56 research outputs found
Assessing Compliance of Open Data in Politics with European Data Protection Regulation
No full textThis chapter analyses the compliance of some category of Open Data in Politics with EU GDPR requirements. After clarifying the legal basis of this framework, with specific attention to the processing procedures that conform to the legitimate interests pursued by the data controller, including open data licenses or anonymization techniques, that can result in partial application of the GDPR, but there is no generic guarantee, and, as a consequence, an appropriate process of analysis and management of risks is required
Few-Shot Class-Incremental Learning for Network Intrusion Detection Systems
No full textIn today's digital landscape, critical services are increasingly dependent on network connectivity, thus cybersecurity has become paramount. Indeed, the constant escalation of cyberattacks, including zeroday exploits, poses a significant threat. While Network Intrusion Detection Systems (NIDSs) leveraging machine-learning and deep-learning models have proven effective in recent studies, they encounter limitations such as the need for abundant samples of malicious traffic and full retraining upon encountering new attacks. These limitations hinder their adaptability in real-world scenarios. To address these challenges, we design a novel NIDS capable of promptly adapting to classify new attacks and provide timely predictions. Our proposal for attack-traffic classification adopts Few-Shot Class-Incremental Learning (FSCIL) and is based on the Rethinking Few-Shot (RFS) approach, which we experimentally prove to overcome other FSCIL state-of-the-art alternatives based on either meta-learning or transfer learning. We evaluate the proposed NIDS across a wide array of cyberattacks whose traffic is collected in recent publicly available datasets to demonstrate its robustness across diverse network-attack scenarios, including malicious activities in an Internet-of-Things context and cyberattacks targeting servers. We validate various design choices as well, involving the number of traffic samples per attack available, the impact of the features used to represent the traffic objects, and the time to deliver the classification verdict. Experimental results witness that our proposed NIDS effectively retains previously acquired knowledge (with over 94% F1-score) while adapting to new attacks with only few samples available (with over 98% F1-score). Thus, it outperforms non-FSCIL state of the art in terms of classification effectiveness and adaptation time. Moreover, our NIDS exhibits high performance even with traffic collected within short time frames, achieving 95% F1-score while reducing the time-to-insight. Finally, we identify possible limitations likely arising in specific application contexts and envision promising research avenues to mitigate them
Development of Indicators to Assess Quality of Care for Prostate Cancer
No full textAbstract not availableNupur Nag, Jeremy Millar, Ian D. Davis, Shaun Costello, James B. Duthie, Stephen Mark, Warick Delprado, David Smith, David Pryor, David Galvin, Frank Sullivan, Aine C. Murphy, David Roder, Hany Elsaleh, David Currow, Craig White, Marketa Skala, Kim L. Moretti, Tony Walker, Paolo De Ieso, Andrew Brooks, Peter Heathcote, Mark Frydenberg, Jeffery Thavaseelan, Sue M. Evan
Mapeamento de epítopos da crotoxina, principal neurotoxina do veneno de Crotalus durissus terrificus (cascavel sul americana)
No full textCrotoxin (CTx) is a dimeric protein that is responsible for the neurotoxic activity of Crotalus durissus terrificus venom. In this work we have used 3 different techniques for mapping of linear epitopes of the Crotoxin B cells. The three methods were: Prediction by bioinformatics, Spot-Synthesis method and mapping by subcutaneous implants of peptides in mice. Sera of horses immunized with the total venom of C. d. terrificus were used in the Spot-Synthesis method. Immunoassays in the Spot-Synthesis method have shown that the C-terminal region of each of the CTx subunits is a dominant immunogenic region. These results were similar to the ones obtained by the bioinformatic method. Mapping by subcutaneous implants has identified other immunodominant regions of the crotoxin. The previously identified amino acid sequences corresponding to the immunogenic regions were chemically synthesized and the purity of these peptides were evaluated by mass spectrometry. The synthetic peptides were antigenically characterized by immunoblot using anticrotalic horse serum, for the immunogenic characterization of peptides, they were polymerized with