Innovation and Development in Agriculture and Food

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    Seroprevalence of SARS-CoV-2 in wet market workers in Dhaka, Bangladesh in 2022

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    Objectives: We assessed the transmission of SARS-CoV-2 and vaccine receipt in a representative sample of wet market workers in a highly dense, low-income setting. Wet markets are key in many Asian settings, including Dhaka, Bangladesh, for fresh food, including animal protein. Methods: During early 2022, we assessed the prevalence of anti-SARS-CoV-2 antibodies in a random sample of poultry and vegetable workers in 15 wet markets, and investigated associations with socio-demographic characteristics and COVID-19 vaccination. Results: In the 204 poultry workers and 87 vegetable sellers recruited, COVID-19 vaccine uptake was similar (69% vs 67%). The most common vaccines were whole inactivated vaccines (Sinopharm or Sinovac; 44%). Nearly all (99%) participants were positive for anti-SARS-CoV-2 spike antibodies. Anti-SARS-CoV-2 nucleocapsid antibodies, indicative of recent infection, was 59.4% (95% confidence interval 54.7-64.0%). There was no evidence that the latter was associated any characteristics, except vaccination (adjusted odds ratio 0.49; 95% confidence interval 0.23-1.02; P = 0.093). Conclusions: The ubiquity of anti-spike and high prevalence of anti-nucleocapsid antibodies were consistent with high transmission after three previous pandemic waves. Wet markets have a potential role amplifying transmission of airborne pathogens, such as SARS-CoV-2 and Avian Influenza Viruses, and an important public-facing hotspot for close monitoring for future emerging infections

    Creating new opportunities for plantation managers: The TALENT Programme

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    The TALENT (TrAining on LandscapE maNagement) programme was designed to raise awareness about sustainable agriculture and the environment among current and future managers of tree-crop plantations. The main objective of the partnership is to develop specific training activities that will disseminate agro-environmental best practices. To achieve this, the project targets four countries (Indonesia, Malaysia, Vietnam and Thailand) and four major commodities (oil palm, rubber, timber and pulp). We have selected a group of six partner universities with the common aim of reaching four different audiences: Masters students, managers of large plantations, managers of smallholder cooperatives and bank executives. The TALENT Programme will create a network of decision-makers who understand and apply the key principles of sustainability, based on their experience in the field. TALENT also develops specific training activities for the finance sector. These will link the current challenges in plantation agriculture to the financing of sustainable plantations and stimulate their development. The TALENT initiative is revising existing master and bachelor's programs and organizes regional seminars and visits to sites of interest. This allows the partnership to reach out directly to producers, financial actors and academic partners. In addition to face-to-face teaching, the e-TALENT sub-project provides online resources to all learners interested in plantation sustainability in Southeast Asia. TALENT is funded by Agence Française de Développement and implemented by CIRAD, the French Agricultural Research Centre for International Development

    Using random forest algorithm to improve Ceutorhynchus napi GYLL. (Coleoptera: Curculionidae) occurrence forecasting

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    Random Forest algorithm was used to predict on-field presence probability of rape stem weevil in France as a function of climatic and landscape variables, based on a long-term and multisite data set. A first version of the model included a set of 342 variables. A variable selection procedure was used to retain only the 15 most influential variables without significant drop in predicting performances. Most retained variables were temperature related and results showed that the sum of maximum daily temperature above 9°C during the week preceding observation was the predictor with the largest influence on rape stem weevil occurrence. This model reached a mean AUC of 0.77 and outperformed some other published models. As such, this model can help farmers to precisely time insecticide application. It has been integrated in a decision support system freely available in the Terres Inovia (French applied agricultural research and development institute dedicated to oilseed crops) website

    Assessing antibiotic use practices on central Burkina Faso cattle farms and the associated risks to environmental and human health contamination: A pilot study

