Repositorio Digital - Academia Colombiana de Ciencias Exactas, Fisicas y Naturales
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Evaluación del efecto de Trialeurodes vaporariorum (Hemiptera: Aleyrodidae) en el crecimiento de plántulas de Oreopanax floribundus (Araliaceae)
Trialeurodes vaporariorum (Westwood) es un insecto fitófago que afecta diversos tipos de cultivos. En las labores del Jardín Botánico de Bogotá para la propagación masiva de especies nativas de bosque altoandino y páramo, se ha evidenciado la presencia de la mosca blanca. El objetivo del presente estudio fue documentar si Oreopanax floribundus podía ser una planta huésped de T. vaporariorum, y determinar si la presencia de este fitófago afectaba su crecimiento. El experimento incluyó tres tratamientos: T1 = control, T2 = plántulas con una infestación baja de T. vaporariorum, y T3 = plántulas con una infestación alta. El registro se realizó en dos momentos, al inicio del experimento (t0) y dos meses después de la infestación (t1). Se registró la altura, el número de hojas y el peso seco en los dos momentos, así como la cantidad de ninfas en el t1 en hojas nuevas y viejas. Se encontraron diferencias entre el número de ninfas presentes en hojas nuevas y hojas viejas (p0,05). Se presentaron diferencias (p0,05). There were differences (p<0,05) in the height between treatments where T2 and T3 showed a higher growth than T1. In conclusion, evidence was provided that can classify O. floribundus as a host plant of T. vaporariorum, and the opportunity opens up to further study if O. floribundus can be tolerant to T. vaporariorum, which is favorable for the massive propagation of this species
Patrones altitudinales de las comunidades vegetales en el Chocó biogeográfico del Valle del Cauca, Colombia
Se estudió la estructura y la diversidad vegetal de cinco localidades en el Chocó biogeográfico para determinar los patrones altitudinales de la vegetación leñosa y evaluar el efecto de los parámetros climáticos. En cada localidad se muestrearon diez parcelas de 50 x 2m, y se incluyeron todos los individuos con un diámetro a la altura del pecho de 2,5 cm o mayor. Además, se tuvieron en cuenta los datos de siete localidades del Chocó biogeográfico muestreadas con el mismo método. Las familias Arecaceae, Rubiaceae y Melastomataceae fueron las más ricas y abundantes, con los más altos índices de valor de importancia. La diversidad alfa fue más alta en las elevaciones bajas y menor en la zona más alta. Al agregar las otras localidades, el patrón altitudinal de riqueza disminuyó al aumentar la altitud. La riqueza de las plantas tuvo una acusada relación lineal con la temperatura, y una relación logarítmica con la precipitación, de tal manera que las zonas del Chocó biogeográfico con una temperatura y humedad relativa más altas presentaron mayor riqueza, aunque la precipitación podría alcanzar un punto de saturación, limitando así el aumento de la diversidad de plantas.In order to identify altitudinal patterns of woody plant diversity in the biogeographical region of Chocó and to evaluate the effect of climatic parameters on these, we studied the structure and plant diversity of five localities. In each locality, we sampled ten subplots of 50 x 2m including all individuals with a diameter at breast height of ≥ 2.5 cm. Additionally, we considered the data from seven biogeographic Chocó localities sampled with the same method. Arecaceae, Rubiaceae and Melastomataceae families dominated in richness and abundance, with the highest importance value indexes. Alpha diversity was higher at low elevations and lower at higher elevations. When adding the other localities, the altitudinal pattern of richness decreased with increasing altitude. The richness of plants had a strong linear relationship with temperature and a logarithmic relationship with precipitation. In this sense, the greatest richness was registered in the areas of the biogeographic Chocó with a higher temperature and relative humidity, although precipitation could reach a saturation point where the increase of plant diversity would be limited
Identificación de proteínas reguladoras de la expresión génica en tripanosomátidos
Los tripanosomátidos son parásitos causantes de patologías de reconocido impacto en salud pública como la enfermedad de Chagas, la enfermedad del sueño y la leishmaniasis. Estos microorganismos divergieron tempranamente de la línea evolutiva de los eucariotas y se caracterizan por poseer mecanismos peculiares de regulación génica finamente orquestados, tan eficaces que han asegurado su transmisión al permitirles adaptarse a ambientes inhóspitos y dispares como los de sus huéspedes invertebrados y mamíferos. Como consecuencia de su peculiar organización genómica, los tripanosomátidos han apostado por regular la expresión de sus genes a través de mecanismos posteriores a la transcripción, mediados principalmente por la acción de proteínas de unión a ARN (RNA-binding proteins, RBP), que reconocen