1,720,981 research outputs found
Análisis comparativo de variables biométricas y estimación de la abundancia de Orestias ascotanensis Parenti, 1984 en dos vertientes con estructura de hábitat diferente en el salar de Ascotán
El salar de Ascotán (21°30’37’’ S, 68°16’31’’ O), se encuentra ubicado a 3720 msnm en las cercanías de la ciudad de Calama. En este hábitat de altura, habita el pez endémico Orestias ascotanensis, el cual se encuentra en las vertientes de este sistema. En este estudio se escogieron dos vertientes (6 y 11) con estructura de hábitat y efecto antrópico diferente, en las cuales se eligieron tres sectores relativamente comparables. Para la captura de los peces, se dispuso de trampas de botellas o “minnow traps” y de cierres perimetrales con red de enmalle de 25 m2, para la estimación de abundancia poblacional, análisis de las variables biométricas (peso total y longitud estándar) y densidad poblacional de las Orestias. Con respecto a la abundancia poblacional, en las trampas de botellas se obtuvo un total de 41 peces en la vertiente 6 y 61 en la vertiente 11. Se realizó un análisis de varianza (ANDEVA) anidado, de lo cual estadísticamente no hubo diferencias significativas entre ambas vertientes (p=0,58), ni tampoco entre los sectores (p=0,27). Dentro de los análisis a las variables biométricas, se compararon los datos de la longitud estándar (mediante un ANDEVA) de todos los peces medidos (156 peces en la vertiente 6 y 129 en la vertiente 11), los cuales tampoco arrojaron diferencias entre una y otra vertiente (p=0,79). Pero, al comparar la variable “peso total” entre vertientes utilizando a la longitud estándar como covariable, el análisis indicó pesos contrastantes, mayores en los peces de la vertiente 6 en relación a los peces de la vertiente 11 (p<0,001)). Se utilizaron diversos métodos para calcular la densidad poblacional de Orestias en los tres cuadrantes de 25 m2 correspondiente a los cierres
xii
perimetrales de enmalle (máxima verosimilitud, estimador de Leslie y el método de remoción generalizada de Otis), En la vertiente 6, con dos de los métodos utilizados, se obtuvieron resultados similares, teniendo alrededor de 380 Orestias por los 25 m2, mientras que en la vertiente 11 se obtuvo un valor de 100 Orestias por los 25 m2. Se puede concluir que existen diferencias entre estas dos vertientes que presentan distinto efecto antrópico con hábitat diferente. Si bien no se encontraron diferencias en la abundancia poblacional ni en la comparación de la variable longitud estándar entre las dos vertientes, si se vio reflejada esta diferencia al comparar el peso total de los peces referidos a una longitud específica.Ascotán salar (21º30'37''S; 68º16'31"0), is located at 3720 meters above sea level, close to the city of Calama. In this high Andean habitat, lives the native endemic fish Orestias ascotanensis Parenti in the springs of this system. In this study we selected two springs (6 and 11) with different habitat structure and anthropic influence. In both we selected three relatively comparable sites. For the fish capture, we used bottle traps or "minnow traps" and gill net enclosures of 25 m2 for the relative abundance estimation, biometrics variables analysis (total weight and standard length and Orestias population density. In relation with the relative abundance in the bottle traps, we obtained a total of 41 fish in spring 6 and 61 at spring 11. A nested analysis of variance (ANOVA) did not show significative differences between both springs (p=0,58), and also among sectors (p=0,27). Among the analysis of biometric variables, we compared the standard length (by ANOVA), of the measured fish (156 at spring 6 and 129 at spring 11). This also did not show differences between springs (p=0,79). But when comparing "total weight" between springs, using the standard length as a covariable, the analysis indicated contrasting weights, greater in the fish of the spring 6 in relation to the fish of spring 11 (p<0,001). We used diverse methods to estimate the population density of Orestias in the three 25 m2 corresponding nets quadrants (maximum likelihood, Leslie estimator and the general remotion Otis method). At spring six there were obtained similar results with both methods. It was obtained around 380 Orestias by 25 m2, meanwhile at spring 11; we obtained a value of 100 Orestias at 25 m2. It can be concluded that there are
xiv
differences between these springs since they present different anthropic influence and have different habitat. Although we did not find differences in relative abundance neither at the standard length, the difference was shown when comparing the total weight in relationship with a specific longitude
La compleja historia de la subfamilia trichomycterinae como modelo para la dispersión y distribución de fauna íctica en Chile
La fauna íctica en Chile es un complejo ensamble de peces que ha sido moldeado
en conjunto a la evolución geológica del territorio, probablemente durante los últimos 30
millones de años. Para comprender el contexto de diversificación de la ictiofauna, se
