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    L'adversaire comme text médiane: le traitement du fait divers et la construction d'un royaume chez Carrère suivi du texte de création Filibuste

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    The research segment of this master's thesis offers a study of the use of "anecdotal news" (in French, "fait divers", literarily "diverse facts") in Emmanuel Carrère's L'adversaire (2000). By undertaking a research process similar to the one made by Truman Capote for its In Cold Blood (1965), a critically acclaimed book that also adapted an anecdote published in the news, Carrère is confronted by a narrative problem, which concerns the place of the "I" of author when relating the story. After In Cold Blood, Capote was never able to finish a written work and following L'adversaire, Carrère went away from the novel as a form in the first half of his texts in order to create more hybrid forms that make reality cohabit with fiction. The writers of "fait divers" create and meet their fictional twin while taking about a real subject and, for Carrère, the integration of anecdotal news does not completely stop his literary activities, but it definitely transforms the way they are narrated. The second segment of this master's thesis offers a creative work titled Filibuste and links together, in different sections of text, testimonies or reconstituted events narrated from the first-person singular. The text gives voice to four women, a mother and her three daughters, who are the collateral victims of an anecdote that went over the news. It is the father's story that is being told, but the reader is never given its perspective. The motorcycle accident, which the text refers to, was taken from a real incident, but the testimonies of the four women and their familial lives belong to fiction. The use of "fait divers" and the intertwinement of fiction and reality constitute the principal links that unite the two segments of this master's thesis.Le volet critique de ce mémoire propose une étude de l'utilisation du fait divers chez Emmanuel Carrère dans L'adversaire (2000). En s'engageant dans une recherche de terrain semblable à celle effectuée par Truman Capote pour écrire De Sang-Froid (1965), une œuvre phare dont la prémisse est aussi un fait divers réel, Carrère fait face à une problématique de narration qui concerne la place que doit occuper le «je» de l'écrivain lorsqu'il relate le fait vécu. Après De Sang-Froid, Capote n'a plus été en mesure d'écrire une œuvre complète et suite à L'adversaire, Carrère s'est éloigné de la forme romanesque de la première moitié de ses textes pour se tourner vers une forme plus hybride qui fait cohabiter le réel et la fiction. Les écrivains du fait divers rencontrent et écrivent leur miroir d'encre en abordant un sujet réel et pour Carrère, la portée du fait divers ne mène pas à l'arrêt complet de toute activité littéraire, mais transforme sa narration de manière définitive. La deuxième partie de ce mémoire propose un texte de création qui s'intitule Filibuste et regroupe plusieurs parties divisées en témoignages ou en reconstitutions d'événements narrées à la première personne du singulier. Le texte donne la parole à quatre femmes, une mère et ses trois filles, qui sont les victimes collatérales d'un fait divers. Le père est celui dont l'histoire est racontée, mais la parole ne lui est jamais accordée. L'accident de moto auquel le texte fait référence est basé sur un fait réel, mais les témoignages des quatre femmes et leur vie de famille appartiennent à la fiction. L'utilisation du fait divers et le mélange du réel et de la fiction constituent le lien principal qui unit les deux volets de ce mémoire

    Intracerebral epidemic spreading of alpha-synuclein pathology in a mouse model of Parkinson's disease

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    Progressive and stereotypical spread of aggregated, misfolded proteins is a common feature of many neurodegenerative diseases, including Parkinson's disease (PD). Animal models, where misfolded proteins are intracerebrally injected, robustly show a similar spread of pathology to anatomically connected regions. Neuroimaging studies have also shown that neurodegenerative diseases preferentially attack different, intrinsic brain networks. Computational models that conceptualize the spread of misfolded proteins as the underlying cause of those imaging patterns further complement the animal model observations. Yet, to date, there has been little attempt to combine these two approaches. The overarching objective of this project was to evaluate a computational "Epidemic Spreading Model" (ESM) using the α-synuclein (αsyn) inoculation mouse model for PD, as it is well-suited for spatial and temporal control over the spread of misfolded proteins. We injected misfolded αsyn pre-formed fibrils (PFFs) into the anterior olfactory nucleus (AON) of wild-type (WT) and M83 (hemi- and homozygous) transgenic (TG) mice. After 4 months, the PFF-inoculated mice all developed αsyn pathology and an olfactory deficit. WT mice were further assessed with longitudinal, in vivo MRI, and showed region-specific volume changes compared to control-injected mice. From these same mice, we generated whole brain, 3D quantitative immunohistochemistry (qIHC) maps of αsyn pathology burden that were used to perform ESM. Using connectivity measures defined from publicly-available tract tracer studies, and also defined from an advanced diffusion MRI protocol we acquired on WT and TG mice, the ESM successfully reproduced the pattern of αsyn pathology in WT mice. In TG mice, the model was successful after applying a simple correction to account for pathology influenced by transgene overexpression. Across behavioral measures, qIHC analyses, and computational modeling, results of WT and TG mice were complementary. We have demonstrated that a computational model works well to describe pathology in a mouse model for PD, and their combined use could be valuable in evaluating potential therapies aimed at slowing or halting the aggregation and spread of misfolded αsyn.La propagation progressive et stéréotypée de protéines agrégées et mal repliées est une caractéristique commune à de nombreuses maladies neurodégénératives, dont la maladie de Parkinson (MP). L'injection intracérébrale de protéines mal repliées à des modèles animaux démontre fortement une propagation de la pathologie similaire dans régions connectées anatomiquement. Des études de neuro-imagerie ont également montré que les maladies neurodégénératives attaquaient préférentiellement différents réseaux cérébraux intrinsèques. Les modèles informatiques qui conceptualisent la propagation des protéines mal repliées comme cause sous-jacente de ces modèles d'imagerie complètent davantage les observations du modèle animal. Pourtant, à ce jour, peu de tentatives ont été faites pour combiner ces deux approches. L'objectif principal de ce projet était d'évaluer un "modèle de propagation épidémique" (MPE) à l'aide du modèle murin d'inoculation de l'α-synucléine (αsyn) pour la MP, ce dernier étant bien adapté pour un contrôle spatial et temporel de la propagation de protéines mal repliées. Nous avons injecté des fibrilles synthétiques préformées (PFF) d'αsyn mal repliées dans le noyaux olfactif antérieur (NOA) de souris de type sauvage (TS) et M83 (hémi- et homozygotes) transgéniques (TG). Après 4 mois, les souris inoculées avec les PFF ont toutes développé une α-synucléinopathie associée à un déficit olfactif. L'évaluation des souris TS par imagerie par résonance magnétique (IRM) longitudinale in vivo a démontré des changements de volume spécifiques à certaines régions par rapport aux souris contrôles. À partir des données de ces souris, nous avons généré des cartes d'immunohistochimie quantitative en 3D (IHCq) du cerveau entier de la charge pathologique d'α-synucléine utilisées pour réaliser le MPE. En utilisant des données de connectivité définies publiées sur l'étude de traceurs, et également à partir d'un protocole avancé d'IRM de diffusion que nous avons acquis sur les souris TS et TG, le modèle MPE a reproduit avec succès le modèle d'α-synucléinopathie chez les souris TS. Chez les souris TG, le modèle a fonctionné suite à l'application d'une simple correction pour tenir compte de la pathologie influencée par la surexpression du transgène. À travers les mesures comportementales, les analyses d'IHCq et la modélisation informatique, les résultats des souris TS et TG étaient complémentaires. Nous avons démontré qu'un modèle informatique fonctionne adéquatement pour décrire la pathologie dans un modèle de souris pour la MP et que leur utilisation combinée pourrait s'avérer utile pour l'évaluation de thérapies potentielles visant à ralentir ou stopper l'agrégation et la propagation de proteines d'αsyn mal repliées

