1,036 research outputs found
Isolation of feed additive xylanase producing bacteria and partial characterization of the enzyme
No full textFen Bilimleri Enstitüsü, Biyoloji Ana Bilim DalıBu çalışmada Osmaniye Korkut Ata Üniversitesi kampüs alanı içerisinden alınan toprak örneklerinden ksilanolitik Bacillus sp. XbO bakterisi izole edilmiştir. XbO ksilanazı optimum aktivitesini 60 °C ve 6.0-7.0 pH aralığında göstermiştir. Ksilanaz enzimi 30 dk ön inkübasyon sonrasında 60 ºC'de %92 kalan aktivite gösterirken, 90 ºC'de %62 kalan aktivite göstermiştir. 40-80 ºC arasındaki ortalama kalan aktivite ise %92 olarak gerçekleşmiştir. Yine enzim 7.0-10.0 pH değerlerinde 30 dk ön inkübasyon sonucunda ortalama %96, 7.0-11.0 pH aralığında ise ortalama %92.4 kalan aktivite göstermiştir. En yüksek ksilanaz üretimi izolatın inokülasyonundan itibaren 24. saatte gerçekleşmiştir. SDS-PAGE ve zimogram analizleri ile enzimin moleküler ağırlığı ~81 kDa olarak belirlenmiştir. MnCl2, CoCl2, ZnCl2, MgCl2, CaCl2, EDTA ve FeCl3 enzim aktivitesini stimüle ederken, HgCl2 ve CuCl2 inhibe etmişlerdir. Ham ve saflaştırılmış enzime ait spesifik aktivite değerleri sırasıyla 27.6 ve 113.8 U/mg protein olarak belirlenmiştir. BLAST analizi sonucunda Bacillus sp. XbO bakterisinin rDNA sekansı ile Bacillus pumilus ve Bacillus safensis bakterilerinin rDNA sekansları arasında %98 oranında benzerlik bulunmuştur.In the study, the xylanolytic bacterium Bacillus sp. XbO was isolated from the soil samples collected from campus area of Osmaniye Korkut Ata University. XbO xylanase showed its optimum activity at 60 °C and 6.0-7.0 pH values. Xylanase enzyme were showed 92 and 62% residual activity after pre-incubation at 60 and 90 ºC for 30 min, respectively. The relative residual activity between 40-80 ºC was occured as 92%. On the other hand, the enzyme was showed 96 and 92.4% residual activities after pre-incubation between 7.0-10.0 and 7.0-11.0 pH values for 30 min, respectively. Maximum xylanase production of isolate was observed after 24 hours later from inoculation. The moecular weight of the enzyme was determined as ~81 kDa by SDS-PAGE and zymogram analysis. The enzyme activity was stimulated by MnCl2, CoCl2, ZnCl2, MgCl2, CaCl2, EDTA and FeCl3, whereas inhibited by HgCl2 and CuCl2. The specific activities of crude and purified enzymes were 27.6 and 113.8 U/mg proteins, respectively. According to BLAST analysis, Bacillus sp. XbO rDNA sequence was similar to Bacillus pumilus and Bacillus safensis rDNA sequences at the rate of 98%
Analysis of Technical Approaches (ATA)
No full textStudies & Prototyping This JSB ATA Study Paper is the author's work product and does not reflec
Isolation of chitinase producing bacteria and increasing of enzyme production by molecular methods
