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In Silico identification and annotation of noncoding RNAs by RNA-seq and de Novo assembly of the transcriptome of Tomato Fruits
No full textThe complexity of the tomato (Solanum lycopersicum) transcriptome has not yet been fully elucidated. To gain insights into the diversity and features of coding and non-coding RNA molecules of tomato fruits, we generated strand-specific libraries from berries of two tomato cultivars grown in two open-field conditions with different soil type. Following high-throughput Illumina RNA-sequencing (RNA-seq), more than 90% of the reads (over one billion, derived from twelve dataset) were aligned to the tomato reference genome. We report a comprehensive analysis of the transcriptome, improved with 39,095 transcripts, which reveals previously unannotated novel transcripts, natural antisense transcripts, long noncoding RNAs and alternative splicing variants. In addition, we investigated the sequence variants between the cultivars under investigation to highlight their genetic difference. Our strand-specific analysis allowed us to expand the current tomato transcriptome annotation and it is the first to reveal the complexity of the poly-adenylated RNA world in tomato. Moreover, our work demonstrates the usefulness of strand specific RNA-seq approach for the transcriptome-based genome annotation and provides a resource valuable for further functional studies. © 2017 Scarano et al. This is an open access article distributed under the terms of the Creative Commons Attribution License, which permits unrestricted use, distribution, and reproduction in any medium, provided the original author and source are credited
I fatti della storia e la storia dei fatti: cronaca e novella nella Toscana del secondo Trecento
No full textConsiderazioni e osservazioni sul problema dei rapporti e delle intersezioni tra cronaca, storia e novella, studiati attraverso modalità ed esempi di racconto novellistico nella cronaca toscana del secondo Trecento (Marchionne di Coppo Stefani Buonaiuti), di diretto riuso di racconti cronachistici nel Pecorone di Ser Giovanni Fiorentino, di intersezione tra l’opera di cronista e novelliere nel Sercambi, di drammatizzazione e sceneggiatura di fatti storici in alcune novelle del Sacchetti (a confronto con i paralleli resoconti cronachistici)
Personaggi e cornice nel dialogo umanistico: "I libri della famiglia"
No full textL’indagine ha per oggetto la struttura del nuovo dialogo umanistico nel Quattrocento, con particolare riferimento all’Alberti e ai Libri della Famiglia, di cui si mettono in evidenza l’approfondita riflessione sulla lezione ciceroniana (soprattutto per quanto concerne De oratore, De senectute e De amicitia) e la cura e novità nella delineazione dei personaggi
Teoria e prassi della riscrittura: l'opera di Leon Battista Alberti
No full textRiflessioni critiche sulla poetica albertiana e sulla prassi dell’autore, in diverse fasi della sua opera, nella scrittura in latino e in volgar
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