15 research outputs found

    Interference Improves Myopathic Phenotypes in Mice Over-expressing FSHD Region Gene 1 (FRG1).

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    Muscular dystrophies, and other diseases of muscle, arise from recessive and dominant gene mutations. Gene replacement strategies may be beneficial for the former, while gene silencing approaches may provide treatment for the latter. In the last two decades, muscle-directed gene therapies were primarily focused on treating recessive disorders. This disparity at least partly arose because feasible mechanisms to silence dominant disease genes lagged behind gene replacement strategies. With the discovery of RNA interference (RNAi) and its subsequent development as a promising new gene silencing tool, the landscape has changed. In this study, our objective was to demonstrate proof-of-principle for RNAi therapy of a dominant myopathy in vivo. We tested the potential of adeno-associated viral (AAV)-delivered therapeutic microRNAs, targeting the human Facioscapulohumeral muscular dystrophy (FSHD) region gene 1 (FRG1), to correct myopathic features in mice expressing toxic levels of human FRG1 (FRG1(-high) mice). We found that FRG1 gene silencing improved muscle mass, strength, and histopathological abnormalities associated with muscular dystrophy in FRG1(-high) mice, thereby demonstrating therapeutic promise for treatment of dominantly inherited myopathies using RNAi. This approach potentially applies to as many as 29 different gene mutations responsible for myopathies inherited as dominant disorders

    The Tomb of Petosiris at Tuna el-Gebel. A study of Egyptian and Greek aspects of the tomb's decorative program

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    The BA thesis deals with scenes from the tomb of Petosiris in Tuna el-Gebel, which combine Egyptian, Greek and even some Persian iconographic elements. The author will analyse individual scenes, define specific elements and aim to answer two main questions. The first one concerns whether the degree of the use of non-Egyptian (iconographic) elements relates to the motif of the scene or its location within the tomb. The second question regards the motives that might have led Petosiris to use these elements in that very place.Bakalářská práce se zabývá vybranými scénami z Petosiridovy hrobky na pohřebišti v Tuna el- Gebel, které kombinují egyptské, řecké, a dokonce i některé perské ikonografické prvky. Autorka rozebere každou scénu zvlášť, určí jednotlivé prvky a následně se pokusí zodpovědět otázku, zda míra použití neegyptských prvků souvisí s motivem scény, případně jejím umístěním v rámci hrobky, a jaké důvody mohly Petosirida vést k jejich použití na daném místě.Český egyptologický ústavCzech Institute of EgyptologyFaculty of ArtsFilozofická fakult

    The Seth animal, or the faunal manifestaion of chaos

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    Annotation: This BA thesis focuses on the god Seth, one of the most prominent deities in the ancient Egyptian pantheon. It aims to evaluate the faunal identity of Seth, whose emblematic animal has not (despite many suggestions) been convincingly and conclusively determined yet. The identification of the so-called "Seth animal" will be primarily based on the synthesis of four main elements: Extant iconographical evidence, evolution of the Seth animal, critically assessed hypotheses suggested so far, and comparison of the physiology and behavioral patterns of the animals with the character traits of Seth. On the basis of this approach, the author will thus attempt to propose the animal species which will seem the most likely possibility for the Seth animal to be modelled on.Anotace: Bakalářská práce pojednává o bohu Sutechovi, jednom z ústředních božstev staroegyptského panteonu. Klade si za cíl taxonomicky zhodnotit Sutechovu emblematickou zvířecí identitu, jež přes mnoho návrhů stále není spolehlivě objasněna. Identifikace tzv. "Sutechova zvířete" se bude opírat zejména o syntézu čtyř hlavních bodů: shromáždění ikonografické evidence a vývoje zobrazení, kritického zhodnocení dosavadních hypotéz a porovnání vzhledu a vzorců chování živočišných druhů s povahovými rysy samotného Sutecha. Na základě tohoto postupu se autorka vynasnaží co nejpřesněji identifikovat živočicha, který byl předobrazem Sutechovy zoomorfní podoby.Český egyptologický ústavCzech Institute of EgyptologyFaculty of ArtsFilozofická fakult