No full textFen Bilimleri Enstitüsü, Biyoloji Ana Bilim DalıBu çalışmada, Hatay ili Erzin ilçesi kıyı kesimlerinden toplanan ve deniz canlısı kabukları içeren toprak numunelerinden üç adet kitinolitik Bacillus sp. izolasyonu gerçekleştirilmiştir. Bakteriler sırasıyla Bacillus sp. DBK1, DBK2 ve DBK3 olarak isimlendirilmişlerdir. Her üç izolata ait kitinaz da optimum aktivitesini 40 °C'de göstermişlerdir. Yine DBK1 kitinazı optimum aktivitesini pH 7.0'de, DBK2 ve DBK3 kitinazları ise pH 6.0'da göstermişlerdir. DBK1, DBK2 ve DBK3 kitinazlarına ait spesifik aktiviteler 40 °C'de sırasıyla 6.61, 13.17 ve 8.65 U/mg olarak gerçekleşmiştir. İzolatlar en yüksek düzeyde enzim üretimini inokülasyondan itibaren DBK1, DBK2 ve DBK3 için sırasıyla 48., 36. ve 60. saatte gerçekleştirmişlerdir. İzolatların EtBr ile muamelesi sonucunda DBK1'den DBK1-M3 ve DBK1-M4, DBK2'den DBK2-M3, DBK2-M4 ve DBK2-M5, DBK3'den ise DBK3-M3 ve DBK3-M4 mutant varyeteleri elde edilmiştir. DBK1-M3, DBK1-M4, DBK2-M3, DBK2-M4, DBK2-M5, DBK3-M3 ve DBK3-M4 mutant varyeteleri kendi yabani tip varyetelerine göre sırasıyla %146, 193, 192, 121, 136, 178 ve 116 oranlarında enzim üretmişlerdir. DBK1 kitinazı için, MnCl2, MgCl2, CaCl2, ZnCl2 ve CuSO4, DBK2 kitinazı için MnCl2, ZnCl2 ve KCl, DBK3 kitinazı için ise MnCl2, CaCl2 ve ZnCl2 aktivatör olarak belirlenmiştir. HgCl2 tüm yabani varyetelere ait kitinazları kuvvetli bir şekilde inhibe etmiştir.In the present study, three chitinolytic Bacillus strains were isolated from the soil samples containing shells of crustaceans collected from the coast sediments of Erzin district of Hatay province. The isolates were entitled as Bacillus sp. DBK1, DBK2, and DBK3, respectively. The optimum enzyme activities were observed at 40 °C for all chitinases. On the other hand, optimum pH value for DBK1 chitinase was 7.0, whereas 6.0 for DBK2 and DBK3 chitinases. The specific activities of DBK1, DBK2, and DBK3 chitinases were 6.61, 13.17 and 8.65 U/mg at 40 °C, respectively. Maximum enzyme productions of isolates were observed after 48, 36, and 60 hours later from inoculation for DBK1, DBK2, and DBK3 isolates, respectively. Mutant varieties DBK1-M3 and DBK1-M4 from DBK1, DBK2-M3, DBK2-M4 and DBK2-M5 from DBK2, and DBK3-M3 and DBK3-M4 from DBK3 were obtained after EtBr treatment. DBK1-M3, DBK1-M4, DBK2-M3, DBK2-M4, DBK2-M5, DBK3-M3 and DBK3-M4 have produced 146, 193, 192, 121, 136, 178 and 116% more chitinase according to their own wild type strains, respectively. The activators for DBK1 chitinase were MnCl2, MgCl2, CaCl2, ZnCl2, and CuSO4, for DBK2 chitinase were MnCl2, ZnCl2 and KCl, and for DBK3 chitinase were MnCl2, CaCl2 and ZnCl2. HgCl2 strongly inhibited all wild type chitinases
Isolation of feed additive lichenase producing bacteria and partial characterization of the enzyme
No full textFen Bilimleri Enstitüsü, Biyoloji Ana Bilim DalıBu çalışmada, Osmaniye'den alınan toprak numunelerinden β-(1,3-1,4)-glukanaz (likenaz) enzimi üreten Bacillus sp. HY3 izolasyonu gerçekleştirilmiştir. Likenaz enzimi optimum aktivitesini 60 °C'de ve 6.0-7.0 pH değerlerinde göstermiştir. Enzim 40-80 ºC arasında ortalama %89.8'lik kalan aktivite ile oldukça stabil kalırken, 80 ºC'de 15 dk ön inkübasyon sonrasında %73 kalan aktivite göstermiştir. Bacillus sp. HY3 en yüksek düzeyde enzim üretimini inokülasyondan itibaren 36. saatte gerçekleştirmiştir. Enzimin moleküler ağırlığı SDS-PAGE ve zimogram analizleri ile 83 kDa olarak belirlenmiştir. Likenaz enzimi için MgCl2, CaCl2, EDTA, MnCl2 ve FeCl3 aktivatör olarak belirlenmiştir. HgCl2, ZnCl2, CuCl2 ve CoCl2 ise enzim aktivitesini değişik oranlarda inhibe etmiştir. Enzimin termo-stabil olması, sıcaklık