24 research outputs found
Supplementary Material for: Sex-Biased Expression of Young Genes in <b><i>Silurana (Xenopus) tropicalis</i></b>
Sex-biased gene expression can evolve from sex-specific selection and is often associated with sex-linked genes. Gene duplication is a particularly effective mechanism for the generation of sex-biased genes, in which a new copy can help resolve intralocus sexual conflicts. This study assesses sex-biased gene expression in an amphibian with homomorphic ZW sex chromosomes, the Western clawed frog Silurana (Xenopus)tropicalis. Previous work has shown that the sex chromosomes in this species are mainly undifferentiated and pseudoautosomal. Consistent with ongoing recombination between the sex chromosomes, this study detected little evidence for the general sexualization of sex-linked regions. A subset of genes closely linked to the sex determining locus displays a tendency for male-biased expression and elevated rates of evolution relative to genes in other genomic locations. This may be a symptom of an early stage of sex chromosome differentiation driven by, for example, chromosomal degeneration or natural selection on genes in this portion of the Z chromosome. Alternatively, it could reflect variation between the sexes in allelic copy number coupled with a lack of dosage compensation. Irrespective of the genomic location, lineage-specific genes and recently duplicated genes had significantly high levels of sex-biased expression, offering insights into the early transcriptional differentiation of young genes
On the principles, assumptions and methods of geodetic very long baseline interferometry
Het functiemodel bij Very Long Baseline Interferometry en de relatie met tektonische bewegingen
Geodetische toepassing van Very Long Baseline Interferometry (VLBI) levert over grote afstanden positieverschillen met een hoge nauwkeurigheid. In principe is deze techniek dan ook geschikt voor het bepalen van wereldwijde tektonische bewegingen. Het eerste gedeelte van deze scriptie beschrijft, na een algemene inleiding, enige verbeteringen in het functiemodel van de Delftse VLBI software DEGRIAS. Het gebruik van VLBI als ’monitor’ techniek voor de genoemde tektonische bewegingen staat centraal in het tweede deel van deze scriptie.Civil Engineering and Geoscience
De berekening van ionosfeercorrecties voor enkel-frequentie gps waarnemingen: een onderzoek naar twee modellen
Het Global Positioning System is een wereldwijd systeem voor plaatsbepaling met behulp van radiosatel1ieten. De voortplantingssnelheid van de radiogolven, die door deze satellieten worden uitgezonden, ondervindt een invloed van de ionosfeer. Dit ionosfeereffeet kan, in eerste orde, worden geëlimineerd via een meting op twee verschillende frequenties. Als men echter op slechts één frequentie waarneemt, dan kan het ionosfeereffeet worden gecorrigeerd met behulp van een model. In het afstudeeronderzoek zijn de resultaten van twee ionosfeermodellen vergeleken met de dubbel-frequentie resultaten. Zodoende kan worden onderzocht in hoeverre het mogelijk is om op basis van een ionosfeermodel correcties aan te brengen aan enkel-frequentie GPS waarnemingen.Civil Engineering and GeosciencesMathematische en fysische geodesi
Reducing supply chain cost by consolidating inventory in a global supply chain
Thesis (BEng. (Industrial and Systems Engineering))--University of Pretoria, 2011.This study will determine if it is economically feasible to consolidate inventory for the smaller affiliates in order to reduce the lead time period and in effect the amount of stock being kept by the smaller affiliates without affecting the desired customer service level
United Nations Environmental Council: The Vertical Farm
Strategic Architectural Design Development (SADD)ArchitectureArchitectur
Onderzoek naar strategieën ter bepaling van deformaties uit gps-metingen
In deze afstudeerscriptie worden enkele strategieën besproken, die het probleem van de bepaling van deformaties uit GPS-metingen kunnen aanpakken. Deformatiemetingen bestaan uit metingen van een netwerk op verschillende tijdstippen. We kunnen het netwerk per tijdstip vereffenen met het mathematisch model per tijdstip. Dit wordt aangeduid met Fase 1. De vereffening van het mathematisch model voor alle tijdstippen, het deformatiemodel, wordt aangeduid met Fase 2. Beide modellen zijn uitgeschreven uitgaande van GPS-metingen.Civil Engineering and Geoscience