utilizó como modelo a la subfamilia Trichomycterinae, un grupo de peces del Orden
Siluriformes que está presente a 1o largo de todo Chile. A través de la filogenia
molecular de este grupo se reconstruye la historia de colonización y dispersión de fauna
íctica desde el Mioceno medio. Se encuentra evidencia molecular que soporta una
hipótesis morfológica recientemente propuesta, indicando que el género Trichomycterus
sería polifilético. El grupo de especies del Rango Altoandino estaría emparentado a 1a
fauna Andina y Neotropical, en cambio el grupo de especies de Chile centro sur formaría
un grupo independiente. Un resultado destacable es el hallazgo de dos clados
mitocondriales, que coexisten en el río Maipo. Debido a la posible existencia de una
especie anteriormente sinonimizada, se pone a prueba la hipótesis de aislamiento
reproductivo y diagnosis morfológica. Se encuentra que entre los ríos Aconcagua y
Maipo existirían 3 agrupamientos genéticos, uno de ellos diagnosticable en base al
sistema de la línea lateral. El tercer grupo no sería diagnosticable en base a este carácter,
sin embargo, el análisis multivariado de los caracteres extremos sugiere una
diferenciación incipiente. Se concluye que es correcta la revalidación de Trichomycterus
maculatus Valenciennes y se designa temporalmente a la población del río Aconcagua
como Trichomycterus sp grp spp maculatus, hasta realizar una descripción formal de Ii
maculatus y la comparación morfológica necesaria.Ichthyological fauna in Chile is a complex assembly of fishes that has been
developed together with the geological evolution of the environment, probably during
the last 30 millions of years. To understa¡d the context of diversification of
icht§ofauna, the Trichomycterinae subfamily, a $oup of fishes of the Siluriformes
Order was used as a model. Through molecular phylogeny, the history of colonization
and dispersion of ichthyofauna was reconstructed since middle Miocene. A molecular
evidence was found that support a morphological hypothesis which indicate that
Trichomycterus genus would be pollphyletic. The group of species of the High Andean
Range would be more closely related to Andean and Neotropical fauna, in tum the group
of species of central-south Chile would be an independent group. A remarkable finding
is the existence of two mitochondrial clades, that coexists in Maipo River. Due to the
possible existence of a species formerly sinonymized, the hypothesis of reproductive
isolation and morphological diagnosis was tested. It is found that between Aconcagua
and Maipo rivers would exist three genetic groups, one of them morphologically
distinguishable based upon the lateralis system. The third group would not be
distinguishable based on this character, but multivariate analysis of extemal characters
suggests that it would be starting to differentiate from the other gtoups. It is concluded
that it is correct the renewal of Trichomycterus maculatus Valenciennes, and the
population of Aconcagua River it is designated temporally as Trichomycterus sp grp spp
maculatus, until a formal description of T. maculatus and fhe necessary comparation
would be done.Esta tesis fue financiada por el proyecto FONDECYT 11060496 (David Véliz), Basal
PFB 023, Contrato ICM-P05-002. Agradezco al Departamento de Postgrado y Prostítulo de la
Vicerrectoría de Asuntos Académicos por financiar la pasantía en Ia Universidad de Kansas,
EEUU, y a CONICYT por la beca de maestría
Explorando los efectos de la contaminación con asimetría fluctuante y morfometría geométrica bajo un entramado ecológico-evolutivo complejo sobre dos especies putativas crípticas de Trichomycterus en la cuenca del Maipo
Una de las medidas para estimar las perturbaciones que desestabilizan el proceso natural del desarrollo es la asimetría fluctuante (AF), que refiere a pequeñas desviaciones aleatorias respecto a la simetría de un carácter bilateral, y puede ser utilizada como un bioindicador de salud individual y calidad de los hábitats. En este trabajo se buscó una asociación entre la AF y el estrés ambiental producido por exposición crónica a la contaminación durante el desarrollo. Para esto se utilizaron bagrecitos de dos grupos genéticos del género Trichomycterus coexistiendo en simpatría en la cuenca del río Maipo; uno de los sistemas fluviales dulceacuícolas más antropizados de Chile y con grados variables de contaminación. Se cuantificó la AF en la forma cefálica de peces adultos fotografiados vivos en ambientes contaminados y menos contaminados. Para proceder se utilizaron datos moleculares (SNPs) en la identificación de los individuos de cada grupo genético y se estimó su diferenciación morfológica extrayendo la forma biológica de la cabeza y analizando patrones de coloración del cuerpo mediante un análisis cuantitativo y cualitativo. Como resultado se pudo corroborar la presencia de dos grupos genéticos diferenciados claramente y cohabitando en tres de los cuatro sitios muestreados en la cuenca del Maipo. A nivel morfológico no fue posible establecer divergencias evidentes entre los grupos, observándose leves diferencias en el patrón de coloración (manchas) y la forma de la