ve pH optimum değerleri ve bazı kimyasal malzemelerce aktivitesinin artması ile enzim endüstriyel kullanım için uygun olabilir.In the present study, β-(1,3-1,4)-glucanase (lichenase) producer Bacillus sp. HY3 was isolated from the soil samples collected from Osmaniye. The enzyme showed its optimum activity at 60 ºC and 6.0-7.0 pH values. While the enzyme was quite stable between 40-80 ºC with the rate of 89.8%, it showed 73% residual activity after pre-incubation at 80 ºC for 15 min. The strain Bacillus sp. HY3 reached its maximum enzyme production after 36 hours after inoculation time. The molecular weight of the enzyme was determined as 83 kDa via SDS-PAGE and zymogram analysis. The activators for the enzyme were MgCl2, CaCl2, EDTA, MnCl2 and FeCl3, whereas the inhibitors were HgCl2, ZnCl2, CuCl2 ve CoCl2 at different rates. The enzyme may be appropriate for industrial application because of its thermo-stability, optimum temperature and pH values, and its increased activity by certain chemicals
Isolation of carboxymethyl cellulase, xylanase and lichenase enzymes producing bacterium and partial characterization of the enzymes
No full textFen Bilimleri Enstitüsü, Biyoloji Ana Bilim DalıBu çalışmada, Adana ilinde bulunan bir seraya ait toprak numunelerinden karboksimetil selülaz, ksilanaz ve likenaz enzimlerini üreten Bacillus sp. CS8 bakterisinin izolasyonu gerçekleştirilmiştir. Her üç enzim de optimum aktivitesini 40 °C'de göstermiştir. Diğer taraftan, CMCaz ve likenaz enzimleri optimum aktivitelerini 7.0 pH değerinde gösterirken, ksilanaz enzimi 6.0 pH değerinde göstermiştir. CMCaz, ksilanaz ve likenaz enzimleri 80 °C'de 15 dk ön inkübasyon sonrasında aktivitelerini sırasıyla %57, 83 ve 71 oranlarında korumuşlardır. 50-80 °C sıcaklık değerleri arasında her üç enzim de yine aynı sırayla %80.25, 87.0 ve 89.25 oranlarında ortalama kalan aktivite göstermişlerdir. İzolat en yüksek CMCaz ve ksilanaz aktivitelerine inokülasyon zamanından itibaren 36. saatte ulaşırken, en yüksek likenaz aktivitesine 48. saatte ulaşmıştır. Her üç enzim için de CaCl2, MgCl2 ve MnCl2, ortak stimülatör olurken, HgCl2 ve CuCl2 ortak inhibitör olmuşlardır. ZnCl2 CMCaz ve ksilanaz enzimlerini stimüle ederken, FeCl3 CMCaz ve likenaz enzimlerini, EDTA ise ksilanaz ve likenaz enzimlerini stimüle etmiştir. Her üç enzim arasından en yüksek aktiviteye sahip ksilanazın aktivitesi %100 olarak kabul edildiğinde CMCaz ve likenaz enzimleri ksilanaz enzimine göre oransal olarak sırasıyla %89 ve 79 düzeylerinde aktiviteye sahip olmuşlardır.In the present study, carboxymethyl cellulase, xylanase, and lichenase producing bacterium Bacillus sp. CS8 was isolated from the soil samples collected from agricultural greenhouse located in Adana province. The optimum activities were observed at 40 °C for all three enzymes. On the other hand, optimum pH values were 7.0 for CMCase and lichenase, whereas 6.0 for xylanase. CMCase, xylanase and lichenase showed 57, 83, and 71% residual activity after pre-incubation at 80 °C for 15 min. The relative residual activities between 50-80 °C occured as 80.25, 87.0, and 89.25%, in the same order. Maximum CMCase and xylanase productions of the isolate were observed after 36 hours following the inoculation time, whereas 48 hours after for lichenase. All three enzyme activities were stimulated by CaCl2, MgCl2, and MnCl2, whereas inhibited by HgCl2 and CuCl2. While ZnCl2 stimulated the CMCase and xylanase activities, FeCl3 stimulated CMCase and lichenase, and EDTA stimulated xylanase and lichenase activities. When xylanase activity was assumed as 100%, the activities of CMCase and lichenase in comparison to the xylanase remained as 89 and 79%, respectively
