Bollettino del CILEA
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STRUMENTI COMPUTAZIONALI PER LA MEDICINA E LA BIOLOGIA: DINAMICA MOLECOLARE DI PROTEINE E DNA
Le simulazioni di dinamica molecolare consentono di analizzare la struttura e la flessibilità di macromolecole importanti dal punto di vista biomedico, come proteine e DNA. Questo permette di studiare le cause di molte malattie genetiche, spesso provocate da una mutazione di un gene che codifica per una proteina, ma anche di progettare nuovi farmaci più efficaci. In particolare, lo studio delle mutazioni che insorgono su proteine di membrana come i canali ionici voltaggio-dipendenti permettono di delucidare i meccanismi molecolari alla base delle più importanti patologie neurologiche e muscolari. Le moderne risorse di calcolo parallelo, basate sui nuovi processori GPU ad architettura multi-core, consentono di estendere la simulazione di questi sistemi biologici su scale di tempo molto maggiori e quindi di modellare funzioni biologiche più complesse. Ma lo sviluppo non è solo nelle tecnologie. Nuovi algoritmi e campi di forza che regolano le interazioni inter-atomiche vengono continuamente proposti e implementati nell’ambiente di calcolo del CASPUR
I SERVIZI ICT DAL WEB 2.0 AL CLOUD COMPUTING: COSA CAMBIA PER GLI UTENTI
La metafora della “rete” [1] è spesso applicata sia a Internet che al suo principale servizio, il World Wide Web, con l’obiettivo di sottolineare, da un lato, la possibilità per ogni nodo di essere sia emittente che destinatario di comunicazioni; dall’altro, l’assenza di un centro unico [2]. Nonostante l’universalità attribuita a tale affermazione, il modo in cui il web si è affermato ed evoluto ha portato a identificare diverse fasi di sviluppo, più o menocontestate e contestabili [3]. Senza ombra di dubbio, a cambiare radicalmente l’ecosistema di rete è stata non tanto l’introduzione di tecnologie assolutamente innovative dal punto di vista tecnico, quanto l’affermazione di standard e idee progettuali talmente apprezzate dagli utenti da decretarne uno straordinario successo. Ed è proprio ai cambiamenti nelle loro pratiche che volgiamo lo sguardo in questo articolo
CAPI2000 - Calcolo ad Alte Prestazioni in Italia
Workshop 26-27 settembre 2000: titoli e abstracts degli interventiApplicazioni e prospettive del calcolo parallelo nella bionformatica di proteine e DNA.Ottimizzazione termofluidodinamica di una paletta di turbina mediante l'accoppiamento CFX-FRONTIER con algortimi generici
Attività didattiche e formative del CILEA
Sistemi e Reti (HP SPP2000/XA, Sistema Operativo Unix)INTERNETAutomazione d'Uffici