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Development of the molecular graphics package MOLEKEL and its application to selected problems in organic and organometallic chemistry
MOLEKEL est un logiciel d'infographie moléculaire qui a été développé pour visualiser interactivement différents modèles de structures et de propriétés moléculaires. Leur représentation graphique est construite à partir des résultats numériques obtenus par des programmes externes de chimie physique pour lesquels des interfaces ont été implémentées. Les caractéristiques essentielles de ce logiciel résident dans sa grande convivialité, dans la haute qualité graphique des images qu'il permet d'obtenir et dans sa flexibilité en vue de traiter des problèmes chimiques très variés. Deux applications illustrent les possibilités de MOLEKEL: une étude de la distribution de densité de spin dans le biradical bis-nitroxide 1,3,5,7-tétraméthyl-2,6-diazaadamantane N,N'-dioxyl et une modélisation de l'attaque électrophile sur le complexe organométallique ([nu]⁵-C₅H₅)Ru(CO)(PPh₃)(H)
La diffusion microscopique et les cartographies d'abondances des étoiles Ap magnétiques
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Induction florale par l'acide gibbérellique: étude du plasmalemme des cellules de l'épinard (Spinacia oleracea L. cv. Nobel)
L'induction florale de nombreuses plantes est soumise aux signaux de l'environnement tels que la durée respective du jour et de la nuit. L'application de composés chimiques tels que AG3 peut aussi provoquer l'induction florale chez l'épinard (Spinacea oleracea L. cv. Nobel), plante de jour long. Les événements se produisant dans la feuille après un traitement par AG3 ou en réponse à une modification de la photopériode pourraient être propagés dans toute la plante jusqu'aux cellule du méristème via le symplaste. La membrane plasmique serait impliquée dans la transmission d'un stimulus. Cette hypothèse nous a fait entreprendre une étude systématique des membranes cellulaires et plus particulièrement du plasmalemme. Les effets de AG3 sur notre matériel végétal ont d'abord été étudiés par des mesures de croissance. Les résultats ont permis de choisir une méthode de traitement par AG3 pour les autres expériences. Les données obtenues ont aussi montré qu'à la fois CaCl2 et LiCl interfèrent avec la réponse des plantes à AG3. L'acide gibbérellique déclencherait au niveau cellulaire des mécanismes de type messager secondaire. Cette hypothèse a été discutée. Du plasmalemme, très pur, a été préparé par électrophorèse en flux continu ou par partition de phase. Il a été identifié, sur la base de l'activité d'enzymes spécifiques et par sa morphologie en microscopie électronique. Les contaminations de nos préparations par des endomembranes ont été estimées par les mêmes techniques. Un épaississement du plasmalemme, en réponse au traitement à AG3 et à la prolongation de la durée du jour, a été observé dans la feuille et dans les cellules du méristème. Quelques composés chimiques peuvent provoquer les mêmes modifications de l'épaisseur de cette membrane lors de l'incubation des vésicules de plasmalemme in vitro. L'aspect structural du plasmalemme a aussi été abordé par des expériences de RMN du proton et du phosphore. Seule la partie superficielle de la membrane semble modifiée par l'allongement de la photopériode. D'autres expériences ont montré que AG3 modifiait la réponse de liposomes à la température. C'est la phase gel de ces modèles membranaires qui est stabilisée par AG3. L'importance de l'eau liée des systèmes membranaires, dans ces deux types d'expériences, a été discutée. Des analyses de la composition du plasmalemme des cellules de feuilles et du tissu méristématique ont montré que le contenu en stérol était modifié lors d'un transfert des plantes en lumière continue. Un traitement de trois jours avec AG3 provoque les mêmes changements mais uniquement sur le plasmalemme des cellules de la feuille. Le contenu en protéines, phospholipides et acides gras, n'est pas modifié par ces deux traitements. Les conséquences de cet effet ont été discutées. L'aspect fonctionnel du plasmalemme a aussi été étudié. Les activités de la K+, Mg2+ ATPase et de la (des) NADH oxydase(s) sont, de manière différente, modifiées par l'acide gibbérellique et par la lumière. Ces résultats sont basés sur des expériences réalisées in vivo et in vitro. Ces résultats sont discutés sur la base de l'implication du plasmalemme dans le stimulus floral. Les relations entre les différents aspects: structure, composition et fonction du plasmalemme sont aussi envisagées