    Knowledge, Astrology and the Power of Healing in Zanzibar

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    This paper explores Zanzibari understandings and practices of astrology. In popular milieus in Zanzibar Town, astrology and cosmology are associated with Islamic knowledge and constitute a form of Arabian scholarship that does not necessarily include formal education. One also notes traces of Hindu influence, although no explicit reference to it is ever made. Knowledge of sacred and non-human agency is considered to be of great value. The person having such knowledge is ascribed strength (nguvu) and prestige, as well as the means to make a living, if not to attain economic wealth. Focusing on astrology, the author discusses the complexity implied by this knowledge by exploring how great religious traditions are understood and reinterpreted by local communities, and how collective representations are expressed through people's acts and experiences within their local communities. People use this knowledge to cope with life, to interpret events, to anticipate the future, to act in the world and to position themselves within social relationships; through such actions, their communities are constituted as true institutions of meaning.Cet article explore les significations et les usages de l'astrologie à Zanzibar. Dans les milieux urbains populaires, la pratique de l'astrologie et de la cosmologie est associée à l'Islam et à une forme de connaissance culturellement attachée au monde arabe qui n'est pas toujours le résultat d'un apprentissage spécialisé. On peut aussi y repérer les traces d'une influence hindoue, qui n'est toutefois jamais évoquée explicitement. La connaissance du sacré et des puissances non humaines représente un savoir très valorisé. Elle donne force (nguvu), et par là-même prestige, à celui ou à celle qui la possède ; elle peut aussi constituer une source de revenus, mais pas nécessairement de richesse. Prenant l'astrologie comme point de référence, l'auteur montre la complexité des savoirs qu'elle mobilise et analyse la façon dont les grandes traditions sont comprises et réinterprétées par les communautés locales. L'auteur décrit également les représentations collectives exprimées dans les conduites et dans les expériences de tout un chacun et démontre comment elles prennent racine au cœur de relations sociales hautement contextualisées. L'utilisation de ce savoir pour faire face aux problèmes de l'existence, interpréter les événements quotidiens, anticiper l'avenir, prendre une décision, revient de fait à se positionner au sein de relations sociales, c'est-à-dire à faire de sa communauté une véritable institution du sens.Larsen Kjersti, Le Guennec-Coppens Françoise, Mery Sophie. Knowledge, Astrology and the Power of Healing in Zanzibar. In: Journal des africanistes, 2002, tome 72, fascicule 2. pp. 175-186

    Homo naledi, a new species of the genus Homo from the Dinaledi Chamber, South Africa

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    Homo naledi is a previously-unknown species of extinct hominin discovered within the Dinaledi Chamber of the Rising Star cave system, Cradle of Humankind, South Africa. This species is characterized by body mass and stature similar to small-bodied human populations but a small endocranial volume similar to australopiths. Cranial morphology of H. naledi is unique, but most similar to early Homo species including Homo erectus, Homo habilis or Homo rudolfensis. While primitive, the dentition is generally small and simple in occlusal morphology. H. naledi has humanlike manipulatory adaptations of the hand and wrist. It also exhibits a humanlike foot and lower limb. These humanlike aspects are contrasted in the postcrania with a more primitive or australopith-like trunk, shoulder, pelvis and proximal femur. Representing at least 15 individuals with most skeletal elements repeated multiple times, this is the largest assemblage of a single species of hominins yet discovered in Africa

    América: indios, indigenismo y política.. Anales del Instituto Nacional de Antropología e Historia. Num. 52 Tomo IV (1972-1973) Séptima Época (1967-1976)