cabeza, que se hacen más marcadas/notorias al comparar individuos más contrastantes en estos aspectos. Para ambos grupos se encontraron niveles variables de asimetría fluctuante, pero no asociados al estrés ambiental. Tampoco se obtuvo una sensibilidad diferenciada entre ambos grupos genéticos de Trichomycterus al evaluar dentro y entre las localidades muestreadas. Estos resultados son consistentes con otros estudios que han observado relaciones débiles o ausentes entre estas variables, que en nuestro caso se podrían atribuir a una gran capacidad de adaptación del bagrecito a entornos perturbados y a otros factores no considerados en los análisis, que podrían generar efectos acumulativos o sinérgicos en la AF (e.g. el sexo, rango etario, inclusión de otras estructuras morfológicas y un mayor contraste en los niveles de contaminación). En consecuencia, los hallazgos presentados aquí resaltan la importancia de realizar estudios de campo en sistemas naturales, utilizando como modelo a especies nativas que habitan ambientes estresantes en donde han demostrado establecerse y persistir en el tiempo.One measure to estimate perturbations that destabilize the natural process of development is fluctuating asymmetry (FA), which refers to small random deviations from the symmetry of a bilateral character, and can be used as a bioindicator of individual health and habitat quality. In this study, we investigated the association between FA and environmental stress induced by chronic exposure to pollution during development. To address this, we used catfishes of two genetic groups of Trichomycterus genus, coexisting in sympatry in the Maipo River basin—one of the most anthropized freshwater fluvial systems with varying degrees of contamination. We quantified FA in the cephalic shape of live adult fish photographed in both contaminated and less contaminated environments. To proceed, we utilized molecular data (SNPs) to identify individuals within each genetic group and estimated their morphological differentiation by extracting the biological shape of the head and analyzing body coloration patterns through quantitative and qualitative analyses. As a result, we confirmed the presence of two clearly differentiated genetic groups cohabiting in three of the four sampled sites within the Maipo River basin. Morphologically, no evident divergences were established between the groups, observing subtle differences in coloration patterns (spots) and the head shape, which became more pronounced when comparing more contrasting individuals in these aspects. For both groups, variable levels of fluctuating asymmetry were found, but they were not associated with environmental stress. Additionally, no differentiated sensitivity was observed between the two genetic groups of Trichomycterus when evaluating within and among the sampled localities. These results are consistent with other studies that have reported weak or absent relationships between these variables. In our case, this could be attributed to the catfish’s remarkable adaptability to disturbed environments and other factors not considered in the analyses, which may contribute to cumulative or synergistic effects on FA (e.g. sex, age range, inclusion of other morphological structures, and greater contrast in contamination levels). Consequently, the findings presented here highlight the importance of conducting field studies in natural systems, using as a model native species that inhabit stressful environments where they have demonstrated to settle and persist over time.Versión original del auto
Funcionamiento de un ecosistema fluvial altiplánico: variación espacio-temporal de macroinvertebrados bentónicos en la cuenca del río Lauca
Seminario de Título para optar al Título de Biólogo con mención en Medio Ambiente.El río Lauca se encuentra ubicado entre las latitudes 18º7’18’’ y 18º48’36’’S y
longitudes 69º0’5’’ y 69º29’27’’O, en la Región de Arica y Parinacota, desde los 3900
a 4500 m s.n.m.. Desde su origen y durante el transcurso de su desarrollo, se han
generado una serie de episodios geológicos, hidrogeológicos y cambio climático que
han delineado a la actual cuenca, generado condiciones que permiten albergar a
comunidades biológicas muy particulares. Este sistema se ve afectado tanto por
factores ambientales como antropogénicos siendo altamente sensible a variaciones
abióticas, lo que generaría un efecto modulador en la biota. Actualmente se cuenta
con escasa información sobre la ecología de comunidades de macroinvertebrados
acuáticos en la zona bioclimática tropical de altura (Altiplano), y cómo estas se
relacionan con las características ambientales y su respuesta a perturbaciones. Se
realizó un estudio de la comunidad de macroinvertebrados bentónicos en el sistema
fluvial río Lauca, con el objetivo de caracterizar a nivel espacial y temporal (pre y postlluvias) la estructura y composición de la comunidad zoobentónica. Además, se describieron propiedades emergentes de la comunidad con el fin de explorar qué
variables ambientales explican la distribución de la comunidad, y por último estimar
atributos ecosistémicos.
