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The Characteristics of Selected Triaxiality Measures of the Stresses for a C(T) Specimen Dominated by the Plane Strain State
No full textThe paper presents a comprehensive analysis of the stress field and selected triaxiality parameters near the crack tip for C(T) specimen dominated by the plane strain state using the finite element method. It includes some theoretical information about elastic-plastic fracture mechanics, the basics of the FEM modeling and presentation of the numerical results. The FEM analysis includes calculations with large strain assumptions. The influence of the external load and crack length is discussed. Additional elements of the paper are a qualitative assessment of the size of plastic zones and the crack tip opening displacement
A Commander, Pilot Officer, and a Major
No full textBox 3, Folder 6; Three military men; Writing on back: Comdr. Frederick B. Watt, Author of ""Who Dare to Live"", on (porem) with Pilot Officer Howard Boyd, and Major Willam Graba
Short study about determining the limit loads for center cracked square plates in biaxial tension
No full textW artykule przedstawiona została tematyka wyznaczania obciążeń granicznych dla kwadratowych płyt zawierających
centralne pęknięcie, które poddane zostały dwuosiowemu rozciąganiu. W pracy przedstawiono krótką charakterystykę
tematu obciążeń granicznych, aspekty modelowania numerycznego oraz wybrane wyniki obliczeń numerycznych.
Dyskutowano wpływ długości pęknięcia, granic plastyczności oraz współczynnika dwuosiowości obciążenia,
zdefiniowanego na potrzeby pracy. Podano również wybrane formuły aproksymacyjne.In the paper the short study about determining of the limit loads for center cracked square plate in biaxial tension was presented. Author presents the limit load topic, aspects of the numerical analysis and selected results of numerical calculations. The influence of the crack length, yield strength and a ratio of the biaxial external load were discussed. In the paper the approximation formulas were presented for selected results
Modélisation des interactions biophysiques entre la dynamique du biofilm épilithique et l'hydrodynamique locale
No full textLes interactions entre l'hydrodynamique locale, la structure et la dynamique temporelle du biofilm épilithique ont été étudiées par analyse et modélisation de séries temporelles de biomasse et de la composition algale sur trois séries de données obtenues en canaux expérimentaux et in situ. Deux séries temporelles ont été obtenues dans des conditions contrôlées à l'Institut de Mécanique des Fluides de Toulouse: la première dans un canal à vitesse constante d'écoulement, et la second dans un canal à trois sections avec trois vitesses d'écoulement incluant un test d'arrachage du biofilm en fin d'expérience. La dernière série temporelle a été collectée sur un banc de galet de la Garonne (France) en amont de Toulouse durant la période de Septembre 2008 à Septembre 2009. Trois formulations décrivant le processus de détachement chronique du biofilm ont été confrontées à la première série de données. Ces trois formulations sont respectivement fonction du débit Q, de la vitesse de frottement u* et du nombre de Reynolds rugueux k+. Elles sont intégrées dans un modèle simple décrivant la dynamique de croissance du biofilm épilithique comme un équilibre entre une croissance phototrophique et une perte chronique dépendante de l'hydrodynamique. Les résultats d'application de ces trois formulations à la première série de données obtenues en canal, ont montré que la dynamique du biofilm épilithique est mieux reproduite en considérant comme variables externes de forçage du détachement chronique, des descripteurs de l'hydrodynamique locale et de la turbulence en proche parois que sont la vitesse de frottement (u*) et la rugosité turbulente (k+). Néanmoins l'utilisation de la rugosité turbulente donne le meilleur résultat car ce descripteur tient compte non seulement de l'effet de l'hydrodynamique mais aussi de l'évolution de la forme et des dimensions du substratum qui est fonction de l'épaisseur et de la structure du biofilm qui le colonise. L'analyse de la série temporelle obtenue dans le canal à trois vitesses d'écoulement a révélé que la structure du biofilm, sa composition algale et sa résistance au détachement catastrophique étaient fortement conditionnées par les caractéristiques hydrodynamiques locales subies pendant la période de