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    Aguirre Beltran, Gonzalo. 1969 Política indigenista en América Latina, en Anuario Indigenista: Vol XXIX, p 17-27. México, III.Aguirre Beltran, Gonzalo. 1970 El proceso de aculturación y el cambio sociocultural en México. México, Universidad Iberoamericana.Aguirre Beltran, Gonzalo. 1973a Regiones de refugio. México, INI.Aguirre Beltran, Gonzalo. 1973b Informe a la Sociedad para la Antropología Aplicada. Ed mimeográfica.Anguiano, Leonel. 1972 Guatemala, en Anuario Indigenista: Vol XXXII, p 71-73. México, III.Ashcraft, Norman. 1972 Educación y desarrollo económico en Honduras Británicas, en América Indígena: Vol XXX-2, p 395-408. México, III.Barandian, Daniel de, y Coppens, Walter. 1971 Ensayo de formulación de una doctrina indigenista venezolana, en América Indígena: Vol XXXI-1, p 107-116. México, III.Barth, Frederik (Ed). 1969 Ethnic Groups and Boundaries. The Social Organization of Culture Differences. Bergen-Oslo, Universitets Forlaget.Benitez, Fernando. 1972 Tierra Incógnita. México, ERA.Bonfil, Guillermo. 1969 Reflexiones sobre la política indigenista y el centralismo gubernamental en México, en Anuario Indigenista: Vol XXIX, p 139-144. México, III.Borgognon, Alfonso. 1968 Panorama indígena paraguayo, en América Indígena: Vol XXVIII-4, p 1101-1117. México, III.Bozzoli de Wille, Maria E. 1972 Notas sobre el parentesco entre los indios talamanqueños y guatusos de Costa Rica, en América Indígena: Vol XXXII-2, p 553-571. México, III.Bravo Ahuja, Gloria R; Garza Cuaron, Beatriz, y Nolasco, Margarita 1972 Instituto de Investigación e Integración Social del Estado de Oaxaca, en Anuario Indigenista: Vol XXXII, p 139-153. México, III.Bureau of Indian Affairs 1972 El reciente progreso de los asuntos indios en los Estados Unidos de Norteamérica, en Anuario Indigenista: Vol XXXII, p 63-69. México, III.Burgos Guevara, Hugo, y Pesantez Reinoso, Gonzalo. 1967 Plan Nacional Indigenista de Colombia: 1966-1969, en América Indígena: Vol XXVII-4, p 751-781. México, III.Bustillos, Oscar A. 1972 La lucha indigenista en Bolivia, en Anuario Indigenista: Vol XXXII, p 203-210. México, III.Cardoso, Ciro F S. 1972 Sobre los modos de producción coloniales de América, en Estudios Sociales Centroamericanos: p 45-82. S José de Costa Rica. Programa Centro Americano de Desarrollo de las Ciencias Sociales.Clara de Guevara, Concepción. 1972 Carta al III, en América Indígena: Vol XXXII-2, p 623-4. México, III.Congreso Nacional de Indios Americanos 1970 Resoluciones adoptadas durante la 26a. Convención Anual del Congreso Nacional de Indios Americanos (Oct 6-10, 1969), celebrado en Albuquerque, Nuevo México, en América Indígena: Vol XXX-2, p 492-536. México, III.Coppens, Walter. 1971 Las Misiones en Venezuela. Perspectivas indigenistas, en América Indígena: Vol XXXI-3, p 625-639. México, III.Coronado Castillo, Luis. 1973 El problema mapuche, en América Indígena: Vol XXXIII-2, p 495-523. México, III.Costales, Piedad Peñaherrera de, y Costales Samaniego, Alfredo. 1970 Resultados del Primer Censo Indigenista de la Provincia del Pichincha, en América Indígena: Vol XXX-4, p 1039-1096. México, III.Departamento de Programacion de la Oficina de Planificacion Agricola y Direccion de Asuntos Indigenas 1972 Chile. El problema mapuche, en Anuario Indigenista: Vol XXXII, p 75-98. México, III.Deloria Jr, Vine. 1969 Custer Died for your Sins. New York, Avon Books.Direccion General de Estadistica: SIC 1971 IX Censo General de Población. México, SIC.Fidheim, Harald. 1969 When Ethnic Identity is a Social Stigma, en Ethnic Groups and Boundaries. Ed Frederik Barth. Bergen-Oslo, Universitets Forlaget.Encyclopaedia Americana. 1961 Encyclopaedia Americana. Chicago, Chicago Press.Fuller, O. T. 1973 Un observador echa una ojeada al indigenismo, en América Indígena: Vol XXXIII-2, p 355-374. México, III.Fundação Nacional do Indio (FUNAI). 1971 Estatuto del Indio de Brasil, en América Indígena: Vol XXXI-2, p 451-464. México, III.Fundação Nacional do Indio (FUNAI). 1972a Boletín Informativo FUNAI, An 1, No. 2, 1o. trimestre. Brasilia, FUNAl.Fundação Nacional do Indio (FUNAI). 1972b Política Indigenista del Brasil, en Anuario Indigenista: Vol XXXII, p 53-62. México, III.Fortun, Julia Elena. 1968 Indigenismo en Bolivia, en América Indígena: Vol XXVIII-4, p 1059-1075. México, III.Griva, Edelmi E. 1970 Síntesis del censo indígena nacional realizado en la República Argentina, en América Indígena: Vol XXX-3, p 657-672. México, III.Guzman Bockler, C, y Herbert, J L. 1970 Guatemala. Una interpretación histórico-social. México, S XXI.Heckadon Moreno, Stanley. 1972 Breve análisis de las estadísticas vitales de la población indígena de Panamá, en América Indígena: Vol XXXII-2, p 573-584. México, III.Herrera, Francisco. 1972 Politización de la población indígena de Panamá, en América Indígena: Vol XXXII-2, p 585-596. México, III.Icken Sofa, Helen. 1969 Asimilación vs pluralismo: dos modelos para la integración de los grupos étnicos en las Américas, en Anuario Indigenista: Vol XXIX, p 163-171. México, III.Instituto Indigenista Interamericano. 1962 Anuario indigenista, Vol XXII. México, III.Instituto Indigenista Interamericano. 1970 Actas del XXXIX Congreso Internacional de Americanistas, en Anuario Indigenista: Vol XXX. México, III.Instituto Indigenista Interamericano. 1973 El problema aborigen argentino en el momento actual. Sinopsis histórica, en América Indígena: Vol XXXIII-3, p 655-666. México, III.Instituto Lingüistico de Verano. 1972 Las lenguas indígenas de Panamá, en América Indígena: Vol XXXII-1, p 95-104. México, III.Juarez Toledo, Luis Adolfo, y Palacios, Reinaldo Alfonso. 1972 El programa de castellanización del medio socioeducativo rural, una fórmula feliz para la educación del indígena monolingüe guatemalteco, en América Indígena: Vol XXXII-2, p 377-385. México, III.Kulshreshtha, S N. 1971 Un enfoque interdisciplinario del problema indígena canadiense, en América Indígena: Vol XXXI-2, p 365-374. México, III.Le Monde de Paris. 1969 La Sociedad de Americanistas se preocupa por la suerte de las poblaciones tribales de la Guayana, en América Indígena: Vol XXIX-4, p 1179-1181. México, III.Lombardo Toledano, Vicente. 1973 El problema del indio. México, Sepsetentas.Mangin, William. 1967 Las comunidades alteñas en la América Latina. México, III.Marroquin, Alejandro D. 1972a Balance del indigenismo. México, III.Marroquin, Alejandro D. 1972b Panorama del indigenismo en Guatemala, en América Indígena: Vol XXXII-2, p 291-317. México, III.Martinez, Hector. 1971 Perú: ¿Las comunidades indígenas hacia una nueva dinámica?, en América Indígena: Vol XXXI-2, p 466-475. México, III.Mckay, Alberto. 