Repositorio Digital - Academia Colombiana de Ciencias Exactas, Fisicas y Naturales
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A Winsorized Adaptive Rank Test for Location when Sampling from Asymmetric Distributions
No full textSe propone una prueba de rangos adaptativa winsorizada para la alternativa de localización en distribuciones asimétricas que provienen de la Familia Lambda Generalizada. Se da un método para calcular la distribución exacta y expresiones analíticas para la distribución asintótica, y los dos primeros momentos de la estadística de prueba. Por medio de un estudio de Monte Carlo, se muestran que para varias selecciones de parámetros de winsorización la prueba propuesta es más potente que la prueba del signo y que la prueba original para selecciones apropiadas del parámetro de winsorización, de la cual la prueba propuesta fue adaptada.We propose a winsorized adaptive rank test for the location alternative for samples from asymmetric distributions coming from the Generalized Lambda Family. We give analytic expressions for the exact and asymptotic distributions and for the first two moments of the test statistic. By means of a Monte Carlo study, we show that for various selections of the winsorization parameter, our test is more powerful than the sign test, and than the original test, from which the proposed test is adapted
Corrección topocéntrica de parámetros orbitales obtenidos mediante las integrales de Kepler para asteroides MBA y NEO
No full textEn este estudio se exploró el problema que entraña calcular un conjunto preliminar de parámetros orbitales para asteroides a partir de la observación de sus posiciones relativas en la esfera celeste. Se implementó un método computacional basado en las integrales de Kepler en una variante geocéntrica y en una topocéntrica. El método se aplicó para cinco cuerpos pertenecientes a la familia de asteroides MBA (main belt asteroids) y cinco de la familia NEO (near Earth object). Además, se analizaron los resultados y los errores en ambas versiones del algoritmo. Los resultados mostraron que el método implementado es adecuado para obtener órbitas preliminares. En general, la versión más precisa para ambas familias de asteroides fue la topocéntrica. También se encontró que la corrección topocéntrica fue más notable para los NEO, puesto que la diferencia entre los errores geocéntricos y topocéntricos expresada como promedio casi dobló la diferencia para los MBA, lo que implica que en el caso de estos cuerpos, la versión del algoritmo utilizada debe ser la topocéntrica debido a la dificultad de hacerles seguimiento si existen incertidumbres muy altas.This paper dealt with the problem of computing an initial set of orbital parameters for asteroids from observations of their relative positions on the celestial sphere. A method based on the two-body integrals was computationally implemented in a geocentric and a topocentric version. This method was applied to five MBA asteroids and five NEO asteroids. The results and errors obtained for both versions of the algorithm were analyzed. The results showed that for both asteroid families, generally the most precise version of the algorithm was the topocentric version. The topocentric correction appears to be better suited for estimating orbit parameters for NEO asteroids in our sample, as, in average, the difference between the geocentric and topocentric errors almost doubled the differences for the MBA asteroids. This means that for these objects the version of the algorithm used should be the topocentric version due to the difficulty of tracking these objects if the uncertainties are high
Los macroinvertebrados como bioindicadores de la calidad del agua: cuatro décadas de desarrollo en Colombia y Latinoamerica
No full textLa comunidad de macroinvertebrados acuáticos mejor estudiada en Colombia es la entomofauna. Los órdenes Ephemeroptera, Plecoptera y Trichoptera son los mejor conocidos en cuanto a su taxonomía, ecología y su utilización como bioindicadores de la calidad del agua. Es necesario profundizar en el estudio de algunos grupos como los anélidos, moluscos, ácaros y dípteros, de los cuales aun falta conocimiento de su taxonomía y autoecología. El índice BMWP (Biological Monitoring Working Party), desarrollado en Europa en el siglo XX a partir de la década de los años setenta, es muy popular en Colombia y Latinoamérica, pero es necesario hacer adaptaciones para las diferentes regiones en el continente.Este trabajo presenta una revisión de los estudios realizados durante las últimas cuatro décadas en Colombia, y de manera general en Latinoamérica. Se presenta el estado actual del conocimiento de los diferentes grupos de los macroinvertebrados acuáticos en términos de la resolución taxonómica, los aspectos ecológicos y su utilización como bioindicadores de la calidad del agua.Entomofauna is the community of aquatic macroinvertebrates best studied in