glutaraldehyde and used as immunogens in the immunization of mice. Anti-peptide anti-mouse antibodies recognized CTx, the total venom of C. d. Terrificus and the synthetic peptides.All epitopes were found in the CTx 3D structure and they are located on the surface of the proteinCrotoxina (CTx) é uma proteína dimerica responsável pela atividade neurotóxica do veneno da serpente Crotalus durissus terrificus. Neste trabalho nós utilizamos três técnicas diferentes para o mapeamento de epítopos lineares para células B na crotoxina. Os três métodos foram: Predição por bioinformática, método de Spot-Sintese e mapeamento por implantes subcutâneos de peptídeos em camundongos. Soros de cavalos imunizados com veneno total de C. d. terrificus foram utilizados no método de Spot-Synthesis. Imunoensaios no método de Spot-Synthesis revelam que a região C-terminal de cada uma das subunidades que conforman a CTx é uma região imunogenicamente dominante. Estes resultados foram coincidentes com os resultados obtidos pelo método bioinformatico. O mapeamento por implantes subcuâneos indentificaram outras regiões imunodominantes da crotoxina. Os peptídeos correspondientes as regiões imunogênicas previamente identificas foram sintetizadas quimicamente e a pureza desses peptídeos foram avaliados por espectrometria de massas. Os peptídeos sintéticos foram antigenicamente caracterizados por imunoblot utilizando soro de cavalo anticrotalico e para a caracterização imunogênica dos peptídeos, eles foram polimerizados com glutaraldehído e usados como imunógenos na imunização de camundongos. Anticorpos de camundongos anti-peptídeos reconheceram a CTx o veneno total de C. d. terrificus e os peptideos sintéticos. Todos os epitopos foram lozalizados na estrutura 3D da CTx e eles se encontram localizados na superficie da proteína
Expression and activity of the calpain proteolitic system in the beef of Marchigiana Cattle.
No full textExpression and activity of the calpain proteolitic system in the beef of Marchigiana Cattle.
No full textIsolamento, caracterização termodinâmica e estudos bioquímicos da lectina de sementes dormentes e de cotilédones de sementes germinadas da leguminosa Macrotyloma axillare
No full textThe Macrotyloma axillare seed lectin (LMA) is an N-acetyl-galactosamine (GalNac) specific lectin very important in biothecnology because the specific hemmaglutination by A1 human erythrocytes. In this work, the LMA from dormant and germinated was purified by precipitation techniques and ion exchange chromatography as a new purification technique. Such methodology yielded three LMA fractions (0.2, 0.3 and 0.4 M) with hemagglutinating activity on erythrocytes A1, being the LMA 0.2 the major fraction considering the mass yielding. The SDS-PAGE 12.5% and mass spectrometry analyses revealed a molecular mass about 28 1 kDa. The LMA hemmaglutinating activity is Ca(II) and Mn(II) dependent and the pH-dependent assays showed best hemagglutinating activity at pH 6.0-8.0; being decreased at acidic/alkaline conditions. The native molecular mass determination showed that the LMA is a tetramer at pH 6.0-8.0 range and a dimer at pH 4.0. The thermodynamic data obtained by ITC using GalNac and NO2-Phenyl-GalNac derivatives have shown that all the LMA fractions tested (from dormant and germinated seeds) are similar and the binding is enthalpically driven. The 2-NO2-Phenyl--D-GalNac ligand is the best ligand and good affinities can be obtained by titrations performed at low temperature (15°C) and high salt concentration (NaCl 1M). The LMA data from germinated seeds have shown that the LMA is a protein resistant to the germination process (120 hours) as it could be seen by mass spectrometry analyses and by ITC titrations. The LMA denaturation studies, provided by DSC, revealed high thermal stability (Tm) at pH 6.2 with melting temperature about 100°C. The LMA denaturation process is irreversible (two state model) and thermodynamically driven at the DSC conditions tested. The LMA germinated data and the high thermal stability for LMA corroborate that lectins are crucial proteins for metabolism, physiology and development events of the Macrotyloma axillare legume.A lectina da Macrotyloma axillare (LMA) é uma lectina N-acetilgalactosamina específica muito importante em biotecnologia uma vez que pode ser utilizada para biotipagem de hemácias humanas do Subgrupo A1. Neste trabalho, a LMA proveniente de sementes dormentes e germinadas foi purificada por uma nova técnica, utilizando métodos de precipitação e cromatografia de troca iônica. Por tal metodologia isolaram-se três frações ativas da LMA (0,2; 0,3 e 0,4M) com atividade hemaglutinante