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La caracterización molecular de aislamientos de Staphylococcus aureus meticilino-resistente revela la diseminación de un nuevo clon en la ciudad de Buenos Aires
Full text linkWe performed a hospital - acquired methicillin - resistant Staphylococcus aureus molecular study in Buenos Aires city. Four clones were found harboring the transposable elementsTn4001 and Tn5405 and the erythromycin resistance determinants ermA and mef(E). Of the isolates, 73% belonged to a clone found previously in the city of Córdoba, which showed an epidemic behavior initially attributed to a widely disseminated South American clone.Fil: Jeric, Paola Elba. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina; ArgentinaFil: Matteo, Mario José. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina; ArgentinaFil: Ramirez, Maria Soledad. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay; ArgentinaFil: Couto, Elsa. Hospital Francés; ArgentinaFil: Tokumoto, Marta. Fundación Favaloro; ArgentinaFil: Centron, Daniela. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina; Argentin
Draft genome of the multidrug-resistant Acinetobacter baumannii strain A155 clinical isolate
Full text linkAcinetobacter baumannii is a bacterial pathogen with serious implications for human health, due to increasing reports of multidrug-resistant strains isolated from patients. Total DNA from the multidrug-resistant A. baumannii strain A155 clinical isolate was sequenced to greater than 65x coverage, providing high-quality contig assemblies.Fil: Arivett, Brock A.. Miami University; Estados UnidosFil: Fiester, Steven E.. Miami University; Estados UnidosFil: Ream, David C.. Miami University; Estados UnidosFil: Centron, Daniela. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; ArgentinaFil: Ramirez, Maria Soledad. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; ArgentinaFil: Tolmasky, Marcelo. Fullerton University; Estados UnidosFil: Actis, Luis A.. Miami University; Estados Unido
Draft Genome Sequence of an International Clonal Lineage 1 Acinetobacter baumannii Strain from Argentina
Full text linkIn the last few years Acinetobacter baumannii has emerged worldwide as an important nosocomial pathogen in medical institutions. Here, we present the draft genome sequence of the international clonal lineage 1 (ICL1) A. baumannii strain A144 that was isolated in a hospital in Buenos Aires City in the year 1997. The strain is susceptible to carbapenems and resistant to trimethoprim and gentamicin.Fil: Vilacoba, Elisabet. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; ArgentinaFil: Déraspe, Maxime. Laval University; CanadáFil: Traglia, German Matias. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; ArgentinaFil: Roy, Paul H.. Laval University; CanadáFil: Ramirez, Maria Soledad. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; Argentina. California State University; Estados UnidosFil: Centron, Daniela. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; Argentin
Characterization of Tn6238 with a New Allele of aac(6′)-Ib-cr
Full text linkHere, we report that the genetic structure of Tn1331 remained conserved in Argentina from 1989 to 2013 (72 of 73 isolates), with the exception being the plasmid-borne Tn1331-like transposon Tn6238 containing a new aac(6′)-Ib-cr allele recovered from a colistin-resistant Klebsiella pneumoniae clinical isolate. A bioinformatic analysis of aac(6′)-Ib-like gene cassettes suggests that this new aac(6′)-Ib-cr allele emerged through mutation or homologous recombination in the Tn1331 genetic platform. Tn6238 is a novel platform for the dissemination of aminoglycoside and fluoroquinolone resistance determinants.Fil: Quiroga, María Paula. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; ArgentinaFil: Orman, Betina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; ArgentinaFil: Errecalde, Laura. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Hospital General de Agudos ; ArgentinaFil: Kaufman, Sara. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Hospital General de Agudos ; ArgentinaFil: Centron, Daniela. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; Argentin
Detección del virus SARS-COV-2 en aguas residuales y su valor como método de vigilancia epidemiológica
No full textPara la vigilancia epidemiológica de COVID-19, un abordaje complementario alos diagnósticos de infección basados en la detección del material genético del virusen el tracto respiratorio y la detección de anticuerpos directamente del pacientees la búsqueda y caracterización del genoma viral en muestras de aguas residuales,ya que permite evaluar en pocos ensayos la presencia del virus a nivel poblacional.Fil: Iglesias, Gabriel. Universidad Nacional de Quilmes; ArgentinaFil: Mbayed, Viviana Andrea. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica; ArgentinaFil: Centron, Daniela. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; ArgentinaFil: Erijman, Leonardo. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Investigaciones en Ingeniería Genética y Biología Molecular "Dr. Héctor N. Torres"; ArgentinaFil: Vera, Carolina Susana. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Centro de Investigaciones del Mar y la Atmósfera. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Centro de Investigaciones del Mar y la Atmósfera; Argentin
Novel Rearrangement of a Class 2 Integron in Two Non-Epidemiologically Related Isolates of Acinetobacter baumannii
