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Étude des effets cytotoxiques de la pectine de citrus fragmentée sur des cellules cancéreuses et identification d'une molécule active
In today's society, cancer is a group of diseases that represents one of the major health problems. Physicians often face cancers that are resistant to conventional treatments. In addition, these treatments are often toxic for patients and at the origin of significant side effects. This is why researchers constantly search for new therapies and new drugs that can enhance the efficiency of current chemotherapy. A large number of interesting molecules for the development of new treatments come from the plant world. Pectin is one of these molecules of interest. It is a polysaccharide found in all higher plant cell wall. Once modified by pH treatment (MCP) or by heat treatment, pectin can induce tumor cell death. However, the type of cell death, the mechanisms involved and the nature of the active fragments are not well known. In this thesis, we aimed at characterizing the type of cell death induced by pectin having undergone a heat treatment. To do so, we used two tumor cell lines, HepG2 and A549 cells. We also tried to identify fragments that yield the cytotoxicity. We have shown that citrus pectin modified by heat treatment (HFCP) induces death of HepG2 and A549 cells. This cell death is different from classical apoptosis since we did not observe caspase-3 activity in HepG2 cells and we did not observe DNA cleavage in both cell types. Inhibition of caspases by Z-VAD-fmk did not affect HFCP-induced cell death in HepG2 cells, indicating that heat modified citrus pectin could induce caspase-independent cell death. We also showed that heat fragmented citrus pectin induced ubiquitination of intracellular proteins in HepG2 cells and an early induction of autophagy. The study of putative pectic fragment receptors did not allow us to identify the receptor capable of binding the active fragments. However, it allowed us to demonstrate that MCP fragments and HFCP have a different nature since the invalidation of galectin-3, which is able to recognize the MCP fragments, does not influence the death induced by HFCP. Analysis of active fragments allowed us to highlight that the cytotoxic activity induced by heat-treated pectin comes from small sized fragments having undergone a chemical modification of their structure which is probably due to Maillard reactions. We have identified at least one of the active compounds of the HFCP, it is called 4,5-dihydroxy-cyclopenten-1-one. This compound has been synthesized in the laboratory and actually displayed cytotoxic activity for cancer cells. To our knowledge, it is the first time that a change of structure is demonstrated during a heat treatment of pectin. This is also the first time that one of the active fragments is identified. Moreover, induction of autophagy and of ubiquitination after cell incubation with heat fragmented pectin was never shown before. This thesis confirms the great potential of modified pectin to improve cancer treatments.(DOCSC03) -- FUNDP, 201
Théorie critique du principe d'équivalence fonctionnelle en droit du commerce électronique
Since the mid-90s, the principle of functional equivalence has been used as a guideline for the regulation of the information society. Its aim is to give legal value to the use of electronic means during the contractual process. According to this principle, electronic documents or data should be considered as equivalent to paper documents if they fulfil the same functions. For instance, considering the legal requirement of a signature, the idea is to take some distance from paperbased environment and handwritten graphics in order to identify the fundamental functions the signature is supposed to fulfill. In this respect, scholars usually consider that a signature is used as a means to authenticate a person, i.e. to identify her and to give consent. Therefore, any electronic means that ensures the authentication function should be equivalent to a handwritten signature. This reasoning also involves principles such as technology neutrality and non-discrimination. The principle of functional equivalence was adopted in 1996 by the United Nations Commission on International Trade Law (UNCITRAL) in its model law on electronic commerce. Since then, it has been recognized by many lawmakers