Colombia. Ephemeroptera, Trichoptera, and Plecoptera orders are the better known in the taxonomy, ecology and their use as bioindicators of water quality. It is necessary to deepen the study of some groups such as annelids, molluscs, mites and dipterans, which still lack knowledge of their taxonomy and autoecology. The BMWP (Biological Monitoring Working Party) index, developed in Europe in the twentieth century in the early seventies, is very popular in Colombia and Latin America, but it is needed to make more detailed adjustments for different regions on the continent. This paper presents a review of studies conducted during the last four decades in Colombia in particular, and more generally, in Latin America. The current state of knowledge of the different groups of aquatic macroinvertebrates in terms of taxonomic resolution, environmental aspects and its use as bioindicators of water quality analyzes is presented
Estudio químico de la fracción de acetato de etilo del hongo Ganoderma lucidum cultivado en desechos agroindustriales
No full textEstudios en hongos han revelado que poseen un alto valor nutricional, comprobada acción farmacológica de los metabolitos secundarios producidos en sus cuerpos fructíferos, siendo muchas las especies estudiadas, destacando entre estas el hongo macromiceto Ganoderma Lucidum, del cual se han aislado compuestos tipo lanostenoides y terpenoides, de importancia química y biológica, mostrando efectividad en la disminución de la presión sanguínea, propiedades antinflamatorias, antivirales, hipoglicémicas e inmunoprotectoras. Por otro lado, el cultivo de hongos promueve la solución a problemas de tipo ambiental, ya que puede hacerse en desechos agroindustriales. El objetivo fue estudiar la composición química del hongo Ganoderma Lucidum, cultivado en desechos agroindustriales y determinar diferencias entre los metabolitos obtenidos, con respecto a los de la especie del hongo en su estado silvestre. Para ello, se cultivó Ganoderma Lucidum, en desechos agroindustriales y se estudió químicamente la fracción de acetato de etilo (AcOEt), mediante cromatografía de columna (CC), cromatografía de capa fina (CCF), cromatografía en capa gruesa (CCP). Además de técnicas de análisis de estructuras CG-EM, RMN-1H, IR. Los resultados indicaron que se obtuvieron 674 fracciones, agrupadas como A-L por comportamiento cromatográfico similar, de estas se estudiaron las fracciones B, F e I, las cuales se sometieron a análisis espectroscópicos para elucidar las estructuras presentes, obteniéndose un total de siete compuestos presentes en ambas especies. De forma general, se puede concluir que al comparar el hongo cultivado con la especie silvestre, se establece que presentan una composición de metabolitos secundarios similar, donde el compuesto mayoritario fue el Ganoderiol B.Studies in fungi have revealed that they have a high nutritional value, proven pharmacological action of the secondary metabolites produced in their fruiting bodies, being many species studied, emphasizing among these, the macromycete Ganoderma lucidum, from which have been isolated compounds type terpenoids and its derivatives, with biological significance, showing effectiveness in the lowering blood pressure, anti-inflammatory properties, antiviral, hypoglycemic and immunoprotective. On the other hand, mushroom cultivation promotes the solution to environmental problems, since it can be done in agro-industrial wastes. The objective was to study the chemical composition of the fungus G. lucidum, grown in agro-industrial wastes and to determine differences between the metabolites obtained, with respect to those of the species of the fungus in their wild state. To do so, G. lucidum, was cultivated in agro-industrial wastes and the ethyl acetate fraction was studied, throught chromatography column thin layer chromatography, preparative thin-layer chromatography. In addition, GC-MS, NMR-1H, IR analysis techniques were done. The results and preparative indicated that the chromatographic separation allowed the characterization of 8 compounds. In general, it can be concluded that cultivated fungus, presents a composition of secondary metabolites similar to the reported by various researchers about the species in its wild state, establishing the majority compound corresponding to the Ganoderiol B
The complexity of genome integration process in human lentivirus
No full textIntroducción. La distribución del DNAc lentiviral en el genoma hospedero ha sido estudiada usando un enfoque estructural, sin embargo éste es incompleto pues no considera la dinámica y la topología de la cromatina interfásica y las redes de expresión de genes en la célula infectada.
Objetivo. Utilizando un enfoque no linear, correlacionar la multifractalidad de los cromosomas humanos con la composición y el disturbio de la topología de la cromatina como un efecto complejo promovido por la integración de ADNc lentiviral.
