99 research outputs found

    Predicting local control of brain metastases after stereotactic radiotherapy with clinical, radiomics and deep learning features

    No full text
    This data package contains the information needed to replicate the research titled - 'Predicting local control of brain metastases after stereotactic radiotherapy with clinical, radiomics and deep learning features

    Automated segmentation of brain metastases in T1-weighted contrast- enhanced MR images pre and post stereotactic radiosurgery

    No full text
    This data package contains the information needed to replicate the research titled - 'Automated segmentation of brain metastases in T1-weighted contrast- enhanced MR images pre and post stereotactic radiosurgery'

    Experience-related effects on the response selectivity of macaque inferior neurons

    No full text
    De laatste decennia hebben verschillende studies de tradionele visie op corticale veranderingen in de volwassen cortex ten gevolge van visuele ervaringen, die erg gelimiteerd zijn na de ‘kritische periode’, ondergraven. In verschillende corticale gebieden werden namelijk ervaringsgerelateerde veranderingen in de functionele organisatie en in de eigenschappen van neuronale responsen gevonden. In dit proefschrift onderzochten we veranderingen in stimulusselectiviteit van neuronen in the inferio-temporale (IT) cortex bij rhesusapen ten gevolge van veranderingen in de stimulus statistieken, categorizatie-leren en adaptatie.Om na te gaan hoe de stimulusselectiviteit van IT neuronen, die gevoelig zijn voor objecteigenschappen als vorm, kleur of textuur, zich aanpast aan veranderingen in de stimulusdistributie statistieken, werd het stimulusbereik op een bepaalde dimensie gemoduleerd, resulterend in twee vormsets die in twee opeenvolgende blokken werden gepresenteerd. De stimuli werden gepresenteerd in een Rapid Serial Visual Presentation (RSVP) paradigma waarvan de validiteit in het bestuderen van vorm-selectiviteit van IT neuronen binnen parametrische vormsets eerst werd aangetoond. De neuronale vormdiscriminatie verbeterde wanneer een vormset met een smaller stimulusbereik (wat onlosmakelijk verbonden was met minder variantie, grotere densiteit en meer inter-stimulus similariteit op pixel-niveau) werd aangeboden. Dit suggereert dat de selectiviteit van IT neuronen zich aanpast aan de stimulusdistributie statistieken bij het snel aanbieden van een beperkte set van stimuli.In een tweede deel onderzochten we de effecten van categorizatie-leren op de neuronale representatie van complexe vormen in IT cortex. Door registraties voor en na het categorizatie-leren en contrabalancering van de relevante dimensie over apen konden we de categorie-gerelateerde effecten onderscheiden van de stimulus-gerelateerde selectiviteitseffecten. We vonden een expansie van de relevante dimensie en een iets gelijkaardiger neuronaal antwoordpatroon voor exemplaren van dezelfde categorie in vergelijking met een verschillende categorie als gevolg van de categorizatie-training. Deze resultaten suggereren dat vorm categorizatie-leren enkel kleine categorie-gerelateerde veranderingen kan induceren in de vormselectiviteit van IT neuronen in volwassen apen.In het laatste deel onderzochten we, zowel met extracellulair gemeten aktiepotentialen van enkelvoudige neuronen als met lokale veld potentialen (LFPs), de effecten van adaptatie op de stimulusselectiviteit van IT neuronen. Voor zowel de aktiepotentialen als de LFP gamma power (61-100Hz) verlaagden de neuronale responses met stimulusrepetitie, zonder dat de tuningbreedte veranderde. De mate van adaptatie was niet enkel afhankelijk van de antwoordsterkte maar werd ook beïnvloed door de relatie tussen adapter en test stimulus, zowel voor veranderingen in vormeigenschappen als positieveranderingen: er was meer adaptatie wanneer de adapter en test stimulus identieke vormeigenschappen hadden en beiden op dezelfde positie gepresenteerd werden in vergelijking met wanneer deze stimuli verschilden in vorm of positie. We vonden ook een dalend adaptatieniveau met dalende adapter-test stimulus similariteit. Deze resultaten suggereren dat adaptatie plaatsvindt voor of op het niveau van de synapse.status: Publishe