around the world. Nevertheless, a certain lack of methodology has resulted in diverging initiatives and implementations. In this context, the aim of this study is to build a theory of functional equivalence based on a comparative and interdisciplinary approach. First it identifies the roots, evolution, forces and weaknesses of the principle. Then it develops its conceptual structure and methodology. For a better understanding of the principle, the first part of the study proposes a cartography of the genesis and propagation of the principle, both at the international and national level. It goes back to the Scandinavian origins of the principle and underlines the influence exerted by methods of Value Analysis. The second part of the study proposes a critical and theoretical model based on the principles of equivalence and technology neutrality. A functional methodology taking into account the teachings of philosophy of science and value analysis reasoning is developed with the hope it will serve as a guide for the lawmaker. Particular attention is devoted to the core notion of function, the selection process of the relevant functions of a given formal requirement and the best way to express their meaning and scope. Finally, the proposed method is tested on three formal requirements: writing, information and signature.Dans le processus de régulation de la société de l’information, le principe d’équivalence fonctionnelle a été utilisé dès les années 90 pour la reconnaissance juridique des procédés électroniques utilisés dans les relations contractuelles. Selon ce principe, les documents et données électroniques peuvent bénéficier de la même reconnaissance juridique que les documents papier, à condition de remplir les mêmes fonctions. Par exemple, considérant l’exigence légale d’une signature, il s’agit de s’abstraire de l’environnement papier traditionnel et de l’apposition manuscrite d’un graphisme personnel, pour identifier les fonctions que la signature est censée remplir. Dans cette optique, la doctrine admet généralement que la signature doit au moins permettre d’identifier le signataire et d’attester son consentement au contenu de l’acte signé. Dès lors, tout dispositif électronique permettant de remplir ces fonctions d’identification et d’adhésion devrait être équivalent à une signature manuscrite. Cette analyse va de pair avec les principes de neutralité technologique et de non discrimination. Le principe d’équivalence fonctionnelle a été consacré en 1996 par la Commission des Nations Unies pour le Droit Commercial International (CNUDCI), dans sa loi type sur le commerce électronique. Il a connu un immense succès auprès de nombreux législateurs à travers le monde. Toutefois, à défaut de contours précis et d’une méthodologie claire, il a fait l’objet de mises en œuvre sensiblement différentes d’une législation à l’autre. Dans ce contexte, l’étude vise à élaborer une théorie des équivalents fonctionnels, en identifiant ses origines, son évolution, ses forces et ses faiblesses, puis en dégageant sa structure conceptuelle et méthodologique, dans une approche combinant droit comparé et interdisciplinarité. Afin de mieux cerner le principe d’équivalence fonctionnelle, la première partie de l’étude retrace sa genèse et sa propagation sur la scène internationale et au niveau national, pour en dresser une cartographie détaillée. Elle remonte ainsi jusqu’aux origines scandinaves du principe et révèle par la même occasion une certaine influence des méthodes d’analyse de la valeur (Value analysis). La seconde partie consiste en l’élaboration d’un modèle théorique, en développant les fondements conceptuels et méthodologiques du principe et en examinant les critiques dont il peut faire l’objet. L’étude révèle ainsi les faiblesses du principe, identifie leur cause et envisage leur remède, tout en systématisant le principe de neutralité technologique et le postulat d’équivalence entre le monde analogique et le monde numérique. À l’aide de la philosophie des sciences et des méthodes d’analyse de la valeur, elle propose une méthodologie fonctionnaliste du principe d’équivalence à l’attention du législateur, en revenant à la notion de fonction, en modélisant le processus de sélection des fonctions pertinentes et en examinant la manière de préciser le contenu et la portée de ces fonctions. Cette méthodologie est ensuite testée sur trois exigences de forme : l’écrit, l’exigence d’une information et la signature.(DOCJURI00) -- FUNDP, 201
