Repositorio Digital - Academia Colombiana de Ciencias Exactas, Fisicas y Naturales
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Filogenia y oncogénesis del virus del papiloma humano: una aproximación translacional al descubrimiento de biomarcadores para la detección de lesiones precancerosas de cérvix
No full textEl cáncer cervical es la principal causa de mortalidad entre las mujeres en poblaciones con índice de desarrollo humano bajo y medio. La infección con 14 de los genotipos del virus del papiloma humano de alto riesgo (VPH-AR) es la causa principal de este cáncer. Las vacunas profilácticas previenen esta infección si se aplican antes del inicio de la actividad sexual. Las mujeres que no han sido vacunadas deben someterse a tamización con la prueba de VPH-AR, y recibir el diagnóstico histopatológico y el tratamiento oportunos. Cerca del 20 % de las mujeres son positivas para el VPH-AR, pero muy pocas presentan lesiones potencialmente malignas. Las mujeres infectadas con los genotipos VPH16 o 18 o aquellas con ascendencia europea infectadas con variantes de origen nativo americano del VPH 16 tienen mayor riesgo de cáncer. También aquellas con historia de uso de anticonceptivos hormonales y de tabaquismo. Estos factores parecen contribuir a un aumento de la expresión de las oncoproteínas E6 y E7 del VPH-AR, lo que conduce a la desregulación del control del ciclo celular y, finalmente, al cáncer. En el presente estudio se pasa revista al estado del arte de los mecanismos carcinogénicos del VPH-AR haciendo énfasis en el papel de las proteínas E6 y E7 y se presentan los resultados de la genotipificación del VPH16 o 18, la tasa de positividad de las proteínas p16 y ki67 y la evaluación bioinformática de la expresión aberrante de los miARN y su correlación con el grado de la lesión cervicouterina, datos que contribuyen a validar el potencial clínico de estos biomarcadores para la detección de lesiones potencialmente malignas de cérvix.Cervical cancer is the main cause of mortality among women in populations with low and medium human development index. The infection with 14 genotypes of the high-risk human papillomavirus (HR-HPV) is the main cause of this cancer. Prophylactic vaccines prevent this infection if they are applied before the onset of sexual activity. Unvaccinated women should be screened with the HR-HPV test and receive the histopathological diagnosis and timely treatment. About 20% of women are HR-HPV positive, but very few have potentially malignant lesions. Women infected with HPV16 or 18 genotypes or women with European ancestry infected with Native American variants of HPV 16 have a higher risk of cancer. Also, those with a history of use of hormonal contraceptives and cigarette smoking. These factors seem to contribute to an increase in the expression of the HR-HPV oncoproteins E6 and E7, which leads to the deregulation of cell cycle control and finally to cancer. We present here the state of the art of the carcinogenic mechanisms of HPV-AR emphasizing the role of the E6 and E7 proteins, as well as the results of our study on the HPV16 or 18 genotyping, the positivity rate of the p16 and ki67 proteins, and the bioinformatic evaluation of the aberrant expression of miRNAs and their correlation with the degree of cervical lesions. These data contribute to validate the clinical potential of these biomarkers for the detection of potentially malignant lesions of the cervix
Efecto del contenido de Ni en las propiedades ópticas y eléctricas de recubrimientos ZrTiSiNiN depositados por co-sputtering
No full textPelículas delgadas de ZrTiSiNiN fueron depositadas sobre sustratos de vidrio y silicio mediante co-sputtering reactivo con magnetrón usando blancos de Ti5Si2, Zr. En esta investigación se varío el contenido de Ni en los recubrimientos mediante la adición de cubos de Ni ubicados sobre el blanco de Zr. La morfología superficial, la estructura cristalina y el espesor de las películas fueron evaluadas mediante microscopía electrónica de barrido (SEM), difracción de rayos X (XRD) e interferometría respectivamente. La resistividad eléctrica se midió mediante el método de cuatro puntas y sus propiedades ópticas se caracterizaron por espectroscopía ultravioleta / visible (UV/Vis). Con base en los resultados de XRD se observó que el Níquel actúa como refinador de grano al lograr disminuir el tamaño de cristalito de 27 nm hasta 15 nm cuando la concentración de Níquel aumenta de 0 at% a 6,8 at%. Tanto la resistividad eléctrica y el “band gap” óptico de los recubrimientos aumentaron con la disminución del tamaño del cristalito como resultado del aumento de la densidad de límites de grano y del efecto de confinamiento cuántico.Thin films of ZrTiSiNiN have been deposited onto a glass and silicon substrates by reactive magnetron co-sputtering of pure Ti5Si2, Zr alloy targets. In this investigation was located Ni pieces on Zr target in order to change the Ni amount in the films. The surface morphology and crystalline structure of the films were investigated by scanning electronic microscope (SEM), X-ray diffraction (XRD) and interferometry respectively. The electrical resistivity was measured by the four-point probe method and their optical properties were characterized by ultraviolet/visible (UV/Vis) spectroscopy. XRD results showed that nickel works as a grain refiner because the crystallite size is reduced from 27 nm to 15 nm when the Ni concentration increases from 0 to% to 6.8 to%. Both the electrical resistance and the optical “band gap” of the coatings increased with the decrease in crystallite size because of the increase in the density of grain boundaries and the quantum confinement effect