1972 Un programa de nutrición del Ministerio de Salud en zonas indígenas de Panamá, en América Indígena: Vol XXXII-1, p 153-158. México, III.Medina H, Andrés. 1972 El indio en el contexto de la sociedad panameña, en América Indígena: Vol XXXII-1, p 67-76. México, III.Medina, Guillermo A. 1972 Algunas consideraciones en torno a la marginalización del indio en Panamá y al desarrollo de la comunidad como medio de integración indigenista, en América Indígena Vol XXX-1, p 105-111. México, III.Ministerio de Asuntos Indígenas y Esquimales de Canadá 1972 Programa de Asuntos Indígenas y Esquimales, en América Indígena: Vol XXXII-1, p 250-1. México, III.Ministerio de Bienestar Social de Argentina. 1970 Proyecto de desarrollo comunitario: Pozo Verde, una comunidad indígena en desarrollo. Buenos Aires, Secretaría de Promoción y Asistencia de la Comunidad.Ministerio de Bienestar Social de Argentina. 1972 Aborígenes argentinos. Estado actual y perspectivas futuras. Documento presentado al VII Congreso Indigenista Interamericano. Brasilia, Dirección Nacional de Asuntos Indígenas. Ed mimeográfica.Morejon Almeida, Luis E. 1972 Ecuador, en Anuario Indigenista: Vol XXXII, p 159-201. México, III.Muñoz, Maurilio. 1972 Memoria de las labores realizadas por el Patrimonio Indígena del Valle del Mezquital, Estado de Hidalgo, en la República Mexicana, en el período 1971-1972, en Anuario Indigenista: Vol XXXII, p 133-137. México, III.Nahmad S, Salomon. 1972 Resumen de la política y la acción del Instituto Nacional Indigenista de México, en Anuario Indigenista: Vol XXXII, p 99-132. México, III.Officer, James A. 1969 Planeando el abandono del paternalismo en la Administración de Asuntos Indígenas de EE UU, en Anuario Indigenista: Vol XXIX, p 29-47. México, III.Organizacion de Estados Americanos e Instituto Interamericano de Estadistica. 1972 América en Cifras: 1972. Situación demográfica, estado y movilidad de la población. Washington, O. E. A.Ortiz Vergara, Pedro. 1965 Las subculturas peruanas. Serie Monográfica 16. Ministerio de Trabajo y Asuntos Indígenas. Plan Nacional de Integración de la Población Aborigen. Lima.Perez Calderon, Jose Antonio. 1972 La población indígena, de la Colonia a la época presente, en América Indígena: Vol XXXII-2, p 325-336. México, III.Queiros Campos, Jose de. 1968 Informe de la Delegación del Brasil ante el VI Congreso Indigenista Interamericano, en América Indígena: Vol XXVIII-4, p 1076-1083. México, III.Queiros Campos, Jose de. 1970 Actividades de la Fundación Nacional del Indio de Brasil: 1969, en América Indígena: Vol XXX-2, p 537-560. México, III.Quijano Obregon, Anibal. 1973 Imperialismo, clases sociales y Estado en el Perú (1895-1930). Ponencia presentada en el Seminario sobre Clases Sociales y Crisis Política en América Latina, en Oaxaca. México, UNAM. Ed mimeográfica.Reichel-Dolmatoff, Gerardo. 1972 El misionero ante las culturas indígenas, en Anuario Indigenista: Vol XXXII-4, p 1137-1149. México, III.Robinson, Scott S. 1971 El etnocidio ecuatoriano. México, Universidad Iberoamericana. Ed mimeográfica.Rockwell, Elsie, y Nolasco, Margarita. 1970 El Instituto de Investigación e Integración Social del Estado de Oaxaca, en América Indígena: Vol XXX-4, p 1119-1124. México, III.Roman Unzueta, Pelegrin. 1968 Informe del Instituto Indigenista Peruano al VI Congreso Indigenista Interamericano, en América lndígena: Vol XXVIII-4, p 1118-1125. México, III.Romano, Agustin. 1972 Exposición de los observadores de la OIT, en Anuario Indigenista: Vol XXXII. p 211-213. México, III.Romero, Eddie J. 1968 Actividades indigenistas del Ministerio de Justicia de la República de Venezuela, durante los años comprendidos entre 1964 y 1968, en América Indígena: Vol XXVIII-4, p 1133-1147. México, III.Rosenblat, Angel. 1954 La población indígena: 1492-1950, Tomo l. Buenos Aires. Ed Nova.Rubio Orbe, Gonzalo. 1972a Panamá Indígena, en América lndígena: Vol XXXII-1, p 3-8. México, III.Rubio Orbe, Gonzalo. 1972b Guatemala Indígena, en América Indígena: Vol XXXII-2, p 275-90. México, III.Rubio Orbe, Gonzalo. 1972c Colombia Indígena, en América Indígena: Vol XXXII-4, p 1091-1108. México, III.Ruiz Franco, Arcadio. 1970 Memoria de labores del Instituto Indigenista Nacional de Guatemala durante el tiempo comprendido entre julio de 1966 y junio de 1970, en América Indígena: Vol XXX-4, p 1097-1117. México, III.Seda Bonilla, Eduardo. 1969 La función de la cultura en los procesos políticos, en Anuario Indigenista: Vol XXIX, p 295-316. México, III.Septimo Congreso Indigenista Interamericano. 1972 Declaración de Brasilia, en Anuario Indigenista: Vol XXXII, p 225-227. México, III.Spicer, Edward H. 1969 Política gubernamental e integración indigenista en México y los Estados Unidos, en Anuario Indigenista: Vol XXIX, p 49-64. México, III.Stavenhagen, Rodolfo. 1965 Clases, colonialismo y transculturación. Contribución al estudio del fenómeno indígena en Mesoamérica. México, SAENAH. Ed mimeográfica.Swadesh, Mauricio. 1960 Estudios sobre lengua y cultura, en Acta Anthropologica. México, SAENAH.Valencia y Valencia, Jaime. 1972 Consideraciones generales sobre la política indigenista de Colombia, en América Indígena: Vol XXXII-4, p 1285-1293. México, III.Villa Rojas, Alfonso. 1971 Antropología e indigenismo en América Latina, en América Indígena: Vol XXXI-1, p 5-44. México, III.Torres de Arauz, Reina. 1972 Panorama actual de las culturas indígenas panameñas, en América Indígena: Vol XXXII-1, p 77-94. México, III.UNESCO. 1967 Apartheid, en El Correo. Una Ventana Abierta al Mundo, Año XX. París.Union Panamericana. 1960 Estructura demográfica de las naciones americanas. IASI. Washington, Unión Panamericana.United Nations. 1971 Demographic Yearbook. Statistical Office of the United Nations. New York.Warman, Arturo; Bonfil G; Nolasco M; Valencia E, y Olivera M. 1970 De eso que llaman antropología mexicana. México, Ed Nuestro Tiempo. 1967 Apartheid, en El Correo. Una Ventana Abierta al Mundo, Año XX. París.Union Panamericana. 1960 Estructura demográfica de las naciones americanas. IASI. Washington, Unión Panamericana.United Nations. 1971 Demographic Yearbook. Statistical Office of the United Nations. New York.Warman, Arturo; Bonfil G; Nolasco M; Valencia E, y Olivera M. 1970 De eso que llaman antropología mexicana. México, Ed Nuestro Tiempo. 1967 Apartheid, en El Correo. Una Ventana Abierta al Mundo, Año XX. París.Union Panamericana. 1960 Estructura demográfica de las naciones americanas. IASI. Washington, Unión Panamericana.United Nations. 1971 Demographic Yearbook. Statistical Office of the United Nations. New York.Warman, Arturo; Bonfil G.; Nolasco M.; Valencia E., y Olivera M. 1970 De eso que llaman antropología mexicana. México, Ed Nuestro Tiempo

