414 research outputs found
Faites "AAAAAA", facile à faire, pas si facile à mesurer
No full textCette présentation vise à introduire une recherche doctorale en cours, en articulant son contenu avec les notions théoriques abordées dans le cadre du cours (variables dépendante et indépendante, type de recherche, question de recherche, etc.). Un sondage interactif via Wooclap a permis d’interroger les représentations des étudiant·es quant au statut de doctorant·e, servant d’amorce à la présentation. Enfin, la présentation détaille le statut de boursier·ère financé·e par un projet ARC
Flexibilité de la biosynthèse du peptidoglycane de la paroi des bactéries à Gram positif
No full textLe peptidoglycane (PG) est un constituant majeur de la paroi des bactéries à Gram positif. Ce polymère de chaînes de sucres reliées entre elles par des peptides entoure la cellule d'un sacculus protecteur. Structure dynamique, il permet à la bactérie de croître et de se diviser tout en assurant sa survie et le maintien de sa forme. La biosynthèse du PG est initiée dans le cytoplasme par la formation d'un précurseur soluble, qui est transporté à la face externe de la membrane plasmique où il est incorporé au PG par les PBPs ou "penicillin binding protein". Les PBPs collaborent avec des hydrolases du PG, qui permettent l'expansion du sacculus et assurent le remodelage ou "maturation" du polymère. La chaîne peptidique du précurseur du PG de Lactococcus lactis se termine par D-alanyl-D-alanine. Chez Lactobacillus plantarum, elle se termine par D-alanyl-D-lactate, ce qui confère la résistance à la vancomycine, un antibiotique dont la cible est la terminaison D-Ala-D-Ala. Au cours de ce travail, nous avons étudié la flexibilité de la synthèse du PG vis à vis de la nature du dernier résidu du précurseur chez ces deux espèces. La stratégie mise en uvre consistait à produire des précurseurs se terminant par D-Ala chez L. plantarum et par D-Lac chez L. lactis. Chez L. plantarum, nous avons mis en évidence la présence d'une D-Ala-D-Ala dipeptidase intervenant dans la sélectivité de l'incorporation du D-Lac dans le précurseur. Nos résultats indiquent également que le précurseur se terminant par D-Ala n'est pas un substrat optimal pour la synthèse du PG. Chez L. lactis, la modification du précurseur mène à des altérations importantes de la composition biochimique du PG et de la morphologie. Ceci suggère que le précurseur modifié interfère avec l'activité des PBPs et/ou des hydrolases du PG. Nos résultats démontrent que malgré un certain niveau de flexibilité de la machinerie de synthèse du PG, la nature du précurseur joue un rôle clef dans la biosynthèse du PG et dans la morphogenèse.The cell wall of Gram-positive bacteria is mainly made of peptidoglycan, a thick, multilayered covalent macropolymer of glycan chains cross-linked via short peptides. The peptidoglycan sacculus is a dynamic structure allowing growth and division, while maintaining cell integrity and shape. Its synthesis starts in the cytoplasm by the formation of a disaccharide-pentapeptide precursor that is subsequently transported through the plasma membrane and incorporated into the nascent peptidoglycan by penicillin binding proteins (PBPs). The two last residues of the pentapeptide chain are linked together by a specific ligase (Ddl) before their incorporation into the precursor as a dipeptide. In many bacterial species, the terminus of peptidoglycan precursor is D-alanyl-D-alanine, which is the target of vancomycin, an important antibiotic that inhibits peptidoglycan synthesis. Vancomycin prevents PBPs activities by binding the precursor once transported to the external face of the plasma membrane. Lactobacillus plantarum produces precursors terminated by D-lactate instead of D-alanine, making the bacterium intrinsically resistant to vancomycin. The Ddl ligase of L. plantarum plays a central role in this specificity by synthesizing D-alanyl-D-lactate depsipetides. In this study, we show that L. plantarum also encodes a specific dipeptidase, Aad, the function of which is to selectively eliminate D-alanyl-D-alanine dipeptides that are produced by the Ddl ligase, thereby preventing their incorporation into the precursors. Although "non canonical" D-alanine-ended precursors can be incorporated in the cell wall, inactivation of Aad failed to suppress growth defects of L. plantarum mutants deficient in D-lactate-ended precursors synthesis, indicating additional levels of control in peptidoglycan precursors selectivity. The importance