Characteristic-dependent linear rank inequalities in 21 variables
No full textEn Álgebra Lineal sobre cuerpos finitos, una desigualdad rango lineal dependiente de la característica es una desigualdad lineal que es válida para dimensiones de sumas de subspacios vectoriales de un espacio vectorial de dimensión finita sobre un cuerpo finito de determinada característica, y no es válida en general sobre cualquier cuerpo de otra característica. Este documento presenta un resultado preliminar referente a la producción de estas desigualdades. Nosotros producimos tres desigualdades nuevas en 21 variables usando como guía una matriz binaria particular, con entradas en un cuerpo finito, cuyo rango es 8, 9 o 10 dependiendo de que la característica sea 2, 3 o distinta de 2 y 3; la primera desigualdad es válida sobre cuerpos de característica 2; la segunda es válida sobre cuerpos de característica 2 o 3; la tercera es válida sobre cuerpos de característica distinta de 2 y 3.In Linear Algebra over finite fields, a characteristic-dependent linear rank inequality is a linear inequality that holds by ranks of spans of vector subspaces of a finite dimensional vector space over a finite field of determined characteristic, and does not in general hold over fields with other characteristic. This paper shows a preliminary result in the production of these inequalities. We produce three new inequalities in 21 variables using as guide a particular binary matrix, with entries in a finite field, whose rank is 8, with characteristic 2; 9 with characteristic 3; or 10 with characteristic neither 2 nor 3. The first inequality is true over fields whose characteristic is 2; the second inequality is true over fields whose characteristic is 2 or 3; the third inequality is true over fields whose characteristic is neither 2 nor 3
Una nueva especie de Miconia (Melastomataceae) con anteras connadas de Colombia
No full textLa tribu Miconieae comprende cerca de 1.900 especies neotropicales y en recientes trabajos se propone solo un género para la tribu, Miconia, que incluye la totalidad de los géneros considerados previamente, entre los que se incluye el Tococa. En el presente trabajo se describe e ilustra una nueva especie bajo el género Miconia, que presenta anteras lateralmente connadas, procedente del departamento del Chocó, Colombia, la cual se asocia con las especies de la tribu Miconieae con anteras coherentes tales como Tococa symphyandra y Miconia croatii. Este nuevo taxón se identifica por el indumento de las ramas de tricomas elongados y alveolados, haz foliar bullada, el cáliz cerrado en botones y con grandes dientes dorsales, los pétalos y el estilo más grandes que las anteriores especies, y el ápice del ovario truncado. Crece en áreas muy húmedas de bosque subandino en la región central de la cordillera Occidental y hasta ahora solo se conoce de la localidad tipo.The Miconieae tribe comprises about 1,900 Neotropical species and recent studies propose only one genus for the tribe, Miconia, which includes all of the genera previously considered including Tococa. Here we describe and illustrate a new species of the genus Miconia with lateral connate anthers from the department of Chocó, Colombia. This new taxon is associated with the species of the Miconieae tribe with laterally coherent anthers in a ring stamens such as Tococa symphyandra and Miconia croatii. This new taxon is characterized by the indument on branches with elongate and alveolate trichomes, bullate leaves, closed calyx in buds and with large dorsal teeth, bigger petals and style, and a truncated ovary apex. This new species grows in very humid areas of the sub-Andean forest in the central region of the Western Cordillera and at present, it is known only from the type locality
Mangroves of Colombia revisited in an era of open data, global changes, and socio-political transition: Homage to Heliodoro Sánchez-Páez
No full textColombia es el único país suramericano con costas tanto en el Océano Pacífico como el Mar Caribe, por lo cual exhibe grandes contrastes para los manglares en términos de tipos de climas y geoformas costeras. Por ejemplo, los manglares son extensos a lo largo de la costa del Pacífico debido a la alta precipitación anual y a la presencia de grandes deltas. Estos manglares son el hábitat de la única especie endémica del Neotrópico (Pelliciera rhizophorae), también clasificada como amenazada. En contraste, los manglares se distribuyen de forma discontinua a lo largo de la costa Caribe, siendo extensos en los tres deltas más grandes y en unas pocas lagunas costeras. Además, los manglares enanos y de baja estatura están presentes en las zonas áridas de la costa norte, bañadas por quebradas y ríos estacionales. En estudios recientes se resalta la importancia global de los manglares de Colombia en términos de su extensión, sus