en conflicto con los programas de conservación y manejo sostenible de la biodiversidad. Además, son recientes los esfuerzos por vincular economía y biodiversidad, para de esta manera divulgar el potencial de los ecosistemas y sus servicios. Por su contenido y orientación, esta obra ofrece valiosos elementos que servirán de base para programas de uso y conservación de la flora, no solo del Oriente Antioqueño, sino también de las zonas similares ubicadas dentro de las regiones del trópico americano. Gabriel Roldán Pérez1 e

    Sistemas morfogénicos contrastados en el norte de la Cordillera Central Colombiana

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    Fondo Michel Hermelin Arbaux, serie Escritos, MHA-101, f.40-49. Sala de Patrimonio Documental, Biblioteca LEV, Universidad EAFI

    Fenología y brotación vegetativa de una nueva especie de Vriesea (Bromeliaceae) de Colombia en condiciones ex situ

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    El Jardín Botánico de Bogotá (JBB) conserva en condiciones ex situ una nueva especie de bromelia epífita de Colombia del género Vriesea, la cual fue parcialmente descrita en el 2001 por Betancur en una publicación local; fue hallada en el municipio de Suachoque, Cundinamarca, pero hasta ahora no ha sido determinada ni publicada. La especie tiene roseta y, a la vez, es de tipo atmosférica estricta. En este estudio se describe el hábitat del área donde se la encontró, los forófitos en los que se sostenía y el rango de altura en donde crecía. También se describe el comportamiento de la fenología reproductiva ex situ durante 30 semanas, los tiempos de floración, de 1,8 semanas en promedio, la polinización ex situ natural, el tiempo de los frutos en desarrollo, de 3,5 semanas en promedio, y la permanencia de los frutos evidentes en el transcurso de 20,9 semanas. La maduración y la liberación de las semillas se produjeron entre las semanas 17 y 28 después del inicio de la floración. Se determinó, asimismo, la brotación vegetativa ex situ 12 meses después del inicio de la floración, con 1,9 brotes en promedio (0 a 3 por planta). El ciclo de vida de la especie por propagación vegetativa debe ser superior a 16 meses y se espera recolectar las semillas para evaluarlo también por la vía de la propagación sexual.The Botanical Garden of Bogotá (JBB) has conserved in ex situ conditions a new species of epiphytic bromeliad of the genus Vriesea, partially described in 2001 by Betancur in a local publication. It was found in the municipality of Subachoque, Cundinamarca, but it had not been determined or published until now. The species exhibits a rosette and, simultaneously, it is strictly atmospheric. In the present study we describe the habitat where it was found, the phorophytes where it grew and its height range on them. We recorded the reproductive phenology behavior ex situ for 30 weeks, as well as the flowering times for an average of 1.8 weeks, the natural ex situ pollination, as well as the average fruit growing time for 3.5 weeks and the evident permanence of fruits for 20.9 weeks. Seed maturation and release occured 17 to 28 weeks after flowering initiation. We also determined the ex situ vegetative growth 12 months after flowering initiation, with 1.9 buds on average (0 to 3 per plant). The species life cycle by vegetative propagation was over 16 months. We expect to collect seeds to evaluate the life cycle also via sexual propagation

    Los diversos efectos de las helmintiasis sobre la inflamación alérgica

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    Las helmintiasis y las alergias son muy frecuentes en países del trópico, donde establecen múltiples interacciones. Los mecanismos de defensa contra estos parásitos son bastante parecidos a la respuesta inmunológica de tipo alérgico, principalmente porque ambos procesos tienen una importante participación de los anticuerpos tipo inmunoglobulina E (IgE). Pero también hay diferencias importantes, siendo una de ellas el grado de inmunomodulación, el cual es débil en la respuesta alérgica y fuerte en la antihelmíntica. Este tema tiene repercusiones en medicina porque algunas helmintiasis como la ascariasis (producida por Ascaris lumbricoides), son capaces de modificar el curso de las enfermedades alérgicas, en ocasiones disminuyendo su intensidad, por lo cual se ha propuesto que una de las razones del incremento de las alergias en el mundo es la disminución progresiva de las infecciones por helmintos. En esta revisión analizaremos varios de los efectos de las helmintiasis sobre la respuesta inmunológica alérgica y especularemos sobre su influencia en las tendencias internacionales de incremento de los problemas inflamatorios de origen inmunológico.Helminth infections and allergies are very common in tropical countries, where they are linked by multiple interactions. Defense mechanisms against helminths are quite similar to the allergic immune response, mainly because both processes have a significant participation of antibodies such as immunoglobulin E (IgE). But there are also important differences, one being the degree of immunomodulation, which is weak in the allergic response and strong in anthelmintic immunity. This issue has implications in medicine because some helminth infections such as ascariasis (caused by Ascaris lumbricoides), are able to modify the course of allergic diseases, sometimes reducing their intensity and sometimes intensifying allergic symptoms. In this review we discuss some of the influence of helminthiases on the allergic immune response and speculate about its impact on the current international prevalence trends of inflammatory disorders