sobre hemácias A1 e com rendimento em massa predominante da LMA 0,2M. Análises por SDS-PAGE 12,5% e por espectrometria de massas do tipo ESI e MALDI-TOF revelaram que as frações de LMA são semelhantes e apresentam massas moleculares de 28 1 kDa. Estudos de estabilidade em diferentes condições de pH mostraram que a LMA apresenta atividade hemaglutinante máxima entre pH 6,0-8,0 e na presença de íons divalentes como o Ca(II) e Mn(II); com decréscimo de atividade em condições ácidas/alcalinas. As determinações de massa molecular nativa da LMA por cromatografia de exclusão por tamanho demonstraram que a LMA se comporta como tetrâmero entre pH 6,0-8,0 e dímero em pH 4,0. Estudos termodinâmicos das diversas frações de LMA (sementes dormentes e germinadas) por ITC, utilizando NacGal e NO2-Fenil-NacGal derivados, revelaram que tais frações de LMA possuem afinidades similares para os diversos carboidratos testados, com ligações entalpicamente dirigidas. O carboidrato 2-NO2-Fenil--D-NacGal foi o melhor ligante para a LMA em titulações realizadas por ITC em baixas temperaturas (15°C), pH próximo à neutralidade e em altas concentrações de NaCl (1M). Os dados obtidos para a LMA de sementes germinadas demonstram que essa proteína é resistente durante o processo de germinação por 120 horas, como verificado pelas análises de espectrometrias de massas e pelas titulações calorimétricas. Estudos de desnaturação realizados por DSC revelaram que a LMA possui elevada estabilidade termodinâmica em pH 6,2 com Tm 100°C. O processo de desnaturação da LMA é irreversível (modelo dois estados) e termodinamicamente dirigido nas condições experimentais testadas no DSC. Os dados obtidos para a LMA de sementes dormentes e germinadas e a elevada resistência térmica da LMA corroboram que tais proteínas podem ser importantes na fisiologia, desenvolvimento e metabolismo das sementes da leguminosa Macrotyloma axillare
Mapeamento de epítopos da crotoxina, principal neurotoxina do veneno de Crotalus durissus terrificus (cascavel sul americana)
No full textCrotoxin (CTx) is a dimeric protein that is responsible for the neurotoxic activity of Crotalus durissus terrificus venom. In this work we have used 3 different techniques for mapping of linear epitopes of the Crotoxin B cells. The three methods were: Prediction by bioinformatics, Spot-Synthesis method and mapping by subcutaneous implants of peptides in mice. Sera of horses immunized with the total venom of C. d. terrificus were used in the Spot-Synthesis method. Immunoassays in the Spot-Synthesis method have shown that the C-terminal region of each of the CTx subunits is a dominant immunogenic region. These results were similar to the ones obtained by the bioinformatic method. Mapping by subcutaneous implants has identified other immunodominant regions of the crotoxin. The previously identified amino acid sequences corresponding to the immunogenic regions were chemically synthesized and the purity of these peptides were evaluated by mass spectrometry. The synthetic peptides were antigenically characterized by immunoblot using anticrotalic horse serum, for the immunogenic characterization of peptides, they were polymerized with glutaraldehyde and used as immunogens in the immunization of mice. Anti-peptide anti-mouse antibodies recognized CTx, the total venom of C. d. Terrificus and the synthetic peptides.All epitopes were found in the CTx 3D structure and they are located on the surface of the proteinCrotoxina (CTx) é uma proteína dimerica responsável pela atividade neurotóxica do veneno da serpente Crotalus durissus terrificus. Neste trabalho nós utilizamos três técnicas diferentes para o mapeamento de epítopos lineares para células B na crotoxina. Os três métodos foram: Predição por bioinformática, método de Spot-Sintese e mapeamento por implantes subcutâneos de peptídeos em camundongos. Soros de cavalos imunizados com veneno total de C. d. terrificus foram utilizados no método de Spot-Synthesis. Imunoensaios no método de Spot-Synthesis revelam que a região C-terminal de cada uma das subunidades que conforman a CTx é uma região imunogenicamente dominante. Estes resultados foram coincidentes com os resultados obtidos pelo método bioinformatico. O mapeamento por implantes subcuâneos indentificaram outras regiões imunodominantes da crotoxina. Os peptídeos correspondientes as regiões imunogênicas previamente identificas foram sintetizadas quimicamente e a pureza desses peptídeos foram avaliados por espectrometria de massas. Os peptídeos sintéticos foram antigenicamente caracterizados por imunoblot utilizando soro de cavalo anticrotalico e para a caracterização imunogênica dos peptídeos, eles foram polimerizados com glutaraldehído e usados como imunógenos na imunização de camundongos. Anticorpos de camundongos anti-peptídeos reconheceram a CTx o veneno total de C. d. terrificus e os peptideos sintéticos. Todos os epitopos foram lozalizados na estrutura 3D da CTx e eles se encontram localizados na superficie da proteína