    Two faces of revolutionary consciousness: solidarity and ideology in the Arab Spring

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    Twentieth-century theorists of revolution focused on articulating what conditions were necessary for motivating transformative political change. In particular, theorists were concerned with the concept of consciousness raising. V.I. Lenin's theory famously argued that consciousness – an understanding of the inner-workings of one's unfreedom – must be brought to people by revolutionary vanguards. Leninist theory was later challenged when post-colonial theorists such as Ranajit Guha rejected the claim that people require their consciousness to be raised by external actors. Guha's work showed that rebels can be conscious on their own terms by highlighting evidence of oppositional consciousness in peasant insurgents in colonial India. My thesis situates itself in this debate by answering the question: what is it that will make people with legitimate claims against existing powers articulate and act on this claim in a way that radically shifts the current political order? Overlaying my argument on the early uprisings in the Arab Spring, I argue that Lenin and Guha describe two crucial, but conceptually distinct forms of political consciousness. Guha's articulation of oppositional consciousness, I argue, answers the first form of the question: rejecting one's subordinate status through solidarity and self-identification with others of the same status will bring about political contestation. Lenin's conception of revolutionary class consciousness answers the second part: a cohesive and public counter-ideology to that of the status-quo is required to challenge and shift hegemonic political practices. Guha's oppositional consciousness leads a revolution to what Asef Bayat calls 'revolution as movement': the radical mobilization and solidarity of political subjects against existing powers. However, the deciding factor for whether the political order will shift or restore is dependent on which actor(s) cohesively articulate the source of peoples' unfreedom, as well as a blueprint for a freer order. This is what Bayat deems 'revolution as change,' which he argues failed to materialize during the Arab Spring. Just as Bayat argues for a conceptual distinction between movement and change, my thesis complements his concepts through mirroring conceptions of revolutionary consciousness. As a result, my argument shows that Lenin's and Guha's conceptions of consciousness are distinct and complementary rather than rivalling accounts.Les théoriciens de la révolution du XXe siècle ont cherché à définir quelles conditions étaient nécessaires pour motiver un changement politique transformateur. En particulier, les théoriciens se sont intéressés au concept sensibilisation. La théorie de V.I. Lénine affirmait que la conscience - une compréhension du fonctionnement interne de la non-liberté d'une personne - devait être amenée du «dehors» par des avant-gardes révolutionnaires. Par la suite, certains théoriciens post-coloniaux tels que Ranajit Guha ont contesté la théorie léniniste en rejetant l'affirmation selon laquelle les individus exigent que leur conscience soit élevée par des acteurs extérieurs. Les travaux de Guha ont montré que les rebelles peuvent être conscientes selon leurs propres termes, en mettant en évidence des preuves de la conscience opposée chez les paysans insurgés de l'Inde coloniale. Ma thèse se situe dans ce débat en répondant à la question: qu'est-ce qui assurera que ceux qui ont des revendications légitimes contre les pouvoirs existants articulent et agissent sur cette revendication d'une manière qui modifie radicalement l'ordre politique actuel? En reprenant mon argument sur les premières étapes du Printemps arabe, je soutiens que Lénine et Guha décrivent deux formes cruciales, mais conceptuellement distinctes, de la conscience politique. Je soutiens que la formulation par Guha de la conscience oppositionnelle répond à la première forme de la question: rejeter son statut de subordonné par la solidarité et l'auto-identification avec des personnes du même statut suscitera une contestation politique. La conception de Lénine de la conscience de classe révolutionnaire répond à la deuxième partie: une contre-idéologie cohérente et publique qui s'oppose à celle du statu quo est nécessaire pour défier et modifier les pratiques politiques hégémoniques. La conscience oppositionnelle de Guha mène une révolution à ce que Bayat appelle «la révolution en tant que mouvement»: la mobilisation radicale et la solidarité des sujets politiques contre les puissances existantes. Cependant, le facteur décisif pour savoir si l'ordre politique changera ou restaurera dépend de quel (s) acteur (s) énonce de manière cohérente la source de la non-liberté des peuples, ainsi qu'un plan pour un ordre plus libre. C'est ce que Bayat considère comme étant une «révolution en tant que changement», qui selon lui n'a pas réussi à se matérialiser lors du Printemps arabe. Tout comme Bayat plaide pour une distinction conceptuelle entre le mouvement et le changement, ma thèse complète ses concepts en reproduisant cette dualité, cette fois-ci appliquée à conscience révolutionnaire. En conséquence, mon argument montre que les conceptions de la conscience de Lénine et de Guha sont distinctes et complémentaires plutôt que rivales

