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Hybrid recommender systems based on autoencoders
No full textDue to the abundance of choice in e-commerce, recommender systems are becoming more and more indispensable. A common task of recommendation is to help users find the items that best fit their personal tastes. In the real world, most recommender services measure their performance by top-K item recommended to the users. In this thesis, we investigate the most common scenario (e.g. movies, products, CDs) with implicit feedback. There are many methods to solve the problem, including Collaborative-filtering (CF). CF is a widely used approach in recommender systems based on past ratings given to items by users. However, CF-based methods suffer from cold-start problem because the ratings are often very sparse. To address this sparsity problem, more attention has been drawn to hybrid methods which utilize auxiliary information such as item content information. However, the learned latent factors of some hybrid methods may not be effective.Here, we propose an optimized unied model based on AutoEncoder to make a prediction from both rating information and content information. We modify the encoding layer by combining two latent factors of two information sources. We also utilize the advances of learning effective representations in deep learning to generate the factors of items from item description which is a sequence of words. Extensive experimental results on three real-world datasets show that our unied model outperforms other state-of-art approaches according to three popular evaluation metrics of recommender task. Our model effectively utilizes side information and achieves performance improvement.En raison de l'abondance de choix dans le commerce électronique, les systèmes de recommandation deviennent de plus en plus indispensables. Une tâche courante de recommandation consiste à aider les utilisateurs à trouver les éléments qui correspondent le mieux à leurs goûts personnels. Dans le monde réel, la plupart des services de recommandation mesurent leurs performances en fonction des éléments recommandés par les utilisateurs. Dans cette thèse, nous étudions le scénario le plus courant (films, produits, CD, par exemple) avec rétroaction implicite.Il existe de nombreuses méthodes pour résoudre le problème, notamment le filtrage collaboratif (FC). La FC est une approche largement utilisée dans les systèmes de recommandation, basée sur les évaluations passées attribuées aux éléments par les utilisateurs. Cependant, les méthodes à base de FC souffrent de problèmes de démarrage à froid car les cotes sont souvent très rares. Pour résoudre ce problème de parcimonie, une plus grande attention a été portée aux méthodes hybrides qui utilisent des informations auxiliaires telles que les informations de contenu d'élément. Cependant, les facteurs latents appris de certaines méthodes hybrides peuvent ne pas être efficaces.Nous proposons ici un modèle unifié optimisé basé sur AutoEncoder pour effectuer une prédiction à la fois des informations de classement et des informations de contenu. Nous modifions la couche d'encodage en combinant deux facteurs latents de deux sources d'informations. Nous utilisons également les avancées en matière d’apprentissage des représentations efficaces dans l’apprentissage en profondeur pour générer les facteurs des éléments à partir de la description des éléments, qui est une séquence de mots. Des résultats expérimentaux approfondis sur trois jeux de données du monde réel montrent que notre modèle unifié surpasse les autres approches de pointe selon trois mesures d'évaluation courantes de la tâche de recommandation. Notre modèle utilise efficacement les informations secondaires et permet d'améliorer les performances
Indoor human activity monitoring for senior well-being using commodity WiFi devices
No full textWith the rapid growth of Internet of Things (IoT) market, the research of indoor human activity monitoring has drawn widespread attention and enables a diverse range of applications in smart homes, health care and home security. An extensive amount of work has been carried out to build an activity monitoring system, whose approaches range from device-free methods (i.e. vision based) to device oriented ones (i.e. sensor based). Among all the design of human activity monitoring system, WiFi-based approaches has gained increasing popularity. The reason for this trend lies with the fact that WiFi-based methods free users from carrying devices by using the pervasive wireless signals indicators. Moving along this direction, we aim to design a device-free approach for human activity monitoring for the well-being of the elderly using existing commodity WiFi infrastructure. To achieve this goal, we use channel state information (CSI) as the signal indicators, which contain fine-grained information that describes how the WiFi signal propagates from the transmitter to the receiver. Moreover, instead of using traditional machine learning techniques, we propose a Deep Convolutional Neural Network (DCNN) based mechanism for feature extractions and activity classification. Additionally, deep models usually require a relatively large quantity of data to achieve a better performance. However, it is usually time-consuming and labor-intensive to collect labeled CSI data. To deal with the difficulty in data collection, we leverage a novel data augmentation technique called Mixup, which proves to be efficient to alleviate this issue. Our experiments and evaluations show that our method can achieve better performance compared with existing work, which has great potential to facilitate human activity related services and applications for senior well-being.Avec la croissance rapide du marché de l'Internet des objets (IoT), la