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Crucial Role of the Accessory Genome in the Evolutionary Trajectory of Acinetobacter baumannii Global Clone 1
Full text linkDespite not being a disease in and of itself, antibiotic resistance could be consideredthe global epidemic of modern times, since it produces the failure to prevent andtreat many infectious diseases. This can ultimately lead to untreatable microbialinfections becoming more widespread and this will significantly increase morbidityand mortality. This worldwide problem is estimated to cause millions of deathsper year and could become an even more significant menace to humanity thanestablished illnesses, such as cancer.In February 2017, the World Health Organization (WHO) published a list ofantibiotic-resistant priority pathogens a catalogue of 12 families of bacteria whichpose the greatest threat to human health - and Acinetobacter baumannii is leadingthe list. The most critical group includes multidrug-resistant bacteria, which pose aparticular threat in hospitals, nursing homes, and among patients whose care requiresdevices such as ventilators and blood catheters. This group includes Acinetobacter,Pseudomonas, and various Enterobacteriaceae and they are often associated withdeadly infections, such as bloodstream infections and pneumonia. Furthermore,these bacteria have become resistant to a large number of antibiotics, includingcarbapenems and third generation cephalosporins ? the best available antibioticsfor treating multidrug-resistant bacteria.A. baumannii is a particularly worrisome example and demands attention: Thispathogen turned into a menace to humans during the late 70s, likely as a result ofintense antibiotic use in hospital settings, and became one of the microorganismsthat are challenging the antibiotic era. Its extreme genome plasticity, combined withmechanisms of horizontal genetic transfer, have played a key role in the evolutionof this microorganism, as well as its adaptability to unfavorable environments.However, its pathophysiology, as well as the mechanisms leading to its success asa pathogen, are not that simple to unveil. However, what is clear is that the triad ofhost-pathogen-environment is crucial in selection and establishment ofmultidrug-resistant clones and outbreaks.Indeed, there are still many aspects of this pathogen that require a deeperunderstanding - not only regarding mechanisms of resistance but also itsglobal pathophysiology. For example, basic understanding of transmissionmechanisms; knowledge of external factors modulating persistence of thepathogen; genetic effects on host susceptibility and infectiousness; mechanisms ofpathogenicity and their dynamics; and genetic variation of the pathogen affectingvirulence and transmissibility are some aspects that would require further study.Frontiers in Microbiology 3 August 2020 | Unraveling the Biology, GeneticsFurthermore, the importance of other members of the genus as important nosocomialpathogens, such as Acinetobacter nosocomialis, has been increasingly recognizedduring the last few years.Fil: Alvarez, Verónica Elizabeth. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; ArgentinaFil: Quiroga, María Paula. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; ArgentinaFil: Galán, Angélica Viviana. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; ArgentinaFil: Vilacoba, Elizabeth. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; ArgentinaFil: Quiroga, Cecilia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; ArgentinaFil: Ramirez, Maria Soledad. California State University; Estados UnidosFil: Centron, Daniela. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; Argentin
La caracterización molecular de aislamientos de Staphylococcus aureus meticilino-resistente revela la diseminación de un nuevo clon en la ciudad de Buenos Aires
Full text linkWe performed a hospital - acquired methicillin - resistant Staphylococcus aureus molecular study in Buenos Aires city. Four clones were found harboring the transposable elementsTn4001 and Tn5405 and the erythromycin resistance determinants ermA and mef(E). Of the isolates, 73% belonged to a clone found previously in the city of Córdoba, which showed an epidemic behavior initially attributed to a widely disseminated South American clone.Fil: Jeric, Paola Elba. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina; ArgentinaFil: Matteo, Mario José. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina; ArgentinaFil: Ramirez, Maria Soledad. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay; ArgentinaFil: Couto, Elsa. Hospital Francés; ArgentinaFil: Tokumoto, Marta. Fundación Favaloro; ArgentinaFil: Centron, Daniela. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina; Argentin
Draft genome of the multidrug-resistant Acinetobacter baumannii strain A155 clinical isolate
