205,228 research outputs found
Haalbaarheidsstudie PAC met laag reservoirpeil
No full textIn dit afstudeerwerk is een globaal ontwerp opgesteld voor een PAC met laag reservoirpeil (zie de bijlagen 2, 11 en 12, uitvoering in bijlagen 20 en 22), Deze variant van pompaccumulatie biedt een oplossing voor twee belangrijke problemen van 'normale' PAC's: bij bezwijken van de dijk is er geen direct gevaar voor de omgeving en problemen met horizonvervuiling treden ook niet meer op. Een PAC met laag reservoirpeil brengt echter wel enige specifieke problemen met zich mee: er treden grotere kweldebieten op dan bij 'normale' PAC's en de bouw is gecompliceerder. Allereerst is globaal vastgesteld hoe groot de PAC met laag reservoirpeil moet worden. Uitgaande van het onderzoek dat in de eerste helft van de jaren tachtig is uitgevoerd, onder andere naar aanleiding van het Plan Lievense, is vastgesteld dat het ontwerp een garantievermogen van 1500 MW en een energie-inhoud van 30 GWh moet krijgen. Met behulp van verschillende vuistregels Is een globale dijkdoorsnede vastgesteld. Met de zo verkregen parameters is een grondbalans opgezet, waarmee bij een gekozen valhoogte en een gekozen waterdiepte een kruinbreedte werd gevonden. De evenwichtseis in de grondbalans was dat er geen aan- of afvoer van zand nodig mocht zijn. De in te voeren waterdiepte volgde uit een onderzoek naar mogelijke projectlocaties. Gekozen is voor een locatie op de coördinaten 52°30'NB, 4°1TOL (circa 16 km ten westen van IJmuiden), Op deze locatie bleek een PAC goed in te passen, mits de totale doorsnede niet groter zou zijn dan circa 8 km. De waterdiepte op de projectlocatie is iets minder dan 18 m (er is gerekend met een diepte bij LLW van 17,75 m). De grondbalans liet zien dat de kruin 720 m breed moet worden. Het grootste deel van de kruin ligt op LLW+7 m, langs de buitenrand is een zeewering geprojecteerd met een kruin op LLW+10 m. De totale diameter komt uit op 7520 m. Uit diverse bronnen werd vernomen dat met name de kwel een belangrijk probleem zou zijn, vandaar dat eerst dit probleem in kaart is gebracht, alvorens het ontwerp uit te werken. Dit is gedaan door met twee analytische modellen de boven- en ondergrens van de te verwachten kweldebieten te bepalen. Deze begrenzingen bleken sterk afhankelijk te zijn van de geohydrologische gegevens op de projectlocatie. Voor een standaardwaarde voor zand van k = 10 m/dag en een va/hoogte van 60 m werd de bovengrens vastgesteld op 2,6 miljoen m3/dag, de ondergrens op circa 1 miljoen m3/dag. Met behulp van het EEM-pakket MSEEP is het te verwachten kweldebiet geschat op 1,2 miljoen m3/dag, Het kwelprobleem bleek minder ernstig dan verwacht, omdat met een afdichting van het buitentalud van de dijk kon worden volstaan om tot deze schatting te komen. Vervolgens is onderzocht of de dijk onder alle bedrijfsomstandigheden veilig is, Dit is gedaan met behulp van het EEM-pakket PLAXIS, Met dit programma zijn niet-stationaire berekeningen gemaakt, om de invloed van snelle pel/wissellingen op de dijkstabiliteit te bepalen (tijdens de pompfase kan de waterstand op het bekken met 0,8 m/uur dalen). Uit het onderzoek kwam naar voren dat de dijk onder deze omstandigheden veilig blijft. Ook is gekeken naar de uitvoering van de dijk, Allereerst wordt een smalle dijk gebouwd, die later de zeewering gaat vormen, Het bekken wordt zo beschut, waardoor de werkomstandigheden veel beter worden, wat de productiviteit ten goede komt. Vervolgens