Isolation of feed additive cellulase producing thermophilic Bacillus strains and partial characterization of the enzymes
No full textFen Bilimleri Enstitüsü, Biyoloji Ana Bilim DalıBu çalışmada, Düziçi sınırları içerisinde bulunan Haruniye Kaplıcasından toplanan toprak numunelerinden üç adet termofilik Bacillus sp. izolasyonu gerçekleştirilmiştir. İzolatlar sırasıyla Bacillus sp HR-1, HR-2 ve HR-3 olarak isimlendirilmişlerdir. Selülaz üretimi, üreme periyodunun başlangıcından itibaren HR-1 ve HR-2 izolatları için 72. saatte, HR-3 izolatı için ise 24. saatte maksimum düzeye çıkmıştır. HR-1 ve HR-2 selülazları optimum aktivitelerini 60 °C'de gösterirken, HR-3 selülazı 70 °C'de göstermiştir. Bununla birlikte HR-1 ve HR-3 selülazları optimum aktivitelerini pH 5.0'de gösterirken, HR-2 selülazı pH 4.0'de göstermiştir. Her üç enzim de 60 °C'de 30 dakika muhafaza edildiklerinde aktivitelerinin tamamını korurken, daha yüksek sıcaklık değerlerinde 30 dakika inkübasyon sonucunda aktivitelerini kaybetmeye başlamışlardır. HR-1, HR-2 ve HR-3 bakterilerinin enzimlerine ait spesifik aktiviteler 55 °C'de sırasıyla 34.1, 67.8 ve 112.3 U/mg olarak belirlenmiştir.In the present study, three thermophilic Bacillus strains were isolated from the soil samples collected from the Haruniye Thermal Spring located in Düziçi. The isolates were entitled as Bacillus sp. HR-1, HR-2, and HR-3, respectively. The maximum productions of cellulases were revealed at 72nd hour of incubation period for HR-1 and HR-2 strains, and at 24th hour of incubation period for HR-3 strain, respectively. The optimum enzyme activity was observed at 70 °C for HR-3 cellulase, whereas at 60 °C for HR-1 and HR-2 cellulases. On the other hand, optimum pH value for HR-2 cellulase was 4.0, whereas 5.0 for HR-1 and HR-3 cellulases. All enzymes protected their activities after pre-incubation at 60 °C for 30 min, but they begin to decrease after pre-incubation at higher temperature values. The specific activities of HR-1, HR-2, and HR-3 bacterial cellulases were 34.1, 67.8 and 112.3 U/mg at 55 °C, respectively
Isolation of keratinase producing bacteria and increasing of enzyme production by molecular methods
No full textFen Bilimleri Enstitüsü, Biyoloji Ana Bilim DalıBu çalışmada, Çukurova Üniversitesi Tavukçuluk Ünitesi'nden toplanan ve tavuk tüyü içeren toprak örneklerinden üç adet keratinolitik Bacillus sp. izolasyonu gerçekleştirilmiştir. Bakteriler sırasıyla Bacillus sp. MK1, MK2 ve MK3 olarak isimlendirilmişlerdir. MK1 ve MK3 keratinazları optimum aktivitelerini 40°C'de gösterirken, MK2 keratinazı 50 ºC'de göstermiştir. Yine MK1 ve MK3 keratinazları optimum aktivitelerini pH 9.0'da, MK2 keratinazı ise pH 8.0'de göstermiştir. MK1, MK2 ve MK3 bakterilerinin