croissance. Ceci met en évidence l'importance de la prise en compte du rôle de cette hydrodynamique locale dans la modélisation du processus de détachement catastrophique associé aux crues, et plus généralement, son rôle dans les différents processus régissant la dynamique temporelle du biofilm épilithique. En tenant compte des résultats obtenus dans les expérimentations et modélisations des interactions biofilm/écoulement dans les canaux expérimentaux précédemment décrites, une nouvelle approche est utilisée pour la modélisation de la série temporelle obtenue in situ. Cette approche tient compte de l'effet des interactions hydrodynamiques locales/structure et composition du biofilm sur sa dynamique temporelle et de la pression de broutage par les invertébrés aquatiques. Cette nouvelle approche permet ainsi de reproduire tous les cycles de croissance et de détachement du biofilm observés in situ en prenant en compte l'effet de la température, de l'intensité lumineuse, des différents processus de détachement (chronique, catastrophique et autogénique) ainsi que la perte par broutage. L'action par broutage direct semble être négligeable face à l'action indirecte des invertébrés liée à leurs déplacements qui déstructurent les couches algo-bactériennes et modifient les capacités d'accrochage du biofilm au substrat.Interactions between local hydrodynamics and epilithic biofilm structure and temporal dynamics have been investigated through analyses and modeling of temporal data of biomass, algal composition and local hydrodynamics evolution obtained in experimental channels and in situ. Two of the used temporal data were obtained in controlled conditions at the Institut de Mécanique des Fluids de Toulouse: the first one in a channel with constant flow velocity, and the second in a channel with three sections and three different flow velocities including a test of detachment of the epilithic biomass at the end of the experiment. The last temporal data was collected on a bench of pebble of the Garonne (France) upstream to Toulouse during period from September, 2008 till September, 2009. Three formulations of biomass chronic detachment that integrated successively the discharge Q, the friction velocity u* and the roughness Reynolds number k+=u* ks /v (v=water kinematic viscosity) as descriptors of flow conditions have been confronted to the first series of data. These formulations were integrated into a simple model describing the dynamics of growth of epilithic biomass as a balance between phototrophic growth and a chronic loss dependent on the hydrodynamics. The results of application of these three formulations to the first series of data showed that the dynamics of the epilithic biomass is better reproduced by considering as external variable of forcing the chronic detachment, the friction velocity (u*) and the turbulent roughness (k+) that are descriptors of local hydrodynamics and turbulence in the near bed region. Nevertheless the use of the turbulent roughness gives the best result because this descriptor takes into account not only the effect of the hydrodynamics but also the evolution of the shape and the dimensions of the substratum according to the thickness and the structure of the biofilm which colonizes it. The analysis of the temporal series obtained in the channel with three flow velocities revealed that the structure, the algal composition and its resistance in the catastrophic detachment of the epilithic biomass were strongly conditioned by the local hydrodynamics endured during the period of growth. This brings to light the importance and the role of this local hydrodynamics in modeling the catastrophic detachment process associated with the floods and more generally its role in the various processes governing the temporal dynamics of epilithic biomass. Considering the previously described results obtained in the experiments and the in the modeling of the biofilm / flow interactions in the experimental channels, a new approach was used for modeling the in situ temporal series. This approach takes into account the effect of the interactions between local hydrodynamics /structure and composition of the biofilm on its temporal dynamics and the grazing pressure of the aquatic invertebrates. This new approach allows reproducing all the growth and detachment cycles of epilithic biofilm observed in situ. This, by considering the effects of temperature, luminous intensity, various detachment processes (chronic, catastrophic and autogenic), as well as the loss by grazing pressure. This last one seems to be unimportant in front of the indirect action of the invertebrates related to their movements which disintegrate the alo-bacterial layers and modify their capacities of to hang on the substrata