wordt het bekken op diepte gebracht en wordt met het vrijkomende materiaal de dijk opgeworpen. Gedurende de werkzaamheden in het bekken is er een open verbinding met zee, zodat schepen in en uit het bekken kunnen varen, Met de bouw van de dijk is ongeveer 6,5 jaar gemoeid. Tevens is een globaal ontwerp gemaakt voor de harde kunstwerken, Dit is gedaan in samenhang met de gekozen uitvoeringsmethode. De uitvoeringsmethode voor de harde kunstwerken is globaal als volgt: in een bouwdok worden caissons voor de turbinebehuizingen gebouwd. Deze caissons worden drijvend uit het dok gesleept, waarna ze in het bekken worden afgezonken en afgebouwd. In het dok worden dan de drukleidingcaissons gebouwd, Ook deze warden uit het dok gesleept afgezonken en afgebouwd, In het dok, dat op de locatie van de in-uitlaatwerken in de dijk ligt warden vervolgens de in-uitlaatwerken gebouwd, De bouw van de harde kunstwerken duurt ongeveer 7,5 jaar, Met alleen een dijk, een bekken en harde kunstwerken is de PAC nog niet gereed, Er zijn nog diverse andere kunstwerken nodig voor een veilige en rendabele exploitatie, Deze werken zijn verzameld onder de noemer 'bijkomende werken', Zo zijn er op vele locaties talud- en bodembeschermingen en –afdichtingen noodzakelijk, moeten er maatregelen warden getroffen om de veiligheid van mens en machine te waarborgen en moeten er voorzieningen worden aangelegd om de bouw en de exploitatie van de PAC mogelijk te maken (haven, opslagterreinen, etcetera), Aan deze bijkomende werken is in dit afstudeerproject weinig aandacht besteed, De totale bouwtijd van de PAC is ongeveer 9,5 jaar, Tenslotte is een kart onderzoek gedaan naar de te verwachten rentabiliteit van de PAC, Met de aanleg van de PAC met laag reservoirpeil is volgens een zeer grove schatting ongeveer 6,1 miljard gulden gemoeid (prijspeil 1985), De baten uit de verhuur verkoop van de circa 1000 ha grond, die op de kruin van de dijk ontstaat blijken van cruciaal belang om de PAC rendabel te maken, De baten-kostenverhouding blijkt nauwelijks boven de 1,0 uit te komen, wat aangeeft dat kleine tegenvallers al kunnen betekenen dat de PAC niet rendabel is, Wel moet warden opgemerkt dat de schatting aan de conservatieve kant is, De belangrijkste conclusie van dit afstudeerproject is dat de PAC met laag reservoirpeil technisch mogelijk is, maar dat de rentabiliteit van een dergelijk project twijfelachtig is, Wel is duidelijk geworden dat het ontwerp op diverse punten kan warden geoptimaliseerd, waardoor de kosten flink lager kunnen uitvallen, Een van de belangrijkste groepen parameters, de geohydrologische eigenschappen van de bodem op de projectlocatie, is een grote onbekende in dit afstudeerproject. Er moet zeker onderzoek worden gedaan naar deze eigenschappen, als wordt besloten de PAC met laag reservoirpeil nader te onderzoeken.Hydraulic EngineeringCivil Engineering and Geoscience
FCP-INDI/C-PAC: C-PAC Version 1.8.4 Beta
No full textCritical Alert for fMRIPrep-Options in C-PAC v1.8.1 - v1.8.3
Fixed a bug that was causing single_step_resampling, when combined with certain other configurations, to inadvertently cause unexpected forks in the pipeline past transform application.
This bug caused any affected fmriprep-options-based pipeline configurations (including fx-options and rbc-options) to produce BOLD time series write-outs to the output directory in template space which were not nuisance regressed or filtered, for C-PAC versions 1.8.1 through 1.8.3.