Reverse Engineering Web Configurators
In many markets, being competitive echoes with the ability to propose customized products at the same cost and delivery rates as standard ones. As a result, companies provide their customers with online Web configurators to facilitate the product customization task. Web configurators offer a highly interactive configuration environment for customers to specify products that match their individual requirements and preferences. They provide capabilities to guide the customer through the multi-step and non linear configuration process, check consistency, and automatically complete partial configuration. To get a better grasp of what is the current practice in engineering Web configurators, we conducted a systematic empirical study of 111 configurators. We quantified their numerous properties, categorized patterns used in their engineering, and highlighted good and bad practices. We provided empirical evidence that Web configurators are complex information systems. Despite of this fact, this study revealed the absence of specific, adapted, and rigorous methods in their engineering. The lack of dedicated methods for efficiently engineering Web configurators leads to reliability, runtime efficiency, and maintainability issues. To migrate legacy Web configurators to more reliable, efficient, and maintainable solutions, we offer to systematically re-engineer these applications. This encompasses two main activities: (1) reverse engineering Web configurators to extract their configuration-specific data and encoding it into dedicated formalisms, and then (2) forward engineering new improved configurators. In this study, we are concerned with the reverse-engineering process. We developed a consistent set of methods, languages and tools to semi-automatically extract configuration-specific data from the Web pages of a configurator. Such data is stored in variability models (e.g., feature models). These models can later be used for verification purposes (e.g., checking the completeness and correctness of the configuration constraints) as well as input for forward-engineering techniques. To reverse engineer variability models from Web configurators, we developed techniques that target static structure and dynamic behaviour of Web configurators to locate and extract configuration-specific data. Experimental results on existing real Web configurators confirm the applicability of our contribution.(DOCSC06) -- FUNDP, 201
L'idée de liberté et sa dialectique négative: de l'histoire du concept à ses contradictions pratiques
XRésumé de la thèse de doctorat Ma thèse, intitulée "L'idée de liberté et sa dialectique négative: de l'histoire du concept à ses contradictions pratiques", articule histoire de la philosophie et philosophie sociale autour d'un axe herméneutique déterminant: les significations successivement attribuées au concept de liberté sont essentiellement reliées à des expériences d'aliénation - attestées par les textes - dont elles constituent des projections négatives idéalisées. Le travail généalogique effectué met en évidence l'indissociabilité de deux lignes d'analyse que le concept de « dialectique négative » est le plus propre à exprimer: la projection d'un concept de liberté à partir d'un contenu expérientiel historiquement mis sur le devant de la scène philosophique et la régression de ce concept en instrument idéologique. Dans cette perspective, l'analyse des différentes formulations paradigmatiques de l'idée de liberté - autour desquels les débats se sont concentrés et dont l'histoire de la philosophie s'est progressivement enrichie - met au jour le contenu philosophiquement inédit de chacune d'elles et son ancrage dans l'expression rationalisée d'une souffrance première, dès lors configurée comme forme d'aliénation. Ainsi, la peur de l'exil dans l'Antiquité, la conception chrétienne de l'homme endetté, la crainte asservissante d'autrui pour les Modernes et la peur contemporaine de l'objectivation unilatérale forgent essentiellement les significations respectives de la liberté comme autochtonie, rédemption, sécurité et réinsertion du sens. D'autre part, cette même analyse fait apparaître la dialectique négative de l'idée de liberté: ce dont les idéaux de liberté veulent émanciper l'homme constitue du même coup et nécessairement le