recherche sur la surveillance de l'activité humaine dans les locaux a attiré une attention soutenue et permet une gamme variée d'applications dans les maisons intelligentes, les soins de santé et la sécurité domestique. Un travail considérable a été effectué pour mettre en place un système de surveillance de l'activité, dont les approches vont des méthodes sans appareil (c'est-à-dire basées sur la vision) à celles orientées appareil (c'est-à-dire basées sur des capteurs). Parmi tous les systèmes de surveillance de l'activité humaine, les approches basées sur le WiFi gagnent en popularité. La raison de cette tendance réside dans le fait que les méthodes basées sur le WiFi libèrent les utilisateurs du transport d'appareils en utilisant les indicateurs de signaux sans fil omniprésents.Dans cette direction, nous visons à concevoir une approche sans dispositif pour la surveillance de l'activité humaine pour le bien-être des personnes âgées à l'aide de l'infrastructure WiFi de base existante. Pour atteindre cet objectif, nous utilisons les informations d'état du canal (CSI) comme indicateurs de signal. Ces informations contiennent des informations détaillées décrivant la manière dont le signal WiFi se propage de l'émetteur au récepteur. De plus, au lieu d'utiliser les techniques traditionnelles d'apprentissage automatique, nous proposons un mécanisme basé sur le réseau de neurones à convolution profonde (DCNN) pour l'extraction de caractéristiques et la classification des activités. De plus, les modèles profonds nécessitent généralement une quantité de données relativement importante pour obtenir de meilleures performances. Cependant, la collecte de données CSI étiquetées prend généralement beaucoup de temps et d’emplois. Pour faire face à la difficulté de la collecte de données, nous utilisons une nouvelle technique d’augmentation de données appelée Mixup, qui s’avère efficace pour remédier à ce problème. Nos expériences et évaluations montrent que notre méthode permet d’atteindre de meilleures performances que les travaux existants, ce qui offre un grand potentiel pour faciliter les services et les applications liés à l’activité humaine destinés au bien-être des personnes âgées
MiRNA from neuronal-derived exosomes isolated from plasma as a biomarker for antidepressant drug response in patients with major depressive disorder
No full textMajor depressive disorder (MDD) is a common mental disorder affecting millions of people worldwide. Antidepressant drug therapy (ADT) is the most frequently used treatment for MDD, however approximately 60% of patients do not respond to first trials of ADT. Research has implicated epigenetic mechanisms as a biomarker for ADT response, but this work uses peripheral tissue, bringing into question the relevance of findings in the context of psychiatry. Exosomes, which are small extracellular vesicles enriched in miRNA, are important regulators of cellular communication in the brain, and can cross the blood-brain barrier bi-directionally. MiRNA from neuronal-derived exosomes (NDEs) that can be accessed in plasma may bridge the gap between an easily accessible biomarker and psychiatric phenotypes.This thesis uses a pilot study cohort of MDD patients who were either responders, or non-responders to escitalopram after an eight-week trial. This exploratory work sought to prove that miRNA cargo from NDE isolated from plasma could be used to identify predictor biomarkers of ADT response. Together, results suggest that NDEs can be successfully isolated from plasma, and both exosome size and contents are interesting avenues for future biomarker work. Collectively, this thesis contributes to the understanding of miRNA biomarkers in ADT response, and supports the role of NDEs in future biomarker studies.Le trouble de dépression majeure (TDM) est le trouble de l’humeur le plus commun et affecte des millions de personnes dans le monde. Le traitement antidépresseur (TA) est le traitement le plus fréquemment utilisé pour le TDM. Cependant, environ 60% des patients ne répondent pas aux premiers essais avec le TA. Certaines études ont investiguer des mécanismes épigénétiques comme biomarqueurs de la réponse au TA, mais ces travaux utilisent des tissus périphériques, ce qui remet en question la pertinence des résultats dans le contexte de la psychiatrie. Les exosomes, des petites vésicules extracellulaires enrichies en micro-ARNs, sont d'importants régulateurs de la communication cellulaire dans le cerveau, et ils peuvent traverser la barrière hémato-encéphalique dans les deux directions. Les micro-ARNs encapsulés dans les exosomes dérivés de neurones (NDE) sont présents dans le plasma et pourraient faire le lien entre un biomarqueur facilement accessible et des phénotypes psychiatriques.Cette thèse utilise une cohorte pilote de patients atteints de TDM qui ont répondu ou n’ont pas répondu à l’escitalopram après un essai de huit semaines. Ce travail exploratoire visait à prouver que les micro-ARNs des NDE isolés du plasma pouvait être utilisés pour identifier des biomarqueurs prédicteurs de la réponse à la TA. Dans l’ensemble, les résultats montrent que les NDE peuvent être isolées du plasma, et que la taille et le contenu de des NDE sont des critères prometteurs pour des travaux futurs sur l’identification de biomarqueurs. Pour conclure, cette thèse contribue à la compréhension des biomarqueurs microARNs dans la réponse au TA et soutient l’inclusion des NDE dans les études futures sur les biomarqueurs
Structural insights into angiotensin II type 1 receptor - β-arrestin complex