Se encontraron 57 taxa a nivel de género y morfotipo siendo los más abundantes los
especímenes de la Familia Chironomidae. Si bien no se encontraron diferencias
significativas entre temporadas (p>0.05) para las propiedades emergentes
comunitarias, se observó alternancia de los taxa y grupos funcionales tróficos entre
estas. Los resultados del análisis de varianza con permutaciones (PERMANOVA)
mostraron que la comunidad, en términos de abundancia, presenta diferencias
significativas derivadas de la interacción entre el factor temporal y los sustratos
(pseudo-F = 1,531; p < 0,02), mientras que para grupos funcionales se presenta variación a nivel mesoescala (sitio) y microescala (sustratos). Los resultados del
análisis RDA mostraron que las variables explicativas son la altitud, pendiente,
nitrato, nitrito y P-Kjeldahl (p < 0,05).
Los índices de atributos ecosistémicos caracterizan al río como un sistema
heterotrófico, donde la productividad primaria no se genera en el sitio, sino más bien
esta podría provenir de desde aguas arribas o por inundaciones laterales del lecho
fluvial. Los bofedales afluentes permiten el desarrollo de macrófitas lo que generaría
mayor productividad in-situ, señalandolos como sistemas autotróficos.
En conclusión, las intensas lluvias estivales producen cambios en el ecosistema
acuático, con respuestas discretas a la estacionalidad en las comunidades
asociadas, generando alternancias de algunos taxa y grupos funcionales tróficos.The River Lauca belongs to the Altiplanic or High Andean region of Arica and
Parinacota, and is located between latitudes 18º7’18’’ - 18º48’36’’S and longitudes
69º0’5’’ - 69º29’27’’O, from 3900 to4500 m. a.s.l. Since its origin there has been a
series of geological, hydrological and climate change episodes, that have shape the
current basin, developing particular conditions that allows housing very specific
biological communities. This stream has been affected by both environmental and
anthropogenic factors which make the system highly sensitive to abiotic variations
that in turn, generates a modulating effect on the biotic composition. Currently, there
is scarce information about the ecology of aquatic macroinvertebrates communities in
tropical bioclimatic areas such as the Altiplano, and how they relate to environmental
settings and respond to disturbances. This study was conducted on the benthic
macroinvertebrate community of the Lauca River, with the goal to characterize
spatially and temporarily (pre and post-rains) the structure and composition of the
biota. Furthermore, emergent properties of the community were described in order to
understand environmental variables that explain the distribution of the community,
and its attributes at the ecosystem level.There were 57 taxa at both genus and morphotype levels, being the most abundant
those belonging to the Chironomidae Family. Although there were no significant
differences of richness and composition between seasons (P > 0.05), there was an
important turnover of both taxa and trophic functional groups temporally.
PERMANOVA showed significant differences of population abundances in the
interaction between temporal and substrates factors (pseudo-F = 1,531; p < 0,02),
while functional groups showed significant differences at both macrosacale (sites) and
microscale (substrates) levels. RDA analysis showed that environmental variables
that explain distributions patterns of taxa (p < 0,05) are altitude, slope, nitrate, nitrite,
and P-Kjeldahl.Indexes of ecosystem attributes characterized the river as a heterotrophic system,
where primary productivity is not generated in-situ, but rather it could come from
headwaters or by lateral flood-pulses of the riverbank. The bofedal tributaries, allow
the development of macrophytes, which would generate productivity in-situ,
characterizing them as autotrophic systems.