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    Background and Aim: Antimicrobial resistance (AMR) poses a significant threat to global health, driven largely by antibiotic misuse in livestock farming. This pilot study explores cattle farmers' antibiotic use practices and their implications for environmental and human health in peri-urban area of Ouagadougou. This study aimed to identify risky antibiotic use behaviors among cattle farmers and evaluate their contribution to environmental contamination and AMR dissemination. Materials and Methods: In April 2023, a survey was conducted among 50 cattle farm owners and managers across four peri-urban area of Ouagadougou, Burkina Faso. Data were collected using structured questionnaires through Kobo Toolbox. Farmers' practices were categorized as “good” or “poor” based on cumulative scores derived from binary-coded responses. Logistic regression was used to identify associations between practices and AMR risk factors. Results: Among participants, 98% (n = 49) were male, 76% (n = 38) had no formal animal health training, and 96% (n = 48) used antibiotics, primarily tetracyclines. Practices associated with increased AMR risk included reliance on non-veterinary personnel for antibiotic administration and inadequate waste management. Multivariate analysis revealed that traditional farming methods significantly reduced contamination risks (p < 0.05). However, ownership of farms and using antibiotics solely for treatment were linked to higher odds of environmental contamination. Awareness of the implications of antibiotic residues in manure was low, with 82% of farmers uninformed about potential health risks. Conclusion: The study highlights prevalent antibiotic misuse and inadequate biosecurity measures among cattle farmers in Burkina Faso. These practices exacerbate AMR risks, necessitating urgent interventions. Strategies should include farmer education on biosecurity, stricter regulation of antibiotic use, and the promotion of sustainable farming practices. A One Health approach integrating human, animal, and environmental health is critical to addressing AMR challenges

    Chapitre 1 : Renseigner les usages de pesticides dans cinq filières tropicales et évaluer les risques liés à ces usages

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    L'usage des pesticides s'est répandu de manière très importante avec le développement de l'agriculture intensive, tous les continents sont concernés. Selon la FAO, en 2022, près de 3.70 millions de tonnes de pesticide ont été utilisées par l'agriculture dans le monde contre moitié moins en 1990. Ces usages ne sont pas sans impacts sur l'environnement et sur la santé humaine. Par ailleurs, ces usages sont aussi nécessairement hétérogènes d'un pays à l'autre, d'une filière à l'autre. L'initiative Pretag vise à apporter des connaissances plus précises sur ces usages en réalisant un inventaire des pesticides utilisés dans cinq filières de production tropicales (banane, café, cacao, maraîchage et riz), à analyser leur utilisation et à évaluer les risques associés. La mobilisation des résultats d'enquêtes menées dans de précédents projets ou dans certains cas de données spécialement acquises dans le cadre de Pretag dans des pays d'Amérique Latine, d'Afrique subsaharienne et du Sud Est Asiatique nous a permis d'inventorier l'utilisation de 300 produits phytopharmaceutiques lesquels sont constitués de 92 substances actives différentes. Sur la base de l'évaluation des risques sanitaires et environnementaux de ces 92 substances réalisée à l'aide de cinq indicateurs (IRSA, BROWSE, ACV (Santé humaine et Environnement) et I-PHY), cette étude a permis d'identifier 39 d'entre elles comme préoccupantes. Nous avons affiné cette évaluation en confrontant les résultats de ces 5 indicateurs à ceux de 4 autres indicateurs de la base de données PPDB1 (Human health, Ecotoxicity et Environmental fate) et le classement CMR2. Au terme de cette analyse, cinq substances actives hautement préoccupantes ont été identifiées, trois insecticides : le chlorpyrifos, l'endosulfan et le terbufos ainsi que deux fongicides : le chlorothalonil et le cyproconazole. Toutes les filières étudiées sont concernées par au moins une de ces substances actives. Malgré les différences méthodologiques entre les indicateurs, on constate une convergence de classement selon la dangerosité d'un tiers des substances actives. Différentes limites méthodologiques de cette étude sont discutées. Globalement, l'approche que nous proposons visant à combiner différents indicateurs pour évaluer les impacts sanitaires et environnementaux des pesticides permet de contrecarrer les limites de chaque indicateur pris isolément. Il est également important de considérer que la variable d'entrée des indicateurs est la substance active et ne considère pas la dangerosité des produits de dégradation de ces dernières souvent plus persistantes dans les milieux. Les indicateurs ne prennent pas en compte non plus les effets synergiques et/ou cumulatifs des substances actives ni même les effets de la formulation des pesticides et des co-formulants et/ou des adjuvants des produits commerciaux. Enfin, les scenarii d'usage choisis pour permettre les calculs de ces indicateurs se sont basés sur les conditions d'usage des bonnes pratiques phytosanitaires (applicateurs protégés, traitement au bon moment, à bonne distance d'un point d'eau…) ne reflétant très probablement pas la réalité et minimisant, de facto, les niveaux de risques que nous avons calculés. Les suites possibles du WP1 sont ensuite abordées afin d'identifier : i) comment améliorer l'évaluation des usages des pesticides dans les filières de production tropicales pour en limiter les risques de transfert vers l'environnement, ii) comment limiter les risques pour la santé humaine en proposant notamment le développement d'un outil d'aide à la décision numérique pour permettre aux producteurs/applicateurs d'avoir accès eux-mêmes à la dangerosité des produits et iii) comment compléter l'approche par indicateurs par le déploiement d'outils d'échantillonnage à bas coûts de type EPI (échantillonneurs intégratifs passifs)