No full textG protein-coupled receptors (GPCRs) represent the largest family of cell surface receptors and as such, they have become key therapeutic targets in the treatment of countless diseases. In the classical model, agonist-bound GPCRs couple to heterotrimeric G proteins, thereby inducing an extensive G protein-dependent signaling network. GPCRs are subsequently phosphorylated by G protein-coupled receptor kinases (GRKs), leading to the recruitment of multifunctional adaptor proteins β-arrestins (β-arrs), which are involved in GPCR desensitization and internalization. Non-classical GPCR signal transduction pathways are also mediated through GPCR ̶ β-arr complexes. Indeed, β-arrs play a prominent role in the signaling network of GPCRs whereby the GPCR ̶ β-arr complex can act as a scaffold to recruit different downstream signaling effectors. Therefore, the interaction of activated and phosphorylated GPCRs with β-arrs is crucial for the regulation of their signaling and functional outcomes. Although nearly all GPCRs interact with β-arrs, the precise molecular details of this interaction remain largely undefined, owing to challenges in obtaining stable receptor ̶ β-arr complexes for structural analysis. The angiotensin II (AngII) type 1 receptor (AT1R) is a GPCR known for its well-established role in the cardiovascular system. It is the best characterized receptor for AngII, a vasopressor hormone involved in hypertension and the effector molecule of the renin-angiotensin-aldosterone system (RAAS). AT1R binds β-arrs with high affinity to form stable complexes in cells. AngII-bound AT1R elicits both G-protein-dependent and β-arr-dependent signaling pathways and such responses can be functionally directed by ligands (i.e. biased ligands) and/or mutations within the receptor. Here, the AT1R was used as a model to characterize specific β-arr binding modalities on the activated receptor. We used bioorthogonal labeling to incorporate the photoactive unnatural amino acid (UAA) p-azido-l-phenylalanine (azF) at various positions into the intracellular loops (ICLs) and C-terminal domain of AT1R. UV-mediated photolysis of azF-labeled receptors was carried out to induce β-arr photocross-linking, enabling the identification of contact residues in AT1R involved in this interaction. We also investigated the effect of β-arr-biased ligands DVG and TRV027, and a bias signaling mutation (T282M) on the dynamics of the AT1R ̶ β-arr complex. Out of the 25 mutants generated, several residues in the C-tail of AT1R, as well as in the helix 8, ICL2, and ICL3 were found to form direct interactions with β-arr. The extent of cross-linking signals differed among mutant receptors, revealing diversity in β-arr engagement to distinct regions of AngII-bound AT1R. Moreover, we showed that photocross-linking patterns of azF-incorporated receptors fluctuate in bias signaling conditions, suggesting that β-arr engagement to AT1R can be modulated by biased ligands and mutations, highlighting the importance of specific contact sites in the AT1R ̶ β-arr complex. These results also imply that β-arr-biased signaling is conferred by the stabilization of distinct receptor and/or β-arr conformations, a concept previously described for some GPCRs. Our findings provide novel structural insights on the important GPCR ̶ β-arr complex and demonstrate the usefulness of our approach to examine protein ̶ protein interactions in their native environment. These studies also improve our understanding on how GPCRs interact with β-arrs in physiological conditions, and thereby shed lights on β-arr-mediated signal transduction.Les récepteurs couplés aux protéines G (RPCGs) forment la plus grande famille de récepteurs de surface et représentent des cibles thérapeutiques cruciales pour le traitement d’innombrables maladies. Dans le modèle classique, les RPCGs activés par un agoniste se pairent aux protéines G hétérotrimériques, déclenchant ainsi un vaste réseau de signalisation. Les RPCGs sont ensuite phosphorylés par les kinases GRKs, menant au recrutement des β-arrestines (β-arrs), des protéines multifonctionnelles impliquées dans la désensibilisation et l’internalisation des RPCGs. Des voies de signalisation non classiques sont également médiées par les complexes RPCG ̶ β-arr. En effet, les β-arrs jouent un rôle important dans la signalisation des RPCGs dans lequel le complexe RPCG ̶ β-arr peut agir en tant que support pour recruter différents effecteurs. De ce fait, l’interaction des RPCGs activés et phosphorylés avec les β-arrs est cruciale pour la régulation de leur signalisation et conséquences fonctionnelles. Même si presque tous les RPCGs interagissent avec les β-arrs, les détails moléculaires précis de cette interaction demeurent largement inconnus en raison des difficultés à obtenir des complexes récepteur ̶ β-arr stables pour l’analyse structurelle. Le récepteur de type 1 à l’angiotensine II (AT1R) est un RPCG connu pour son rôle au sein du système cardiovasculaire. C’est le récepteur le mieux caractérisé à l’angiotensine II (AngII), une hormone vasopresseur impliquée dans l’hypertension artérielle et la molécule principale du système rénine-angiotensine-aldostérone. L’AT1R se lie aux β-arrs avec haute affinité pour former des complexes stables dans les cellules. L’activation du AT1R déclenche à la fois des voies de signalisation dépendantes des protéines G et dépendantes des β-arrs. De telles réponses peuvent être dirigées par des ligands (c.