su mensajero blanco gracias a la presencia de elementos reguladores en cis y se asocian con el ARN formando complejos ribonucleoprotéicos. De esta manera, las células establecen redes reguladoras en las que una misma RBP puede actuar sobre centenares de ARN mensajeros y el destino de cada uno de estos es dictado por la combinación de RBP con las que interactúa. Si bien mediante herramientas de bioinformática se han predicho cerca de un centenar de proteínas con capacidad de unión al ARN en tripanosomátidos, son pocas las que se han caracterizado y, sin duda, son muchas las que están aún por descubrir. En este artículo, se presentan las estrategias seguidas para la identificación y caracterización de proteínas reguladoras de la expresión génica en tripanosomátidos durante la última década en nuestro grupo de investigación, especialmente
de las proteínas RBP directamente implicadas en la regulación posterior a la transcripción de los genes HSP70 de Leishmania braziliensis.Trypanosomatids are parasites that cause pathologies with renowned impact on public health such as Chagas disease, the sleeping sickness, and leishmaniasis. These eukaryotes are characterized by having diverged early from their evolutionary path developing regulatory mechanisms that are efficient and finely orchestrated. Mechanisms which have ensured their transmission by allowing their adaptation to inhospitable and disparate environments such as those encountered in their invertebrate and mammal hosts. As a consequence of their peculiar genome organization, trypanosomatids have opted for regulating their gene expression mainly through post-transcriptional mechanisms, which are mediated through the action of RNA-binding proteins (RBP). These proteins recognize trypanosomatids target messengers due to the presence of cis elements and they link to the corresponding RNA forming ribonucleoprotein complexes. Thus, cells establish regulatory networks where a single RBP can act over hundreds of RNA messengers, and the destiny of any given RNA is dictated by the combination of the RBP with which it interacts. Around 100 RNA-binding proteins have been predicted by bioinformatics tools in trypanosomatids, but few of them have been characterized and there is no doubt that many are to be discovered still. In this article, we present the strategies used for the identification and characterization of gene-expression regulatory proteins in trypanosomatids over the past decade in our research group, particularly of RBPs directly implicated in the post-transcriptional regulation of the HSP70 genes of Leishmania braziliensis
Sizes of the centric diatom Actinocyclus normanii as salinity function, a new tool for the assessment of paleoenvironments
En estudios anuales sobre el fitoplancton realizados en la Ciénaga Grande de Santa Marta (CGSM), costa caribe colombiana, en 1987 y 1995, en los que se hicieron análisis cualitativos y cuantitativos y se establecieron las relaciones con variables fisicoquímicas, entre ellas la salinidad, se concluyó que la variación del diámetro de Actinocyclus normanii está ligada a la variación de la salinidad del agua. Así, las células pequeñas se generan cuando la salinidad baja durante la estación lluviosa, y las grandes lo hacen cuando la salinidad se incrementa, durante la estación seca. Las células pequeñas y las grandes son el resultado de la reproducción asexual y sexual, respectivamente. Durante la reproducción asexual, A. normanii se divide profusamente y se generan las células pequeñas. Durante la reproducción sexual, se generan las auxosporas, que dan lugar a las células grandes. Las auxosporas no se generan por debajo de 8 USP, pero sí lo hacen por encima de este valor, hasta cerca de 30 USP. Se hicieron, también, bioensayos en el laboratorio con A. normanii para establecer su relación con la salinidad y se llegó a los mismos resultados hallados en el medio natural: las auxosporas no se generaron en una concentración salina de 2.8 USP, pero sí en concentraciones de 10 y 20 USP. Con el fin de probar la utilidad de la medición del diámetro de A. normanii en función de la salinidad como herramienta aplicada a la interpretación de paleoambientes, se midieron 300 valvas de A. normanii que se hallaban en 15 placas permanentes de diatomeas obtenidas a partir de las muestras de sedimento de un núcleo de 6 m de profundidad en la desembocadura del río Sevilla (río Frío), en octubre de 2010. Para la prueba del método, se escogieron placas dentro de los primeros 265 cm del núcleo (ca. 2.300 años antes del presente [AP]). Con base en la definición de un diámetro de 40 μm en promedio como el punto de inflexión entre las células pequeñas de la especie y las grandes, se determinó que las pequeñas serían indicadoras del predominio de agua dulce y las grandes del predominio de agua marina. Debido a que las células pequeñas y grandes de A. normanii son generadas en el mismo ciclo de vida de esta especie, no se consideraron las formas o variedades