    El hilo encadenante o el tiempo en las culturas

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    Resumen: Texto de conferencia en el cual el autor plantea la relación entre tiempo y vida en cualquiera de sus manifestaciones, a partir de interrogantes que busca responder con referencias culturales del pensamiento e historia occidental y griega, la contemporaneidad industrializada y postindustrializada y los significados lingüísticos. Sitúa el tema en la complejidad de la comprensión cultural del tiempo. Ilustra con datos que arrojan las ciencias naturales, especialmente la astrofísica. Para la cultura occidental plantea su restricción en la dimensión cuantitativa, sin tener en cuenta la cualitativa en formas y contenidos. Precisa que en cada cultura y sociedad a través de sus estructuras el tiempo es determinado. En la cultura occidental la noción del tiempo como pasado presente y futuro, se constituye en un referente de dominación de la vida, lo cual hace más dramática la vida humana en las sociedades globalizadas actuales, con un tiempo sincronizado en el mundo globalizado, al cual se le quiere sacar el máximo provecho en cantidad de cosas que se hacen y las consecuencias dramáticas que de esta tendencia emergen para la salud humana, en especial por el estrés de hoy que se vive en occidente.ABSTRACT: THE LINKING THREAD OR TIME IN CULTURES The following text is the conference exposed by the author on the relation between time and life in any of its manifestations, based on questionings that intend to answer the industrialized and post—industrialized contemporary times and the linguist meanings by means of cultural references of Greek thought and Western history. The author places the topic in the complexity of the cultural comprehension of time, making use of examples belonging to natural sciences, especially astrophysics. In regards to Western culture, time is restricted in the quantitative dimension, ignoring the qualitative forms and contents. Each culture and society determines its time by means of its structures. In Western culture the notion of time as past, present and future, a reference to life domination is constituted, making even more dramatic human life in present globalized societies. Time is synchronized in the globalized world, time that has to be well spent in as many things as possible, creating dramatic consequences harmful to human health, especially due to the amount of stress present in Western societ