Os cuidados familiares: Aspectos da reprodução social à luz da desigualdade de gênero
No full textThis article proposes taking an uncommon route to understanding gender and inequality, based on functions organized around kinship and residency. In this sense, family and home are components of the function of “care” currently considered to be a valuable resource that is either tangible or intangible; in an environment that conciliates the productive and reproductive realm, at a time when family care is seen as a social problem and an object of public policy. Analyzing the relationship between gender and care allows linking not only the role of the family, State and market, but also including family oriented positions as well as a “defamilizing” regiment, whilealso including in this dynamic other civil society, educational and legal institutions as well as belief systems.El artículo propone un recorrido menos habitual para comprender el género y la desigualdad, a partir de aquellas funciones que se organizan a través del parentesco y la residencia. En este sentido, familia y hogar explican la función de “cuidados” considerada hoy en día un valioso recurso de carácter tangible como intangible; un medio que concilia el ámbito productivo y el reproductivo, enmomentos en que se aboga por el tratamiento de los cuidados familiares como problema público y objeto de políticas. Pensar en la relación entre género y cuidados permite vincular no sólo el papel de la familia, el Estado y de la oferta mercantil, desde posiciones tanto familistas como desde un régimen desfamiliarizador, sino incluir en esta dinámica a otras instituciones de la sociedad civil, los sistemas educativos y legales, y los sistemas de creencias.O artigo propõe um percurso menos habitual para se compreender questões de gênero e desigualdade, a partir daquelas funções que se organizam através do parentesco e da vida doméstica. Neste sentido, família e lar explicam a função de “cuidados” considerada hoje em dia um valioso recurso de caráter tanto tangível como intangível; um meio que concilia o âmbito produtivo e reprodutivo, em momentos em que se advoga pelos cuidados familiares como problema social e objeto de políticas públicas. Pensar na relação entre gênero e cuidados permite vincular não apenas o papel da família, Estado e mercado, a partir de posições “familistas”, como a partir de um regime “desfamiliarizador”, mas também incluir, nesta dinâmica, outras instituições da sociedade civil, os sistemas educativos e legais, e os sistemas de crenças
Regulação do transporte de lactose em Kluyveromyces lactis JA6.
No full textPrograma de Pós-Graduação em Ciências Biológicas. Núcleo de Pesquisas em Ciências Biológicas, Pró-Reitoria de Pesquisa de Pós Graduação, Universidade Federal de Ouro Preto.Kluyveromyces lactis é uma levedura capaz de fermentar a lactose e por isso é considerada como modelo alternativo para estudos bioquímicos, fisiológicos e genéticos de leveduras não Saccharomyces. Compreender os mecanismos de captação de lactose e a regulação envolvida no transporte é um passo importante para melhores aplicações biotecnológicas destas células. O transporte de lactose, em K. lactis é mediado por uma permease da membrana, codificada pelo gene LAC12. Nesse estudo as estirpes utilizadas foram a K. lactis JA6 e a K. lactis JA6 LAC12-GFP. As células foram cultivadas em meio YNB completo, suplementado com diferentes fontes de carbono (lactose, galactose, glicose e glicerol (3% w/w)) a uma concentração de 2% (w / v), em uma incubadora orbital a 30 ° C. As células foram colhidas no meio de fase exponencial, lavadas por três vezes com água fria, resuspensas em 100 mM Tris / tampão de citrato, pH 5.0 para medições de transporte de [D-glucose-1-14C] lactose. A cinética da taxa inicial de captação de [D-glucose-1-14] lactose foi investigada numa gama de concentrações de 0,025 a 10 mM de lactose. Galactose foi testada como inibidor competitivo do transporte de lactose, uma vez que em K. lactis Lac12p também foi descrito como transportador de galactose. Para estudar o efeito da glicose no transporte de lactose, as células foram cultivadas em lactose e divididas em duas alíquotas (controlo e 100 mM de glicose adicionada). As células foram colhidas, lavadas e a captação inicial de lactose foi medida. A taxa de