of the nature of the pentapeptide last residue was also evaluated in Lactococcus lactis, a vancomycin sensitive species, which uses D-alanyl-D-alanine dipeptides for peptidoglycan synthesis. For this, a mutant strain of L. lactis producing D-lactate-ended precursors instead of D-alanine-ended precursors was constructed by expressing genes from L. plantarum. We found that both the Ddl ligase and the Aad dipeptidase were required to confer vancomycin resistance to L. lactis, confirming the role of Aad in D-lactate selectivity. In addition, the modification of the last residue of the peptide moiety of the precursor affected cell wall composition and cell morphology. Mutant cells were spherical instead of ovoid and formed chains not normally observed with the wild-type cells. This suggests that modified precursors interfere with the activity of enzymes involved in peptidoglycan growth and maturation, such as PBPs and /or peptidoglycan hydrolases. Together, these results demonstrate that despite some level of functional flexibility in peptidoglycan biosynthesis machinery, the nature of the precursor plays a key role in cell wall synthesis and morphogenesis.Doctorat en sciences (sciences biologiques) (BIOL 3)--UCL, 200
Fluent-IA : un outil de rééducation fonctionnelle auto-administrée pour l’anomie en aphasie au moyen de l’IA générative
No full texteditorial reviewedL’anomie est une manifestations fréquentes au sein de l’aphasie acquise. Plusieurs travaux ont démontré l’efficacité des exercices auto-administrés dans la rééducation de l’anomie post-AVC. Cependant, la majorité des études visent le réapprentissage de mots illustrés via des banques d’images limitées, indépendamment de leur fonctionnalité dans la vie quotidienne.
Dans ce cadre, l’application Fluent-IA a été développée afin de permettre une rééducation auto-administrée pour les patients aphasiques au moyen de l’intelligence artificielle générative d’images. Cet outil, disponible sur tablette ou téléphone, offre une rééducation personnalisée, utilisable en collaboration avec le clinicien ou proche aidant, tout en étant simple d’utilisation et réprésenant un cout financier réduit.
Fluent-IA se base sur la théorie de l'activation étendue. L’application propose une tâche de dénomination d'images permettant au clinicien de définir les items à travailler par catégorie sémantique. L’appel à l’IA générative permet de varier les images associées à un même item à chaque itération. Ainsi, cette visualisation sans cesse mise à jour permet de mettre en évidence les différents traits (spécifiques ou non) d'un même concept, aidant à renforcer la compréhension et le rappel du mot associé.
À la suite de la dénomination de chaque item, cinq questions sémantiques sont proposées à l’utilisateur, auxquelles il doit répondre par « oui » ou « non ». Ces questions interrogent la catégorie du concept, l’usage, l’objet associé et la localisation, et sont suivies d’un feedback. En cas d’échec de la dénomination, une tâche de répétition de l’item est proposée à l’aide de la technologie « Text-To-Speech ».
L’outil Fluent-IA consiste en une application novatrice à visée rééducative et auto-administrée pour des patients aphasiques. Des études supplémentaires de validation sont encore nécessaires pour vérifier l’efficacité d’une rééducation avec Fluent-IA auprès de la population cible
Science that "knows" and science that "asks".
No full textClinician-researchers and experimental scientists do not speak the same language; they have different professional environments and different end-points in their research. This creates considerable problems of comprehension and communication, which constitute a major drawback in multidisciplinary work such as translational medicine. A stereotypic representation of both these worlds is presented as a starting point to encourage debate on this issue.EditorialResearch Support, Non-U.S. Gov'tSCOPUS: no.jinfo:eu-repo/semantics/publishe
Proposition d’un outil permettant la rééducation auto- administrée de patients aphasiques, au moyen de l’IA générative : Fluent-IA
No full textIntroduction - L’anomie est une de ses manifestations les plus fréquentes au sein de l’aphasie induite (Haldin et al., 2022). Or, nous savons que des thérapies auto-administrées sont efficaces dans la rééducation de l’anomie postAVC. Cependant, la majorité des études visent le réapprentissage de mots déjà illustrés provenant de banques d’images, indépendamment de leur fonctionnalité dans la vie quotidienne (Lavoie et al., 2016).