    Calculs électrostatiques rapides dans l'analyse énergétique : Développement de la méthode, applications aux études de cristaux organiques et organométalliques et de complexes protéine/ligand

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    One usually considers the electrostatic nature of atoms to explore intermolecular interactions. The Hansen-Coppens multipolar model is widely used to bring a detailed view of electron distribution on an atomic scale. It is thus a common starting point to investigate chemical behaviour of selected systems, giving access to microscopic insights that elucidate material properties on the large scale.One such property is the electrostatic interaction energy, which tells how strongly two charges attract or repel each other. The multipolar model brings forward a clear picture of charge distributions inside molecules, so a calculation of electrostatic energy based on it provides a better estimate than by using traditional methods (simplifications like point charges). The methods already exist to calculate electrostatic interaction energy, but their weak point is that they take their time to calculate the underlying integrals.The method discussed in this thesis (analytical exact potential / pseudo-multipolar moments, aEP/pMM) replaces the slow numerical integration inherent to the older method with analytical integration. It was integrated in the program Charger. The boost of speed comes from replacing a 3D cubature with a one-dimensional integral, due to favourable mathematical properties of the underlying multipolar model. The improvement in speed goes from 4 to 200 times, and the resulting energies are almost indistinguishable from those obtained by the older method.The goal was also to see how wide one can cast the net of this new Charger approach. It was tested on protein/ligand complexes, organic molecules and metal-organic complexes involving many elements of the first three rows in the periodic table. It was also applied on an organometallic complex containing nickel atoms in its core. In all of these applications, Charger reigned supreme over the old approach in terms of computational time, while guarding exceptional accuracy.The application on the protein/ligand complex pointed to residues which are the major contributors and detractors to ligand binding. It also revealed a possible mutation candidate that could show the predictive power of the Charger approach. The metal-organic complex contained a peculiar contact: Charger helped to characterise it. Charger also unveiled the electrostatic energy of crystal packing for an organic and an organometallic compound. The author hopes that the new aEP/pMM approach will encounter a positive reception and contribute to many an interesting finding across various fields that rely on molecular modeling.La nature électrostatique des atomes est généralement prise en compte pour explorer les interactions intermoléculaires. Le modèle multipolaire de Hansen-Coppens est largement utilisé pour obtenir une description détaillée de la distribution des électrons. Il s'agit donc d'un point de départ pour étudier le comportement de systèmes chimiques. Le choix du système donne accès à des informations microscopiques qui permettent d'élucider les propriétés des matériaux à l'échelle macroscopique. L'une de ces propriétés est l'énergie d'interaction électrostatique, qui indique la force avec laquelle deux charges s'attirent ou se repoussent. Le modèle multipolaire donne une image claire de la distribution des charges à l'intérieur des molécules. Les énergies obtenues à partir de ce modèle sont plus fiables que celles provenant de méthodes traditionnelles (comme les charges ponctuelles). Des méthodes existent déjà pour calculer l'énergie d'interaction électrostatique à partir du modèle multipolaire, mais leur point faible est qu'elles prennent du temps pour calculer les intégrales sous-jacentes. La méthode discutée dans cette thèse (potentiel analytique exact / moments pseudo-multipolaires, aEP/pMM) propose une intégration analytique rapide à la place de l'intégration numérique de l'ancienne méthode. Cette nouvelle méthode a été intégrée dans le programme Charger. Le gain de vitesse provient du remplacement d'une cubature 3D par une intégrale unidimensionnelle, grâce aux propriétés mathématiques du modèle multipolaire. Ce gain varie d'un facteur 4 à 200, et les énergies résultantes sont presque indiscernables de celles obtenues par l'ancienne méthode. L'objectif était également d'estimer le potentiel de Charger en termes d'application. Il a été testé sur des complexes protéine-ligand, des molécules organiques et des complexes métal-organique impliquant de nombreux éléments des trois premières rangées du tableau périodique. Un complexe organométallique contenant des atomes de nickel dans son cœur a également été analysé. Dans toutes ces applications, Charger domine sur l'ancienne approche en termes de temps de calcul, tout en conservant une précision exceptionnelle. L'analyse du complexe protéine/ligand a permis de distinguer les environnements favorables et défavorables à la fixation du ligand. Elle a également révélé un candidat possible à la mutation qui confère un pouvoir prédictif à l'approche Charger. Le complexe métal-organique contenait un contact particulier que Charger a aidé dans sa caractérisation. Il a également permis le calcul de l'énergie électrostatique de la maille cristalline pour un composé organique et un composé organométallique. L'auteur espère que la nouvelle approche aEP/pMM recevra un accueil positif et contribuera à de nombreuses découvertes dans divers domaines qui reposent sur la modélisation moléculaire