    Hippocampal shape and volume alterations in youth born with a congenital heart defect

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    There is a high prevalence of neurodevelopmental impairments in individuals living with congenital heart disease (CHD) and the neural correlates of neurodevelopmental impairments are not yet fully understood. Recent studies have shown that hippocampal volume and shape differences may provide unique biomarkers for neurodevelopmental disorders. The hippocampus is vulnerable to early life injury, especially in populations at risk for hypoxia or ischemia such as in neonates with CHD. Therefore, we compared hippocampal grey and white matter volume and morphometry between youth born with CHD aged 16-24 years and healthy peers. We also explored whether hippocampal volume and morphometry are associated with executive function and self-regulation deficits. To do so, participants underwent 3T brain magnetic resonance imaging and completed the self-reported Behaviour Rating Inventory of Executive Function, Adult version. Hippocampal circuitry was segmented using the Multiple Automatically Generated Templates brain segmentation algorithm to extract volume and morphometry. We found that youth with CHD had smaller hippocampal volumes (all statistics corrected for False Discovery rate; q<0.05) as compared to controls. We also observed significant smaller surface area bilaterally and inward displacement on the left hippocampus predominantly on the ventral side (q<0.10) in the CHD group that were not present in the controls. Left CA1 and left CA2/3 volumes were negatively associated with working memory performance (p<0.05). No associations between hippocampal morphometry and executive function and self-regulation were found. This study is the first report of hippocampal morphometric alterations in youth born with CHD when compared to healthy peers, as well as, structure-function relationships between hippocampal volumes and EF and self-regulation. These differences may reflect long-lasting early life brain alterations that are present in these at-risk neonates with CHD.Le taux de troubles neurodéveloppementaux chez les personnes vivant avec une cardiopathie congénitale est très élevé, cependant, les mécanismes neuraux de ces troubles neurodéveloppementaux ne sont pas encore bien compris. Des projets de recherche ont montré que les différences de volume et de morphométrie de l'hippocampe peuvent fournir des biomarqueurs uniques pour certain de ces troubles neurodéveloppementaux. L'hippocampe est susceptible aux lésions en début de vie, surtout chez les populations à risque d'hypoxie, telles que les nouveau-nés atteints de cardiopathie congénitale. Par conséquent, nous avons comparé le volume de la substance grise et blanche et la morphométrie de l'hippocampe entre des jeunes nés avec une cardiopathie congénitale âgés de 16 à 24 ans et des jeunes adultes en bonne santé. Nous avons également examiné si le volume et la morphométrie de l'hippocampe étaient associés à des difficultés de fonction exécutive et d'autorégulation. Les participants ont été soumis à une imagerie par résonance magnétique du cerveau et ils ont complété un questionnaire de FE et d'autorégulation. L'hippocampe a été segmenté à l'aide de l'algorithme de « segmentation cérébrale de modèles générés automatiquement » pour obtenir le volume et la morphométrie. Les jeunes atteints de cardiopathie congénitale présentaient avec des volumes d'hippocampe plus petits comparé aux contrôles (q<0.05). Un plus petit volume des surfaces bilatérales de l'hippocampe et des déplacements internes de l'hippocampe gauche, principalement sur le côté ventral (q<0.10) ont été observé uniquement chez les jeunes atteints de cardiopathie congénitale. Le volume de la région 1 de la corme d'Ammon (CA) gauche et de la CA2/3 gauche étaient associés avec une moins bonne mémoire de travail (p<0.05). En ces résultats, nous rapportons, pour la première fois, des altérations morphométriques de l'hippocampe chez des adolescents et des jeunes adultes nés avec une cardiopathie congénitale qui ne sont pas présents chez les contrôles, ainsi que des relations entre les volumes de l'hippocampe et la FE et l'autorégulation. Ces différences pourraient refléter des altérations persistantes du maldéveloppement cérébral précoce de ses enfants à haut risque

    Deconstructing the air-liquid-interface: the role of oxygen in epithelial cell differentiation