In conclusion, heavy rains in summer season produce important changes in the
aquatic ecosystem. Its response is discreet and strongly associates to seasonality,
generating important turnover of some taxa and trophic functional groups along the
river
Evaluación del estado ecológico del estero Puangue (Regiones V y Metropolitana-Chile), mediante los índices de hábitat fluvial (IHF) y de integridad biótica (IIBP) aplicado a Ictiofauna
El estero Puangue (orden 2), principal afluente extraandino del río Maipo, está situado entre las comunas de Quilpué (V Región), Curacaví, María Pinto y Melipilla (RM) y presenta diversa actividad antrópica a lo largo de toda su extensión, encontrando agricultura, zonas urbanas, descargas de aguas servidas puntuales y difusas, actividad industrial láctea, extracción de agua para riego y el trasvase de un canal procedente del río Mapocho, aún cuando en su tercio superior conserva una fauna íctica autóctona importante para la biodiversidad regional, catalogada con problemas de conservación. Se evaluó el estado ecológico del estero Puangue mediante la utilización de dos índices, el Índice de Integridad Biótica aplicado a ictiofauna y el Índice de Hábitat Fluvial, junto con la evaluación de ciertos parámetros fisicoquímicos, contemplando 3 unidades del estado ecológico: el componente biológico, el físico-estructural y el fisicoquímico. Para dicha aplicación se requirió de la adaptación del Índice de Integridad Biótica al estero Puangue, siguiendo la metodología general utilizada en diversos países, con lo que se establece el Índice de Integridad Biótica aplicable al estero Puangue, IIBP. La determinación del Estado Ecológico se realizó a través de dos campañas de monitoreo en las estaciones de otoño y primavera del año 2006, evaluadas en 9 sitios de trabajo. Los componentes físico-estructural y fisicoquímico del estado ecológico del estero Puangue mostraron un gradiente negativo desde las estaciones superiores bien conservadas, hasta las estaciones cercanas a la desembocadura; y el componente biológico, evaluado a través del IIBP, segregó claramente las estaciones de acuerdo a la presencia de ictiofauna introducida, y las estaciones impactadas por calidad fluvial y por parámetros fisicoquímicos. El Estado Ecológico del estero Puangue queda establecido como Bueno para la estación 1, Deficiente para la estación 2, Moderado para la estación 3, y Malo para las estaciones 4 a 9. En consecuencia, se propone: i) establecer usos y objetivos de calidad diferenciados, tanto para la zona media-alta del estero (Naciente a Curacaví), como para la zona media-baja (Curacaví –Ruta 78, Ruta 78 – desembocadura), en función de sus calidades dispares actuales; ii) establecer medidas integrales de protección del ecosistema acuático en la zona desde la naciente del estero Puangue hasta Curacaví; iii) establecer medidas de reparación y protección para la zona media-baja del estero Puangue.Trabajo de titulación parcialmente financiado por el Fondo De Investigación Patrimonial número 24-03-192-46 del Museo De Historia Natural De Valparaís
Caracterización de la riqueza íctica en ecosistemas lacustres y fluviales de Chile comparando metabarcoding de ADN ambiental (eDNA) con un método tradicional de captura
Seminario de Título entregado a la Universidad de Chile en cumplimiento parcial de los requisitos para optar al Título de Bióloga con mención medio ambiente.Conocer la composición y riqueza de especies que componen un ecosistema dado es uno de los factores más relevantes al realizar estudios de biodiversidad, tanto como para satisfacer los requerimientos legales, como por su valor intrínseco, único e incalculable. Los estudios que contienen información sobre la riqueza y composición íctica en ecosistemas acuáticos continentales se realizan habitualmente con un equipo de pesca eléctrica que deja inconsciente a los peces y estos se pueden capturar e identificar, metodología sesgada por el esfuerzo de muestreo, abundancia y tamaño corporal de los peces, además de ser potencialmente mortal. En los últimos años, se ha usado el ADN extraído desde una muestra ambiental de agua para detectar la presencia de macroorganismos en sistemas acuáticos (e.g. peces, anfibios, macroinvertebrados). Utilizando herramientas de genómica comunitaria, se realiza la técnica de metabarcoding en muestras de ADN ambiental, que consiste en amplificar mediante PCR una porción específica del ADN comunitario usando partidores universales, para secuenciar de forma masiva con tecnologías de próxima generación (Next Generation Sequencing, NGS). En este estudio se evaluó la riqueza y composición íctica en dos ecosistemas lénticos del altiplano chileno y en seis puntos lo largo de la cuenca del Río Maipo realizando metabarcoding del gen COI (Citocromo Oxidasa I) en muestras de ADN ambiental y se comparó lo obtenido con la metodología estándar de pesca eléctrica. Además, se evaluó el desempeño de estas metodologías al comparar la riqueza y composición esperada con información de capturas históricas y recientes. Los resultados mostraron que el metabarcoding de ADN ambiental