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    SMNPAG/HLA-mutations: HLA mutations

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    HLA mutational pipeline for targeted, whole exome and whole genome sequencing. For research use only. Publications: Molecular landscape of immune pressure and escape in aplastic anemia. Pagliuca S, Gurnari C, Hercus C, Hergalant S, Nadarajah N, Wahida A, Terkawi L, Mori M, Zhou W, Visconte V, Spellman S, Gadalla SM, Zhu C, Zhu P, Haferlach T, Maciejewski JP. Leukemia. 2023 Jan;37(1):202-211. doi: 10.1038/s41375-022-01723-w. Epub 2022 Oct 17. PMID: 36253429 Clinical and Molecular Determinants of Clonal Evolution in Aplastic Anemia and Paroxysmal Nocturnal Hemoglobinuria. Gurnari C, Pagliuca S, Prata PH, Galimard JE, Catto LFB, Larcher L, Sebert M, Allain V, Patel BJ, Durmaz A, Pinto AL, Inacio MCB, Hernandez L, Dhedin N, Caillat-Zucman S, Clappier E, Sicre de Fontbrune F, Voso MT, Visconte V, Peffault de Latour R, Soulier J, Calado RT, Socié G, Maciejewski JP. J Clin Oncol. 2023 Jan 1;41(1):132-142. doi: 10.1200/JCO.22.00710. Epub 2022 Sep 2. PMID: 3605488

    Analisi di vitamina B12 in prodotti lattiero-caseari mediante cromatografia liquida ad ultra prestazione accoppiata alla spettrometria di massa tandem

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    Analisi di vitamina B12 in prodotti lattiero-caseari mediante cromatografia liquida ad ultra prestazione accoppiata alla spettrometria di massa tandem Elisa Zironi, Teresa Gazzotti, Andrea Barbarossa, Federica Farabegoli, Andrea Serraino, Giampiero Pagliuca* Dipartimento di Scienze Mediche Veterinarie, Alma Mater StudiorumUniversità di Bologna, Ozzano Emilia (BO), Italy *Corresponding author: [email protected] La vitamina B12, o cobalamina, è una molecola idrosolubile composta da un complesso tetrapirrolico con un atomo di cobalto al centro. È un nutriente essenziale assai importante per l’uomo che, a differenza delle altre vitamine del gruppo B, viene sintetizzato unicamente dai batteri e per questo motivo è presente solo negli alimenti fermentati battericamente o in quelli derivati da animali che l’hanno assunto tramite la dieta o attraverso la microflora gastrointestinale. Gli alimenti di origine animale sono quindi l’unica fonte di questa vitamina per l’uomo, il cui fabbisogno giornaliero è circa di 1-2 mg. Poiché il latte ed i prodotti lattiero-caseari forniscono un apporto dietetico significativo di questa vitamina, sono stati analizzati diversi campioni raccolti in vari stadi durante quattro processi di caseificazione, al fine di valutare la ripartizione di questa molecola nei differenti prodotti; in particolare sono stati esaminati: latte crudo, caglio, siero, cagliata, ricotta, mozzarella e caciotta, tutti prelevati in doppio. La procedura di estrazione è stata condotta su 5 g di ciascuna matrice, aggiungendo un tampone sodio acetato e cianuro di potassio; i campioni sono poi stati sottoposti a trattamento termico che, in presenza di cianuro, converte tutte le cobalamine in cianocobalamina. Dopo purificazione su cartucce per estrazione in fase solida i campioni sono stati iniettati nel sistema di cromatografia liquida ad alta prestazione accoppiata alla spettrometria di massa tandem (UPLC-MS/MS) ed analizzati in elettrospray positivo con modalità multiple reaction monitoring (MRM). Dai risultati ottenuti, il dato più interessante è quello del livello di B12 rilevato nel siero e nella ricotta, in cui si ha una concentrazione circa 10 volte maggiore rispetto a quella del latte di partenza. Parallelamente si assiste ad un calo in cagliata, caciotta e mozzarella. Essendo nota l’affinità della vitamina B12 per alcune proteine, questi dati confermerebbero la tendenza della cobalamina a concentrarsi nella frazione proteica del sier