    Calculs électrostatiques rapides dans l'analyse énergétique : Développement de la méthode, applications aux études de cristaux organiques et organométalliques et de complexes protéine/ligand

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    One usually considers the electrostatic nature of atoms to explore intermolecular interactions. The Hansen-Coppens multipolar model is widely used to bring a detailed view of electron distribution on an atomic scale. It is thus a common starting point to investigate chemical behaviour of selected systems, giving access to microscopic insights that elucidate material properties on the large scale.One such property is the electrostatic interaction energy, which tells how strongly two charges attract or repel each other. The multipolar model brings forward a clear picture of charge distributions inside molecules, so a calculation of electrostatic energy based on it provides a better estimate than by using traditional methods (simplifications like point charges). The methods already exist to calculate electrostatic interaction energy, but their weak point is that they take their time to calculate the underlying integrals.The method discussed in this thesis (analytical exact potential / pseudo-multipolar moments, aEP/pMM) replaces the slow numerical integration inherent to the older method with analytical integration. It was integrated in the program Charger. The boost of speed comes from replacing a 3D cubature with a one-dimensional integral, due to favourable mathematical properties of the underlying multipolar model. The improvement in speed goes from 4 to 200 times, and the resulting energies are almost indistinguishable from those obtained by the older method.The goal was also to see how wide one can cast the net of this new Charger approach. It was tested on protein/ligand complexes, organic molecules and metal-organic complexes involving many elements of the first three rows in the periodic table. It was also applied on an organometallic complex containing nickel atoms in its core. In all of these applications, Charger reigned supreme over the old approach in terms of computational time, while guarding exceptional accuracy.The application on the protein/ligand complex pointed to residues which are the major contributors and detractors to ligand binding. It also revealed a possible mutation candidate that could show the predictive power of the Charger approach. The metal-organic complex contained a peculiar contact: Charger helped to characterise it. Charger also unveiled the electrostatic energy of crystal packing for an organic and an organometallic compound. The author hopes that the new aEP/pMM approach will encounter a positive reception and contribute to many an interesting finding across various fields that rely on molecular modeling.La nature électrostatique des atomes est généralement prise en compte pour explorer les interactions intermoléculaires. Le modèle multipolaire de Hansen-Coppens est largement utilisé pour obtenir une description détaillée de la distribution des électrons. Il s'agit donc d'un point de départ pour étudier le comportement de systèmes chimiques. Le choix du système donne accès à des informations microscopiques qui permettent d'élucider les propriétés des matériaux à l'échelle macroscopique. L'une de ces propriétés est l'énergie d'interaction électrostatique, qui indique la force avec laquelle deux charges s'attirent ou se repoussent. Le modèle multipolaire donne une image claire de la distribution des charges à l'intérieur des molécules. Les énergies obtenues à partir de ce modèle sont plus fiables que celles provenant de méthodes traditionnelles (comme les charges ponctuelles). Des méthodes existent déjà pour calculer l'énergie d'interaction électrostatique à partir du modèle multipolaire, mais leur point faible est qu'elles prennent du temps pour calculer les intégrales sous-jacentes. La méthode discutée dans cette thèse (potentiel analytique exact / moments pseudo-multipolaires, aEP/pMM) propose une intégration analytique rapide à la place de l'intégration numérique de l'ancienne méthode. Cette nouvelle méthode a été intégrée dans le programme Charger. Le gain de vitesse provient du remplacement d'une cubature 3D par une intégrale unidimensionnelle, grâce aux propriétés mathématiques du modèle multipolaire. Ce gain varie d'un facteur 4 à 200, et les énergies résultantes sont presque indiscernables de celles obtenues par l'ancienne méthode. L'objectif était également d'estimer le potentiel de Charger en termes d'application. Il a été testé sur des complexes protéine-ligand, des molécules organiques et des complexes métal-organique impliquant de nombreux éléments des trois premières rangées du tableau périodique. Un complexe organométallique contenant des atomes de nickel dans son cœur a également été analysé. Dans toutes ces applications, Charger domine sur l'ancienne approche en termes de temps de calcul, tout en conservant une précision exceptionnelle. L'analyse du complexe protéine/ligand a permis de distinguer les environnements favorables et défavorables à la fixation du ligand. Elle a également révélé un candidat possible à la mutation qui confère un pouvoir prédictif à l'approche Charger. Le complexe métal-organique contenait un contact particulier que Charger a aidé dans sa caractérisation. Il a également permis le calcul de l'énergie électrostatique de la maille cristalline pour un composé organique et un composé organométallique. L'auteur espère que la nouvelle approche aEP/pMM recevra un accueil positif et contribuera à de nombreuses découvertes dans divers domaines qui reposent sur la modélisation moléculaire