Full text linkAcinetobacter baumannii is a bacterial pathogen with serious implications for human health, due to increasing reports of multidrug-resistant strains isolated from patients. Total DNA from the multidrug-resistant A. baumannii strain A155 clinical isolate was sequenced to greater than 65x coverage, providing high-quality contig assemblies.Fil: Arivett, Brock A.. Miami University; Estados UnidosFil: Fiester, Steven E.. Miami University; Estados UnidosFil: Ream, David C.. Miami University; Estados UnidosFil: Centron, Daniela. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; ArgentinaFil: Ramirez, Maria Soledad. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; ArgentinaFil: Tolmasky, Marcelo. Fullerton University; Estados UnidosFil: Actis, Luis A.. Miami University; Estados Unido
Draft Genome Sequence of an International Clonal Lineage 1 Acinetobacter baumannii Strain from Argentina
Full text linkIn the last few years Acinetobacter baumannii has emerged worldwide as an important nosocomial pathogen in medical institutions. Here, we present the draft genome sequence of the international clonal lineage 1 (ICL1) A. baumannii strain A144 that was isolated in a hospital in Buenos Aires City in the year 1997. The strain is susceptible to carbapenems and resistant to trimethoprim and gentamicin.Fil: Vilacoba, Elisabet. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; ArgentinaFil: Déraspe, Maxime. Laval University; CanadáFil: Traglia, German Matias. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; ArgentinaFil: Roy, Paul H.. Laval University; CanadáFil: Ramirez, Maria Soledad. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; Argentina. California State University; Estados UnidosFil: Centron, Daniela. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; Argentin
Aminoglycoside modifying enzymes
Full text linkAminoglycosides have been an essential component of the armamentarium in the treatment of life-threatening infections. Unfortunately, their efficacy has been reduced by the surge and dissemination of resistance. In some cases the levels of resistance reached the point that rendered them virtually useless. Among many known mechanisms of resistance to aminoglycosides, enzymatic modification is the most prevalent in the clinical setting. Aminoglycoside modifying enzymes catalyze the modification at different -OH or -NH2 groups of the 2-deoxystreptamine nucleus or the sugar moieties and can be nucleotidyltranferases, phosphotransferases, or acetyltransferases. The number of aminoglycoside modifying enzymes identified to date as well as the genetic environments where the coding genes are located is impressive and there is virtually no bacteria that is unable to support enzymatic resistance to aminoglycosides. Aside from the development of new aminoglycosides refractory to as many as possible modifying enzymes there are currently two main strategies being pursued to overcome the action of aminoglycoside modifying enzymes. Their successful development would extend the useful life of existing antibiotics that have proven effective in the treatment of infections. These strategies consist of the development of inhibitors of the enzymatic action or of the expression of the modifying enzymes.Fil: Ramirez, Maria Soledad. California State University Fullerton; Estados Unidos. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; ArgentinaFil: Tolmasky, Marcelo E.. California State University Fullerton; Estados Unido
Bacteremia due to Dysgonomonas spp: A report of two cases
No full textWe report the first documented case of bacteremia caused by a Dysgonomonas species in a patient undergoing hemodialysis and a new case of bacteremia caused by D. capnocytophagoides in a patient with biliary tract infection.Fil: Almuzara, Marisa. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Instituto de Fisiopatología y Bioquímica Clínica; ArgentinaFil: Cittadini, Roxana. Sanatorio Mater Dei; ArgentinaFil: Ladelfa, Maria Fatima. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Complejo Medico Policial Bartolome Churruca Andres Visca; ArgentinaFil: Olivieri, Laura. No especifíca;Fil: Ramirez, Maria Soledad. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay; ArgentinaFil: Zamponi, Juan Carlos. Sanatorio Mater Dei; ArgentinaFil: Famiglietti, Angela María Rosa. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Instituto de Fisiopatología y Bioquímica Clínica; ArgentinaFil: Vay, Carlos Alberto. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Instituto de Fisiopatología y Bioquímica Clínica; Argentin
Novel Rearrangement of a Class 2 Integron in Two Non-Epidemiologically Related Isolates of Acinetobacter baumannii
Full text linkTn7::In2-8 contains sat2-aadB-catB2(attC)-dfrA1-sat2-aadA1-orfX in the variable region of a class 2 integron embedded in the Tn7-like transposon. This novel transposon was inserted in its preferred site downstream of the glms gene in Acinetobacter baumannii. Acquisition of the pseudocassette catB2 could have arisen by a secondary-site integrase-mediated intermolecular recombination event.Fil: Ramirez, Maria Soledad. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; ArgentinaFil: Quiroga, Cecilia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; ArgentinaFil: Centron, Daniela. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; Argentin