Émission X et ultraviolette des quasars et galaxies de Seyfert
L’émission X des noyaux actifs de galaxies se distingue par son spectre en loi de puissance étendu sur trois ordres de grandeurs dans l' espace des fréquences et par sa variabilité rapide. Nous avons utilisé des observations de quasars et de galaxies de Seyfert 1 effectuées avec les satellites EXOSAT et JUE pour étudier la relation entre les variations spectrales de l'émission X et celles de la composante ultraviolette. Nous avons mis en évidence une anti-corrélation entre la pente spectrale de la composante X et le rapport de son flux à celui de la composante de plus faible énergie dans la moitié des objets observés. Cette anti-corrélation montre que les photons X sont probablement émis par diffusion Compton inverse de photons ultraviolets dans un nuage optiquement mince d’électrons thermiques (kT =me c2). Le régime de la variabilité change quand le rapport des flux ultraviolets et X diminue reflétant probablement le passage d'un milieu optiquement mince à un milieu opaque dans lequel l'effet des paires électrons-positrons devient dominant
Biodisponibilité du phosphore lié aux sédiments en suspension du Rhône et d’autres affluents du Léman
La fertilité des suspensions sédimentaires est nulle en hiver, à cause de teneurs élevées en P dissous dans le lac. Entre avril et septembre, la croissance du phytoplancton est favorisée nettement par les sédiments de la Dranse et de la Venoge, moyennement par ceux de l'Aubonne et faiblement par ceux du Rhône. Les suspensions de la STEP s'avèrent être toxiques, en raison des concentrations élevées en métaux lourds et micropolluants organiques.
La détermination des formes du phosphore particulaire met en évidence une influence des sources ponctuelles importante dans la Venoge en 1989, à cause de conditions météorologiques sèches, et restreinte dans le Rhône en été, en raison de la dilution par les apports glaciaires.
Pour quelques tests la croissance algale est bien corrélée avec le phosphore inorganique non-apatitique, mais la réponse des algues résulte en fait de l'interaction entre la fertilité des nutriments et la toxicité des contaminants.Suspended sediments were recovered in 1988 and 1989 by continuous flow centrifugation of water samples at the mouths of the Rhone, Venoge, Dranse and Aubonne rivers. ln addition the effluent of the sewage treatment plant {STP) at Lausanne-Vidy was sampled in each of the two years (fig. 4.1 ). The performance of the system using two centrifuges in parallel (a Westphalia and an Alfa-Laval) has been assessed (Santiago & al. 1989). Both centrifuges show good agreement for particle size and trace metal concentrations in suspended solids, providing the sediment trapped in the brass core of the Alfa-Laval is discarded.
Results indicate that primary production can be promoted in the short term by the suspended sediments, and that the bioassay is particulate specific and well adapted to determine the bioavailable proportion of the particulate phosphorus. Conditions of incubation (temperature, illumination, turbidity effect, length) and methodological procedures (filtration, DMSO extraction, liquid scintillation counting) have been assessed (figs. 4.5, 4.6, tabs. 4.1, 4.2). Addition of soluble nutrients, either in filtered river water or as a pure solution of orthophosphate, did not enhance growth before 15 hours of incubation (fig. 4.7). This lag is believed to be necessary to allow algal adaptation.</p
Études relatives à la multiplicité des étoiles de petite masse
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Intérêt des dinokystes dans le Crétacé inférieur : morphologie, systématique, phylogénie, bio- et morphostratigraphie et paléoécologie
Ce mémoire présente les résultats de cinq années d'étude sur les kystes de dinoflagellés (ou dinokystes) du Crétacé inférieur. Les nouveaux concepts et applications décrits dans ce travail sont supportés par l'étude de plusieurs centaines d'échantillons de provenance diverse: domaine boréal, téthysien ou austral. L'ensemble du mémoire s'articule autour d'une étude morphologique fine, appuyée sur l'observation de plusieurs milliers de spécimens. Il montre les différentes interactions de la morphologie avec la systématique, la biostratigraphie et la paléoécologie.