keratinazlarına ait spesifik aktiviteler 40 °C'de sırasıyla 2.76, 0.77 ve 5.48 U/mg protein olarak gerçekleşmiştir. En yüksek düzeyde enzim üretimini inokülasyondan itibaren MK1 izolatı 36., MK2 ve MK3 izolatları ise 24-36. saatlerde gerçekleştirmişlerdir. İzolatların EtBr ile muamelesi sonucunda MK1'den MK1-M3, MK1-M4 ve MK1-M5, MK2'den MK2-M3 ve MK2-M4, MK3'den ise MK3-M1, MK3-M3, MK3-M4 ve MK3-M5 aşırı üretici mutant varyeteleri elde edilmiştir. MK1-M3, MK1-M4, MK1-M5, MK2-M3, MK2-M4, MK3-M1, MK3-M3, MK3-M4 ve MK3-M5 mutant varyeteleri kendi yabani tip suşlarına göre sırasıyla %186, 117, 133, 144, 171, 122, 116, 214 ve 187 oranında enzim üretmişlerdir. PMSF, üre, CaCl2, Tween 80 her üç enzim için de ortak aktivatör olarak belirlenmiştir. EDTA ise her üç enzimi de inhibe etmiştir. BLAST analizleri sonucunda Bacillus sp. MK1 bakterisi B. subtilis NCDO 1769 ile %96 oranında rDNA sekans benzerliği göstermiştir. Diğer taraftan Bacillus sp. MK2 ve MK3 bakterileri ise B. subtilis NRRL B-4219 ve B. tequilensis 10b bakterileri ile %99, B. subtilis SBMP4 bakterisi ile de %98 oranında rDNA sekans benzerliği göstermişlerdir.In the present study, three keratinolytic Bacillus strains were isolated from the feather containing soil samples collected from the poultry enterprise of Çukurova University. The isolates were entitled as Bacillus sp. MK1, MK2, and MK3, respectively. The optimum enzyme activities were observed at 40°C for MK1 and MK3 keratinases whereas 50 ºC for MK2 keratinase. Similarly, optimum pH value for MK1 and MK3 keratinase was 9.0, whereas 8.0 for MK2 keratinase. The specific activities of MK1, MK2, and MK3 keratinases were 2.76, 0.77 and 5.48 U/mg protein at 40°C, respectively. Maximum enzyme productions of isolates were observed after 36 hours for MK1, and 24-36 hours for MK2, and MK3. Over-expressing mutant varieties MK1-M3, MK1-M4 and MK1-M5 from MK1, MK2-M3 and MK2-M4 from MK2, and MK3-M1, MK3-M3, MK3-M4 and MK3-M5 from MK3 were obtained after EtBr treatment. MK1-M3, MK1-M4, MK1-M5, MK2-M3, MK2-M4, MK3-M1, MK3-M3, MK3-M4 and MK3-M5 have produced 186, 117, 133, 144, 171, 122, 116, 214 and %187 keratinase according to their own wild type strains, respectively. PMSF, urea, CaCl2 and Tween 80 were determined common activators for all enzymes. However, EDTA has also inhibited all these three enzymes. According to BLAST analysis, Bacillus sp. MK1 rDNA sequence was similar to B. subtilis NCDO 1769 rDNA sequence at the rate of 96%. On the other hand, Bacillus sp. MK2 and MK3 rDNA sequences were similar to B. subtilis NRRL B-4219 and B. tequilensis 10b rDNA sequences at the rate of 99%, and B. subtilis SBMP4 rDNA sequence at the rate of 98%
1924’te İlkokullarda Tarih Öğretimi: D'alembert Etkisi Altında Türk Deneyimi