-à-d. des ligands biaisés) et/ou des mutations dans le récepteur. Ici, l’AT1R a été utilisé en tant que modèle pour caractériser les modalités de liaison spécifiques de β-arr sur le récepteur. Nous avons utilisé une méthode de marquage bioorthogonale pour incorporer l’acide aminé non naturel photo actif p-azido-l-phénylalanine (azF) à diverse positions dans les boucles intracellulaires (ICLs) et le domaine C-terminale de l’AT1R. La photolyse par des récepteurs marqués à l’azF a été effectué pour induire une liaison covalente entre le récepteur et β-arr, permettant l’identification de résidus dans l’AT1R impliqués dans cette interaction. Nous avons également étudié l’effet des ligands biaisés DVG et TRV027 et d’une mutation à signalisation biaisée sur la dynamique du complexe AT1R ̶ β-arr. Sur les 25 mutants générés, plusieurs résidus dans la région C-terminale de l’AT1R, ainsi que dans l’hélix 8, l’ICL2 et l’ICL3 se sont avérés former des interactions directes avec β-arr. L’ampleur des signaux du complexe lié de façon covalente différait entre les récepteurs mutants, ce qui révèle une diversité dans l’engagement de β-arr avec des régions distinctes du récepteur. De plus, nous avons démontré que le niveau de ces signaux fluctue dans des conditions de signalisation biaisée, ce qui suggère que l’engagement de β-arr à l’AT1R peut être modulé par des ligands et des mutations, soulignant l’importance de certains sites de contact dans le complexe AT1R ̶ β-arr. Ces résultats impliquent aussi que la signalisation biaisée vers β-arr est conférée par la stabilisation de conformations distinctes du récepteur et/ou de β-arr, un concept précédemment décrit pour quelques RPCGs. Nos résultats fournissent de nouvelles connaissances structurelles sur l’important complexe RPCG ̶ β-arr et démontre l’utilité de notre approche pour examiner les interactions protéine ̶ protéine dans un environnement physiologique. Ces études nous aident également à comprendre comment les GPCRs interagissent avec les β-arrs en conditions physiologiques et, ainsi, nous éclairent sur les mécanismes de traduction signalétiques médiés par β-arr
Usability in blended learning programs within health professions education: a scoping review
No full textBackground: Blended learning, an educational pedagogy that combines both traditional face-to-face teaching methods with technological innovations, is being implemented in training programs worldwide and specifically within the field of health professions education. Research indicates that usability, a multidimensional concept used to evaluate products and services, can be of paramount importance when evaluating the effectiveness, efficiency, and satisfaction with the use of blended learning programs (BLPs). Despite its importance, knowledge about the concept of usability and its consideration in BLPs within the field of health professions education remains lacking.Objective: The purpose of this study is to develop a foundational understanding of how BLPs have generally been and are currently being evaluated in the field of health professions education in relation to the concept of usability and its primary components (effectiveness, efficiency, and satisfaction).Methods: A scoping review guided by the framework outlined by Arksey & O’Malley, 2005 was conducted. The PRISMA-ScR checklist illustrated by Tricco et al., 2018 was also corroborated when completing this study. The databases searched were Scopus and ERIC (EBSCO). Searches were carried out in an iterative manner, where new terms were identified and added to the search between September 17, 2018 and September 21, 2018. Screening was conducted via the use of a questionnaire guide and in significant collaboration with academic liaison librarians and co-authors. Charted data was validated by a co-author. Thematic analysis was then conducted by two independent reviewers. Results: The search strategy identified 8626 studies of potential relevance for the scoping review. After title and abstract screening, 508 studies were identified to be full-text reviewed. Full-text review yielded 53 studies to be included in this scoping review. No study evaluated the overall concept of usability. 47/53 studies utilized a survey/questionnaire or feedback tool to evaluate their BLP. 33/47 studies did not indicate if their tool was reliability tested, standardized, or validated. Qualitative content analysis indicated that scholars do evaluate for the usability components effectiveness, efficiency, and satisfaction. Thematic analysis found three overarching themes: (1) Avoiding the ‘Usability’ Label and Using Undefined Related Terms such as Helpfulness and Usefulness; (2) Confusing Conceptualization of the Components of Usability (i.e. Effectiveness, Efficiency, & Satisfaction); and (3) Lack of Consensual Approach to Evaluation. These themes ascertained that the concept of usability is discussed across studies that met eligibility criteria, albeit implicitly. Authors were found to use multiple different terms to describe the same concepts. Where the same terms are applied across studies, different connotations are found to be applied to these terms. However, 31 key concepts were identified as associated with usability components (effectiveness, efficiency, and satisfaction), and two related concepts (accessibility and user experiences). Seven key “take home” ideas of what BLP evaluations should include were also identified through thematic analysis. Conclusion: A lack in the conceptual understanding of usability and its associated terms is found across the literature. The results suggest that there is no consensus among researchers regarding evaluation terminology or methodology in this context. This review presents several key findings that help to establish a fundamental understanding of BLP evaluations with respect to usability in the field of health professions education. The findings of this study will be of paramount importance to stakeholders that plan on conducting evaluations of BLPs or developing new tools or frameworks to evaluate BLPs using the concept of usability in the context of health professions education.Contexte: L’apprentissage mixte, pédagogie combinant à la fois des méthodes d’enseignement traditionnelles en personne et des innovations technologiques, est actuellement mis en œuvre dans le cadre de programmes de formation dans le domaine de formation aux