    Tuning plasticity of macaque inferior temporal neurons

    No full text
    Plasticiteit van stimulus selectiviteit van inferio-temporale neuronen bij rhesusapen De laatste decennia hebben verschillende studies de traditionele visie op corticale plasticiteit in de volwassen cortex ten gevolge van visuele ervaringen, die erg gelimiteerd zou zijn na de ‘kritische periode’, ondergraven. In verschillende corticale gebieden werden namelijk veranderingen op basis van visuele ervaringen gevonden in de functionele organisatie en in de eigenschappen van neuronale responsen. In dit doctoraatsproject focussen we op de veranderingen in de stimulus selectiviteit van neuronen in de inferio- temporale (IT) cortex bij rhesusapen ten gevolge van leereffecten, adaptatie-effecten en effecten van stimulus statistieken. Om na te gaan hoe de selectiviteit van IT neuronen, die gevoelig zijn voor objecteigenschappen zoals vorm, kleur en textuur, zich aanpast aan veranderingen in de stimulus distributie statistieken, manipuleerden we het stimulusbereik op een bepaalde dimensie, resulterend in twee vormsets die in twee opeenvolgende blokken werden gepresenteerd. De neuronale vormdiscrimatie verbeterde wanneer een set met een smaller stimulusbereik (dus met minder variantie, grotere densiteit en meer inter-stimulus similariteit op pixel-niveau) werd aangeboden. Dit suggereert dat de neuronale selectiviteit in IT cortex zich aanpast aan de statistieken van de stimulus distributie wanneer een beperkte set van stimuli heel snel aangeboden worden. In een tweede deel onderzochten we de effecten van categorie-leren op de neuronale representatie van complexe vormen in IT cortex. Door registraties voor en na het categorie- leren en contrabalancering van de relevante dimensie over apen konden we de geleerde categorie-gerelateerde effecten onderscheiden van de stimulus-gerelateerde selectiviteitseffecten. Onze resultaten suggereren dat de selectiviteit van IT neuronen kan beïnvloed worden door het leren categorizeren van stimuli: de verhouding tussen binnen- categorie en tussen-categorie respons similariteiten verhoogde met categorie-leren. Dit effect was klein, maar significant. Daarnaast was er ook een expansie van de relevante dimensie als gevolg van de categorie-training. In een derde deel willen we, zowel met extracellulair gemeten aktiepotentialen van enkelvoudige neuronen als met lokale veld potentialen (LFP) van een populatie van neuronen, nagaan hoe adaptatie de neuronale stimulus selectiviteit in de IT cortex beïnvloedt als functie van het verschil tussen adaptatie en test stimuli. Verder willen we ook onderzoeken in welke mate de sterkte van het adaptatie effect functie is van de effectiviteit van de stimulus, d.i. hoe sterk het neuron gedreven wordt door de stimulus.status: Publishe

    Conflict monitoring in speech processing: an fMRI study of error detection in speech production and perception

    No full text
    To minimize the number of errors in speech, and thereby facilitate communication, speech is monitored before articulation. It is, however, unclear at which level during speech production monitoring takes place, and what mechanisms are used to detect and correct errors. The present study investigated whether internal verbal monitoring takes place through the speech perception system, as proposed by perception-based theories of speech monitoring, or whether mechanisms independent of perception are applied, as proposed by production-based theories of speech monitoring. With the use of fMRI during a tongue twister task we observed that error detection in internal speech during noise-masked overt speech production and error detection in speech perception both recruit the same neural network, which includes pre-supplementary motor area (pre-SMA), dorsal anterior cingulate cortex (dACC), anterior insula (AI), and inferior frontal gyrus (IFG). Although production and perception recruit similar areas, as proposed by perception-based accounts, we did not find activation in superior temporal areas (which are typically associated with speech perception) during internal speech monitoring in speech production as hypothesized by these accounts. On the contrary, results are highly compatible with a domain general approach to speech monitoring, by which internal speech monitoring takes place through detection of conflict between response options, which is subsequently resolved by a domain general executive center (e.g., the ACC)

    Cue-switch effects do not rely on the same neural systems as task-switch effects

    No full text
    The cued task-switching paradigm is often used to study cognitive control. In this paradigm, people are generally slower and make more errors when switching tasks as compared with repeating the same task. When two cues are mapped to each task, these switch costs could result from a mixture of cue-switch effects (which are thought to reflect cue encoding) and task-switch effects (which are thought to reflect task set preparation). In the behavioral literature, there has been a lively debate on the degree to which cue-switch effects and task-switch effects indeed reflect different phenomena. In the present study, we used fMRI to examine whether and to what extent the neural network underlying task-switch effects is also involved in cue-switch effects. We found task-switch but no cue-switch effects in the frequently observed preparation-related activation in fronto-parietal areas. These results suggest that the fronto-parietal areas displaying preparatory activity in task-switching paradigms are engaged in task preparation but not in cue encoding and that task preparation and cue encoding rely on completely different processes

    Regression.m

    No full text
    matlab code for regression analysis</div

    connectivityAAL.mat

    No full text
    Connectivity matrix with 90 (AAL) nodes for 46 patients.<br

    CognPerformance.mat

    No full text
    Cognitive performance scores for the domains Verbal Memory, Visual Memory, Psychomotor Speed, Processing Speed, Reaction Time, Complex Attention and Cognitive Flexibility.<br
    corecore