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    Current airborne particulate toxicity screens require the culture of a ciliated, pseudostratified epithelium to achieve physiologically accurate cytotoxicity data. Air-liquid interface (ALI) is the de facto standard technique that is used to drive differentiation of epithelial cells towards an in vivo-like phenotype. This technique consists of exposing the apical side of the cellular surface to ambient incubator air, and the basal surface to culture medium which diffuses through a porous substrate. Microporous filters are most commonly used to achieve ALI for human bronchial epithelial cell (HBEC) culture. However, these filters are expensive and difficult to handle, and it remains unclear which biophysical cues specific to this culture system promote differentiation. Understanding how defined microenvironmental cues drive ALI-related differentiation is the first step towards eliminating the need for this complex culture processing condition. In this thesis, I hypothesize that exposure to increased oxygen levels present on the air-side of the ALI culture would trigger HBEC differentiation. Hence, properly designed hyperoxic culture system would eliminate the need for an ALI in in vitro pulmonary health studies. In this thesis, a model human bronchial epithelial cell line was used to confirm that cells were sensitive enough to minute oxygenation differences arising from the addition of an apical media layer during culture. A finite element simulation was designed to model the oxygen diffusion gradient present in apical media during submerged culture. This model aided us in the design of our hyperoxic incubator conditions. HBECs were then cultured in standard/ALI, standard/submerged and hyperoxic/submerged conditions and it was found that hyperoxic/submerged culture surprisingly promoted the highest level of differentiation. This work shows that ALI is not necessary for HBEC differentiation and that other microenvironmental characteristics of the filter culture system work in conjunction with proper oxygenation to allow for HBEC differentiation. A better understanding of these microenvironmental cues gained through these experiments can hence guide the design of novel high-throughput culture systems for airborne particulate toxicity studies.Les études actuelles sur la toxicité des particules nécessitent un épithélium cilié et pseudostratifié pour atteindre des résultats de cytotoxicité pertinents. L'interface air-liquide (IAL) est la technique de facto utilisée pour promouvoir la différenciation de cellules épithéliales vers un phénotype ressemblant celui in vivo. Cette technique consiste d'exposer le côté apical de la surface cellulaire à l'air ambiant et la surface basale au milieu de culture qui diffuse à travers un substrat poreux. Les filtres microporeux sont traditionnellement utilisés pour atteindre une interface air-liquide durant la culture de cellules épithéliales bronchiques humaines (CÉBHs). Toutefois, ces filtres sont couteux and difficile à manipuler, et ce n'est pas connu quel signaux biophysiques émis par cette méthode de culture promeuvent la différenciation. Comprendre comment les signaux microenvironmentaux reliés a l'IAL influencent la différenciation est la première étape vers l'élimination du besoin de cette méthode de culture complexe. Nous avons comme hypothèse que les concentrations d'oxygène augmentés présents sur the coté d'air de l'IAL déclenchent la différenciation de CÉBHs. Par conséquent, si on conçoit un système hyperoxique idéal, on éliminerait le besoin de IAL dans les études de santé pulmonaire. Dans cette thèse, une lignée de cellules épithéliales bronchiques humaines à été utilisé pour confirmer que les cellules sont assez sensibles aux perturbations d'oxygène résultant de l'addition d'une couche de milieu de culture apical. Une simulation par éléments finis a été créé pour modeler la diffusion d'oxygène à travers cette couche de milieu durant la culture submergée. Ce model nous a aidé à sélectionner les conditions de culture hyperoxiques. Ensuite, des CÉBHs ont été culturés en conditions standard/IAL, standard/submergé et hyperoxique/submergé et on a observé que la culture hyperoxic/submergé entraine le plus haut niveau de différenciation. Ces résultats démontrent qu'une IAL n'est pas uniquement nécessaire pour la différenciation de CÉBHs et suggèrent que d'autres caractéristiques microenvironnementales permettent la différenciation cellulaire en conjonction avec l'oxygénation. Une meilleure compréhension de ces signaux environnementaux obtenue par ces expériences peut, par conséquent, guider le développement de nouveaux systèmes pour les études de toxicité à haut débit

    Leveraging epigenome-based subgroups to uncover mechanism of Tumorigenesis

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    Current disease classification is coarse and would benefit from unsupervised, biochemical data driven approaches. Thus, challenging the top-down, histopathological classification of tumors, we suggest that DNA methylation profiling is a relevant tool to classify tumors into relevant groups, according to their epigenome or cancer state. In turn, subgroups identified from this bottom-up, data-driven approach should share related genetic alterations, such as mutations in genes involved in the same pathway. In this thesis, we show the validity of using this approach by recuperating groups of patients that share common genetic alterations. First, we show that unsupervised clustering of DNA methylation data segregates ETMRs, which shared a common gene fusion, from other related tumors. This was consistent in pediatric glioblastoma samples, in which samples that clustered together shared the same driver mutation. Next, we used the same approach and grouped samples by their DNA methylation profile, including patients with unknown genetic driver event. Uncharacterized samples that grouped with samples with known drivers were further investigated, focusing on genes involved in the same pathways as the known drivers. This guided strategy uncovered novel oncogenic mutations in Giant Cell Tumor of the bone (GCTs) and a new Head & Neck Squamous Cell Carcinoma (HNSCC) entity, enriched for specific oncogenic mutations. Finally, we leveraged results from this approach to identify H3K36me2 as key player of the H3K36 methylation pathway and its role in cancer. Profiling this understudied epigenomic mark allowed us to uncover its role in establishing DNA methylation. This thesis describes examples of using DNA methylation, unsupervised clustering and an integrative genomics approach in different cancers, in an attempt to highlight the utility of data-driven cancer diagnosis and research.La classification contemporaine des maladies manque de nuance, et bénéficierait d'approches non biaisées, fondées sur les données biomédicales des patients. Dès lors, et tout en remettant en cause la classification histo-pathologique « par le haut » des tumeurs, cette thèse propose une approche « par le bas », utilisant la méthylation de l'ADN comme base afin d'assigner les tumeurs à des groupes bio-médicalement pertinents, selon leur état épigénomique. Nous postulons que ces groupes, définis par leurs caractéristiques épigénomiques, devraient être composés d'échantillons ayant des altérations génétiques connexes, tel que des mutations dans des gènes impliqués dans les mêmes voies de signalisation moléculaire. Cette thèse démontre la validité de cette approche, qui permet effectivement d'identifier des groupes de patients qui partagent des altérations génétiques analogues. Premièrement, nous démontrons que l'application d'un algorithme de regroupement non-supervisé permet de distinguer clairement les ETMRs, un sous-groupe de tumeurs qui sont définies par une fusion de gènes caractéristique. Le même résultat est obtenu chez les glioblastomes pédiatriques, où les échantillons ayant la même altération génétique se regroupent ensemble. Ensuite, nous utilisons la même approche de regroupement non-supervisé sur les données de méthylation sur un ensemble tumeurs contenant notamment des échantillons sans mutation causale identifiée. Nous avons ensuite profilé les échantillons non-caractérisés se trouvant assignés à des sous-groupes contenant des échantillons caractérisés, en focalisant notre analyse sur les gènes impliqués dans les mêmes voies de signalisation moléculaire que les gènes contenant des mutations pilotes connues. Cette stratégie d'analyse canalisée nous a permis de découvrir de nouvelles mutations pilotes dans le GTC, ainsi qu'un nouveau sous-groupe de -HNSCC, enrichi en mutations oncogéniques spécifiques. Enfin nous avons mobilisé les résultats de cette approche pour identifier H3K36me2 comme une mutation clé dans la voie de méthylation de H3K36 et avons démontré son rôle dans l'oncogénèse. Cette thèse, focalisée sur l'exemple du cancer, détaille plusieurs exemples qui démontrent l'utilité d'une méthode novatrice d'analyse fondée sur la méthylation de l'ADN, des algorithmes de classification non-supervisée, et des techniques de génomique intégrée. A travers ces exemples, ces travaux mettent en lumière l'utilité primordiale des recherches et diagnostiques fondées sur des approches guidées par les données