contenu motivationnel qui le conduit à s'aliéner. Dès lors, après avoir retracé de manière non exhaustive le contexte génétique de chaque paradigme philosophique, les chapitres déploient la dynamique régressive de l'idée de liberté, de telle façon qu'en chacune de ses formulations, elle engendre une nouvelle forme d'aliénation. Apparaît par là la dialectique de la praxis au sein de laquelle l'idée de liberté devient mythe et mobilise des mécanismes psychologiques à la faveur desquels l'aspiration à l'émancipation se mue en désir d'adaptation et d'obéissance. Aussi le fil directeur tissé par ma thèse est-il que l'histoire de la philosophie fournit des éléments fondamentaux non seulement pour réveiller les sens du terme « liberté » confusément sédimentés dans notre usage discursif, mais aussi pour comprendre le rôle essentiel de l'idée de liberté dans l'imaginaire social.(DOCFILO00) -- FUNDP, 201
Caractérisation structurale et étude de l'inhibityion de la 1-déoxy-D-xylulose-5-phosphate réductoisomérase (DXR) de E. coli et de la DXR-like (DRL) de B. abortus, par des analogues de la fosmidomycine
The 2-C-methyl-D-erythritol-4-phosphate (MEP) pathway for isoprenoid biosynthesis has come under increased scrutiny as a target for novel antimalarial, antibacterial and antituberculosis agents. 1-Deoxy-D-xylulose 5-phosphate reductoisomerase (DXR) is a key enzyme of the pathway that catalyzes the rearrangement and nicotinamide adenine dinucleotide phosphate (NADPH)-dependent reduction of 1-deoxy-D-xylulose 5-phosphate (DXP) to MEP. The unique properties of DXR make it a remarkable and rational target for drug design. First, it is a vital enzyme for synthesis of isoprenoids in algae, plants, several eubacteria including the pathogenic bacteria like Bacillus anthracis, Helicobacter pylori, Yersinia pestis, Mycobacterium tuberculosis and the malarial parasite, Plasmodium falciparum. Second, there are no functional equivalents to DXR in humans, making it an attractive target for therapeutic intervention. Third, DXR appears to be a valid target and the results from fosmidomycin, the only available DXR inhibitor under clinical trials, suggests synergistic effects with the lincosamide antibiotics, lincomycin and clindamycin. Despite drug design efforts in this area, no successful drug specifically designed to inhibit DXR has emerged yet. Recently, it has been shown that Fosmidomycin inhibited growth of B. abortus cells expressing the Escherichia coli GlpT transporter (required for fosmidomycin uptake), confirming that a DXR-like (DRL) activity exists in these bacteria. The B. abortus DRL protein was found to belong to a family of uncharacterized proteins similar to homoserine dehydrogenase. Our work was focus on the production, purification and characterization of the E. coli DXR enzyme and the B. abortus DRL enzyme. This allowed us to study three series of analogs of fosmidomycin, a specific competitive inhibitor of DXR, available through collaboration with the University of Gent (Prof S.VanCalenberg). Two approaches were used to characterize interaction between inhibitor and enzyme, a theoretical approach by docking and an experimental approach by crystallography.(DOCSC02) -- FUNDP, 201
Potency of a recombinant NDV-H5 vaccine against HPAI H5N1 virus challenge in presence or absence of maternal derived antibodies.
Highly Pathogenic Avian Influenza (HPAI), especially the Asian H5N1 (AsH5N1), and velogenic Newcastle disease (NDV) virus infections are responsible for the two most contagious and economically devastating poultry diseases. Continuous outbreaks and spread of both diseases support the need for efficacious vaccine strategies. However, traditional inactivated vaccines present some well-known shortcomings and Avian Influenza virus (AIV) live vaccination is prohibited. To fight off both viruses at once, live bivalent NDV-vectored vaccines expressing the haemagglutinin of AIV (rNDV-HA) have been developed by reverse genetics. This thesis aimed investigating the vaccine potency of a recombinant NDV-H5 candidate vaccine administrated early in life in the absence or presence of passive immunity. An optimal vaccination schedule was developed by evaluating different vaccination strategies using the rNDV-H5 vaccine through animal challenge experiments during which clinical protection, viral shedding and immune responses were evaluated in specific pathogen free (SPF) chickens. First, different routes of vaccination and doses of vaccine were tested in order to determine the minimal protective dose against challenge with an antigenically close clade 1 AsH5N1 virus, the A/crested_eagle/Belgium/01/2004 strain. A clear dose dependency was observed after 1-day-old vaccination of SPF chickens with 105, 106 and 107 50 % embryo infectious dose (EID50) of vaccine followed by a challenge at 3 weeks of age. The 106 EID50-dose was shown as the minimal protective dose, allowing 90% clinical protection, significant reduced viral shedding and induction of significant NDV and H5 AIV serological responses. However, the H5 humoral response was weak and slow even after boost vaccinations despite good clinical protection and reduced viral excretion, suggesting a role of cellular and mucosal immunity in the induced protection. An ideal vaccine should be protective against a large panel of strains. In this context, the rNDV-H5 protective range was addressed by challenges with two antigenically divergent 15 clade 2.2.1 HPAI H5N1 Egyptian strains, one circulating in 2007 (A/chicken/Egypt/1709-1/2007, “Egypt 2007”) and the other in 2008 (A/chicken/Egypt/1709-6/2008, “Egypt 2008”). Vaccination of SPF chickens at 1-day-old and two weeks of age with 106 EID50 of rNDV-H5 vaccine was shown to be highly protective (90%) after challenge at 5 weeks of age with the “Egypt 2007” challenge strain but failed to protect against the “Egypt 2008” strain. One of the main shortcomings of early vaccination with live vaccines is the interference of maternal derived antibodies (MDA), often considered as one of the main reasons for vaccine failures. Since the rNDV-H5 vaccine candidate was shown as a good potential candidate for routine mass vaccination, there was a need to investigate the impact of specific H5- and NDV-MDA, alone or in combination, with the efficacy of the rNDV-H5 vaccine. To circumvent the logistical difficulty of obtaining a sufficient number of chicks with homogenous titres, an artificial model mimicking maternal passive immunity was developed. Different routes of injection and doses of H5N1 or NDV hyperimmunized polyclonal chicken serum were compared. The best results were obtained by combining egg yolk injection at embryonic day (ED) 14 with intraperitoneal (IP) injection at day-old, resulting in levels and duration of MDA approaching the natural decline of MDA. The interference of MDA on vaccination was compared in birds presenting either only NDV, both NDV and H5-MDA or no MDA. A strong interference of the NDV-H5-MDA was demonstrated resulting in reduced clinical protection and high viral shedding. Surprisingly, the NDV-MDA had a positive impact on the vaccine efficacy with full clinical protection and the absence of viral excretion after challenge with H5N1. To clarify the distinct impact of H5- and NDV-MDA, the artificial model was used to induce an H5 AIV or NDV specific artificial passive immunity in SPF birds. A strong interference of the H5-MDA with the rNDV-H5 vaccine efficacy was confirmed by a faster and complete mortality 16 compared with vaccinated SPF chickens. Moreover, the beneficial impact of the NDV-MDA was confirmed as well. In conclusion, in countries vaccinating against NDV and prohibiting AIV vaccination, the rNDV-H5 vaccine combined with a high prevalence of NDV-MDA in progeny could be a valuable vaccine candidate in case of emergency vaccination. However, in countries with high H5 seroprevalence, delivery at young age should be postponed until the decline of the H5-MDA.Les virus de la grippe aviaire hautement pathogène (HPAI), et en particulier le H5N1 Asiatique, et de la maladie de Newcastle (NDV) vélogène sont responsables des deux maladies les plus contagieuses et économiquement dévastatrices chez la volaille. Les foyers continus et la propagation des deux maladies supportent la nécessité de stratégies de vaccination efficaces. Cependant, les vaccins inactivés traditionnels (IA) présente des lacunes et l’usage de vaccins vivants IA est interdit. Pour lutter contre les deux virus à la fois, des vaccins vivants NDV-vectorisés bivalents exprimant l'hémagglutinine de l’IA (rNDV-HA) ont été mis au point par génétique inverse. Cette thèse vise à étudier l'efficacité vaccinale d'un vaccin candidat NDV-H5 recombinant administré chez de jeunes poussins, en absence ou présence d'une immunité passive. Tout