Although these outputs were not expressly labeled as nuisance regressed or filtered, they were labeled as preprocessed with desc-preproc and were the only functional data transformed to template space and used for downstream processing, such as ROI-based timeseries extraction.
If you are unsure if you have been affected, you can check the side-car JSON for your template-space BOLD data from these versions for those pipeline configurations, as the JSON will still accurately reflect what operations had been performed on the data.
Summary Here's what's new with C-PAC Version 1.8.4
RBC-options pipeline RBC-options pipeline was built and integrated in C-PAC based on the Reproducible Brain Charts initiative, which aims to aggregate and harmonize phenotypic and neuroimage data to delineate node mechanisms regarding developmental basis of psychopathology in youth and yield reproducible growth charts of brain development (Scopel Hoffman et. al., 2021)
Scopel Hoffmann, M., Salum, G., Moore, T. M., Milham, M., & Sattherwaite, T. (2021, December 13). Reproducible Brain Charts initiative - Reliability and Validity of Bifactor Models of Dimensional Psychopathology in Youth. doi:10.17605/OSF.IO/UWY5N
Surface outputs Previously in C-PAC, the main output for the surface pipeline was the CIFTI timeseries (.dtseries) file. Now we are also outputting CIFTI parcellations (.dlabel) in Desikan-Killiany and Destrieux spaces in 164K and 32K resolutions.
Relicense C-PAC was relicensed from BSD-3-Clause to LGPL-3.0-or-later. This license freely allows use, distribution, and modification under the conditions of disclosing the source, license and copyright notice, propagating the license in redistributions and when modified, stating what was changed. Any modifications to LGPL-covered components are required to be made available under the same version or newer of the LGPL or the more restrictive GPL.
Additional v1.8.4 improvements, changes, and fixes can be seen throughout the rest of this release note.
Pipeline Harmonization Updates
Updated the rbc-options configuration, based on the Reproducible Brain Charts (RBC) initiative.
Updated XCP-QC files to better adhere to the PennLINC XCPEngine pipeline.
https://www.pennlinc.io/
https://xcpengine.readthedocs.io/
New Features
Surface pipeline now outputs 164k and 32k CIFTI parcellations in each of Desikan-Killiany and Destrieux spaces to output directory.
Added a log of expected outputs, generated at the beginning of each C-PAC run.
Improvements
Made ndmg correlation matrices a configurable option, as it used to automatically run for all pipelines before.
Made surface output filenames more BIDS-compliant.
Added the ability to follow symlinks for BIDS directories.
Updated templates used for rodent pipeline and added outputs that were missing.
Added the ability to disable the exception raised if the initial resource check estimates more memory is needed.
Added --runtime_usage and --runtime_buffer flags and related pipeline config entries and functionality.
Added additional error checks and a more informative message for node block connecting in the engine.
Expanded some surface post-processing workflows to be more flexible with other pipeline configurations.
Added list of preconfigured pipelines to the usage string.
Relicensed C-PAC from BSD-3-Clause to LGPL-3.0-or-later.
Bug Fixes
Fixed a bug that was causing single_step_resampling to crash with 3dVolReg.
Fixed a bug that was causing datasets containing phase-difference field maps to crash.
Fixed a merge error preventing QC files and surface derivatives copying to output directory and renaming connectome → connectivity matrix files.
Fixed a bug where subsequent subjects' logs were being appended to prior subjects' logs.
Fixed a bug in which ITK header imprecision was causing N4 bias correction to crash.
Fixed a bug where a node with zero nanoseconds in timing information causes report generation to fail.
Fixed a bug in which --tracking_opt-out was not applied to calls to utils.
Developer Improvements
Updated CI to only rebuild software dependencies on change.
Added lint definition file.