    Measuring the impact of universal childcare program on mental health and substance use behaviours in adolescents: evidence from a longitudinal cohort in Quebec

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    Background Social inequalities in health emerge during early childhood. Interventions such as access to quality childcare services have the potential to promote child development, mitigate inequalities in health, and affect the development of human capital. The Quebec Family Policy proposed a series of new measures, including universal childcare and parental leave, and was implemented in 1997 with this objective in mind. It represents a unique opportunity to evaluate the effects of a universal and subsidized childcare program on child health outcomes and socioeconomic inequalities in health. Few studies have evaluated the long-term health effects of childcare and previous research on behavioural and mental health outcomes has produced heterogeneous results. Objectives The primary objective of this study was to measure the impact of Quebec's universal childcare policy, and specifically the utilization of subsidized childcare, on children's health, including mental health outcomes and substance use in adolescence. A secondary objective was to evaluate whether the impact varies across socioeconomic status (SES), given that the Quebec Family Policy's aim is to alter the distribution of social determinants of health. MethodsData from a longitudinal cohort of children born in Quebec between October 1997 and July 1998 (n= 2,120) was used. Primary childcare arrangement was classified as CPE care (Centre de la Petite Enfance affiliated settings; subsidized), non-CPE care (non-affiliated non-subsidized settings), or no formal childcare. Primary outcomes were behaviors, mental health, and substance use in adolescents at age 15, including: internalized and externalized behaviours, physical aggression, depressive and anxiety symptoms, and substance use. A multitude of child and family characteristics were included in the analysis to control for potential confounding using propensity score inverse propensity weights (PS-IPW). The association between childcare attendance, comparing CPE-care to other childcare arrangements, and outcomes of interest, were estimated by Poisson regression with robust variance estimation or logistic regression, according to the outcome measured, and reported as average treatment effects. Finally, we examined if socio-economic status acted as an effect measure modifier between childcare arrangement and the outcomes of interest, in order to assess the implications of subsidized childcare on social inequalities in health. Results While baseline characteristics of participants differed significantly for key covariates including maternal education, income and employment status, we achieved comparability between participants with different childcare arrangements after PS-IPW weighting. Overall, there were no substantial risk differences in outcomes at age 15 between children exposed to CPE-type care compared to non-CPE care, and between children exposed to CPE-type care and those with no formal childcare. Likewise, the effects of childcare on reported outcomes by level of SES did not differ consistently, except for 0.14 (95%CI 0.02-0.27; p=0.02) and 0.11 (95%CI 0.01-0.22; p=0.04) increases in the probabilities of smoking and having smoked more than once per month in the past 12 months respectively, among children whose family belonged to the bottom quartile of the SES index and who attended a CPE-type care compared to those not in formal childcare; these results were not reproducible when using maternal education as the indicator of SES. Conclusion Overall, there was no consistent evidence that exposure to different childcare arrangements, following the implementation of the Quebec universal childcare program, influenced externalized and internalized behaviours, or substance use, in adolescence. Additionally, we did not observe differential impacts of subsidized childcare by socio-economic status on these outcomes.Mise en contexte Les inégalités sociales en santé émergent dès la petite enfance. Ainsi, des interventions visant à favoriser l'accès à des services de garde (SG) de qualité ont le potentiel de promouvoir le développement de l'enfant et d'atténuer ces inégalités, affectant possiblement le développement du capital humain. La Politique familiale du Québec de 1997 a été instaurée avec cet objectif en tête. Cela représente une opportunité unique d'évaluer les effets d'un programme d'éducation à la petite enfance universel et subventionné sur la santé et les inégalités sociales en santé. Peu d'études ont évalué les effets à long terme de fréquenter un SG sur la santé et ces études ont produit des résultats hétérogènes en termes de santé mentale et de comportements à risque.ObjectifsLe principal objectif de cette étude était de mesurer les impacts du programme universel de services de garde du Québec sur la santé des enfants, particulièrement l'impact de l'utilisation des SG subventionnés sur la santé mentale et la consommation de substances à l'adolescence. De plus, nous avons évalué si l'impact mesuré variait selon le statut socio-économique (SES). Méthodes Les données d'une cohorte longitudinale d'enfants nés au Québec entre octobre 1997 et juillet 1998 (n= 2,120) ont été utilisées. Le type principal de SG a été classifié en trois catégories d'exposition : « CPE » (correspondant aux SG subventionnés), « non-CPE » (SG non-subventionnés) et garde parentale. Les indicateurs suivants ont été analysés chez des adolescents de 15 ans : les comportements intériorisés et extériorisés, l'agressivité, les symptômes de dépression et d'anxiété et la consommation de substances. La méthode de pondération inverse sur les probabilités d'être traitées du score de propension (PS-IPW) a été utilisée afin de contrôler pour les facteurs de confusion potentiels. L'association entre l'utilisation d'un SG, comparant la fréquentation d'un SG de type « CPE » aux autres catégories d'exposition, et les variables d'intérêt a été estimée par des régressions de Poisson avec variance robuste ou des régressions logistiques, et rapportée comme un effet moyen de traitement. Finalement, nous avons examiné si le SES était un modérateur entre le type de SG fréquenté et les variables d'intérêt. Résultats Alors que les caractéristiques des participants pour certaines variables, tel le statut d'emploi, l'éducation maternelle et le revenu, différaient significativement selon le type de SG fréquenté, la comparabilité entre les groupes a été atteinte suite à la pondération par PS-IPW. De façon générale, il n'y avait pas de différences de risque substantielles sur les variables étudiées à 15 ans, entre les enfants ayant fréquenté un SG de type « CPE » comparativement à ceux ayant fréquenté un SG de type « non-CPE » ou n'ayant pas fréquenté un SG formel. De plus, les effets de la fréquentation d'un SG ne variaient pas selon le statut socio-économique, à l'exception d'une augmentation de 0.14 (95%CI 0.02-0.27; p=0.02) et de 0.11 (95%CI 0.01-0.22; p=0.04), respectivement, de la probabilité de fumer la cigarette et d'avoir fumé plus d'une fois par mois dans les derniers douze mois, parmi les enfants provenant du quartile inférieur du score indexé du statut socio-économique fréquentant un service de garde de type « CPE » comparativement à ceux n'ayant pas fréquenté de SG formel. Ces résultats n'ont toutefois pas été observés en utilisant le niveau d'éducation maternelle comme indicateur du SES. Conclusions Nous n'avons pas détecté de preuves consistantes à l'effet que l'exposition à différents types de SG, suivant l'introduction du programme de garderies subventionnées au Québec, avait influencé les comportements intériorisés et extériorisés, ainsi que la consommation de substance à l'adolescence. De plus, il n'y avait pas de preuves consistantes de l'impact différentiel de la fréquentation d'un SG sur l'ensemble des indicateurs étudiés selon le SES