professions de la santé. Les recherches indiquent que la facilité d'utilisation, un concept multidimensionnel utilisé pour évaluer les produits et services, peut revêtir une importance primordiale pour évaluer l'efficacité, l'efficience et la satisfaction liées à l'utilisation de programmes d'apprentissage mixte (BLP). Malgré son importance, les connaissances sur le concept de convivialité et sa prise en compte dans les BLP dans le domaine de la formation des professionnels de la santé font encore défaut.Objectif: Le but de cette étude est de développer une compréhension fondamentale de la façon dont les BLP ont été et sont actuellement évalués dans le domaine de formation des professionnels de la santé en relation avec le concept de convivialité et ses composantes principales.Méthodes: Une étude de cadrage a été réalisée, guidée par le cadre défini par Arksey & O’Malley, 2005. La liste de contrôle PRISMA-ScR illustrée par Tricco et al., 2018, a également été corroborée lors de la réalisation de cette étude. Les bases de données consultées étaient Scopus et ERIC. Les recherches ont été effectuées de manière itérative. De nouveaux termes ont été identifiés et ajoutés à la recherche entre le 17-21 sept 2018. Ils ont été effectués à l'aide d'un guide et en collaboration étroite avec des bibliothécaires. Les données cartographiées ont été validées par un co-auteur. Une analyse thématique a ensuite été menée par deux examinateurs indépendants. Résultats: La stratégie de recherche a identifié 8626 études potentiellement pertinentes pour l'examen de la portée. Après sélection du titre et du résumé, 508 études ont été identifiées comme faisant l’objet d’une révision en texte intégral. L’examen en texte intégral a permis d’inclure 53 études dans cet examen. Aucune étude n’a évalué le concept général de convivialité. 47/53 études ont utilisé une questionnaire ou un outil de feedback pour évaluer leur BLP. 33/47 études n'ont pas indiqué si leur outil avait été testé, normalisé ou validé en termes de fiabilité. L'analyse qualitative du contenu a montré que les spécialistes évaluent l'efficacité, l'efficience et la satisfaction des composants liés à la convivialité. L’analyse thématique a permis de dégager trois thèmes: (1) éviter l’étiquette utilisabilité et utiliser des termes associés non définis, tels qu’utilité; (2) conceptualisation déroutante des composantes de la convivialité; et (3) le manque d'approche consensuelle en matière d'évaluation. Ces thèmes ont permis d’établir que le concept de convivialité fait l’objet d’une discussion entre les études répondant aux critères d’éligibilité, même implicitement. On a constaté que les auteurs utilisaient plusieurs termes différents pour décrire les mêmes concepts. Lorsque les mêmes termes sont appliqués à travers les études, différentes connotations s’y appliquent. Cependant, 31 concepts clés ont été identifiés comme étant associés à des composants de convivialité et à deux concepts connexes (accessibilité et expériences utilisateur). Sept idées clés que les évaluations du BLP devraient inclure ont également été identifiées à travers une analyse thématique. Conclusion: La compréhension conceptuelle de la convivialité et de ses termes associés fait défaut dans la littérature. Les résultats suggèrent qu'il n'y a pas de consensus parmi les chercheurs concernant la terminologie ou la méthodologie d'évaluation dans ce contexte. Les conclusions de cette étude revêtiront une importance capitale pour les partis prenants qui prévoient de mener des évaluations des points de vente blancs ou de développer de nouveaux outils pour évaluer ces points de vue en utilisant le concept de convivialité
Oral parafunctional behaviours: Acute versus chronic painful temporomandibular disorders
No full textAim. This case-control study was designed to investigate the association of oral parafunctional behaviors in chronic painful temporomandibular disorders (PTMD) relative to the acute PTMD. Methods. Participants with PTMD were recruited from four different sites: (i) dental clinic of the Jewish General Hospital; (JGH); (ii) Oral Diagnosis (OD) clinic of McGill University, Faculty of Dentistry; (iii) Montreal General Hospital (MGH), Montreal, Quebec, Canada; and (iv) the Dental Specialty Group, in Ottawa, Ontario, Canada. Pain classification based on the International Association of the Study of Pain (IASP) was used to classify PTMD participants in acute (< 3 months) or chronic (≥ 3 months) groups. The validated Oral Behaviour Checklist, General Anxiety Disorder (GAD-7) and Patient Health Questionnaire (PHQ-9) were used to assess the oral parafunctional behaviors, anxiety, and depression, respectively. The association between oral parafunctional behaviors and PTMD was assessed using unconditional logistic regression analysis.Results. A total of 284 participants accepted to participate in this study; 48 (17%) were included in the acute PTMD group and 236 (83.1%) in the chronic group. The majority of both groups were females (P = 0.23). Results from the crude logistic analysis showed that participants with chronic PTMD were more likely to present high odds of OBC1 (OR = 2.43, P = 0.04) compared to acute PTMD participants. A strong association was found with OBC2 score (OR = 4.12, P = 0.0004). These associations remained in the multivariable analyses when adjusted for potential confounders; OBC1 (OR = 3.07, P = 0.01), and OBC2 (OR = 4.71, P = 0.0005). The sensitivity analysis also showed that these results were not biased by pain intensity or patients’ recruitment location OBC1 (OR = 3.07, P = 0.01), and OBC2 (OR = 4.71, P = 0.0005). Conclusion. Relative to acute PTMD, chronic PTMD is associated with oral parafunctional behaviors. This association was not confounded by demographic characteristics, psychological symptoms, pain