es una herramienta altamente sensible al detectar igual o mayor riqueza que lo obtenido con pesca eléctrica y detectando los taxa esperados en los ecosistemas estudiados. Un aspecto relevante es que se pudo (i) identificar y diferenciar las especies cripticas Trichomycterus areolatus y Trichomycterus maculatus, (ii) detectar al bagre Nematogenis inermis (EN) y (iii) detectar a especies exóticas invasoras tales como Salmo trutta y Oncorhynchus mykiss. Estos resultados sugieren que el metabarcoding de ADN ambiental es una herramienta con el potencial de aumentar la tasa de detección de especies raras, cripticas, en baja abundancia y/o exóticas en ecosistemas acuáticos continentales de Chile, pudiendo ser en el futuro un elemento importante para el monitoreo de la diversidad con bajo impacto.Knowing species composition and richness of an ecosystem is one of the key issues in biodiversity studies, to satisfy legal requirements and due to its intrinsic, unique and incalculable value. Studies that contain information about fish species composition and richness in freshwater environments are usually made using an electrofishing equipment. This technique paralyzes fish, and afterwards they can be captured and identified. Unfortunately, this method is biased by sampling effort, body size and abundance, and can be life threatening for fish. In recent years, DNA extracted from an environmental sample of water has been used to detect the presence of macroorganisms in aquatic systems (e.g. fish, amphibians and macroinvertebrates). Using a community genomic approach with environmental DNA (eDNA), the metabarcoding technique consists in amplify a small portion of community DNA through conventional PCR using universal primers, and then sequencing the PCR product using next-generation sequencing technologies (NGS). After a series of computational steps, the identity and taxonomy of each sequence within samples can be known. In this study, fish richness and composition was evaluated with metabarcoding of the gen COI (cytochrome c oxidase subunit I) in two lentic ecosystems of the Chilean Altiplano and from six sites along the Maipo river basin. Number of species obtained through metabarcoding was compared to what was obtained using electro-fishing. Additionally, performance of these methodologies was evaluated by comparing observed with expected richness and composition, as reviewed by data gathered through historical and recent fish survey. Results showed that eDNA metabarcoding is a highly sensitive tool that detects equal or greater species richness than electrofishing, and all expected taxa were identified in the ecosystems studied. It is noteworthy to mention that (i) the cryptic species Trichomycterus areolatus and Trichomycterus maculatus could be identified and differentiated, (ii) the catfish Nematogenis inermis (EN) and (iii) the invasive alien species such as Salmo trutta and Oncorhynchus mykiss could be also detect. These results suggest that environmental DNA metabarcoding is a promising tool with potential to increase detection rates of rare, cryptic, low abundance and exotic species in freshwater ecosystems in Chile, which could be, in the near future, an important element for monitoring diversity with low impact.31-12-202
Estructuración de grupos funcionales de macroinvertebrados bentónicos en un río de carácter urbano de Chile Central: “El río Mapocho"
Tesis entregada a la Universidad de Chile en cumplimiento parcial de los requisitos para optar al grado de Magíster en Ciencias Biológicas.En la actualidad los sistemas lóticos mediterráneos han sido
altamente modificados y contaminados por actividades de tipo
antrópico, afectando la estructuración de las comunidades de
macroinvertebrados bentónicos. Esta investigación tuvo como objetivo
determinar la estructuración de los grupos funcionales alimentarios
de macroinvertebrados bentónicos y su relación con los factores
ambientales en un río mediterráneo de origen altoandino de Chile
Central. Nuestros resultados mostraron una baja similitud en la
estructuración de los grupos funcionales entre los tramos altos y
bajos del río (ANOSIM, R= 0.969; p < 0.05), la que estaría
influenciada principalmente por las concentraciones de nitrato,
nitrito, amonio y fosfato, asociadas a la contaminación de origen
orgánico. Aun así, el río es capaz de recuperar un estado ecológico
permitiendo sustentar la fauna nativa íctica y de macroinvertebrados
bentónicos del lugar, las que se caracterizan por su alto grado de
endemismo.At present, Mediterranean lotic systems have been highly modified
and contaminated by anthropogenic activities, negatively affecting
the diversity and structure of benthic macroinvertebrates
communities. This research aims to determine the structure of the
food functional groups of benthic macroinvertebrates and their
relationships with the environmental factors of a Mediterranean
river of high Andean origin in Central Chile. Our results showed a
low similarity in the structuring of the functional groups between
the high and low sections of the river (ANOSIM, R= 0.969; p < 0.05).