d'abord, différents schémas de vaccination avec le vaccin rNDV -H5 ont été étudiés à travers des expériences au cours de laquelle la protection clinique, l'excrétion virale et les réponses immunitaires ont été évaluées chez des poulets EOPS (exempt d'organismes pathogènes spécifiés). Différentes voies de vaccination et doses vaccinales ont été testées afin de déterminer la dose minimale protectrice contre un virus Asiatique H5N1 clade 1 antigéniquement proche, la souche A/crested_eagle/Belgium/01/2004. Une claire relation dose-effet a été observée après vaccination chez des poulets EOPS âgés de 1 jour avec 105, 106 ou 107 EID50 de vaccin suivie d'un challenge à 3 semaines d'âge. La dose de 106EID50 a été démontrée comme étant la dose minimale protectrice permettant 90 % de protection clinique, une excrétion virale significativement réduite et l'induction de réponses sérologiques anti-NDV et H5 IA. La comparaison entre les voies d’inoculation oculo-nasale ou d’eau de boisson avec une même dose de vaccin de 106EID50 par animal n'a pas montré de différence significative indiquant que le vaccin utilisé dans le contexte d’une stratégie de vaccination de masse ne serait pas affecté dans son efficacité de protection. Un vaccin idéal doit avoir un effet protecteur contre un large éventail de souches. Dans ce 18 contexte, le spectre de protection du rNDV-H5 a été abordée avec deux souches égyptiennes antigéniquement divergentes de clade 2.2.1 HPAI H5N1 circulant en 2007 (A/chicken/Egypt/1709-1/2007, " Egypte 2007 ") et 2008 (A/chicken/Egypt/1709-6/2008, " Egypte 2008"). La vaccination des poulets EOPS à jour 1 et à deux semaines d'âge avec 106 EID50 de vaccin rNDV -H5 a été démontrée très protectrice (90 %) après l’inoculation à 5 semaines d'âge de la souche challenge "Egypte 2007" mais n'a pas été capable de protéger contre la souche "Egypte 2008". L'une des principales lacunes de la vaccination précoce avec des vaccins vivants est l'interférence des anticorps maternels (MDA), souvent considérée comme l'une des principales raisons des échecs vaccinaux. Etant donné que le vaccin rNDV -H5 est un candidat potentiel pour la vaccination de masse en routine, il est nécessaire d'étudier l'impact de MDA spécifique pour H5 IA et NDV, seul ou en combinaison, avec l'efficacité du vaccin rNDV -H5. Pour contourner la difficulté logistique d'obtenir un nombre suffisant de poussins avec des titres homogènes de MDA, un modèle artificiel mimant une immunité passive maternelle a été développé. Différentes voies d'injection et de doses de sérum polyclonal de poulets hyperimmunisés contre H5N1 ou NDV ont été évaluées. Les meilleurs résultats ont été obtenus en combinant l'injection dans le jaune d'oeuf à ED14 avec une injection intrapéritonéale (IP) avec des niveaux d’anticorps et une durée de vie approchant le déclin naturel des MDA. L'interférence des anticorps maternels a ensuite été comparée chez des oiseaux présentant soit uniquement des MDA-NDV, -NDV-H5 ou en l'absence de MDA. Une forte interférence des MDA-NDV-H5 a ainsi été démontrée par une réduction de la protection clinique et l'absence de réduction de l'excrétion virale. Étonnamment, les MDA-NDV ont eu un impact positif sur l’efficacité vaccinale avec une protection clinique complète et l'absence d'excrétion virale après challenge avec le virus H5N1. Pour clarifier les impacts distincts 19 des MDA-NDV et –H5, le modèle artificiel a été utilisé pour induire une immunité passive artificielle H5 AI ou NDV spécifique en oiseaux EOPS. Une forte interférence des MDA-H5 avec l'efficacité vaccinale du rNDV-H5 a été confirmée par une mortalité complète au contraire des poulets EOPS vaccinés. Par ailleurs, l’impact positif des MDA-NDV a été confirmé. En conclusion, dans les pays vaccinant contre le NDV et interdisant la vaccination IA, le vaccin rNDV-H5 combiné à la forte prévalence de MDA-NDV chez les jeunes poussins serait un candidat vaccinal précieux en cas de vaccination d'urgence. Toutefois, dans les pays à forte séroprévalence anti-H5, la vaccination précoce devrait être reportée après le déclin des MDA-H5.(DOCSC03) -- FUNDP, 201
On the link between Brucella abortus cell cycle and its intracellular trafficking