severity or patients’ recruitment location. This result suggests that these behaviors contribute to the transition from acute to chronic PTMD.Objectif. Cette étude cas-témoins a été conçue pour étudier le lien entre les comportements parafonctionnels oraux dans les troubles temporo-mandibulaires douloureux chroniques (DPMT) et les DMP aiguës. Méthodes Les participants atteints de MPT ont été recrutés dans quatre sites différents: (i) la clinique dentaire de l'Hôpital général juif; (HGJ); (ii) la clinique de diagnostic oral (OD) de la faculté de médecine dentaire de l'Université McGill; (iii) l’hôpital général de Montréal (Hôpital général de Montréal), Montréal, Québec, Canada; et (iv) le groupe de spécialité dentaire, à Ottawa, Ontario, Canada. Une classification de la douleur basée sur l'Association internationale pour l'étude de la douleur (IASP) a été utilisée pour classer les participants PTMD dans les groupes aigus (<3 mois) ou chroniques (≥ 3 mois). La liste de contrôle validée sur le comportement oral, le trouble d'anxiété générale (GAD-7) et le questionnaire sur la santé du patient (PHQ-9) ont été utilisés pour évaluer les comportements parafonctionnels oraux, l'anxiété et la dépression. L'association entre les comportements parafonctionnels oraux et la PTMD a été évaluée à l'aide d'une analyse de régression logistique inconditionnelle. Résultats. Au total, 284 participants ont accepté de participer à cette étude. 48 (17%) ont été inclus dans le groupe PTMD aigu et 236 (83.1%) dans le groupe chronique. La majorité des deux groupes étaient des femmes (p = 0.23). Les résultats de l'analyse logistique brute ont montré que les participants atteints de PTMD chronique étaient plus susceptibles de présenter des probabilités élevées de CBO1 (OR = 2.43, P = 0.04) par rapport aux participants de PTMD aigus. Une forte association a été trouvée avec le score OBC2 (OR = 4.12, P = 0.0004). Ces associations sont restées dans les analyses multivariées après ajustement pour les facteurs de confusion potentiels; OBC1 (OR = 3.07, P = 0.01) et OBC2 (OR = 4.71, P = 0.0005). L’analyse de sensibilité a également montré que l’intensité de la douleur ou le lieu de recrutement des patients; OBC1 (OR = 3.07, P = 0.01) et OBC2 (OR = 4.71, P = 0.0005) n'étaient pas biaisés dans ces résultats.Conclusion. Par rapport à la DPM aiguë, la DMPT chronique est associée à des comportements para fonctionnels oraux. Cette association n’est pas confondue avec les caractéristiques démographiques, les symptômes psychologiques, la gravité de la douleur ou le lieu de recrutement des patients. Ce résultat suggère que ces comportements contribuent à la transition de la PTMD aiguë à chronique
Fabry-Perot microcavity for diamond-based photonics
No full textOpen Fabry-Perot microcavities represent a promising route for achieving a quantum electrodynamics (cavity-QED) platform with diamond-based emitters. In particular, they offer the opportunity to introduce high-purity, minimally fabricated material into a tunable, high quality factor optical resonator. Here, we demonstrate a fiber-based microcavity incorporating a thick (>10μm) diamond membrane with a finesse of 17 000, corresponding to a quality factorQ∼106. Such minimally fabricated thick samples can contain optically stable emitters similar to those found in bulk diamond. We observe modified microcavity spectra in the presence of the membrane, and we develop analytic and numerical models to describe the effect of the membrane on cavity modes, including loss and coupling to higher-order transverse modes. We estimate that a Purcell enhancement of approximately 20 should be possible for emitters within the diamond in this device, and we provide evidence that better diamond surface treatments and mirror coatings could increase this value to 200 in a realistic system
Compensation Strategy to Reduce Geometry and Mechanics Mismatches in Porous Biomaterials Built with Selective Laser Melting
No full textThe accuracy of Additive Manufacturing processes in fabricating porous biomaterials is currently limited by their capacity to render pore morphology that precisely matches its design. In a porous biomaterial, a geometric mismatch can result in pore occlusion and strut thinning, drawbacks that can inherently compromise bone ingrowth and severely impact mechanical performance. This paper focuses on Selective Laser Melting of porous microarchitecture and proposes a compensation scheme that reduces the morphology mismatch between as-designed and as-manufactured geometry, in particular that of the pore. A spider web analog is introduced, built out of Ti-6Al-4V powder via SLM, and morphologically characterized. Results from error analysis of strut thickness are used to generate thickness compensation relations expressed as a function of the angle each strut formed with the build plane. The scheme is applied to fabricate a set of three-dimensional porous biomaterials, which are morphologically and mechanically characterized via Micro Computed Tomography, mechanically tested and numerically analyzed. For strut thickness, the results show the largest mismatch (60% from the design) occurring for horizontal members, reduces to 3.1% upon application of the compensation. Similar improvement is observed also for the mechanical properties, a factor that further corroborates the merit of the design-oriented scheme here introduced
Mechanisms of mRNA post-transcriptional regulation in mammalian oocytes
