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Manejo do solo para favorecer a manutenção da umidade.
No full textA manutenção da umidade no solo é de suma importância para o desenvolvimento das culturas, embora seja um grande desafio para o semiárido, principalmente por causa das condições de clima e de solo. A temperatura e a insolação são elevadas, enquanto a umidade relativa do ar é baixa, resultando em altas taxas de evapotranspiração, as quais, associadas ao baixo índice pluviométrico, e à distribuição irregular das chuvas resultam em deficit hídrico na maior parte do ano. Além disso, as características comuns aos solos, em geral arenosos e pouco profundos, são fatores que limitam sua capacidade de armazenamento de água. Assim, estratégias de manejo que possam favorecer à manutenção da água no solo são de grande importância para os cultivos dependentes de chuva praticados nessa região. As práticas de manejo que podem afetar a umidade no perfil do solo estão estritamente relacionadas às práticas conservacionistas, à manutenção da fertilidade e ao controle da erosão. Por isso, é importante que alguns aspectos sejam considerados
SIGNOR: a database of causal relationships between biological entities
Get PDFAssembly of large biochemical networks can be achieved by confronting new cell-specific experimental data with an interaction subspace constrained by prior literature evidence. The SIGnaling Network Open Resource, SIGNOR (available on line at http://signor.uniroma2.it), was developed to support such a strategy by providing a scaffold of prior experimental evidence of causal relationships between biological entities. The core of SIGNOR is a collection of approximately 12 000 manually-annotated causal relationships between over 2800 human proteins participating in signal transduction. Other entities annotated in SIGNOR are complexes, chemicals, phenotypes and stimuli. The information captured in SIGNOR can be represented as a signed directed graph illustrating the activation/inactivation relationships between signalling entities. Each entry is associated to the post-translational modifications that cause the activation/inactivation of the target proteins. More than 4900 modified residues causing a change in protein concentration or activity have been curated and linked to the modifying enzymes (about 351 human kinases and 94 phosphatases). Additional modifications such as ubiquitinations, sumoylations, acetylations and their effect on the modified target proteins are also annotated. This wealth of structured information can support experimental approaches based on multi-parametric analysis of cell systems after physiological or pathological perturbations and to assemble large logic models
Influência do biocarvão na retenção de água em argissolo e vertissolo.
Get PDFO biocarvão é uma forma de carbono resistente à decomposição e sua aplicação ao solo promove melhorias em atributos que em melhores condições para o crescimento das plantas. O objetivo desse trabalho foi avaliar o efeito da adição de diferentes doses de biocarvão sobre a capacidade de retenção de água em um Argissolo e em um Vertissolo. O estudo foi realizado utilizando diferentes doses de biocarvão (0, 25, 50, 75 e 100%, proporção em massa) adicionadas a um Vertissolo e a um Argissolo. O experimento foi conduzido em esquema fatorial 5 x 2 (5 doses de biocarvão x 2 tipos de solo), em delineamento inteiramente casualizado, com três repetições. Nas misturas de solo+biocarvão foram determinadas as quantidades de água retida em diferentes tensões pelo método da centrífuga. A aplicação de biocarvão aumentou a quantidade de água no ponto de murcha permanente e na capacidade de campo do solo tanto no Vertissolo quanto no Argissolo, com efeitos de maior intensidade nesse último. O aumento de 1% na quantidade de biocarvão adicionada ao solo promoveu um aumento de 3,23 g kg-1 na quantidade de água disponível no solo, independentemente do solo avaliado. Assim, o biocarvão apresenta-se como um condicionador de solo com grande potencial para aumentar a retenção de água em solos da região Semiárida
Decomposição de resíduos orgânicos.
No full textDecomposição de resíduos orgânicos. protocolo XII. Determinação da taxa de Contagem de Decomposição de resíduos orgânicos. Material. Metodologia
Noções de segurança em laboratório.
No full textO laboratório, independentemente do tipo de atividade, é um local de trabalho onde as pessoas estão expostas a riscos físicos, químicos, biológicos, ergonômicos e, por isso, possui grande potencial para a ocorrência de acidentes. Em razão disso, são apresentadas neste capítulo algumas normas que devem ser seguidas pelos usuários visando a minimizar acidentes
Mesofauna.