Morphologie et systématique. Un meilleur vocabulaire descriptif et une sélection adéquate des critères morphologiques, choisis si possible pour leur caractère alternatif (oui ou non), permettent la création d'une terminologie plus adaptée (par exemple chez les genres Odontochitina DEFLANDRE 1935 et Xenascus COOKSON & EISENACK 1969). Cette terminologie nouvelle conduit à des diagnoses plus systématiques, moins littéraires et non ambiguës, qui restituent au concept de l'espèce sa véritable valeur universelle (par exemple chez le genre Muderongia COOKSON & EISENACK 1958). Ces apports descriptifs et terminologiques sont à l'origine de nombreux changements taxinomiques: amendations, combinaisons nouvelles ou création de nouveaux genres et espèces (par exemple la révision du genre Cometodinium DEFLANDRE & COURTEVILLE 1939 et la création de l'espèce C. habibi). L'importance d'une synonymie critique est réaffirmée. Enfin, des clés de détermination accessibles aux non-spécialistes sont présentées: elles incorporent les nouvelles données terminologiques et taxinomiques, et reposent sur des schémas et symboles qui permettent de visualiser facilement les critères de reconnaissance utilisés (par exemple chez les genres Amphorula DODEKOVA 1969 et Palaeotetradinium DEFLANDRE 1936).This study presents the results of a five-year research on Lower Cretaceous dinoflagellate cysts (dinocysts). The new concepts and observations described herein are supported by the study of hundreds of samples coming from various palaeogeographical domains: boreal, tethysian or austral. The framework of the study is based on a fine morphological study of thousands of specimens. This research brings forward the various interactions between morphology, systematics, biostratigraphy and palaeoecology.
Morphology and systematics. The choice of a better descriptive vocabulary and of proper morphological criteria, the latter chosen as much as possible for their alternative (yes or no) character, allows to define a better adapted terminology (e.g. in the genera Odontochitina DEFLANDRE 1935 and Xenascus COOKSON & EISENACK 1969). This new terminology leads to more systematical, less litterary and non ambiguous diagnoses, which bring back to the concept of "species" its true universal value (e.g. in the genus Muderongia COOKSON & EISENACK 1958). This new terminology results in numerous taxonomic changes: emendations, new combinations or creation of new genera and species (e.g. revision of the genus Cometodinium DEFLANDRE & COURTEVILLE 1939 and creation of the new species C. habibi). The value of a critical synonymy is emphasized. Finally, determination keys accessible to non-specialists are established: they include the new terminology and taxonomic data, and use schematic symbols which permit a quick visualization of the determination criteria (e.g. in the genera Amphorula DODEKOVA 1969 and Palaeotetradinium DEFLANDRE 1936).</p
Paramètres physiques expérimentaux de roches de la croute continentale intermédiaire à profonde
L'intérêt de cette étude est l'analyse des effets des changements de la lithologie, du degré de métamorphisme et de l'anisotropie sur la réflectivité sismique de la croûte continentale intermédiaire à profonde, telle qu'elle se trouve représentée par la Zone d'Ivrée.
Pour réaliser ce travail un équipement expérimental pour la mesure de paramètres physiques de roches, à haute pression (400 MPa), a été développé. Le système est contrôlé par un dispositif informatisé.
On a mesuré sur 55 échantillons, représentant des lithologies et des faciès métamorphiques différents, les vitesses sismiques de compression (p) et de cisaillement (s), les densités brutes et de matrice ainsi que la susceptibilité magnétique initiale.
Les vitesses obtenues confirment la règle que la vitesse perpendiculaire au plan de structuration de la roche est la plus faible alors que celle correspondant à la linéation est la plus grande. On observe que le taux d'anisotropie moyen est par exemple de l'ordre de 10% dans les paragneiss.
Nos résultats indiquent que le contraste d'impédance acoustique est suffisant entre les divers lithologies et les faciès métamorphiques pour être la cause des réflexions observées sur les profils sismiques profonds.
Les calculs du pouvoir réflecteur appliqués à un profil géologique synthétique, montrent de nombreuses possibilités de réflexion. Ceci se compare à la forte densité de réflecteurs discontinus visibles sur les coupes sismiques et permettrait leur interprétation.</p
L'étude de la rotation stellaire dans les stades avancés de l'évolution
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