Métodos. De 2.409 secuencias genómicas obtenidas del GeneBank y flanqueantes al 5’LTR de lentivirus humanos, (cobertura mayor del 98,6% del genoma humano), se correlacionaron con los valores de multifractalidad (AvΔDq) de la cromatina humana. Adicionalmente se empleó el programa Cytoscape v.2.63 para simular computacionalmente los efectos de la integración sobre las redes de expresión de genes humanos.
Resultados. El 54,21% de la integración lentiviral ocurrió en aquellos cromosomas con valores altos e intermedios de multifractalidad; el 18.14% de estas integraciones se localizo en los cromosomas con más altos valores de multifractalidad (16, 17, 19, 22). La multifractalidad se correlacionó con el porcentaje Alu. Se registraron 2.770 interacciones entre 28 genes localizados cerca de provirus VIH-1 en macrófagos humanos. La integración del DNAc lentiviral alteró dramáticamente, la topología de la red de expresión de genes en macrófagos.
Conclusión. Algunos cambios topológicos asociados a las regiones con elevada frecuencia de integración del ADNc, podrían, de manera sinérgica, reconfigurar localmente la topología del ambiente cromatínica que las redes de expresión de genes en la célula infectada.Introduction: The distribution of human lentiviral cDNA into the host genome has been studied using a linear structural approach, however such analysis is incomplete because do not consider the dynamics and topology of interphase chromatin and the gene expression networks in infected cells.
Objective: To correlate using a non-linear approach the multifractality of human chromosomes, with the composition and disturbing of chromatin topology, as complex effect promote by the lentiviral cDNA integration.
Methods: From 2,409 human genome sequences flanking the 5’LTR of human and simian lentiviruses obtained from GeneBank (NCBI) database, several human genomic variables were correlated with the multifractality values AvΔDq of chromosomes covering more than 98.6% of the human genome. Moreover Cytoscape v.2.63 was used to simulate the effects of viral cDNA integration on gene expression networks in macrophages.
Results: 54.21% of lentivirus cDNA integrations were registered in chromosomes with high and medium fractality; 18.14% of these cDNA integrations was exclusively located in chromosomes 16, 17, 19 and 22 corresponding to that with high multifractality values. High scores of Pearson’s correlation for AvΔDq/chromosome vs integrations/chromosome; percentage of Alu sequences were recorded. 2,770 interactions among 28 genes located closed to HIV-1 proviruses in human macrophages were recorded. cDNA integration alters the gene interaction networks in infected cells, the topological parameters of non-infected macrophage network gene was dramatically changed upon HIV-1 integration.
Conclusion:Some topological changes in those regions with high frequency of cDNA viral integrations would synergistically configure local topological chromatin environments that alters the gene interaction networks in infected cells
Carta 42
No full textEscribe Caldas, en una importante carta que dirige a José Celestino Mutis y en que resume sus estudios p. 115. «Por fortuna [en San Francisco] le tocó un catedrático ilustrado [Restrepo], que detestaba esa jerga escolástica [...] se aplicó bajo su dirección al estudio de la aritmética, geometría, trigonometría, álgebra y física experimental, porque el curso de filosofía fue verdaderamente un curso de física y de matemáticas» (Popayán, 5 de agosto de 1801, pp. 113-114)
Microstructural characterization of pore types in unconventional gas reservoirs utilizing FEG-SEM: An example from the Galembo Member of the Cretaceous La Luna Formation, Middle Magdalena Valley Basin (Colombia)
No full textLa mineralogía y la microestructura son variables claves que definen las propiedades físicas de una roca. Las lodolitas muestran distribuciones de tamaño de poro en la matriz inherentemente heterogéneas. Ellos pueden mostrar poros orgánicos e inorgánicos y el mecanismo de transporte a través de poros es diferente, y, por lo tanto, es necesario describir su porosidad orgánica e inorgánica. Este trabajo utiliza Microscopía Electrónica de Barrido de Fuente de Emisión de Campo para caracterizar las lodolitas del Miembro Galembo de la Formación La Luna del Cretácico, Cuenca del Valle Medio del Magdalena, Colombia. Hay varios tipos de poros en las lodolitas, incluyendo poros interpartículas debido a la floculación de minerales de arcilla, porosidad orgánica debida al enterramiento y madurez térmica de la materia orgánica, poros intrapartıculas de organismos, poros intrapartículas dentro de granos minerales, y microcanales y microfracturas, incluyendo disolución, relleno y fracturas entre capas. La existencia de poros interconectados en tal complejo sistema de poros-fracturas ofrece vías eficaces para la migración primariade gas y también proporciona un espacio de