    Chapitre 4 : Les plateformes multi-acteurs et leur accompagnement en appui à la réduction de l'usage des pesticides : retour d'expérience Pretag

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    Au démarrage de l'initiative Pretag, nous avons émis l'hypothèse que des “plateformes multi-acteurs" organisées par filière pouvaient être des leviers importants de la réduction de l'usage des pesticides dans les agricultures du Sud compte tenu de l'appui souvent limité dont bénéficient ces agricultures en termes de services et conseils, de formations disponibles, de politiques publiques d'accompagnement à la transition. Au cours de ces deux années de l'étude, nous avons expérimenté à travers 5 cas d'étude filières (banane dessert, cacao, café, maraichage périurbain, riz) comment ces plateformes pouvaient émerger et se structurer. La méthodologie utilisée a été basée sur l'analyse des retours d'expérience des chercheurs en termes de connaissances des acteurs et d'accompagnement de la transition et sur la mobilisation de la démarche ImpresS. Nous avons pu constater l'intérêt de la part de nombreuses catégories d'acteurs (de l'amont à l'aval de la filière) pour l'action collective que constituent ces plateformes. Elles permettent l'échange d'informations et la création une dynamique de co-construction de trajectoire de progrès et d'impact. Elles permettent également le développement d'interactions à bénéfices réciproques entre le secteur de la recherche et les différents acteurs du changement. La nature des acteurs représentés dans ces plateformes et leur périmètre d'action sont naturellement liés au type de chaîne de valeur mais il est important que les producteurs y occupent une place centrale car ils sont au coeur de la décision et directement impactés par les coûts de la transition. Les plateformes des filières export doivent de facto inclure les acteurs de l'aval de la filière (transformateur, metteur en marché, grande distribution), en particulier dans le cas de filières export. Les plateformes des filières d'approvisionnement local peuvent s'organiser à l'échelle territoriale, par filière et/ou en inter-filières. Nous avons identifié, quel que soit la nature de la filière considérée, 6 étapes clé de fonctionnement des plateformes qui constituent une forme de “cadre conceptuel” qui pourra servir de guide pour la suite des travaux initiés dans Pretag et pour le lancement de nouvelles actions collectives. Ces étapes clé concernent : Nous avons identifié, quel que soit la nature de la filière considérée, 6 étapes clé de fonctionnement des plateformes qui constituent une forme de “cadre conceptuel” qui pourra servir de guide pour la suite des travaux initiés dans Pretag et pour le lancement de nouvelles actions collectives. Ces étapes clé concernent : - la préparation du lancement de la plateforme pour pré-identifier les acteurs du changement et rassembler les retours d'expériences en matière de réduction des pesticides, - la réunion d'un premier panel d'acteurs pour partager les connaissances sur la réduction des pesticides et identifier les cadres de contraintes des différents acteurs, - la co-construction d'une vision commune globale de la transition et d'un chemin d'impact vers la réduction de l'usage des pesticides avec le panel d'acteurs, - la co-construction d'un plan d'action avec les acteurs les plus motivés, basé sur un “périmètre actionnable” de la transition, - le développement de sites pilotes pour tester les alternatives techniques de réduction et tester également les hypothèses de valorisation par les marchés de la démarche de transition, - l'animation de la plateforme tout au long du processus de sa construction et de son développement. En deux ans, nous n'avons pu que partiellement expérimenter le fonctionnement des plateformes sur les cinq filières, notre retour d'expérience concerne cependant les points suivants : - le temps long nécessaire à l'appropriation par les acteurs de la démarche et à la compréhension/reconnaissance par tous de la diversité des cadres de contraintes des différents acteurs, - le passage critique entre l'étape 3 et 4, l'étape 4 correspondant à un engagement fort et opérationnel des acteurs dans la démarche de réduction des pesticides, - la “souplesse” nécessaire au développement de la démarche avec une capacité d'adaptation des 6 phases en fonction des spécificités des filières et de la réactivité des acteurs, des expériences déjà existantes en matière de réduction des pesticides, - à côté de la dimension technique et partenariale de la transition à prendre en compte dans la construction du plan d'action, la place clé de l'identification des couts de la transition et de solvabilisation de ces coûts, - la place déterminante du secteur de la recherche pour soutenir et animer l'émergence et le fonctionnement de la plateforme. La suite envisagée pour le WP4 concerne en priorité le développement d'indicateurs d'évaluation des coûts des innovations ainsi que des indicateurs multicritères d'évaluation des compromis entre les performances environnementales, sociales et économiques des transitions. Elle concerne également les liens à développer entre les actions portées par des acteurs privés dans le cadre de ces plateformes avec les actions portées par les décideurs publics dans le cadre de leur politique d'appui aux transitions. Elles concernent enfin une réflexion sur le passage à l'échelle de la transition par rapport au plan d'action décidé par les acteurs