subsalsa y normanii. Los resultados permiten concluir que A. normanii puede ser utilizado como indicador de la variabilidad salina de los cuerpos de agua.Two studies on the phytoplankton and the physical and chemical characteristics of the Ciénaga Grande de Santa Marta (CGSM) lagoon in the Colombian Caribbean, carried out in 1987 and 1995, found that salinity has been a key factor in the variation of the cell diameter of the diatom Actinocyclus normanii. Small cells are produced when salinity is low, while big ones are produced when salinity is higher. In turn, salinity variations are determined by precipitation: during the rainy season salinity decreases while it increases during the dry season. Small cells are produced by asexual reproduction during the rainy season. Bigger cells result from sexual reproduction and the production of auxospores, normally when salinity concentrations are above 8 PSU and up to 30 PSU. Bio-essays in the lab have confirmed that auxospores were not formed at 2.8 PSU salinity concentrations but they did at 10 and 20 PSU concentrations. To prove the use of cell diameter in paleoenvironmental reconstructions, 300 valves of A. normanii were measured in 15 diatom slides from a 6 m sedimentary core extracted from the lagoon in front of Sevilla River (río Frío) in October 2010. The core interval selected (5 to 265 cm) represents approximately the
last 2,300 years before present (BP). Statistical analyses indicated that the diameter of 40 μm marked the division between small and bigger cells. Diameters under 40 μm indicated fresher water conditions, and those larger than these, more saline conditions. Due to the relationship between small and bigger cells of A. normanii and taking into consideration that they are part of the same life cycle of this species, forms and varietes subsalsa and normanii were not considered. We concluded that variations in the diameter of A. normanii were dependent on salinity concentrations
XV Encuentro Nacional de Óptica – VI Conferencia Andina y del Caribe en Óptica y sus Aplicaciones
Promovido por la actual Sociedad Red Colombiana de Óptica, el Encuentro Nacional de Óptica (ENO) ha sido una actividad periódica desde su primera versión realizada en el año 1987 en la ciudad de Medellín. En el año 2006, la Red Colombiana de Óptica amplió la cobertura de promoción, fomento y fortalecimiento de la óptica y sus aplicaciones al invitar grupos de investigación de la región Andina (Chile, Perú, Bolivia y Venezuela) y del Caribe (Panamá, Cuba, Costa Rica, Honduras, El Salvador, Guatemala, Jamaica y República Dominicana) realizando, en el marco del X ENO, la Primera Conferencia Andina y del Caribe en Óptica y sus Aplicaciones (CANCOA)
El papel de la membrana mitocondrial externa en el control del metabolismo energético celular
Hasta 95 % de la energía en las células eucariotas se produce en las mitocondrias, las cuales se componen de dos membranas, la interna y la externa. La principal función de la membrana interna es la fosforilación oxidativa. El trifosfato de adenosina (adenosine triphosphate, ATP) y el fosfato de creatina, producidos en las mitocondrias, se transfieren al citosol atravesando la membrana mitocondrial externa, básicamente a través de las porinas (voltagedependent anion cannel, VDAC). Dado que los mecanismos de generación del potencial eléctrico en esta membrana se desconocen, generalmente se asume que la compuerta eléctrica de los VDAC siempre está abierta. Sin embargo, el potencial de la membrana mitocondrial externa puede generarse de manera dependiente del metabolismo energético celular mediante diversos mecanismos. La generación de dicho potencial mediante los complejos VDAC-hexocinasa en las células cancerígenas, o la oxidación directa del NADH citosólico en las mitocondrias de la levadura Saccharomyces cerevisiae permiten explicar los efectos de Crabtree y Warburg como una supresión eléctrica de las mitocondrias. Según el modelo desarrollado, la prevención de la formación de los complejos VDAC-hexocinasa por acción de algunos factores podría causar efectos anti-Warburg y anticancerígenos. Además, este potencial positivo generado por los complejos VDAC-creatina-cinasa podría proteger las mitocondrias de los cardiomiocitos y de otras células frente a los niveles tóxicos de calcio en el citosol. Los mecanismos propuestos de generación del potencial de la membrana dependiente del metabolismo energético celular, sugieren que las propiedades eléctricas del VDAC tienen un papel importante en varios procesos fisiológicos y patofisiológicos.Up to 95% of the energy in the eukaryotic cells is produced in the mitochondria, which are composed of two membranes, internal and external. The main function of the inner membrane is the oxidative phosphorylation. ATP and/or phosphocreatine produced in mitochondria are transferred to the cytosol across the mitochondrial outer membrane, mainly through the porins (voltage-dependent anion channel, VDAC). As the mechanisms