almacenamiento para el petróleo residual en las lodolitas, lo cual es importante para la migración primaria y almacenamiento de los recursos de gas asociado a lodolitas. La conectividad entre poros es alta y aumenta hacia la parte superior del Miembro Galembo.Mineralogy and microstructure are key variables defining the physical properties of a rock. Mudstones show inherently heterogeneous matrix pore-size distributions. They can show organic and inorganic pores and the transport mechanism through pores is different, and, therefore, it is necessary to describe their organic and inorganic porosity. This work uses Field Emission Gun Scanning Electron Microscopy to characterize the Galembo Member mudstones, Cretaceous La Luna Formation, Middle Magdalena Valley Basin, Colombia. There are several pore types in mudstones, including interparticle pores due to flocculation of clay minerals, organoporosity due to burial and thermal maturity of organic matter, intraparticle pores from organisms, intraparticle pores within mineral grains, and microchannels and microfractures, including dissolution, fillings and interlayer fractures. The existence of interconnected pores in such complex fracture-pore system provides effective pathways for primary gas migration and it also provides a storage space for the residual petroleum in mudstones, which is important for the primary migration and storage for mudstone gas resources. The pore connectivity is high and increases towards the top of the Galembo Member
Estructura estacional del ensamblaje de escarabajos coprófagos (Coleoptera: Scarabaeinae) en una parcela permanente de bosque seco tropical
No full textLos bosques secos tropicales en América del Sur son uno de los ecosistemas menos conocidos y presenta una de las mayores pérdidas de cobertura anual. Con el objetivo de entender la dinámica estacional de estos remanentes de bosque y generar herramientas de conservación, se ha propuesto la utilización de grupos indicadores como el de los escarabajos coprófagos. Durante las épocas de sequía y de lluvias en el 2012 se hizo un muestreo con el fin de conocer la estructura del ensamblaje de escarabajos coprófagos (Coleoptera: Scarabaeinae) en una parcela permanente de bosque seco tropical en la Universidad del Magdalena, distrito de Santa Marta (Magdalena, Colombia). Se instalaron tres transectos en la parcela con trampas de caída cebadas con excremento humano. Se registraron 5.001 individuos pertenecientes a 13 especies y siete géneros. Cabe resaltar la abundancia de la especie Canthon variabilis en las dos épocas. No se encontraron diferencias significativas en la abundancia entre las dos épocas, pero sí en la riqueza. De las 13 especies encontradas, 11 se registraron en la época de sequía y ocho en la de lluvias, en tanto que siete se encontraron exclusivamente en una u otra de las dos épocas. No se registró la presencia de Malagoniella astyanax ni de Digitonthophagus gazella, lo cual indica que el fragmento tiene un grado intermedio de conservación. El número de especies y la estructura del ensamblaje concordaron con lo registrado para la región Caribe, y se evidenció una marcada dinámica estacional. Es necesario continuar con este tipo de estudios y analizar el efecto funcional de la fragmentación y el tamaño de los fragmentos en los procesos y servicios ecosistémicos.Tropical dry forests in South America are one of the less known ecosystems and they exhibit one of the biggest annual losses in forest cover. From a conservationist perspective, it has been proposed to use indicator groups such as dung beetles to try to understand the seasonal dynamics of the species community structure of these forest remnants. Sampling was performed during the dry and rainy seasons in 2012 to characterize the species composition of the dung beetle assemblage (Coleoptera: Scarabaeinae) in a permanent plot of dry forest located in the University of Magdalena, Santa Marta district (Magdalena – Colombia). Three sampling transects were set up in the parcel using pitfall traps baited with human dung. A total of 5,001 individuals, corresponding to 13 species and seven genera were registered. The abundance of the species Canthon variabilis during the two seasons was noteworthy. Although no significant differences in abundance between seasons were found, they were registered for species richness. Of the 13 species that we found, eight appeared exclusively in one season. The absence of Malagoniella astyanax and Digitonthophagus gazella indicates that the parcel has an intermediate degree of conservation. The number of species and the structure of the assemblage matched with values of other studies carried out in the Caribbean region showing a strong seasonal dynamic. Our results highlight that it is necessary to continue with this type of studies, analyzing the functional effects of fragmentation and fragment size in ecosystem services and processes