    Comment cultiver plus de légumineuses? 5 fiches techniques en Afrique de l'Ouest

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    Ce document rassemble 5 fiches techniques issues de travaux de recherche, dans le but de présenter les stratégies permettant de cultiver plus de légumineuses : les associations de culture, les rotations et la diversification des légumineuses pour l'alimentation humaine ou animale. Ces fiches sont à destination des agriculteurs, conseillers, techniciens, étudiants, et tous les acteurs de la recherche et du développement en Afrique de l'Ouest

    Advancing breeding for climate-resilient yam production in Côte d'Ivoire

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    Societal Impact Statement Yam plays an important role in ensuring food security in Côte d'Ivoire, serving as a staple crop for 60% of the population and a significant source of income. It holds deep cultural significance for the Akan and Gour ethnic groups. Preserving yam production is essential for both food security and the preservation of cultural heritage. However, productivity is decreasing while demand is expected to double in the next 30 years. Soil degradation and climate change are major threats to yam production. This article contextualizes the main factors threatening yam production (i.e., soil degradation and climate change) and discusses the consequences and ways to mitigate them. Summary The anticipated twofold increase in Côte d'Ivoire's population within the next three decades poses a significant challenge for agricultural research to sustain food security. Despite being an under-researched and often neglected crop, yam remains the primary staple food and a crucial source of income in the country. With an annual estimated market value of over 2000 billion CFA francs, yam ranks among the top five most economically valuable crops in Côte d'Ivoire. For the past 15 years, yam production has experienced a decline in productivity, which has been compensated for by expanding the cropped area. Unfortunately, this approach exacerbates the risk of deforestation and soil degradation. Additionally, the impact of climate change on yam production, coupled with a lack of financial resources to address it, has rendered this unsustainable mode of production even more precarious. The purpose of this study is to provide an overview of the effects of climate change on yam production in Côte d'Ivoire. We investigated the reasons for the productivity decline and described the risks on food security. Furthermore, we explained how varietal innovation of Dioscorea alata could play a critical role in mitigating these effects and outlined related research avenues that need to be explored. To help policymakers and research programme directors justify the importance of this agenda, this article presents the main arguments in favour of a substantial investment in adapting yam production to the global changes affecting Côte d'Ivoire

    Root growth and belowground interactions in spring wheat / faba bean intercrops

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    Background and aims: Intercrops offer multiple advantages over sole crops. The aim of our study was to characterize root growth and interactions in spring wheat/faba bean intercrops to better understand belowground interactions that govern resource capture. Materials and methods: A field experiment was conducted with one faba bean cultivar and two spring wheat cultivars sown at three sowing densities, defining three intercropping designs. Destructive root coring was conducted (0–100 cm) in the intercrops and sole crops at two development stages. FTIR spectroscopy was used to discriminate the species' root masses. The plant-plant interaction index was calculated to represent the belowground interactions. Results: A negative impact of intercropping on total root mass was observed in the treatment with high sowing density in both stages. For the fully and partial replacement design treatments, plant-plant facilitation was more pronounced than competition in all layers. Competition dominated root growth in the treatment with high sowing density in both stages. Lower sowing densities encouraged deep root growth of wheat (both cultivars) in intercropping. The early root growth in depth and in density of one spring wheat cultivar impacted negatively faba bean root growth. Intercropping resulted in a grain yield advantage in both fully and only one partial replacement design treatment. Conclusion: In the intercrops, total root mass and plant-plant interactions were affected more by sowing density than by the spring wheat cultivar. Understanding the effect of sowing density on root growth in intercropping can help to support the design of sustainable intercropping systems

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