    Fast electrostatic calculations in energy analysis : method development, applications in investigating organic and organometalic crystals, and to protein/ligand complexes

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    La nature électrostatique des atomes est généralement prise en compte pour explorer les interactions intermoléculaires. Le modèle multipolaire de Hansen-Coppens est largement utilisé pour obtenir une description détaillée de la distribution des électrons. Il s'agit donc d'un point de départ pour étudier le comportement de systèmes chimiques. Le choix du système donne accès à des informations microscopiques qui permettent d'élucider les propriétés des matériaux à l'échelle macroscopique. L'une de ces propriétés est l'énergie d'interaction électrostatique, qui indique la force avec laquelle deux charges s'attirent ou se repoussent. Le modèle multipolaire donne une image claire de la distribution des charges à l'intérieur des molécules. Les énergies obtenues à partir de ce modèle sont plus fiables que celles provenant de méthodes traditionnelles (comme les charges ponctuelles). Des méthodes existent déjà pour calculer l'énergie d'interaction électrostatique à partir du modèle multipolaire, mais leur point faible est qu'elles prennent du temps pour calculer les intégrales sous-jacentes. La méthode discutée dans cette thèse (potentiel analytique exact / moments pseudo-multipolaires, aEP/pMM) propose une intégration analytique rapide à la place de l'intégration numérique de l'ancienne méthode. Cette nouvelle méthode a été intégrée dans le programme Charger. Le gain de vitesse provient du remplacement d'une cubature 3D par une intégrale unidimensionnelle, grâce aux propriétés mathématiques du modèle multipolaire. Ce gain varie d'un facteur 4 à 200, et les énergies résultantes sont presque indiscernables de celles obtenues par l'ancienne méthode. L'objectif était également d'estimer le potentiel de Charger en termes d'application. Il a été testé sur des complexes protéine-ligand, des molécules organiques et des complexes métal-organique impliquant de nombreux éléments des trois premières rangées du tableau périodique. Un complexe organométallique contenant des atomes de nickel dans son cœur a également été analysé. Dans toutes ces applications, Charger domine sur l'ancienne approche en termes de temps de calcul, tout en conservant une précision exceptionnelle. L'analyse du complexe protéine/ligand a permis de distinguer les environnements favorables et défavorables à la fixation du ligand. Elle a également révélé un candidat possible à la mutation qui confère un pouvoir prédictif à l'approche Charger. Le complexe métal-organique contenait un contact particulier que Charger a aidé dans sa caractérisation. Il a également permis le calcul de l'énergie électrostatique de la maille cristalline pour un composé organique et un composé organométallique. L'auteur espère que la nouvelle approche aEP/pMM recevra un accueil positif et contribuera à de nombreuses découvertes dans divers domaines qui reposent sur la modélisation moléculaire.One usually considers the electrostatic nature of atoms to explore intermolecular interactions. The Hansen-Coppens multipolar model is widely used to bring a detailed view of electron distribution on an atomic scale. It is thus a common starting point to investigate chemical behaviour of selected systems, giving access to microscopic insights that elucidate material properties on the large scale.One such property is the electrostatic interaction energy, which tells how strongly two charges attract or repel each other. The multipolar model brings forward a clear picture of charge distributions inside molecules, so a calculation of electrostatic energy based on it provides a better estimate than by using traditional methods (simplifications like point charges). The methods already exist to calculate electrostatic interaction energy, but their weak point is that they take their time to calculate the underlying integrals.The method discussed in this thesis (analytical exact potential / pseudo-multipolar moments, aEP/pMM) replaces the slow numerical integration inherent to the older method with analytical integration. It was integrated in the program Charger. The boost of speed comes from replacing a 3D cubature with a one-dimensional integral, due to favourable mathematical properties of the underlying multipolar model. The improvement in speed goes from 4 to 200 times, and the resulting energies are almost indistinguishable from those obtained by the older method.The goal was also to see how wide one can cast the net of this new Charger approach. It was tested on protein/ligand complexes, organic molecules and metal-organic complexes involving many elements of the first three rows in the periodic table. It was also applied on an organometallic complex containing nickel atoms in its core. In all of these applications, Charger reigned supreme over the old approach in terms of computational time, while guarding exceptional accuracy.The application on the protein/ligand complex pointed to residues which are the major contributors and detractors to ligand binding. It also revealed a possible mutation candidate that could show the predictive power of the Charger approach. The metal-organic complex contained a peculiar contact: Charger helped to characterise it. Charger also unveiled the electrostatic energy of crystal packing for an organic and an organometallic compound. The author hopes that the new aEP/pMM approach will encounter a positive reception and contribute to many an interesting finding across various fields that rely on molecular modeling
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