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Il microbiota in salute, in malattia e nel piatto
No full textLo sviluppo recente di nuove tecnologie molecolari (Next Generation Sequencing, NGS) ha dato un sostanziale contributo per l’identificazione
della composizione dei complessi consorzi microbici che popolano ogni nicchia ecologica del nostro pianeta, dal corpo degli insetti agli oceani e ai sedimenti sottostanti. Le piattaforme di Next generation o Deep sequencing (NGS), caratterizzate da performances sinora impensabili, garantiscono una sensibilità tale da consentire l’identificazione efficiente anche di specie molto rare e stanno fornendo
un’opportunità senza precedenti per studiarne diversità globale, fisiologia, ecologia e filogenesi. Per esempio, il 454 massively parallel tag sequencing (MPTS) e la sempre più diffusa piattaforma Illumina sono in grado di produrre, per ogni campione analizzato, centinaia di migliaia di brevi sequenze del gene 16S che vengono poi sottoposte a ulteriore indagine tassonomica mediante pipelines bioinformatiche in seguito alla quale possono essere identificate anche quelle specie microbiche che non possono essere coltivate. Ne deriva un vasto potenziale applicativo nel campo della diagnostica e della ricerca per la salute umana e nel capo ecologico ambientale per la identificazione di generi e specie microbiche importnati epr la detossificazione ambientale
Exosomes and epigenetic information
No full textThe expression of some micro RNA (miRNA) previously correlated with HCC was studied in serum from patients and controls. miRNAs deregulated in cancer tissues resulted to be deregulated too in serum exosomes
Molecular identification of Hepatozoon Miller, 1908 (Apicomplexa: Adeleorina) haemoparasites in Podarcis muralis lizards from northern Italy and detection of conserved motifs in the 18S rRNA gene
Full text linkThis study applies a non-invasive molecular test on common wall lizards (Podarcis muralis) collected in Northern Italy in order to i) identify protozoan blood parasites using primers targeting a portion of haemogregarine 18S rRNA; ii) perform a detailed bioinformatic and phylogenetic analysis of amplicons in a context where sequence analyses data are very scarce. Indeed the corresponding phylum (Apicomplexa) remains the poorest-studied animal group in spite of its significance for reptile ecology and evolution. A single genus, i.e., Hepatozoon Miller, 1908 (Apicomplexa: Adeleorina) and an identical infecting genotype were identified in all positive hosts. Bioinformatic analyses identified highly conserved sequence patterns, some of which known to be involved in the host-parasite cross-talk. Phylogenetic analyses evidenced a limited host specificity, in accord with existing data. This paper provides the first Hepatozoon sequence from P. muralis and one of the few insights into the molecular parasitology, sequence analysis and phylogenesis of haemogregarine parasites
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