    Caldas, matematización de la naturaleza y sentimiento telúrico

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    Con motivo de conmemorarse en el próximo mes de octubre el bicentenario de la muerte de Francisco José de Caldas (1768-1816), la Academia Colombiana de Ciencias Exactas, Físicas y Naturales ha venido adelantando desde el año pasado, en conjunto con universidades, bibliotecas, museos y otras instituciones académicas y científicas, distintas actividades tendientes a recordar aspectos de la vida y la obra del personaje histórico que sin duda alguna más contibuyó a la promoción de la cultura científica en los primeros momentos de instauración de nuestra República. A estas actividades se suma ahora la Revista de la Academia Colombiana de Ciencias Exactas Físicas y Naturales al dedicar a la figura de Caldas el diseño de las portadas de los números publicados en el volumen 40 de este año. Entre todos sus méritos, la posteridad le ha reconocido a Caldas la capacidad y el talento con los cuales adelantó sus mediciones y cálculos en la Nueva Granada. En este campo Caldas se destacó por aprovechar al máximo libros e instrumentos que él mismo se supo proporcionar después de ingentes dificultades. Humboldt se encuentra entre quienes más contribuyeron a proyectar esta ima-gen de Caldas. A su llegada a estas regiones de los Andes, Humboldt percibió el genio de Caldas y lo relacionó con el sentimiento telúrico que alentaba la preocupación de los eruditos criollos por el conocimiento del entorno natural y para ello aprovechó las observaciones científicas legadas por los expedicionarios europeos. Estas ideas se encuentran en el más conocido de los elogios de Humboldt a Caldas, en carta enviada a Mutis a su paso por Popayán el 10 de noviembre de 1801 (Hernández de Alba, 1983)

    Estudio de la actividad antimicrobiana de películas delgadas de dióxido de titanio modificado con plata

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    Se estudió la actividad antimicrobiana de películas delgadas de dióxido de titanio (TiO2) solo y modificado con plata. Las películas de TiO2 solo se sintetizaron con el método Doctor Blade y las modificadas con plata con el método de fotorreducción química bajo irradiación UV. Las propiedades de las películas se midieron por espectroscopia Raman y microscopía electrónica de barrido; también se determinó el efecto de la incorporación de las partículas de plata en las propiedades antimicrobianas de las películas de TiO2 frente a Staphylococcus aureus. Los resultados de la caracterización indicaron que las partículas de plata se aglomeraban sobre la superficie del TiO2 generando agregados del orden de los 200 nm; en el análisis por espectroscopia Raman se vio que los agregados de plata depositados sobre las películas de TiO2 podrían presentar el fenómeno de resonancia de plasmones superficiales localizada. El ensayo preliminar de la actividad antimicrobiana indicó que la modificación de las películas de TiO2 con partículas de plata aumentó en 2,18 veces la eficiencia del proceso.We studied titanium dioxide (TiO2 ) thin films and silver-modified titanium dioxide thin films antimicrobial activity. The TiO2 thin films were synthesized using Doctor Blade method. The synthesis of silver-modified films was done by chemical photoreduction under UV irradiation. Materials were characterized by Raman spectroscopy and scanning electron microscopy (SEM) measurements. We determined the antimicrobial effect against Staphylococcus aureus of the incorporation of silver particles on TiO2 . Results indicated silver particles agglomerated on the surface of TiO2 generating aggregates of around 200 nm. Raman spectroscopy suggested that silver aggregates may present the plasmon resonance superficial phenomenon. The antimicrobial activity assay indicated that the TiO2 films modification with silver increased by 2.18 times the efficiency of the process

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