captação inicial de [D-glucose-1-14C] lactose também foi investigada em células cultivadas em glicose e transferidas para lactose na presença / ausência de cicloheximida ou Higromicina B. A localização do transportador Lac12-GFP foi investigada em células crescidas em glicose e em células transferidas para lactose, ou galactose, ou glicerol. O perfil de consumo de açúcares por células de K.lactis foi analisado através de HPLC. Os resultados mostraram que o transporte de lactose em células cultivadas em 2% de lactose obedece a uma cinética de saturação. A constante de afinidade (Ks) foi de 1,49 ± 0,38 mM e a velocidade máxima (Vmáx) foi 953,47 ± 116,24 μmoles.h-1.g-1. O mesmo sistema de transporte estava presente em células cultivadas em galactose e glicerol. As células cultivadas em 2% (w/v) de glicose transportaram a lactose em taxas muito baixas. No entanto, quando as células crescidas em glicose foram transferidas para 2% (w/v) de lactose, o transporte exibe recuperação parcial. Esta recuperação não parece requerer a síntese de proteínas uma vez que cicloheximida e higromicina B não impediram a desrepressão parcial. Além disso, o transporte de lactose não é inativado pela glicose. A localização sub celular do transportador Lac12 é dependente da fonte de carbono e da sua concentração. O consumo de glicose e lactose é simultâneo apesar da glicose retardar o consumo da lactose. O consumo de lactose é preferencial ao de galactose quando os dois açúcares estão presentes simultaneamente. Estes dados nos permitem inferir que o sistema de transporte de lactose em K. lactis JA6 é constitutivo e que a glicose exerce um controle não muito claro no transporte lactose. Provavelmente, este controle envolve mecanismos transcricionais e postranscricional.Kluyveromyces lactis is able to ferment lactose and it is considered as an alternative model for biochemical, physiological and genetic studies in non-Saccharomyces yeasts. Understanding the mechanisms of lactose uptake and the regulation involved in the transport is an important step towards better biotechnological applications. The transport of lactose in K. lactis is mediated by a membrane permease encoded by the LAC12 gene. In this study we used the strains K. lactis JA6 and K. lactis JA6 LAC12-GFP. Cells were harvested in mid-exponential growth phase, washed with cold distilled water, resuspended in 100 mM Tris/citrate buffer, pH 5.0 for [D-glucose-1-14C] lactose transport measurements. The kinetics of the initial rate of uptake [D-glucose-1-14C] lactose was investigated in the range of concentration of 0.025 to 10 mM. Galactose was tested as competitive inhibitor of lactose transport since this system also transport galactose. To study the effect of glucose on lactose transport, cells were grown on lactose and divided in two aliquots (control and 100 mM glucose added). Cells were harvested, washed and the uptake was measured. The initial uptake rate of [D-glucose-1-14C] lactose was also investigated in cells grown on glucose and transferred to lactose in the presence/absence of cycloheximide or Hygromycin B. The sub-cellular localization of the carrier Lac12-GFP was investigated in glucose grown cells and after the transference to lactose or galactose or glycerol. The sugar consumption profile of K.lactis was analyzed by HPLC chromatography. The results indicate that the transport of lactose into cells grown on 2% lactose follows the kinetics of saturation.The half-saturation constant (Ks) was 1.49 ± 0.38 mM and the maximum velocity (Vmax) was 953.47 ± 116.24 μmoles.h-1.g -1. The same transport system was present in cells grown on galactose and glycerol. Cells grown on 2% (w/v) glucose transport lactose at very low rates. However, when the cells grown on glucose were transferred to 2% (w/v) lactose, the transport exhibited a partial recovery. In addition, the lactose transport is not inactivated by glucose. This recovery does not appear to require protein synthesis since cycloheximide and hygromycin B did not inhibit the partial derepression. The sub-cellular localization of Lac12p is dependent of carbon source and concentration. Consumption of glucose and lactose is simultaneous although glucose retard consumption of lactose. The consumption of lactose is preferred to galactose when both sugars are present. These data allow us to infer that the lactose transport system in K. lactis JA6 is constitutive, and that glucose exerts a control not so clear in the lactose transport. From experiments with Lac12-GFPp, we conclude that glucose control involves transcriptional and posttranscriptional steps
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