These results would be influenced by variations in the concentration
of nitrate, nitrite, ammonium and phosphate, associated with
pollutants of organic origin. Even so, the river is suitable for
recovering an ecological status, allowing it to sustain the native
macroinvertebrates and fish fauna of the place, fauna which is
characterized by their high degree of endemism
Distribución potencial de la ballena fin (Balaenoptara physalus) en la zona norte y centro de Chile
Para diversas especies y poblaciones de cetáceos, se desconocen sus hábitats críticos, información que se considera clave al planificar medidas de conservación para la sobrevivencia de una población o especie. La identificación de hábitats críticos de una especie en el océano es de alta complejidad, ya que involucra especificar las variables ambientales que los influencian, las que pueden corresponder a características geográficas estables y/o a variables oceanográficas. Para el caso de la ballena fin (Balaenoptera physalus), en particular, su presencia y uso de hábitats críticos son escasamente conocidos en Chile, por lo que en este trabajo se utilizó el método de modelación de distribución de especies Maxent con el fin de identificar posibles sitios de distribución y alimentación de esta especie dentro de la Zona Económica Exclusiva chilena. Para ello se utilizaron datos de presencia de ballena fin provenientes de diferentes estudios, entre los años 2014 y 2020, y desde las bases abiertas de datos digitales. El modelo final consideró las variables ambientales que mostraron un mayor porcentaje de contribución: la concentración de clorofila promedio anual y de los meses de septiembre y octubre, la temperatura superficial del mar y la distancia a la costa. Para evaluar el rendimiento del modelo se utilizaron dos métodos, la validación cruzada y un conjunto de datos independiente correspondiente a seis ballenas fin marcadas con tag satelitales. El modelo final identificó un 0,12% del área con una probabilidad "alta" y "muy alta" de ocurrencia de la ballena fin. Se identificaron dos zonas principales de mayor idoneidad de hábitat donde la probabilidad de ocurrencia de la especie es alta y muy alta, ambas en la zona norte. La primera abarca desde el límite sur de la Región de Tarapacá hasta la ciudad de Antofagasta, en la Región de Antofagasta y la otra desde el sur de Chañaral, Región de Atacama, hasta el sur de Coquimbo, Región de Coquimbo. Estas dos zonas se caracterizan por ser costeras, a no más de 35 km desde la línea de costa. En la validación del modelo con datos independientes, la categoría de idoneidad alta presentó un calce promedio del 57,1% y la de idoneidad muy alta presentó un calce del 66,6% de sus celdas y las posiciones de ballenas fin marcadas en conducta de ARS (Area restricted search). La importancia de las variables ambientales seleccionadas y de la zona costera, parece radicar en la influencia que tiene el sistema de la corriente de Humboldt en las zonas norte y centro del país, que facilita la presencia de una surgencia costera que sustenta una alta productividad primaria en la zona. La preferencia de la ballena fin por áreas costeras representa un riesgo para su conservación, ya que los individuos están más susceptibles a amenazas antropogénicas como la colisión con embarcaciones. El presente modelo es, a nuestro entender, el primero desarrollado para la ballena fin en el Pacífico suroriental, destacando zonas de importancia ecológica para la especie, información que es un insumo fundamental para definir áreas de protección para la especie y aportar a su conservación
Diferencias en el ensamble de macroinvertebrados bentónicos mediterráneos en lugares contaminados y no contaminados : uso de una metodología basada en taxonomía tradicional y molecular
Los estudios de Impacto ambiental (EIA) requieren de una descripción
pormenorizada de los componentes bióticos del lugar que será intervenido para
otorgar el permiso respectivo, considerando entre otras cosas, la descripción
[taxonómica] de macroinvertebrados bentónicos. Debido a la baja resolución
taxonómica alcanzada y su consecuente deficiente descripción comunitaria, esta
información no es suficiente para determinar la calidad ambiental, por lo que es
necesario desarrollar nuevas herramientas que permitan un EIA más preciso y menos
cuestionable. Nuevas tecnologías genómicas desarrolladas en los últimos años
pueden ser de gran utilidad. Por ejemplo, el gen mitocondrial Citocromo oxidasa I
(COI) aumentaría la resolución taxonómica de los individuos lo que valida esta
metodología para el uso en gestión ambiental. Considerando esta información, el
presente seminario tiene como objetivo determinar las diferencias en las
comunidades de macroinvertebrados bentónicos de zonas contaminadas y no
contaminadas de la cuenca del río Maipo comparando una aproximación morfológica
y una a través de la secuenciación masiva. Se muestreo una zona no contaminada
(Isla de Maipo) y una contaminada (Melipilla) dentro del Río Maipo en la Región
Metropolitana utilizando la metodología MiQu (Universidad de Barcelona) para tomar
muestras de macroinvertebrados donde se incorpora la velocidad en los sustratos
muestreados. Se complementó esta aproximación con un análisis físico y químico de
las muestras de agua de ambas zonas. Los invertebrados obtenidos con redes
Surber fueron primero identificados morfológicamente y luego secuenciados con
tecnología de próxima generación usando partidores universales para el gen COI.