No full textThe aim of this article is to discuss the affect of European pedagogical heritage to the early Republican period in Turkey by taking into account the teaching of History from the present to the past times at the 3rd grade and the 5th grade in Elementary School. Also I want to show the political and the pedagogical grounds of the application that put into action just after the proclamation of the Republic in 1923. Starting from very limited resources in this subject, I tried to show how this idea might have come to Turkey, who were the main actors in this application by using the historical method. In this context, three questions are tried to be answered. These are as follows; 1. Who put forward the idea of teaching of History at elementary school from the present to the past and on what grounds? * Doç. Dr. , Gazi Üniversitesi, Gazi Eğitim Fakültesi, Tarih Eğitimi ABD, E-posta: [email protected]. What was the influence of the history education studies at the Second Constitutional Period to the Early Republican Period in Turkey on this matter. 3. What were the results of the teaching of the History from to present to past at the at the rd grade and the 5th grade in Elementary School in 1924
TÜRKİYE’DE BİR PSİKOLOG TARİH DERS KİTABI YAZARI OLDU: PSİKOLOG ALİ HAYDAR TANER ve ORTAOKUL İÇİN TARİH-II ÜZERİNE
No full textBu çalışmanın amacı 1940 ve 1948 yılları arasında Talim
ve Terbiye Kurulu Başkanlığı tarafından onaylanan ve okutulan psikolog Ali
Haydar Taner’in (1883-1956) ismini
taşıyan Ortaokul İçin Tarih II ders
kitabını geniş bir bakış açısı içinde
ele almaktır. Bu çalışmada üç alt
probleme cevap verilecektir;1- Ali Haydar Taner, Ortaokul İçin Tarih II kitabına “yazan” olarak neden ve nasıl
geçmiş olabilir? 2- Cumhuriyetin ilk yıllarından 1940’a
kadar Millî Eğitim Bakanlığı’nın okul ders kitaplarının basılmasına yönelik
uygulamaları nasıldı?3- Ali Haydar Taner imzalı Ortaokul için Tarih II’nin içeriğinin
bir önceki baskılarla (1937 baskısı) benzer ve farklı yönleri nelerdir? 1934’te
okutulmaya başlanan Ortamektep I-II-III ders kitaplarına yönelik pedagojik
eleştiriler, 1937 sonrası oluşturulan komisyonlarda çözülmeye çalışıldı.
1940’dan sonra Ortaokul Tarih II kitabın üzerinde Ali Haydar Taner ismi görülmektedir. 1943’te
toplanan II. Maarif Şurası ile bu iyileştirme çabalarının daha geniş katılımla
meşru bir zemine oturması sağlandı. Türkiye’de geçmişte tarih ders
programlarındaki köklü değişimler, tarih ders kitaplarının tekâmül etmesini engellemiştir
TARİH: İNGİLTERE VE ABD’DEKİ TARİH EĞİTİMİ ARAŞTIRMALARINI TOPLU BİR DEĞERLENDİRME (1917-1950 ARASI) - C. M. FLEMING
No full textYöntem ve içerik üzerine yapılan araştırmaların etkisi, Tarih öğretiminde İmlâ ve Aritmetik gibi pek çok dersin öğretimine göre daha az belirgindir. Bununla beraber son elli yılda amaç ve tutumlarda belirli değişimler oldu. Bunları kısmen öğrenme psikolojisinde yapılan araştırmaların etkilerine bağlamak mantıklı görünmektedir. Örneğin etkinliğin ve işbirliğinin öneminin idrak edilmesi, yöntemin çeşitliliğine yol açmıştır. Sosyal kullanış analizi ve en alt düzeylerin belirlenmesi çabaları, ders kitabı içeriklerinin sadeleşmesine sebep oldu ve test yapmanın gelişmesi de olgulardan tutumların, bağlılıkların ve becerilerin değerlendirilmesine vurguya yol açtı. Tarih öğretimi, bir kuşak öncesine göre menzil açısından daha geniştir ve sınırlılıklarının daha fazla bilincindedir. Bir ölçüde uluslararası olaylarda ve toplumsal vicdanı canlandırmada değişimler artan oranda ilgiyle takip edilebilirken, aynı zamanda araştırmacıların sabırlı çalışmalarının, oluşan çeşitliliğin yönünün belirlenmesinde rolünü oynadığına inanmak için sebep vardır. </p
- …