bajas tasas de deforestación (particularmente en la costa Pacífica) y sus grandes reservas de carbono. Sin embargo, la mayor parte de lo que actualmente sabemos de la biogeografía de los manglares colombianos se ha obtenido a partir del análisis de estudios independientes llevados a cabo en diferentes sitios y años. La voluminosa información recolectada por Heliodoro Sánchez-Páez y sus colaboradores en el mayor inventario nacional de manglares (PMC: Proyecto Manglares de Colombia, Ministerio del Medio Ambiente) recopilado a mediados de la década de 1990, ofrece una oportunidad para, en combinación con datos abiertos, revisar hipótesis biogeográficas (por ejemplo, que la alta precipitación promueve el valor de importancia del mangle rojo) y explorar patrones macroecológicos. En homenaje a Heliodoro Sánchez-Páez (fallecido en el 2017), se presenta a la comunidad la base de datos HELIO_SP.CO v.1, derivada de este inventario forestal, como una plataforma para los estudios macroecológicos y línea de base para futuras evaluaciones del impacto del cambio climático y en los usod de la tierra. Se revisaron las contribuciones del PMC y se exploraron patrones geográficos generales utilizando la base de datos HELIO_SP.CO v.1. En este sentido, se describió el recambio de las dos especies dominantes a lo largo del gradiente de precipitación observado desde Nariño hasta La Guajira. Se utilizaron datos rasterizados de WorldClim 2 para explorar los espacios de precipitación y temperatura donde las especies fueron registradas. Por último, se revisó brevemente el progreso de las “ciencias del manglar” desde 1997 y se detectaron algunos de los desafíos relacionados con el cambio climático y las situaciones posteriores al acuerdo de paz en Colombia.Colombia is the only South American country with coasts in both the Pacific Ocean and the Caribbean Sea thus providing great contrasts for mangroves in terms of climatic types and geomorphic settings. For instance, mangroves are extensive along the Pacific coast due to both high annual rainfall rates and the presence of many world-class deltas. Besides, they are the habitat of the only Neotropical endemic mangrove (Pelliciera rhizophorae), which is also a threatened species. In contrast, mangroves are discontinuously distributed along the Caribbean coast and they are extensive in the three major deltas and a few coastal lagoons. In addition, dwarf and stunt mangroves are found in northern arid lands sprung by seasonal streams and rivers. Recent studies have highlighted the global significance of the Colombian mangroves in terms of their extension, low deforestation rates (particularly in the Pacific coast), and high reservoirs of ecosystem carbon scattered nation-wide. Nonetheless, most of the current understanding of the biogeography of our mangroves has been obtained by integrating studies independently conducted in different sites and years. The voluminous information collected by Heliodoro Sánchez-Páez and his colleagues in the largest national inventory of mangroves (MCP: Mangroves of Colombia Project, Ministry of the Environment) undertaken in the mid 1990’s provides an opportunity to re-assess biogeographic hypotheses (e.g., that high rainfall promotes the increase in the importance value of red mangroves) and to explore macroecological patterns when combined with open data sets. The objective of this paper was to introduce HELIO_SP.CO v.1, an open database derived from this mangrove inventory as a homage to Heliodoro Sánchez-Páez, who passed away in 2017, as a platform for macroecological studies and benchmark for future impact assessments of climate change and land-use change on mangroves in Colombia. In addition, the contributions of the MCP were reviewed and the general geographic patterns were explored by using HELIO_SP.CO v.1. For instance, the shift of the two dominant mangrove species in Colombia across the rainfall gradient observed from Nariño to La Guajira was clearly depicted. Using WorldClim 2, we also explored the rainfall and temperature spaces where the species occur. Finally, we briefly reviewed the progress of mangrove science since 1997 and identified some challenges regarding climate change and post-armed conflict scenarios in Colombia
Breve reseña de los aspectos taxonómicos y nomenclaturales actuales del género Cinchona (Rubiaceae-Cinchoneae)
No full textOdonatos de la Sierra Nevada de Santa Marta, Colombia: una lista preliminar
No full textSe presenta una lista de especies y géneros de odonatos de ocho ríos de la Sierra Nevada de Santa Marta (SNSM) producto de la revisión de artículos científicos, trabajos de grado y especímenes depositados en el centro de Colecciones Biológicas de la Universidad del Magdalena (CEBUMAG). Se registran 38 especies distribuidos en 35 géneros en ocho familias. La familia Libellulidae presentó la mayor riqueza (14 géneros) y los rangos más amplios de distribución altitudinal (entre 50 y 2800 msnm), encontrándose en todas las coberturas vegetales. El río Gaira exhibió la mayor riqueza entre los ríos revisados, 26 géneros, de los cuales ocho son exclusivos de la cuenca, en tanto que en el río Ranchería solo se registró Progomphus. La distribución espacial más amplia fue la de los géneros Argia y