No full textProtocolo. Metodologia da extração da mesofauna edáfica pelo método do funil de Berlese-Tullgren modificado
MeSH term explosion and author rank improve expert recommendations
Get PDFInformation overload is an often-cited phenomenon that reduces the productivity, efficiency and efficacy of scientists. One challenge for scientists is to find appropriate collaborators in their research. The literature describes various solutions to the problem of expertise location, but most current approaches do not appear to be very suitable for expert recommendations in biomedical research. In this study, we present the development and initial evaluation of a vector space model-based algorithm to calculate researcher similarity using four inputs: 1) MeSH terms of publications; 2) MeSH terms and author rank; 3) exploded MeSH terms; and 4) exploded MeSH terms and author rank. We developed and evaluated the algorithm using a data set of 17,525 authors and their 22,542 papers. On average, our algorithms correctly predicted 2.5 of the top 5/10 coauthors of individual scientists. Exploded MeSH and author rank outperformed all other algorithms in accuracy, followed closely by MeSH and author rank. Our results show that the accuracy of MeSH term-based matching can be enhanced with other metadata such as author rank
Conformation and Interactions of All-d-bombolitin-iii, Retro-all-d-bombolitin-iii and Retro-bombolitin-iii Analog In Aqueous-solution and In the Presence of Detergent Micelles
No full textBombolitins are five structurally related heptadecapeptides which lyse erythrocytes and liposomes and enhance the activity of phospholipase A(2). The conformational properties of the all-D-, retro-all-D-, and retro-L-analogues of bombolitin III were investigated by circular dichroism (CD) and two-dimensional H-1-nuclear magnetic resonance (NMR) techniques. In water, all three sequences are in a random conformation and aggregate to various extents depending on pH and concentration. The two enantiomeric retro-sequences exhibit a higher propensity to form beta-aggregates, while the D-analogue of the native sequence fends to form aggregates of alpha-helices. In the presence of an excess of sodium dodecyl sulfate (SDS), the peptides fold into an amphiphilic alpha-helical conformation (left-handed in the case of the all-D sequences). NMR studies on the L-retro-analogue indicate that the helical segment is localized in the central part of the sequence. Combined CD and surface tension measurements indicate that the critical micellar concentration of SDS is raised in the presence of peptide and that helical folding occurs before micelle formation. These results are interpreted in terms of formation of peptide-detergent complexes. It is estimated that the helical structure forms when 40-50 molecules of detergent are bound to each peptide molecule. These data and our previous results of in vitro biological tests confirm that the ability to form amphiphilic helices is the major determinant of biological activity of bombolitins
SIGNOR 2.0, the SIGnaling Network Open Resource 2.0: 2019 update
Get PDFThe SIGnaling Network Open Resource 2.0 (SIGNOR 2.0) is a public repository that stores signaling information as binary causal relationships between biological entities. The captured information is represented graphically as a signed directed graph. Each signaling relationship is associated to an effect (up/down-regulation) and to the mechanism (e.g. binding, phosphorylation, transcriptional activation, etc.) causing the up/down-regulation of the target entity. Since its first release, SIGNOR has undergone a significant content increase and the number of annotated causal interactions have almost doubled. SIGNOR 2.0 now stores almost 23 000 manually-annotated causal relationships between proteins and other biologically relevant entities: chemicals, phenotypes, complexes, etc. We describe here significant changes in curation policy and a new confidence score, which is assigned to each interaction. We have also improved the compliance to the FAIR data principles by providing (i) SIGNOR stable identifiers, (ii) programmatic access through REST APIs, (iii) bioschemas and (iv) downloadable data in standard-compliant formats, such as PSI-MI CausalTAB and GMT. The data are freely accessible and downloadable at https://signor.uniroma2.it/
Minhocas.
No full textClassificação das minhocas; Hábito alimentar; Reprodução e crescimento; Protocolo XVII: Método de extração de minhocas do solo com extrato de cebola:metodologia e etapas de campo. Etapas de laboratório, cálculos e resultados
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