Radio interferometrie
Het eerste deel van deze scriptie tracht de lezer die nog niet of slechts in geringe mate kennis bezit op het gebied van de radio - astronomie een beeld te geven van de radio-interferometrie in het algemeen en de "Very Long Baseline Interferometry" in het bijzonder. Er is getracht een evenwicht te vinden tussen een globaal overzicht en een veelheid aan details. Aan de hand van een ruime hoeveelheid literatuurverwijzingen kan de lezer desgewenst verder in de materie doordringen. Achtereenvolgens zullen aan de orde komen: in hfdst. I: een globale beschrijving van het meetsysteem, een vergelijking met andere meetsystemen en de toepassingsmogelijkheden van de radio-interferometfie. In hoofdstuk II wordt na een kort geschiedkundig overzicht dieper ingegaan op het meetproces voor de astronomie in het algemeen met aandacht voor bnonnen,stations,apparatuur en foutenbronnen. In het derde hoofdstuk vindt men dan de gang van zaken bij V.L.B.I. toegespitst op geodetische doeleinden. Hier wordt ingegaan op de data-verwerking, met afschattingen van de precisies, uitgaande van bepaalde instrumentele mogelijkheden. Hoofdstuk IV tenslotte vormt de afsluiting van dit 1 deel met een blik op de toekomst.Civil Engineering and Geoscience
The Chvátal–Gomory procedure for integer SDPs with applications in combinatorial optimization
In this paper we study the well-known Chvátal–Gomory (CG) procedure for the class of integer semidefinite programs (ISDPs). We prove several results regarding the hierarchy of relaxations obtained by iterating this procedure. We also study different formulations of the elementary closure of spectrahedra. A polyhedral description of the elementary closure for a specific type of spectrahedra is derived by exploiting total dual integrality for SDPs. Moreover, we show how to exploit (strengthened) CG cuts in a branch-and-cut framework for ISDPs. Different from existing algorithms in the literature, the separation routine in our approach exploits both the semidefinite and the integrality constraints. We provide separation routines for several common classes of binary SDPs resulting from combinatorial optimization problems. In the second part of the paper we present a comprehensive application of our approach to the quadratic traveling salesman problem ( QTSP ). Based on the algebraic connectivity of the directed Hamiltonian cycle, two ISDPs that model the QTSP are introduced. We show that the CG cuts resulting from these formulations contain several well-known families of cutting planes. Numerical results illustrate the practical strength of the CG cuts in our branch-and-cut algorithm, which outperforms alternative ISDP solvers and is able to solve large QTSP instances to optimality.Discrete Mathematics and Optimizatio
Territorial Factors in a Globalised Art World?
In comparison to other disciplines of high culture, the visual arts seem to be the most suitable to internationalise (cf. Crane, 1992; Janssen, Kuipers & Verboord, 2008). The global diffusion of visual art works, for example, is far less complex than that of the performing arts, which entails an impressive transportation operation of both goods – instruments, sets, costumes – and the actors involved, such as orchestra musicians, theatre company actors or dancers. The global distribution of literature, meanwhile, is easier to achieve than is the case for the visual arts, yet language obstacles manifestly hinder its internationalisation (Heilbron, 1999; Janssen, 2009; Sapiro, 2010). Indeed, the only way to overcome such hurdles is when the author provides a translation of the work, or when the reader learns the foreign language in which it is written (De Swaan, 2001). This is similar in the case of theatre plays or the cinema (Hofstede, 2000). On the other hand, the visual language is deemed to be universal and is unhindered by these issues. In short, while the internationalisation of other domains demands different kinds of investment, the visual arts seem to have the best conditions for artists to conquer the world