Brechmorhoga, registrados en seis ríos. La revisión evidenció la falta de estudios en las vertientes oriental y suroccidental de la Sierra Nevada de Santa Marta, por lo que se recomienda realizar trabajos taxonómicos y de biodiversidad para contribuir al conocimiento de odonatos en el Caribe colombiano.We raised a list of Odonata species and genera from eight rivers of the Sierra Nevada of Santa Marta (SNSM) after the revision of scientific articles, theses, and specimens deposited in the Centro de Colecciones de la Universidad del Magdalena (CEBUMAG). We found 38 species distributed in 35 genera and eight families. The Libellulidae family presented the greatest richness (14 genera) and the widest range of altitudinal distribution (between 50 and 2,800 m a.s.l.) found in all vegetable coverages. The Gaira River exhibited the greatest wealth among the revised rivers with 26 genera of which eight are exclusive to the basin while in the Ranchería River only Progomphus was registered. Argia and Brechmorhoga had a wide spatial distribution as they were recorded in six rivers. The review revealed the lack of studies on the eastern and southwestern slopes of the Sierra Nevada de Santa Marta, so it is recommended to carry out taxonomic and biodiversity work to contribute to the knowledge of Odonata in the Colombian Caribbean
First records of Theobroma speciosum fruits dispersion
No full textNumerosas especies amazónicas productoras de frutos de utilidad económica han sido explotadas intensamente por lo cual las poblaciones silvestres se redujeron drásticamente. Theobroma speciosum es una especie importante, ya que proporciona frutos para roedores y primates y también tiene un gran potencial económico pues puede servir como fuente de variedad genética para especies relacionadas que se explotan económicamente como T. cacao. Se presenta aquí por primera vez la dispersión de semillas de T. speciosum por S. apella, Mico argentatus (Primates) y G. aestuans (Rodentia). La información es útil para desarrollar estrategias de conservación de este cacao silvestre en fragmentos remanentes de los bosques de la Amazonia oriental.Numerous Amazonian species that produce economically useful fruits have been intensively exploited, which is why wild populations were drastically reduced. Theobroma speciosum is an important species for humans and wildlife because it provides fruits for rodents and primates. This plant species is also of great economical potential because it can serve as a source of genetic variation for related species that are economically exploited as T. cacao. Here we report for the first time the seed dispersal by Sapajus apella, Mico argentatus, and Guerlinguetus aestuans. The information is useful to develop conservation strategies for this wild cocoa in remnant fragments of the forests of the eastern Amazon
Una convolución muy útil y unas derivadas ilustres
No full textEste artículo trata sobre operadores de molificación discreta y sobre derivadas fraccionarias. Los operadores de molificación se definen a partir de convoluciones con núcleos gaussianos truncados, tanto en una como en dos dimensiones. Iniciamos con una descripción de sus orígenes y de sus principales propiedades y después consideramos en detalle dos aplicaciones que indican lo útiles que son estos operadores. Las aplicaciones se basan en ecuaciones diferenciales parciales difusivas con derivadas temporales fraccionarias. Estas derivadas merecen el calificativo de ilustres como se verá más adelante. La primera aplicación consiste en la solución estable de un problema inverso de advección-dispersión, con derivada temporal fraccionaria, en el que la concentración es desconocida en la frontera de un dominio unidimensional semi-infinito. La segunda aplicación es la solución estable de un problema inverso bidimensional de identificación de un término fuente en una ecuación de difusión con derivada temporal fraccionaria. En cada caso se incluye la descripción del problema, la implementación de la molificación, el método de solución y algunos experimentos numéricos. Para el problema en dos dimensiones incluímos resultados recientemente enviados para publicación.This paper deals with discrete mollification operators and fractional derivatives. The mollification operators are based on convolutions with truncated Gaussian kernels in one and two dimensions. We begin with a description of their origin and main properties and then we consider two applications that show the usefulness of these operators. Both applications are based on time-fractional diffusion equations. Fractional derivatives deserve to be called illustrious, as we will see later. The first application consists of the stable solution of an inverse problem for a time fractional advection-dispersion equation. The problem consists of the identification of the boundary concentration in a one-dimensional semi-infinite setting. The second application is the stable solution of a problem of source term identification in a bidimensional time-fractional diffusion equation. In each case, we include a description of the problem, the mollification implementation, the method of solution, and some numerical experiments. For the two dimensions problem we include results that were recently published