Acinetobacter baumannii is able to gain and maintain a plasmid harbouring In35 found in Enterobacteriaceae isolates from Argentina
Full text linkThe aim of this study was to determine the presence of bla CTX-M-2 in our A. baumannii population and their putative role as an alternative mechanism of resistance to third-generation cephalosporins in this species. The bla CTX-M-2 gene is widespread among the Enterobacteriaceae isolates from our country; however, it was not found in 76 isolates A. baumannii non-epidemiologically related clinical isolates resistant to third-generation cephalosporins isolated since 1982 in hospitals from Buenos Aires City. A plasmid isolated from Proteus mirabilis that possesses the complex class 1 integron In35::ISCR1::bla CTX-M-2 was used to transform the natural competent A. baumannii clinical strain A118. PCR, plasmid extraction, DNA restriction, and susceptibility test confirmed that A118 could gain and maintain the plasmid possessing In35::ISCR1::bla CTX-M-2, the genetic platform where the bla CTX-M-2 gene is dispersing in Argentina.Fil: Ramirez, Maria Soledad. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Departamento de Microbiología; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Merkier, Andrea Karina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Departamento de Microbiología; ArgentinaFil: Quiroga, María Paula. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Departamento de Microbiología; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Centron, Daniela. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Departamento de Microbiología; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentin
Evaluation of matrix-assisted laser desorption ionization-time-of-flight mass spectrometry for species identification of Nonfermenting Gram-Negative Bacilli
Full text linkMatrix-assisted laser desorption ionization-time-of-flight mass spectrometry (MALDI-TOF MS) to identify 396 Nonfermenting Gram-Negative Bacilli clinical isolates was evaluated in comparison with conventional phenotypic tests and/or molecular methods. MALDI-TOF MS identified to species level 256 isolates and to genus or complex level 112 isolates. It identified 29 genera including uncommon species.Fil: Almuzara, Marisa. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Hospital de Clínicas General San Martín; ArgentinaFil: Barberis, Claudia. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Hospital de Clínicas General San Martín; ArgentinaFil: Traglia, German Matias. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; ArgentinaFil: Famiglietti, Angela María Rosa. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Hospital de Clínicas General San Martín; ArgentinaFil: Ramirez, Maria Soledad. California State University; Estados Unidos. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Vay, Carlos Alberto. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Hospital de Clínicas General San Martín; Argentin
Outbreak of extensively drug-resistant Acinetobacter baumannii indigo-pigmented strains
Full text linkAcinetobacter baumannii pigmented strains are not common in clinical settings. In the present work we report an outbreak caused by indigo-pigmented A. baumannii strains isolated in an acute hospital in Argentina from March to September 2012. Pan-PCR assays exposed a unique pattern belonging to the recently described regional CC113B/CC79P that confirms the relevant relationships among the indigo-pigmented A. baumannii strains. All of them were extensively drug-resistant and harbored different genetic elements associated with horizontal genetic transfer as the transposon Tn2006, class 2 integrons, AbaR-type islands, IS125, IS26, strA, strB, florR and the small recombinase ISCR2 associated to the sul2 gene proceed by ISAba1.Fil: Vilacoba, Elisabet. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones En Microbiología y Parasitología Médica; ArgentinaFil: Almuzara, Marisa. Hospital Interzonal de Agudos Eva Perón; ArgentinaFil: Gulone, Lucia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones En Microbiología y Parasitología Médica; ArgentinaFil: Rodriguez, Rocio. Hospital Interzonal de Agudos Eva Perón; ArgentinaFil: Pallone, Elida. Hospital Interzonal de Agudos Eva Perón; ArgentinaFil: Bakai, Romina. Hospital Interzonal de Agudos Eva Perón; ArgentinaFil: Centron, Daniela. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones En Microbiología y Parasitología Médica; ArgentinaFil: Ramirez, Maria Soledad. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones En Microbiología y Parasitología Médica; Argentin
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