Added smoke tests
Pomp Accumulatie Centrale Brouwersdam: Deelrapportage Fase 2 Morfologie
No full textDoor de deelprojectgroep Morfologie zijn binnen het kader van de doelstelling van de fase 2 studie de morfologische effecten van een PAC-bekken op de omgeving nagegaan. Deze effecten hangen in sterke mate af van de grootte van het bekken. In verband hiermee is door de deelprojectgroep besloten de effecten na te gaan voor "het grootste" PAC bekken (40GWh). Met behulp van de resultaten uit de 1e fase studie kunnen de effecten bij de centrale variant (en afgeleide varianten) door interpolatie worden ingeschat. Door deze werkwijze behoefde slechts 1 variant met behulp van de beschikbare kustmorfologische rekenmodellen te worden doorgerekend. Daarnaast zijn nog enige specifieke onderwerpen nader beschouwd in het kader van het kustwaterbouwkundig ontwerp. In dit rapport wordt een samenvatting gepresenteerd van de werkzaamheden, echter met uitzondering van de kostenaspecten, welke afzonderlijk zijn gerapporteerd in de deelrapportage "Kosten". Dit rapport dient beschouwd te worden als een vervolg op de deelrapportage morfologie fase 1 waarnaar regelmatig verwezen wordt. De indeling komt overeen met het 1e fase rapport teneinde vergelijking mogelijk te maken. Indien de situatie verschilt ten opzichte van de gevonden resultaten uit de 1e fase studie, wordt dit nader aangegeven.PA
Experiencing the armed struggle : the Soweto generation and after
No full textIncludes bibliographical references (p. 354-369).This study explores the experiences of the rank-and-file soldiers of Umkhonto we Sizwe and the Azanian People's Liberation Anny. Extensive interviews by the author and other researchers reveal the voices of the soldiers themselves. The African National Congress and Pan African Congress archives at the University of the Western Cape and the University of Fort Hare supplement and verify these oral testimonies, as do some published sources. Most previously published materials about the armed struggle against apartheid have already focused on diplomacy, strategy and tactics, operations, leadership, and human rights abuses to the neglect of the soldiers' actual experiences. This study complements these with significant new oral history materials from the Soweto generation of soldiers and their successors. When dealing with MK, many authors have documented issues of the camp structure in Angola, and operations inside South Africa, so much of this detail is only addressed briefly, leaving space to explore the soldiers' experiences. In the case of APLA, very little has been written on its history, and more detail is provided on these subjects. This study therefore deals with the soldiers' politicisation and motivation for joining the armed struggle, their experiences in leaving South Africa and training in exile, the crises in exile which limited their effectiveness for a time, their return to fight in South Africa, and their difficulties in the "new" South Africa. These materials reveal that vast problems remain facing these veterans of the struggle against apartheid, and that they have the potential, if properly supported and employed, to contribute substantially to the development of present day South Africa. Conversely, if their neglect continues, they also have the potential to bring vast harm to the country. Further use of the investigative tools of oral history, especially if extended to the former soldiers' vernacular languages, is necessary to augment the history of South Africa, and these soldiers' contributions
Valid generalisation from approximate interpolation
No full textLet H and C be sets of functions from domain X to R. We say that H validly generalises C from approximate interpolation if and only if for each j ? 0 and ffl; ffi 2 (0; 1) there is m 0 (j; ffl; ffi) such that for any function t 2 C and any probability distribution P on X , if m m 0 then with P m -probability at least 1 \Gamma ffi, a sample x = (x 1 ; x 2 ; : : : ; xm ) 2 X m satisfies 8h 2 H; jh(x i ) \Gamma t(x i )j ! j; (1 i m) =) P(fx : jh(x) \Gamma t(x)j jg) ! ffl: We find conditions that are necessary and sufficient for H to validly generalise C from approximate interpolation, and we obtain bounds on the sample length m 0 (j; ffl; ffi) in terms of various parameters describing the expressive power of H. 1 Introduction and Definitions Much work has recently been carried out on probabilistic models of machine learning such as the `probably approximately correct' (or pac) model due to Valiant [26]. In particular, the pac learning of f0; 1g-valued functions (equivalent..