    Activation of Parkin

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    Parkinson's disease is the second most common neurodegenerative disease, and 10% of the cases can be genetically inherited. Mutations in PARK2 gene, which encodes for parkin, are responsible for most cases of autosomal-recessive juvenile parkinsonism (AR-JP). Parkin is an E3 ubiquitin ligase, which promotes the ubiquitination of specific substrate proteins, and it is activated by PINK1 in order to participate in mitophagy. Parkin is basally autoinhibited, where its E2 binding site and catalytic cysteine are occluded; however, when parkin is bound to phosphorylated ubiquitin (pUb), the released Ubl domain becomes phosphorylated and binds to RING0 domain, releasing the catalytic cysteine on RING2. Recently, an activating element (ACT) has been suggested to participate in the activation of parkin by competing with RING2 for its binding site on RING0, promoting the release of RING2. The first topic of this thesis investigates the effect of each conserved ACT residue on parkin activation through auto-ubiquitination assays. The autoubiquitination assays suggest that the ACT element may enhance the activity of parkin, but it is not essential for its activity. The second topic examines the interaction between parkin and protein-interacting with C-kinase I (PICK1). PICK1 is a substrate of parkin, but unlike most polyubiquitinated substrates, PICK1 becomes monoubiquitinated by parkin, and monoubiquitinated PICK1 inhibits parkin. Its unique inhibitory effect on parkin makes it a potential target as the reduction of PICK1 may enhance parkin's protective function. PICK1 was previously reported to bind to the C-terminus of parkin through its PDZ domain, but it was recently reported to bind to RING1 through its BAR domain. The latest findings in the domain rearrangement of parkin at different stages of activation suggested that phosphorylated parkin may result in stronger binding between PICK1 and parkin. However, the GST-pull down assays showed no binding between phosphorylated parkin and PICK1, suggesting that phosphorylated parkin does not enhance the interaction between parkin and PICK1.La maladie de Parkinson est la deuxième maladie neurodégénérative la plus courante dont 10 % des cas peuvent être héréditaires. Les mutations du gène PARK2, qui code pour l'enzyme parkine, sont responsables de la plupart des cas de parkinsonisme juvénile récessif autosomique (AR-JP). La parkine est une ubiquitine ligase E3, qui favorise l'ubiquitination de protéines de substrat spécifiques, et elle est activée par PINK1 afin de participer à la mitophagie. La parkine est autoinhibée basalement, où son site de liaison E2 et la cystéine catalytique sont occlus; cependant, lorsque la parkine est liée à l'ubiquitine phosphorylée (pUb), le domaine Ubl libéré devient phosphorylé et se lie au domaine RING0, libérant la cystéine catalytique sur RING2. Récemment, l'élément activateur (ACT) a été identifié comme participant à l'activation de la parkine en rivalisant avec RING2 pour son site de fixation sur RING0, ce qui favorise la libération de RING2. Le premier sujet de cette thèse porte sur l'effet de chaque résidu d'ACT conservé sur l'activation des parkines par des tests d'auto-ubiquitination. Les essais d'autoubiquitination suggèrent que l'élément ACT peut améliorer l'activité du parkin, mais qu'il n'est pas essentiel pour son activité. Le deuxième sujet présenté dans cette thèse examine l'interaction entre la parkine et l'interaction des protéines avec la C-kinase I (PICK1). Le PICK1 est un substrat de parkine, mais contrairement à la plupart des substrats qui sont polyubiquitinés, le PICK1 devient monoubiquitiné par parkine et le PICK1 monoubiquitiné inhibe la parkine. Son effet inhibiteur unique sur la parkine est en fait une cible potentielle car la réduction du PICK1 peut renforcer la fonction protectrice de la parkine. Le PICK1 se fixait auparavant au terminal C du parkin par l'intermédiaire de son domaine PDZ, mais on a récemment signalé qu'il se fixait à RING1 par l'intermédiaire de son domaine BAR. Cette recherche utilise des essais in vitro pour étudier la liaison entre le parkin et le PICK1 afin d'étudier plus en profondeur les sites de liaison exacts. Cependant, aucune liaison n'a été observée entre parkin et PICK1, ce qui suggère que différentes approches devraient être adoptées pour étudier leurs interactions