of generation of the electrical potential on this membrane are not known, it is generally assumed that the VDAC electric gate is always open. However, the outer membrane potential (OMP) of mitochondria may be generated by various mechanisms in a manner dependent on the cell energy metabolism. OMP generation by the VDAChexokinase complexes in cancer cells, or by the direct oxidation of cytosolic NADH in the mitochondria of the yeast Saccharomyces cerevisiae, may explain the Crabtree and Warburg effects as an electrical suppression of mitochondria. According to the model developed, the prevention of the formation of the VDAC-hexokinase complexes may result in anti- Warburg and anti-cancer effects. In addition, the generation of the positive OMP by the VDAC-creatine kinase complexes could protect mitochondria in cardiomyocytes and other cells against toxic levels of cytosolic calcium. The mechanisms proposed for OMP generation dependent on the cell energymetabolism suggest that the VDAC electrical properties play an important role in various physiological and pathophysiological processes
Modelo estructural del Campo Escuela Colorado a partir de modelos análogos
La cuenca del Valle Medio del Magdalena es una cuenca intermontana (Cooper, et al., 1995; Taboada, et al., 2000; Sarmiento-Rojas, et al., 2006), que se caracteriza por tener estructuras con doble vergencia y está limitada por las cordilleras Central y Oriental (Córdoba, et al., 2000). En el sector sureste del Valle, asociado al frente de deformación occidental de la Cordillera Oriental, se localiza el Campo Escuela Colorado de la Universidad Industrial de Santander. Los estudios previos (Ecopetrol, 2003; Chajín, et al., 2013; Zafra, 2013) en dicho campo difieren en cuanto al modelo estructural y su relación con las estructuras regionales (por ejemplo, la falla de La Salina). En este trabajo se presentan los resultados de 15 modelos de simulación de una cuña crítica para definir las características estructurales en un ambiente compresivo. Los resultados de los modelos muestran un frente de deformación dominado por fallas con vergencia hacia el promontorio y retrocabalgamientos asociados. El apilamiento de material causó elevación topográfica en la zona axial de la cuña. Con base en la tendencia observada en los 15 experimentos realizados, se concluyó que la geometría de las estructuras está dominada por la escamación delgada y que el modelo estructural que define al Campo Escuela Colorado es una zona triangular controlada por un retrocabalgamiento.The Middle Magdalena Valley is an intermontane basin (Cooper, et al., 1995; Taboada, et al., 2000; Sarmiento-Rojas, et al., 2006) characterized by double vergence structures and flanked by the Central and Eastern Cordilleras (Córdoba, et al., 2000). The Campo Escuela Colorado oil field of the Universidad Industrial de Santander is located in the South Eastern zone of the Valley, associated with the western deformation front of the Eastern Cordillera. Previous works on this oil field have diverged as regards the structural model and the relationship with major structures (e.g., La Salina Fault). We present the results of 15 critical wedge simulation models to define the main structural characteristics in a compressive tectonic setting. Our results showed a deformation front dominated by thrust faults that verge towards the foreland and by associated backthrusts. The topographic elevation is caused by material stacked in the axial zone of the wedge. Based on the 15 experimental models we concluded that the geometry of the structure is dominated by thin flaking and that the structural model of the Campo Escuela Colorado is a triangular zone dominated by a backthrust
Moutabea chartacea (Polygalaceae), a new species from the north-central Amazon and Guayana Shield
Se describe e ilustra la especie Moutabea chartacea, de los bosques húmedos de tierras bajas de Brasil (estado Amazonas), Venezuela (estados Amazonas, Bolívar y Delta Amacuro) y Colombia (departamentos de Caquetá, Meta y Vaupés), y se discuten sus relaciones morfológicas con su especie afín. Esta nueva especie es similar a M. gentryi, sin embargo, difiere por poseer los pecíolos, hojas, lóbulos de cáliz, frutos y semillas más pequeños, así como brácteas triangulares, pétalos con los ápices no reflexos y semillas densamente cubiertas por tricomas estrellados. Se incluye una clave actualizada de las especies de Moutabea.We describe and illustrate Moutabea chartacea from the wet lowland forests of Brazil (Amazonas state), Venezuela (Amazonas, Bolívar and Delta Amacuro states), and Colombia (Caquetá, Meta and Vaupés departments), and we discuss its morphological relationships with an allied species. This new species is similar to M. gentryi, but it differs by its smaller petioles, leaf blades, calyx lobes, fruit, and seeds; triangular bracts; petals not reflexed; and the seed densely covered by stellate trichomes. An updated key to the named species of Moutabea is provided