Mode d’action des homéoprotéines : contrôle de la progression transcriptionnelle et rôle de la coopérativité intra-moléculaire
No full textLe présent travail de doctorat vise deux approches distinctes formant deux parties distinctes de la thèse.La première approche visait à étudier la mode d'action des protéines Hox d'une manière indépendante du PBC / Exd. Pour élucider les mécanismes indépendants Exd de contrôle transcriptionnel par Hox, des cellules S2 stables dépourvues d'Exd nucléaire et exprimant conditionnellement Abd-A ont été générées et utilisées pour le profilage de ChiP-Seq et ARN-Seq. Les analyses ont montré que Abd-A est principalement associé à des promoteurs de gènes, proches du site de départ de la transcription. Le but de cette section de la thèse était d'étudier les mécanismes moléculaires sous-jacents au rôle de promoteur associé Abd-A. Les résultats indiquent que le ciblage proximal du promoteur par Abd-A est important pour la libération de Pol II bloqué à des gènes qui sont précédemment ciblés par le facteur de pause M1BP. Cette libération de Pol II est concomitante avec une transcription génique accrue ainsi que la perte des protéines du promoteur proximal Polycomb Group (PcG).La deuxième approche consistait à déterminer si les séquences C-terminales à l'homéodomaine (HD) sont généralement importantes pour l'activité et la fonction des protéines non Hox HD. Pour répondre à cette possibilité, nous nous sommes concentrés sur la protéine Paired (Prd) HD. Les résultats suggèrent que les séquences C-terminales à la HD sont nécessaires pour la liaison de l'ADN coopératif de la protéine appariée et l'observation préliminaire in vivo suggèrent que les séquences C-terminales à la Paired HD sont essentiels pour le réglage fin de l'expression wingless et engrailed.The present PhD work aims two distinct approaches forming two separate parts of the thesis.The first approach aimed at studying basic feature underlying the mode of action of Hox proteins in a PBC/Exd-independent manner. To elucidate Exd independent mechanisms of transcriptional control by Hox, stable S2 cell lacking nuclear Exd and conditionally expressing Abd-A were generated and used for ChiP-Seq and RNA-Seq profiling. The analyses illustrated that Abd-A is predominantly associated with gene promoters, proximal to transcriptional start site. The aim of this section of the thesis was to investigate the molecular mechanisms underlying the role of promoter-associated Abd-A. Results indicate that promoter-proximal targeting by Abd-A is important for the release of poised Pol II at genes that are previously targeted by the pausing factor, M1BP. This release of poised Pol II is concomitant with increased gene transcription as well as loss of promoter proximal Polycomb Group (PcG) proteins. Evidence suggest that the functional cooperation between Abd-A and M1BP as well as between M1BP and PcG proteins are biologically relevant in the developing animal. The second approach consisted in addressing if sequences C-terminal to the homeodomain (HD) are generally important for the activity and function of non-Hox HD-containing proteins. To address this possibility, we focused on the Paired (Prd) HD protein. Results suggest that sequences C-terminal to the HD are required for cooperative DNA binding of the Paired protein and preliminary in vivo observation suggest that sequences C-terminal to the Paired HD are essential for fine-tuning wingless and engrailed expression
Spécificité des protéines Hox : Rôle des motifs connus et découverte de nouveaux motifs