Objectif - L'objectif de ce mémoire est le développement d’une application inspirée de l’outil iTSA de Lavoie et al. (2019), intégrant l’intelligence artificielle générative afin de proposer une rééducation auto-administrée et personnalisée aux patients aphasiques.
Méthode - L'application, nommée Fluent-IA, réside en une tâche de dénomination d'images permettant à l'utilisateur de définir ses items à rééduquer. Celle-ci génère une nouvelle image pour un même concept à chaque itération de la rééducation. Cinq questions d'ordre sémantique sont ensuite affichées à l'écran. Enfin, le son de l'item est généré par le programme afin de fournir une aide au patient. Dans un second temps, l’outil a fait l’objet d’une évaluation par différents acteurs afin d’identifier ses forces et ses limites.
Résultats - Les résultats montrent une appréciation positive de Fluent-IA. Les acteurs ont souligné la facilité d'utilisation et la portabilité de l'application, ainsi que son potentiel thérapeutique. Des suggestions d'amélioration ont été fournies permettant de nouvelles perspectives pour l’outil.
Conclusion - Ce mémoire a permis de proposer une application à visée rééducative et auto- administrée pour des patients aphasiques. Tout cela en se basant sur trois principes développés par Haldin et al. (2022) et partagé par Lavoie et al., (2019), l’intensité, l’engagement social et la personnalisation, afin de garantir une rééducation pertinente et possiblement efficiente. Les différents retours suggèrent, en effet, un fort potentiel clinique. Des études supplémentaires seront néanmoins nécessaires pour affiner l’outil et valider sa pertinence thérapeutique
Assessment of Speech Disorders in Dysarthric Subjects based on the MonPaGe-2.0.2-S Evaldy Protocol
No full textIntroduction: This study presents a comprehensive protocol for acoustic data collection used in the initial phase of the present research project. The protocol uses the MonPaGe-2.0.2-S battery and its applications to capture speech productions from patients with various etiologies and severities of dysarthria. It includes both basic and newly added complementary modules in order to provide a detailed evaluation of different aspects of speech, crucial for precise analysis of motor speech disorders. Methods: Participants included individuals diagnosed with dysarthria of diverse etiologies, recruited across several clinical settings in French-speaking countries. The MonPaGe-2.0.2-S battery, consisting of MonPaGe_Passation for recording speech productions, was employed along with additional modules ("Nasality", "Glides", "Phonetic Flexibility") to assess specific aspects of speech motor control. Discussion: This comprehensive data collection will enable us to address key clinical and research objectives in the subsequent phases of the EvalDy project. MonPaGe-2.0.2-S, with its computerized and objective approach, stands out in the limited landscape of standardized tools for assessing motor speech disorders in French. The additional modules enhance our ability to analyze articulatory dynamics and compensatory mechanisms, particularly in patients with Parkinson's disease. By integrating acoustic and articulatory measures, we aim to thoroughly document dysarthric speech, ultimately developing reliable, objective assessment tools that complement existing clinical practices focused on subjective evaluations
Évaluation objective de la Dysarthrie Hypokinétique dans la Maladie de Parkinson : Identification de Mesures Fiables des Niveaux de Sévérité.
No full textpeer reviewedIntroduction : La maladie de Parkinson (MP) entraîne divers symptômes, dont des troubles de la parole (dysarthrie hypokinétique) présents jusqu’à chez 90% des patient·e·. En effet, celle-ci se caractérise, entre autres, par des mouvements articulatoires réduits en amplitude et en vitesse. La présence de troubles de la parole limite grandement la communication des patient.e.s, constituant ainsi un enjeu de santé publique important. Alors que l'évaluation clinique repose principalement sur des jugements perceptuels, des mesures acoustiques objectives pourraient améliorer la prise en charge de la dysarthrie. Ainsi, la présente étude vise à identifier des indices acoustiques pertinents et robustes pour différencier les niveaux de sévérité de la dysarthrie hypokinétique.
Méthodes : 30 patient·e·s atteint·e·s de MP ont été répartis en trois groupes de sévérité de la dysarthrie (légère, modérée, sévère) selon l’évaluation clinique. Le recueil de productions de parole a été réalisé à l'aide de la batterie MonPaGe-2.0.2-S et de 3 nouveaux modules (Nasalité, Glides, Flexibilité phonétique). Des questionnaires ont permis de documenter le trouble et d’évaluer son impact sur la qualité de vie.