Brucellae are the agent responsible for a worldwide zoonosis called « brucellosis ». This intracellular bacterium is able to infect professional and non-professional phagocytes. Therein, the infection occurs in two successive stages, composed of an early phase characterized by a stable number of viable bacteria, followed by a proliferative phase. Inside the cell, the bacterium resides in a vacuole, which interacts transiently with the endocytic pathway (carrying the LAMP-1 marker) before reaching its replicative niche, an endoplasmic reticulum-like compartment. All cells, either prokaryotic or eukaryotic, are characterized by a cell cycle. There are two major aspects of the bacterial cell cycle, the replication of the genome and the growth of the bacteria. The bacterial cell cycle occurs in three main stages, first the "newborn" (Nb) stage between cell division and the initiation of genome replication, then the "intermediate" (Int) stage corresponding to growing bacteria without detectable constriction site, and finally the predivisional (Pd) stage. Given the biphasic infectious mode of Brucella abortus, we hypothesized that the progression of its cell cycle could be modulated during infection. However, the Brucella cell cycle in bacterial culture and a fortiori during infection is poorly investigated, as well as its regulation. Such as other Rhizobiales of the -proteobacteria group, Brucella abortus displays a unipolar growth and we took advantage of the TRSE labeling to characterize the "growth" aspect of the cell cycle during infection. Indeeed, this TRSE labelling allows the monitoring of growth for individual bacteria. During this thesis, we showed that during the first 6 h PI, constricting bacteria were almost inexistent and bacterial growth was undetectable. This suggests a non-proliferation and an arrest of the unipolar growth of B. abortus during the first stage of the infection. In addition, the newborn bacteria (originating from a division event) were predominantly found during the early phase of the infection. Consistently, the majority of bacteria were blocked in a G1 stage of the cell cycle during this phase (M. Deghelt). All together those data define newborn bacteria as the specific infectious subpopulation. Surprisingly, we also observed growing bacteria in both LAMP-1 positive or LAMP-1 negative compartments. Moreover, after proliferation, a fraction of the mother bacteria are in LAMP-1 positive compartments while daughter bacteria are almost all in LAMP-1 negative compartments. We also observed that the growth of the virB mutant resumed in LAMP-1 positive compartments with the same timing as a wild type strain, but this mutant remains in LAMP-1 positive compartments and does not proliferate. At the early stage of a cellular infection, the Brucella containing vacuole encounters harsh conditions, such as starvation, reactive oxygen species-related damages and an acidic pH. Therefore, we propose that the regulation and modulation of Brucella abortus cell cycle along intracellular trafficking during host cells infection is probably linked to the adaptation of Brucella for survival in the presence of those detrimental stresses.La bactérie du genre Brucellae est l’agent responsable de la zoonose mondiale appelée “brucellose”. Cette bactérie intracellulaire est capable d’infecter des phagocytes professionnels ou non. L’infection d’une cellule hôte se déroule en deux étapes, la première étant caractérisée par un nombre stable de bactéries vivantes, suivie par une phase de prolifération. Une fois à l’intérieur de la cellule hôte, la bactérie réside dans une vacuole, qui interagit de façon transitoire avec la voie d’endocytose avant d’établir sa niche de prolifération, constituée de compartiments dérivés du réticulum endoplasmique. Toutes cellules, procaryotes ou eucaryotes, sont caractérisées par un cycle cellulaire. Il y a deux aspects majeurs du cycle cellulaire bactérien, la réplication du génome and la croissance bactérienne. Le cycle bactérien se déroule en trois étapes, premièrement la phase « newborn » (Nb) entre la division cellulaire et l’initiation de la réplication du génome, ensuite la phase « intermediate » (Int) correspondant aux bactéries en croissance ne présentant aucun site de constriction détectable et finalement la phase de prédivision (Pd). Etant donné le mode biphasique d’infection de Brucella abortus, nous avons émis l’hypothèse selon laquelle la progression de son cycle cellulaire pourrait être modulée durant l’infection. Cependant, le cycle cellulaire de Brucella et sa régulation in vitro et in vivo ne sont presque