    A critical point in chiral chromatography–mass spectrometry analysis of ketamine metabolites

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    Ketamine is a widely used dissociative drug, whose quantification in plasma and urine can be of pharmacological, toxicological, and clinical interest. Although tandem mass spectrometry allows the reliable determination of ketamine and its metabolites in biological matrices, the structural similarity between norketamine (main active metabolite) and dehydronorketamine (a less relevant metabolite) can represent a critical aspect. These compounds differ exclusively in two hydrogen atoms, but the consequent two-unit difference in their mass/charge ratio is partially nullified by the isotopic abundance of the chlorine atom present in their structure. This, along with their similar fragmentation pattern, can result in the incorrect identification of the enantiomers of these ketamine metabolites even with triple quadrupole instruments, if shared transitions are monitored after chiral chromatography. The key to prevent norketamine overestimation is therefore observing analyte-specific MS/MS transitions. Here, we describe in detail how we investigated this issue, during the development of an analytical method for ketamine and norketamine enantiomer determination in plasma

    Letter, [Author unclear] to Paulina T. Merritt

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    Handwritten letter to Paulina Merritt from an unknown author, October 1, 1876.

    Fumonisin B1 and B2 in dry dog food: preliminary study on commercial samples

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    A reliable liquid chromatography tandem mass spectrometry (LC-MS/MS) method for the identification and quantification of fumonisin B1 (FB1) and fumonisin B2 (FB2) in complete and complementary formulations of dry dog foods has been optimized and validated. The sample preparation consists of an extraction step followed by immunoaffinity clean-up. Method performance characteristics were evaluated spiking blank samples on multiple levels in four replicates. The method showed appropriate performance characteristic: good values of recovery (> 95.9 %) and precision (RSD < 6.8 %), as well as satisfying linearity of calibration curves (r2 ≥ 0.99). The limits of quantification (LOQs) and detection (LODs) were 0.100 μg/g and 0.005 μg/g, respectively, both in complete and complementary dry dog foods and both for FB1 and FB2. This method was applied to 41 commercial samples in order to tests its efficacy and gain some preliminary data about fumonisins contamination in dog foods available in the Italian market. Fumonisin FB1 and FB2 were detected in all samples analyzed and in particular 63.41 % and 56.10 % of the samples showed concentrations above the LOQs of FB1 and FB2, respectively. The levels of contamination quantified ranged between LOQs and 5.87 μg/g and 2.93 μg/g for FB1 and FB2, respectively. Among the complete dry dog foods, standard formulations generally showed an average fumonisins contamination higher than premium formulations. The guidance value of 5 μg/g set by Commission Recommendation 2006/576/EC for the sum of FB1 and FB2 was exceeded in two samples: one standard complete dry dog food showed a total fumonisins contamination of 5.19 μg/g and one complementary food a contamination of 8.80 μg/g

    Primi risultati dell'applicazione del T-GIS come strumento operativo per la rigenerazione edilizia

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    Vengono illustrati i primi risultati di una realizzazione ed utilizzazione sull'applicazione di un T-GIS, ovvero GIS Tipologico, nella progettazione di rigenerazione edilizia. Il T-GIS è pensato come uno strumento di conoscenza approfondita dell'ambiente costruito e come efficace supporto al complesso processo decisionale. Infatti, conoscere l'oggetto edilizio significa conoscere non solo le caratteristiche fisiche dell’edificio, ma tutta la complessità di aspetti che di volta in volta devono essere indagati per far proprie le conoscenze che riguardano la nascita, la crescita e lo sviluppo dell’edificato e del suo contesto. La ricerca è ancora in corso in quanto, anche se le fasi di costruzione del T-GIS sono essenzialmente complete, sono tuttora in corso le fasi di analisi
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