No full textPrecise regulation of gene expression is indispensable for proper cell function. This challenge is particularly complex in oocytes where transcription is active during growth but is undetectable in fully grown oocytes and during meiotic maturation. Transcripts required to drive oocyte maturation and early post-fertilization embryogenesis are therefore synthesized in growing oocytes and kept translationally silent until the appropriate time. RNA processing mechanisms play central roles in regulating translation and are indispensable for timely and successful oogenesis. In Manuscript I, an RNA processing mechanism is described in the oocyte. Maternal transcripts are categorized according to their poly(A) tail length at different stages of oocyte development. Type I and Type II transcripts are deadenylated and polyadenylated, respectively, during maturation. Type III transcripts are polyadenylated in the first half of maturation and deadenylated in the second half of maturation. CNOT6, a key component of the CCR4-NOT deadenylase complex, requires Pumilio and FBF binding elements (PBE) to deadenylate type III transcripts. Surprisingly however, the modulation of the poly(A) tail does not affect RNA translation and turnover in the oocyte. In Manuscript II, a novel type of RNP is described in cold-shocked oocytes. Inducible 18033 granules are identified as a novel type of stress granules whose formation is controlled by oocyte cell cycle regulators. More specifically, CDK1 activity prevents the formation of the granules at the later stages of maturation. A functional reporter gene assay also reveals a protective role for 18033 granules, preventing the non-reversible inhibition of translation in cold-shocked oocytes. The results described in this thesis highlight different facets of RNA metabolism in the oocyte and explore their role during maturation in producing eggs.Une régulation précise de l'expression des gènes est indispensable au bon fonctionnement des cellules. Ce défi est particulièrement complexe dans les ovocytes, où la transcription est active pendant la croissance mais indétectable dans les ovocytes à bout de croissance. Les transcrits nécessaires à la maturation des ovocytes et en début d'embryogenèse post-fécondation sont donc synthétisés dans les ovocytes en croissance et gardés silencieux jusqu'au moment opportun. Les mécanismes de maturation de l'ARN jouent un rôle central dans la régulation de la traduction et sont indispensables pour une ovogenèse opportune et réussie. Dans le Manuscrit I, un mécanisme de maturation de l'ARN chez l'ovocyte est décrit. Les transcrits maternels sont classés en fonction de la longueur de leur queue poly (A) durant les différents stades de développement de l'ovocyte. Les transcrits de type I et de type II sont respectivement déadénylés et polyadénylés pendant la maturation. Les transcrits de type III sont polyadénylés au cours de la première moitié de la maturation et déadénylés pendant la seconde moitié de la maturation. CNOT6, un composant clé du complexe de déadénylase CCR4-NOT, nécessite les éléments de liaison Pumilio et FBF (PBE) pour déadényler les transcrits de type III. Étonnamment, cependant, la modulation de la queue poly (A) ne régule pas la traduction et la dégradation de l'ARN dans l'ovocyte. Dans le manuscrit II, un nouveau type de RNP est décrit dans des ovocytes soumis à un choc thermique à froid. Les granules inductibles d'EDC4 sont identifiés comme étant un nouveau type de granules de stress dont la formation est régulée par le cycle cellulaire de l'ovocyte. Plus précisément, l'activité de CDK1 empêche la formation des granules à la fin de la maturation. Un essai fonctionnel de gènes rapporteurs décrit également un rôle protecteur pour les granules d'EDC4, empêchant la diminution de la traduction dans les ovocytes traités à froid. Les résultats décrits dans cette thèse mettent en évidence différentes facettes du métabolisme de l'ARN et explorent leur rôle au cours de la maturation de l'ovocyte et la production d'œufs compétents et de bonne qualité
Beyond negative emotions: Examining the role of positive emotions in non-suicidal selfinjury
No full textAccording to the broaden-and-build theory (Fredrickson, 1998, 2001), negative emotions restrict individuals' thoughts and actions. Contrarily, the experience of positive emotions broadens an individual's repertoire of thoughts and actions, which has the ability to reduce the impact of negative emotions in the short-term (Tugade &Fredrickson, 2004, 2007). However, despite the important role that positive emotions are thought to play in emotion regulation, scholars have yet to look beyond the dysregulation of negative emotion and develop an understanding of the regulation of positive emotions in individuals who engage in NSSI. Accordingly, the primary goal of this dissertation isto re-conceptualize how emotion dysregulation is studied within the field of NSSI through the investigation of positive emotions. The first manuscript examines the role of negative and positive emotional reactivity in 96 female university students who reported engaging in NSSI within the past two years (Mage = 20.28 years; SD = 1.65) and an age-matched female no-NSSI comparison group (Mage = 20.43 years; SD = 1.76). Females with a history of NSSI reported higher negative emotional reactivity across all facets (emotional intensity,sensitivity, and persistence) compared to females without a history of the behaviour. Additionally, the persistence of negative emotions was found to be the only significant predictor of NSSI engagement. On the other hand, no differences were found between the two groups in relation to positive emotional reactivity. The second manuscript investigates the role of emotional dysregulation of negative and positive emotions inindividuals with and without a history of NSSI. Participants included 95 female university students who reported engaging in NSSI over the past two years (Mage =20.27; SD = 1.65) as well as 95 female university students without a history of NSSI engagement (Mage = 20.43; SD = 1.77). Results indicated that individuals with a history