    Cell Wall plasticity regulation in pollen tubes related to mechanical stress

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    The pollen tube is a rapidly growing plant cell that features particular traits that can only be understood when integrating cell biological with cell mechanical concepts. Firstly, regular temporal variations in the growth rate are governed by a feedback mechanism involving the regulation of the mechanical properties of the apical cell wall and mechanosensitive ion channels. Recent developments in image analysis have allowed making significant progress in the quantification of this behavior. Secondly, a pollen tube uses invasive growth to penetrate the flower tissues with the aim to transport the male sperm cells to their target, an ovule. Turgor was recently found to be the driving force of this invasive behavior and the mechanical underpinnings have been characterized using Lab-on-Chip (LOC) technology. Thirdly, the pollen tube is able to reorient its growth direction upon exposure to a guidance cue and the steering mechanism involves the sophisticated choreography of intracellular transport processes serving to fuel the polar growth process. This morphogenetic process relies on the precise spatial control of a gradient in the mechanical properties of the cell wall. Sophisticated imaging and micromanipulation techniques have been instrumental for the advancement in characterizing the biomechanical features of this crucial cell in the plant reproductive cycle. It has been recently shown that the pollen tube diameter changes in response to mechanical hindrance; this change in diameter suggests there is an adaptive mechanism within the cell wall formation pathway. In order to investigate this, pollen tubes from four plant species, Camellia sinensis, Nicotiana tabacum, Solanum chacoense and Arabidopsis thaliana, were germinated in media of varying stiffness to expose them to different degrees of mechanical stress during cell wall formation. Diameter has been correlated with the characteristic spatial profile of the distribution of cell wall polysaccharides. The pollen tubes were stained and immunolabeled to show beta-glycan contents as well as that of methyl esterified and de-esterified homogalacturonan (HG) to determine if the biochemical composition of the cell wall was affected by exposure to different types of mechanical environment. Though they grow in different pistil environments in vivo, both C. sinensis and A. thaliana had higher de-esterified HG content at the tip during growth in the stiff media suggesting the formation of a stiffer tip in response to stress. Some N. tabacum and S. chacoense pollen tubes displayed swollen bulbous tips with abnormal tip cell wall biochemistry suggesting this is an adaptive mechanism in response to stress. The abnormal swollen tips contained low levels of de- esterified HG in the bulbous tip cell wall suggesting this polysaccharide is necessary in maintaining pollen tube diameter during growth.Le tube pollinique est une cellule végétale dont la croissance rapide présente des caractéristiques particulières que l'on ne peut assimiler qu'en associant biologie cellulaire et concepts de mécanique cellulaire. Premièrement, les variations temporelles, à intervalles réguliers, du taux de croissance sont régies par un mécanisme de rétroaction associé à la régulation des propriétés mécaniques de la paroi cellulaire apicale et des canaux ioniques mécano- sensibles. Les récents développements en analyse d'images ont permis de faire d'importants progrès dans la quantification de ce mécanisme. Deuxièmement, la croissance invasive du tube pollinique lui permet de pénétrer les tissus du pistil afin de transporter les cellules spermatiques vers leur cible, un ovule. La force exercée par la turgescence est le principal moteur de ce comportement invasif dont les fondements mécaniques ont été caractérisés à l'aide de la technologie Lab-on-Chip (LOC). Troisièmement, le tube pollinique est capable de réorienter sa direction de croissance en réponse à un signal de guidage. Cette réorientation nécessite une régulation complexe des processus de transport intracellulaire contrôlant la croissance polaire. Ce processus morphogénétique repose sur le contrôle spatial précis d'un gradient de propriétés mécaniques de la paroi cellulaire. Les techniques de pointe en imagerie et en micromanipulation ont été déterminantes pour la caractérisation des propriétés biomécaniques de cette cellule, dont le rôle dans le cycle reproductif des plantes est crucial. Il a été récemment démontré que le diamètre du tube pollinique change en réponse à un obstacle mécanique. Ce changement de diamètre suggère l'existence d'un mécanisme adaptatif dans la formation de la paroi cellulaire. Afin de comprendre ce mécanisme, j'ai induit la germination de tubes polliniques de quatre espèces végétales, C. sinensis, N. tabacum, S. chacoense et A. thaliana, dans des milieux de différentes rigidités. Le but étant de les exposer à différents degrés de stress mécanique lors de la formation des parois cellulaires. Le diamètre des tubes a été comparé au profil de distribution spatial des beta-glycanes pariétaux. Les tubes polliniques ont été spécifiquement marqués par des anticorps afin de montrer la présence de beta-glycanes spécifiques ainsi que les pectines méthyl- estérifiées et dé-estérifiées. Le but de ces marquages est de déterminer si la composition biochimique de la paroi cellulaire serait affectée par les différentes propriétés mécaniques des milieux de croissance des tubes polliniques. Bien que les tubes polliniques de C. sinensis et d'A. thaliana germent in vivo dans différents environnements pistillaires, leurs apex sont caractérisés par une forte concentration en pectines de-estérifiées lorsqu'ils poussent, in vitro, dans des milieux rigides, suggérant ainsi la formation d'un apex plus rigide en réponse au stress. Certains tubes polliniques de N. tabacum et de S. chacoense sont caractérisés par des apex de forme bulbeuse et par une composition biochimie pariétale atypique au niveau apical, suggérant la présence d'un mécanisme adaptatif en réponse au stress. Les apex de forme atypique bulbeuse ont contenu des bas niveaux de pectines de-estérifiées dans la paroi cellulaire en soulignant que les pectines de-estérifiées sont nécessaires pour maintenir le diamètre du tube pollinique pendant la croissance

    Fostering happiness among public transit users: Analyzing customer satisfaction surveys through non-traditional approaches