No full textLes gènes Hox sont responsables de l’identité des segments le long de l’axe antéro-postérieur. Ils sont évolutivement conservés et codent des facteurs de transcription. In vitro, toutes les protéines Hox se lient à des séquences nucléotidiques très similaires via un domaine de liaison à l’ADN très conservé, l’homéodomaine (HD). Cette faible spécificité de liaison à l’ADN in vitro contraste avec leur spécificité d’action in vivo. Une manière d’expliquer ce paradoxe est que les protéines Hox agissent en interaction avec des protéines cofacteurs, dont le mieux caractérisé est Extradenticle (Exd) chez la drosophile, Pbx chez les mammifères (collectivement appelés PBC). L’interaction Hox-PBC s’appui sur un motif conservé chez la presque totalité des protéines Hox, situé en amont de l’HD, le motif Hexapeptide (HX). Des travaux récents au sein de notre équipe ont montré l’existence d’un nouveau mode d’interaction Hox-PBC, non-générique, médié par un motif spécifique à certains groupes de paralogies seulement, et situé en en C-terminal de l’HD. Ceci souligne que les interactions Hox-PBC, qui spécifient la fonction des protéines Hox, reposent sur de modes multiples d’interaction.Mes travaux de thèse ont porté sur le mode d’action des protéines Hox, en étudiant la fonction de trois motifs ayant un rôle démontré ou potentiel dans le recrutement du cofacteur Exd par la protéine Hox de drosophile AbdominalA (AbdA). L’approche empruntée visait à analyser de manière globale la manière dont chacun de ces motifs pris isolément, ou en interaction, définit la fonction d’AbdA. Les conclusions de ce travail soulignent l’absence de pléiotropie fonctionnelle et un haut degré d’interactivité entre ces motifs. Le second volet de ma thèse a été d’initier la découverte de nouveaux motifs fonctionnels au sein des protéines Hox. J’ai abordé cette question en sélectionnant des modules phylogénétiquement conservés. Afin d’évaluer leur fonction, ces motifs ont été mutés et l’impact de leur mutation a été analysé in vitro et in vivo. Les résultats obtenus ont permis l’identification d’au moins un domaine protéique qui contribue de manière prédominante à la fonction de la protéine Dfd.Hox genes are responsible for the identity of segments along the antero-posterior axis. They are evolutionarily conserved and encode transcription factors. In vitro, all Hox proteins bind to a similar nucleotide sequence via a highly conserved DNA binding domain, the homeodomain (HD). This low specificity of DNA binding in vitro contrasts with their specificity in vivo. One way to explain this paradaox is that Hox protein function with protein cofactors, best represented by Extradenticle (Exd) in Drosophila, Pbx in mammals (collectivaly refered as PBC). Hox-PBC interaction relies on a motif located upstream of the HD, conserved in most Hox proteins, the Hexapeptide (HX). Recent work in our group identified a novel mode of Hox-PBC interaction, non-generic, specific to a subset only of Hox paralog groups, and relying on a motif located C-terminal to the HD. This highlight plasticity in Hox-PBC interaction.My PhD work aimed at investigating the mode of action of Hox protein, by studying the function of three protein motifs, with known or putative role in Exd recruitment by the Drosophila Hox protein AbdominalA (AbdA). The approach taken aimed at analyzing, using a large functional window, how these motifs, taken in isolation or collectively, define AbdA protein activity. Conclusions highlight the absence of pleitropy and a high degree of functional interaction for these protein motifs. The second part of my PhD work has been to initiate the search for novel functionally important protein motifs within Hox proteins. This was approached by selecting phylogenetically conserved motifs, and addressing their function in vitro and in vivo following motif mutations. At least one functional domain was isolated, that contributes predominantly to Dfd protein function
Impressionistic physionomy portraits by Orzeszkowa
No full textAs hypothesised in this paper, Eliza Orzeszkowa was Poland's unquestionable precursor of physiognomic experiments with her portraying skills being particularly intensively de veloped in her early works. For her, the face played the most important, uncovering the "intimate man", betraying hidden passions, decrypting unspoken thoughts. When observ ing people, the author used the bodily signs (shape of the head, line of the mouth, size of the eye, appearance of the forehead, nose, wrinkles) to try to uncover the inner man, his nature, defects and advantages. The analysis goes back to two of Orzeszkowa's earliest novels, "Rozstajne drogi" ["Crossroads"] (1866) and "W klatce" ["In the Cage"] (1867) to proceed to such works as "Pan Graba" ["Mr. Graba"] (1872) and "Na dnie sumienia" ["On the Bottom of the Conscience"] (1872), which all fall within Orzeszkowa's first artistic period. A comparison of the there portraits, both female and male, allows tracing how the young writer's compe tence in physiognomy and pathognomy developed
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