of NSSI reported significantly more difficulties regulating their negative and positive emotions than those who have not engaged in NSSI. Furthermore, while both groups displayed similar patterns of strategy use across a range of positive and negative emotions, a higher number of unhealthy strategies were selected for situations involving negative emotions. Participants across groups (NSSI and no-NSSI) were found to use more healthy strategies in positive valence situations than unhealthy strategies; however,those with a history of NSSI to a lesser degree than their non-NSSI counterparts. The third manuscript extends these findings by comparing overall group responses on questionnaires that target general tendencies in negative and positive emotional reactivity and regulation, as well as responses following a standardized in-person mood induction. The sample consisted of 36 females (Mage = 20.06; SD = 1.51) with a history of NSSI within the last two years and a no-NSSI female comparison group (n = 34; Mage = 20.15;SD = 1.54). The results indicated that individuals with a history of NSSI reported significantly greater difficulties than those without NSSI in negative emotional reactivity and regulation on the self-report questionnaires. On the other hand, no group differences were found for positive emotional reactivity and regulation. Furthermore, participants' responses to the mood inducement task revealed no group differences in reactivity or regulation for either negative or positive emotions. Consistent with previous research, individuals' negative emotional reactivity and regulation play an important role in NSSI. Nonetheless, the importance that the broaden-and-build theory places on positive emotions has the potential to deepen our understanding of the underlying processes involved in NSSI. Notably, for the regulation but not the reactivity, of positive emotions.Selon la théorie broaden-and-build (élargissement et construction) (Fredrickson, 1998, 2001), les émotions négatives limitent les pensées et les actions, contrairement; l'expérience des émotions positives élargit le répertoire de pensées et d'actions d'un individu, ce qui a la capacité de réduire l'impact des émotions négatives à court terme (Tugade et Fredrickson, 2004, 2007). Cependant, bien que la théorie de l'élargissement et de la construction (Fredrickson, 1998, 2001) place sur le rôle des émotions positives auprès de la régulation des émotions, les chercheurs n'ont pas encore recherché au-delà de la dérégulation des émotions négatives pour développer une meilleure compréhension de la régulation des émotions chez les individus qui s'automutilent. En conséquence, l'objectif principal de cette thèse est d'élargir la conceptualisation de la dysrégulation des émotions dans le domaine de l'automutilation non suicidaire (AMNS) en intégrant les émotions positives. Le premier manuscrit examine le rôle de la réactivité émotionnelle négative et positive chez 96 étudiantes qui s'étant déjà automutilée au cours des deux dernières années (Mâge = 20,28 ans; ÉT = 1,65) et un groupe témoin non-AMNS (Mâge = 20,43années, ÉT = 1,76). Les femmes ayant des antécédents d'AMNS ont signalé uneréactivité négative plus élevée dans tous les aspects (intensité émotionnelle, sensibilité et persistance) comparativement aux femmes n'ayant pas les mêmes antécédents de comportement. De plus, la persistance des émotions négatives était le seul prédicteur significatif de l'AMNS. Aucune différence n'a été trouvée entre les deux groupes en ce qui concerne les émotions positives. Le deuxième manuscrit étudie le rôle de la dérégulation émotionnelle des émotions positives et négatives chez les personnes avec ou sans antécédents d'AMNS. Les participants comprenaient 95 étudiantes universitaires ayant déclaré avoir eu un comportement d'automutilation non suicidaire au cours des deux dernières années (Mâge = 20,27, ÉTæ = 1,65) ainsi que 95 étudiantes universitaires sans antécédents d'engagement NSSI (Mâge = 20,43; ÉT= 1,77). Les résultats ont indiqué que les personnes atteintes d'automutilation non suicidaire ont signalé beaucoup plus de difficultés à réguler leurs émotions positives et négatives que celles qui n'ont pas un historique récent de l'ANMS. De plus, bien que les deux groupes aient présenté des schémas similaires en ce qui concerne l'utilisation des stratégies à travers les émotions, un plus grand nombre de stratégies inadaptées ont été sélectionnées pour des situations impliquant des émotions négatives. Les individus avec et sans AMNS ont été trouvés d'utiliser davantage de stratégies plus adaptatives lors des situations de valence positive; cependant, celles qui se sont déjà automutilées se trouvent dans une moindre mesure queleurs homologues non-AMNS. Le troisième manuscrit étend nos résultats en comparant les réponses des participants à des questionnaires qui ciblent les tendances générales de la réactivité émotionnelle et la régulation positive et négative avec les réponses des participants à la suite d'une induction d'humeur standardisée en personne. L'échantillon comprenait 36 femmes (Mâge = 20,06, ÉT = 1,51) ayant des antécédents d'AMNS au cours des deux dernières années et un groupe de comparaison de femmes non-AMNS (n= 34, Mâge = 20,15, ÉT = 1,54). Les résultats ont indiqué que les individus ayant des antécédents d'AMNS ont signalé des difficultés significativement plus grandes dans la réactivité émotionnelle négative et la régulation lors des questionnaires d'auto-évaluation. D'autre part, aucune différence de groupe n'a été trouvée pour la réactivité émotionnelle et la régulation des émotions positives. De plus, les réponses des participants à la tâche d'induction de l'humeur n'ont révélé aucune différence de réactivité ni de régulation entreles émotions positives et négatives