A foot in the door: do PAC contributions buy access?
No full textDue to the character of the original source materials and the nature of batch digitization, quality control issues may be present in this document. Please report any quality issues you encounter to [email protected], referencing the URI of the item.Includes bibliographical references: p. 55-59.Issued also on microfiche from Lange Micrographics.A between-groups experimental design tests the theory that PACs have an advantage over constituents in gaining access to members of the U.S. House of Representatives. Sixty-nine congressional staffers participated in an exercise designed to simulate the process by which scheduling decisions are made. The study was conducted in Washington, DC in the Fall of 1996. Analysis of variance reveals constituency to be the main effect. There are, however, partisan differences in the way access is granted to PACs. When making decisions on requests from non-constituents, Democrats and Republicans behave alike, favoring PAC associated requests over the non-PAC requests. But when responding to requests from constituents, Democrats favor requests from constituent PACs over those from constituents not associated with a PAC, while Republicans exhibit the opposite pattern, granting greater access to constituents not associated with PACs than constituents associated with PACs. Nevertheless, constituency remains the strongest influence as both Democrats and Republicans are more likely to grant requests from constituents than from non-constituents with the same PAC status. Further analysis of covariance suggests that a member's historical dependence on PAC contributions may influence the priority of access granted to PACs
Pattern classification via unsupervised learners
No full textWe consider classification problems in a variant of the Probably Approximately Correct (PAC)-learning framework, in which an unsupervised learner creates a discriminant function over each class and observations are labeled by the learner returning the highest value associated with that observation. Consideration is given to whether this approach gains significant advantage over traditional discriminant techniques.
It is shown that PAC-learning distributions over class labels under Ll distance or KL-divergence implies PAC classification in this framework. We give bounds on the regret associated with the resulting classifier, taking into account the possibility of variable misclassification penalties. We demonstrate the advantage of estimating the a posteriori probability distributions over class labels in the setting of Optical Character Recognition.
We show that unsupervised learners can be used to learn a class of probabilistic concepts (stochastic rules denoting the probability that an observation has a positive label in a 2-class setting). This demonstrates a situation where unsupervised learners can be used even when it is hard to learn distributions over class labels - in this case the discriminant functions do not estimate the class probability densities.
We use a standard state-merging technique to PAC-learn a class of probabilistic automata and show that by learning the distribution over outputs under the weaker L1 distance rather than KL-divergence we are able to learn without knowledge of the expected length of an output. It is also shown that for a restricted class of these automata learning under L1 distance is equivalent to learning under KL-divergence
FCP-INDI/C-PAC: C-PAC Version 1.3.0 Beta
No full text<p>Dear Colleagues,</p>
<p>We are happy to inform you that we have released CPAC Version 1.3.0 Beta.</p>
<p><strong>New Features</strong>
1) MOVIE-FMRI ANALYSIS. Inter-Subject Correlation (ISC) and Inter-Subject Functional Connectivity (ISFC) (Simony et al., 2016). Implementation adapted from BRAINIAK.
Dynamic reconfiguration of the default mode network during narrative comprehension. Erez Simony, Christopher J Honey, Janice Chen, Olga Lositsky, Yaara Yeshurun, Ami Wiesel & Uri Hasson. Nature Communications, 7(May 2015), 12141. (<a href="https://doi.org/10.1038/ncomms12141">https://doi.org/10.1038/ncomms12141</a>)
BRAINIAK - <a href="https://github.com/brainiak/brainiak">https://github.com/brainiak/brainiak</a>
2) GRAPH GENERATION. Users can now generate functional connectivity matrices for any parcellation set using Pearson Correlation, Partial Correlation and Tangent Embedding. Implementation based on Dadi et al (2018).