Los análisis físicos y químicos del agua indicaron que Melipilla posee aguas degradadas en comparación a Isla de Maipo. Los análisis de diversidad, comúnmente
usados en EIA, no mostraron diferencias entre zonas, exhibiendo baja resolución de
separación de los sitios contaminados y no contaminados en un plano bidimensional
cuando se usó información morfológica. Sin embargo, el análisis genómico permitió
una mejor separación entre los sitios contaminados y no contaminados. Como
información adicional se pudo asignar nombre especifico a organismos que no se
tenía información en el país además de poder detectar especies invasivas en las
muestras. La fortaleza del análisis genómico de próxima generación mostró que es
una novedosa metodología que podría ser utilizada como método de gestión
ambiental.AL FPA NAC-I-052-2014, Beca IEBVersión original del auto
Estimación de abundancia de ensambles de peces de agua dulce mediante métodos de pesca y ADN ambiental.
Tesis presentada para optar al título de Biólogo/a.Studying the diversity and abundance of native and introduced fish communities is crucial for the management and conservation of aquatic ecosystems, both to monitor native species populations and to detect the presence of invasive species, understand community structure, and how the presence/absence of species can alter ecosystem dynamics. Recently, environmental DNA (eDNA) has emerged as an effective tool for monitoring biodiversity without the need for direct organism capture. In some cases, this technique has proven to be more efficient than traditional methods and has generated great interest in its integration into aquatic conservation strategies. In this research, the diversity and abundance of the fish assemblage in the Nonguén stream, one of the most important tributaries of the Andalién River, were studied at four stations, combining eDNA metabarcoding, a qPCR assay specific for rainbow trout, an introduced species, and abundance estimates obtained through a depletion model using electrofishing. The results showed that electrofishing captured a greater diversity of species than eDNA metabarcoding. The qPCR assay specific for rainbow trout was more sensitive in detecting the species at all sampling sites compared to environmental DNA metabarcoding. However, assays conducted with the latter were sensitive in detecting species that were not captured through electrofishing, such as G. australis and P. irwinii. The results of the linear regression between the relative abundance estimated by the depletion method and the data obtained through environmental DNA did not reveal a statistically significant relationship. Finally, although each method has its own limitations and biases, combining both provides a broader view of the dynamics and ecology of these species.Estudiar la diversidad y abundancia de las comunidades de peces nativos e introducidos es crucial para la gestión y conservación de los ecosistemas acuáticos, tanto para monitorear las poblaciones de especies nativas como para detectar la presencia de especies invasoras, comprender la estructura de las comunidades y cómo la presencia/ausencia de las especies pueden alterar las dinámicas de los ecosistemas. Recientemente, el ADN ambiental (eDNA) ha emergido como una herramienta eficaz para monitorear la biodiversidad sin necesidad de una captura directa del organismo. En algunos casos esta técnica ha demostrado ser más eficiente que los métodos tradicionales y ha generado gran interés en su integración en estrategias de conservación acuática. En esta investigación se estudió la diversidad y abundancia del ensamble de peces del estero Nonguén, uno de los tributarios más importantes del río Andalién, en cuatro estaciones combinando metabarcoding de eDNA, un ensayo de qPCR específico para trucha arcoíris, una especie introducida, y estimaciones de abundancia obtenidas mediante un modelo de depleción a través de pesca eléctrica. Los resultados mostraron que la pesca eléctrica capturó una mayor diversidad de especies que el metabarcoding de eDNA. El ensayo de qPCR específico para trucha arcoíris resultó ser más sensible en la detección de la especie en todos los sitios de muestreo en comparación con el metabarcoding de ADN ambiental. Sin embargo, los ensayos realizados con este último resultaron ser sensibles en la detección de especies que no fueron capturadas mediante pesca eléctrica; tales como G. australis y P. irwinii. Los resultados de la regresión lineal entre la abundancia relativa estimada por el método de depleción y los datos obtenidos mediante ADN ambiental no reveló una relación estadísticamente significativa. Finalmente, aunque cada método presenta sus propias limitaciones y sesgos, la combinación de ambos proporciona una visión más amplia de la dinámica y ecología de estas especies.ANID, Núcleo Milenio de Salmónidos Invasores Australes (INVASAL) ANID- Iniciativa Científica Milenio NCN2021_056Facultad de Ciencias Naturales y OceanográficasDepartamento de ZoologíaConcepció
- …