Full text linkTn7::In2-8 contains sat2-aadB-catB2(attC)-dfrA1-sat2-aadA1-orfX in the variable region of a class 2 integron embedded in the Tn7-like transposon. This novel transposon was inserted in its preferred site downstream of the glms gene in Acinetobacter baumannii. Acquisition of the pseudocassette catB2 could have arisen by a secondary-site integrase-mediated intermolecular recombination event.Fil: Ramirez, Maria Soledad. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; ArgentinaFil: Quiroga, Cecilia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; ArgentinaFil: Centron, Daniela. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; Argentin
Acinetobacter baumannii is able to gain and maintain a plasmid harbouring In35 found in Enterobacteriaceae isolates from Argentina
Full text linkThe aim of this study was to determine the presence of bla CTX-M-2 in our A. baumannii population and their putative role as an alternative mechanism of resistance to third-generation cephalosporins in this species. The bla CTX-M-2 gene is widespread among the Enterobacteriaceae isolates from our country; however, it was not found in 76 isolates A. baumannii non-epidemiologically related clinical isolates resistant to third-generation cephalosporins isolated since 1982 in hospitals from Buenos Aires City. A plasmid isolated from Proteus mirabilis that possesses the complex class 1 integron In35::ISCR1::bla CTX-M-2 was used to transform the natural competent A. baumannii clinical strain A118. PCR, plasmid extraction, DNA restriction, and susceptibility test confirmed that A118 could gain and maintain the plasmid possessing In35::ISCR1::bla CTX-M-2, the genetic platform where the bla CTX-M-2 gene is dispersing in Argentina.Fil: Ramirez, Maria Soledad. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Departamento de Microbiología; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Merkier, Andrea Karina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Departamento de Microbiología; ArgentinaFil: Quiroga, María Paula. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Departamento de Microbiología; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Centron, Daniela. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Departamento de Microbiología; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentin
ISCR2 and IS26: Two Insertion Sequences Highly Dispersed among Acinetobacter spp. Clinical Strainss
Full text linkThe aim of this work is to study the dispersion of two ISs, ISCR2 and IS26, which are known to contribute in the acquisition of resistance determinants and genome plasticity, among a collection of hundred and seventy-four Acinetobacter spp. clinical isolates. PCR amplification reactions using total DNA were performed to search ISCR2, IS26, and different antibiotic resistance genes (tet(B), aphA6, sul2, floR, dfr9) previously described in the genetic context of ISCR2.Among A. baumannii, positive amplification for ISCR2 was obtained in 66% of the included isolates and most of them (93%) were positive for IS26 amplification. The platform tet(B)::ISCR2 was found in 57% of the ISCR2 positive isolates and only 14 gave negative amplification for tet(B). In these isolates positive amplifications of genes that were previously described associated to ISCR2 -such as, aphA6, sul2, floR, and dfr9- were observed. When searching these ISs in the non-baumannii Acinetobacter studied-collection, two isolates were positive for ISCR2 and two isolates for IS26. No positive results were obtained for tet(B), but the presence of sul2, floR and dfr9 was found. Our results exposed a great dispersion of ISCR2 as well as IS26 among Acinetobacter spp. clinical isolates reinforcing the idea that the ISs play a crucial role in the plasticity and evolution towards drug resistance in this genus.Fil: Montaña, Sabrina Daiana. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; ArgentinaFil: Almuzara, Marisa. Laboratorio de Bacteriología; ArgentinaFil: Pennini, M. Unidad Microbiología; ArgentinaFil: Sucari, A.. Unidad Microbiología; ArgentinaFil: Centron, Daniela. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; ArgentinaFil: Vay, C.. Laboratorio de Bacteriología; ArgentinaFil: Ramirez, Maria Soledad. California State University; Estados Unido
Outbreak of extensively drug-resistant Acinetobacter baumannii indigo-pigmented strains
Full text linkAcinetobacter baumannii pigmented strains are not common in clinical settings. In the present work we report an outbreak caused by indigo-pigmented A. baumannii strains isolated in an acute hospital in Argentina from March to September 2012. Pan-PCR assays exposed a unique pattern belonging to the recently described regional CC113B/CC79P that confirms the relevant relationships among the indigo-pigmented A. baumannii strains. All of them were extensively drug-resistant and harbored different genetic elements associated with horizontal genetic transfer as the transposon Tn2006, class 2 integrons, AbaR-type islands, IS125, IS26, strA, strB, florR and the small recombinase ISCR2 associated to the sul2 gene proceed by ISAba1.Fil: Vilacoba, Elisabet. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones En Microbiología y Parasitología Médica; ArgentinaFil: Almuzara, Marisa. Hospital Interzonal de Agudos Eva Perón; ArgentinaFil: Gulone, Lucia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones En Microbiología y Parasitología Médica; ArgentinaFil: Rodriguez, Rocio. Hospital Interzonal de Agudos Eva Perón; ArgentinaFil: Pallone, Elida. Hospital Interzonal de Agudos Eva Perón; ArgentinaFil: Bakai, Romina. Hospital Interzonal de Agudos Eva Perón; ArgentinaFil: Centron, Daniela. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones En Microbiología y Parasitología Médica; ArgentinaFil: Ramirez, Maria Soledad. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones En Microbiología y Parasitología Médica; Argentin
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