Résultats : Les analyses acoustiques de la présente étude se sont centrés sur l’analyse de la lecture de texte. Nos analyses acoustiques ont tenté d’identifier les mesures les plus pertinentes pour distinguer les différents niveaux de sévérité de la dysarthrie hypokinétique parkinsonienne, notamment via les paramètres articulatoires, prosodiques et phonétiques.
Discussion : Cette étude contribue à soutenir le suivi, en clinique, des troubles de la parole chez les patient·e·s parkinsonien·ne·s. Ces résultats permettront ainsi de proposer un suivi longitudinal des troubles dysarthriques, en mettant en évidence l’évolution de la sévérité
Proposition d’un outil permettant la rééducation auto- administrée de patients aphasiques, au moyen de l’IA générative : Fluent-IA
No full textL’anomie est une manifestations fréquentes au sein de l’aphasie acquise. Plusieurs travaux ont démontré l’efficacité des exercices auto-administrés dans la rééducation de l’anomie post-AVC. Cependant, la majorité des études visent le réapprentissage de mots illustrés via des banques d’images limitées, indépendamment de leur fonctionnalité dans la vie quotidienne.
Dans ce cadre, l’application Fluent-IA a été développée afin de permettre une rééducation auto-administrée pour les patients aphasiques au moyen de l’intelligence artificielle générative d’images. Cet outil, disponible sur tablette ou téléphone, offre une rééducation personnalisée, utilisable en collaboration avec le clinicien ou proche aidant, tout en étant simple d’utilisation et réprésenant un cout financier réduit.
Fluent-IA se base sur la théorie de l'activation étendue. L’application propose une tâche de dénomination d'images permettant au clinicien de définir les items à travailler par catégorie sémantique. L’appel à l’IA générative permet de varier les images associées à un même item à chaque itération. Ainsi, cette visualisation sans cesse mise à jour permet de mettre en évidence les différents traits (spécifiques ou non) d'un même concept, aidant à renforcer la compréhension et le rappel du mot associé.
À la suite de la dénomination de chaque item, cinq questions sémantiques sont proposées à l’utilisateur, auxquelles il doit répondre par « oui » ou « non ». Ces questions interrogent la catégorie du concept, l’usage, l’objet associé et la localisation, et sont suivies d’un feedback. En cas d’échec de la dénomination, une tâche de répétition de l’item est proposée à l’aide de la technologie « Text-To-Speech ».
L’outil Fluent-IA consiste en une application novatrice à visée rééducative et auto-administrée pour des patients aphasiques. Des études supplémentaires pour terminer et ajouter les fonctionnalités nécessaires sont à prévoir afin de pouvoir vérifier l’efficacité d’une rééducation avec Fluent-IA auprès de la population cible
Evaldy: Evaluation des Troubles Moteurs de la Parole chez les Sujets dysarthriques via le Protocol MonPaGe-2.0.2-S
No full texteditorial reviewedThis study proposes a comprehensive protocol for collecting acoustic data as part of the initial phase of the EvalDy research project. Using the MonPaGe-2.0.2-S battery and its applications, this protocol enables the vocal productions of patients with various etiologies and severities of dysarthria to be captured. The basics modules, as well as new add-on modules, “Nasality”, “Glides” and “Phonetic Flexibility”, are included to offer a detailed assessment of different aspects of speech, essential for an accurate analysis of motor speech disorders. Study participants are people diagnosed with dysarthria of different etiologies, recruited from various clinical settings in French-speaking countries. The MonPaGe-2.0.2-S battery, including MonPaGe_Passation for recording speech production, was used to assess specific aspects of speech motor control.
This data collection will enable the main clinical and research objectives of the EvalDy project to be achieved in subsequent phases. MonPaGe-2.0.2-S stands out for its computerized and objective approach, in a context where standardized tools for the assessment of motor speech disorders are limited in French. The additional modules enhance our ability to analyze articulatory dynamics and compensatory mechanisms, particularly in patients with Parkinson's disease. By combining acoustic and articulatory measurements, this study aims to better document dysarthric speech.
Finally, one of the main objectives is to develop reliable, objective assessment tools that will complement current clinical practices, which are still often based on subjective assessments. These tools will also facilitate longitudinal follow-up, enabling clinicians and researchers to assess the progression of dysarthria over time and adapt therapeutic interventions accordingly
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