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    Customer satisfaction surveys are one of the most heavily utilized tools within the public transit industry to gain insight into the perceptions, attitudes and behaviours of customers. The efficacy of policies and service improvement strategies derived from satisfaction data are presently limited by the methodologies that are used to analyze this data. The overarching goal of this dissertation is to expand the understanding of public transit customer satisfaction through incorporating personal, spatial and contextual factors. This research goal will be achieved through answering the following research question: How can customer satisfaction data be effectively analyzed and utilized to generate targeted service quality improvements? This dissertation consists of four research objectives which are as follows: 1.To show differences in perceptions of service quality across different socioeconomic neighbourhoods in a highly competitive and well-monitored transit market; 2.To develop a transit market segmentation approach that includes personal, spatial and contextual factors; 3.To understand the extent to which transfers influence trip satisfaction; 4.To expand our understanding of how public transit performance measures can be integrated into satisfaction analyses to better predict overall satisfaction.The four research objectives each correspond to an analysis chapter comprising this manuscript-based dissertation. These chapters build on one another, and collectively aim to advance existing methods of analyzing customer satisfaction data for better knowledge of the transit market. The first two chapters of this dissertation present spatial methods of analyzing customer satisfaction data. Chapter two examines satisfaction with bus service across neighbourhoods of varying socio-economic status in London, UK. This spatial method allows agencies to identify areas for improvement at a more disaggregate level than previous research. The third chapter presents a new market segmentation approach that incorporates spatial and contextual factors that have not previously been incorporated into the practice of segmenting the transit market. This new method is demonstrated using a sample of commuter rail users in the Greater Toronto and Hamilton Area, Canada. The remaining two chapters demonstrate how contextual and operational data can be incorporated into satisfaction analyses. Chapter four explores the relationship between transferring and trip satisfaction using a survey of transit commuters to McGill University. In Chapter 5, satisfaction levels among users of a local and a limited-stop bus service in Vancouver, Canada are studied, while controlling for operational characteristics describing the service these users experienced, such as crowding. A concluding chapter consolidates the findings of these chapters and presents policy and research implications to support a better understanding of satisfaction. More specifically, this dissertation contributes to the knowledge in the following four ways:m •Identifies important shortcomings regarding how customer satisfaction data is analyzed; •Develops reproducible methodologies to both integrate spatial data into the analysis of satisfaction levels, as well as to apply spatial analysis techniques to examine satisfaction with service at a local scale (i.e. the route or neighbourhood level); •Demonstrates how detailed trip data can be applied to understand how specific service characteristics influence satisfaction levels; •Shows how transit performance data can be integrated into satisfaction analyses to provide a more complete understanding of passenger satisfaction levels. As customers are the most important judges of service quality, this dissertation demonstrates how transit agencies can more effectively analyze customer perceptions of service as stated in satisfaction surveys and generate policies for service improvements that will have the strongest impact on riders.Les enquêtes de satisfaction des usagers sont un des outils les plus utilisés dans le secteur des transports en commun pour mieux comprendre les perceptions, les attitudes et les comportements des voyageurs. L'efficacité des politiques et des stratégies d'amélioration du service conçues à partir des données de satisfaction est actuellement limitée par les méthodologies utilisées pour analyser ces données. L'objectif général de cette thèse est d'obtenir une meilleure compréhension de la satisfaction des usagers des transports en commun en intégrant des facteurs personnels, spatiaux et contextuels. L'objectif de cette étude vise à répondre à la question suivante : Comment analyser et utiliser efficacement les données relatives à la satisfaction des usagers pour développer des améliorations ciblées de la qualité du service? Cette thèse s'articule autour des quatre objectifs suivants :1.Dévoiler les différences de perception relatives à la qualité du service entre des quartiers avec différents profils socio-économiques, dans un secteur très concurrentiel et étroitement réglementé ;2.Développer une approche de segmentation du marché des transports en commun intégrant des facteurs personnels, spatiaux et contextuels ;3.Comprendre dans quelle mesure les correspondances influencent le niveau de satisfaction du trajet ; 4.Obtenir une meilleure compréhension de la façon dont les mesures de performance des transports en commun peuvent être intégrées à l'analyse de la satisfaction des usagers pour aider à mieux comprendre la satisfaction globale.Les quatre objectifs de recherche correspondent chacun à un chapitre d'analyse de la présente thèse. Ces chapitres se complètent et visent collectivement à améliorer les méthodes d'analyse des données relatives à la satisfaction des usagers actuellement en vigueur afin de permettre une meilleure connaissance du secteur des transports en commun.Le chapitre final regroupe les faits saillants des chapitres précédents et présente leurs implications en termes de politiques et de recherche pour permettre une meilleure compréhension de la satisfaction des usagers. Plus précisément, ce mémoire apporte de nouveaux éléments par rapport aux connaissances préexistantes qui s'articulent autour des quatre points suivants: •Identifie des lacunes importantes dans la manière dont les données relatives à la satisfaction des usagers sont actuellement analysées ;•Développe des méthodologies reproductibles pour intégrer les données spatiales dans l'analyse des niveaux de satisfaction, ainsi que pour appliquer des techniques d'analyse spatiale visant à examiner le niveau de satisfaction à l'égard du service à l'échelle locale (c.-à-d. au niveau du trajet ou du quartier) ;•Démontre comment les données détaillées sur les trajets peuvent être utilisées pour comprendre l'influence des caractéristiques spécifiques de service sur les niveaux de satisfaction ;•Montre comment les données relatives à la performance du transport en commun peuvent être intégrées aux analyses de satisfaction pour permettre une compréhension plus complète des niveaux de satisfaction des usagers. Dans la mesure où les usagers sont les meilleurs juges de la qualité du service, cette thèse montre comment les agences de transport en commun peuvent analyser plus efficacement les perceptions des usagers vis-à-vis du service telles qu'exprimées dans les enquêtes de satisfaction afin d'élaborer des politiques d'amélioration du service qui auront le plus d'impact sur les usagers

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