Dadi K., Rahim M., Abraham A., Chyzhyk D., Milham M., Thirion B., Varoquaux G. (2018) Benchmarking functional connectome-based predictive models for resting-state fMRI. <hal-01824205> <a href="https://hal.inria.fr/hal-01824205">https://hal.inria.fr/hal-01824205</a>
3) BOOTSTRAP-BASED FUNCTIONAL CONNECTIVITY-BASED PARCELLATION. Users can now seamlessly run Bootstrap Analysis of Stable Clusters (BASC) (Bellec et al., 2008, 2010) on data preprocessed by C-PAC. This is accomplished using PyBASC - a Python implementation of BASC, by Aki Nikolaidis - which is now integrated in C-PAC.
Bellec, P., Marrelec, G., & Benali, H. (2008). A bootstrap test to investigate changes in brain connectivity for functional MRI. Statistica Sinica, 1253-1268.
Bellec, P., Rosa-Neto, P., Lyttelton, O. C., Benali, H., & Evans, A. C. (2010). Multi-level bootstrap analysis of stable clusters in resting-state fMRI. Neuroimage, 51(3), 1126-1139.
Garcia-Garcia, M., Nikolaidis, A., Bellec, P., Craddock, R. C., Cheung, B., Castellanos, F. X., & Milham, M. P. (2017). Detecting stable individual differences in the functional organization of the human basal ganglia. NeuroImage.
<a href="https://github.com/AkiNikolaidis/PyBASC">https://github.com/AkiNikolaidis/PyBASC</a>
Nikolaidis, A., Vogelstein, J., Bellec, P., Milham, M.P. (2018). Improving Corticostriatal Parcellation Through Multilevel Bagging with PyBASC. BioRxiv.
4) ICA-AROMA. Robust de-noising using the ICA-AROMA implementation of Independent Components Analysis for the removal of motion artifacts, as implemented by Maarten Mennes.
ICA-AROMA: A robust ICA-based strategy for removing motion artifacts from fMRI data. Pruim RHR, Mennes M, van Rooij D, Llera A, Buitelaar JK, Beckmann CF. Neuroimage. 2015 May 15;112:267-277.
<a href="https://github.com/maartenmennes/ICA-AROMA">https://github.com/maartenmennes/ICA-AROMA</a>
5) CUSTOM BRAIN EXTRACTION MASKS. You can now provide brain masks created with your own preferred skull-stripping method.</p>
<p><strong>Improvements</strong></p>
<ul>
<li>AWS S3 links can now be provided for all ROI and mask inputs in the pipeline configuration. This makes it easier to kick off runs without needing to gather or transfer ROI and mask files to a local disk.</li>
<li>C-PAC is now compatible with Nipype version 1.1.2 (latest). </li>
</ul>
<p><strong>Error Fixes</strong></p>
<ul>
<li>AWS S3 bucket credentials fixed to allow for anonymous connections.</li>
<li>An error causing the Visual Quality Control interface to print warnings has been fixed.</li>
<li>An error where the FSL FEAT Model Preset GUI dialogs would sometimes clear fields prematurely has been fixed.</li>
</ul>
<p><strong>Coming Soon (Releases 1.4 and 1.5 this winter)</strong></p>
<ul>
<li>More ICA denoising options</li>
<li>FSL Randomise</li>
<li>Supervised Learning</li>
<li>A new Graphical User Interface (GUI) Upgrade</li>
</ul>
<p>Updated user documentation for this release can be found here:
<a href="http://fcp-indi.github.io/docs/user/index.html">http://fcp-indi.github.io/docs/user/index.html</a></p>
<p>And as always, you can contact us here for user support and discussion:
<a href="https://groups.google.com/forum/#!forum/cpax_forum">https://groups.google.com/forum/#!forum/cpax_forum</a></p>
<p>Regards,
The CPAC development team.</p>
- …