pas étudiés. Comme d’autres Rhizobiales du groupe des -protéobactéries, Brucella abortus croît de manière unipolaire. Grâce au marquage TRSE, nous avons caractérisé l’aspect de la croissance bactérienne du cycle cellulaire durant l’infection de cellules hôtes. En effet, ce marquage permet d’observer la croissance pour chaque bactérie individuellement. Au cours de cette thèse, nous avons montré que durant les 6 premières heures après infection, les bactéries présentant un site de constriction sont presque inexistantes et la croissance bactérienne est indétectable. En plus, les bactéries « newborn » sont prédominantes au cours de cette première phase. De façon consistante, la majorité des bactéries sont bloquées au stage G1 du cycle cellulaire durant cette phase (M. Deghelt). Ensemble, ces données indiquent que les bactéries « newborn » constituent la population infectieuse. De manière surprenante, nous avons également observé que des bactéries en croissance dans des compartiments LAMP-1 positifs. De plus, après prolifération, une fraction des bactéries mères se trouve dans ces mêmes compartiments alors que les bactéries filles sont principalement dans les compartiments LAMP-1 négatifs. Nous avons aussi observé que la croissance du mutant virB reprend dans les compartiments LAMP-1 positifs selon le même timing que la souche sauvage, mais ce mutant reste dans les compartiments LAMP-1 positifs et ne prolifèrent pas. Durant la phase précoce de l’infection, la vacuole contenant Brucella recontre des conditions rudes comme la famine, les dommages liés aus ROS et un pH acide. C’est pourqoi nous pensons que la régulation et la modulation du cycle cellulaire de Brucella abortus au cours du trafic intracellulaire durant l’infection de cellules hôtes sont problablement liées à l’adaptation de Brucella pour sa survie en présence de ces stress détrimentaux.(DOCSESG00) -- FUNDP, 201
Stabilité des astéroïdes multiples
Multiple systems, composed of several asteroids rotating around their common center of mass, are common in the solar system but misunderstood. These systems can be very different from each other due to their location, the shape of the bodies or their rotations. In this thesis, we carry out several studies on the subject by considering two types of multiple systems: satellites of asteroids and double asteroids. In the first part, we detect gravitational resonances between an ellipsoid in constant rotation and a point mass. Next, we determine the main resonances surrounding the triple system (87) Sylvia and other triple systems known. The evolution of these systems by tidal effects and BYORP is then analyzed. In the second part, we seek to understand the lack of binary asteroids among Plutinos. Finally, we express the interaction potential in the symmetric trace free tensor formalism and we test it on the double system (66391) 1999 KW4.Les systèmes multiples, composés de plusieurs astéroïdes en rotation autour de leur centre de masse commun, sont nombreux dans le système solaire mais encore méconnus. Ils peuvent être très différents les uns des autres, dû à leur situation, à la forme des corps ou encore à leurs rotations. Dans cette thèse, nous réalisons plusieurs études sur le sujet en considérant deux catégories de systèmes multiples : les satellites d'astéroïdes et les astéroïdes doubles. Dans la première partie, nous détectons les résonances gravitationnelles entre un ellipsoïde en rotation constante et une masse ponctuelle. Nous déterminons ensuite les résonances principales entourant le système triple (87) Sylvia et les autres systèmes triples connus. L'évolution de ces systèmes par les effets de marée et de BYORP est analysée par la suite. Dans la seconde partie, nous cherchons à comprendre la raison du petit nombre d'astéroïdes binaires parmi les Plutinos. Enfin, nous montrons l'adéquation du formalisme des tenseurs symétriques sans trace pour l'expression du potentiel d'interaction et nous testons nos résultats sur le système double (66391) 1999 KW4.(DOCSC00) -- FUNDP, 201
Des actualités filmées au service de l'histoire. La propagande audiovisuelle d'un gouvernement belge en état de siège (1940-1945)
Avant l’introduction de la télévision, le cinéma est le seul média qui permet de donner une perception visuelle et animée d’un événement. A priori, pour le public, l’attrait du journal d’actualités filmées réside plus dans son aspect ‘audio-visuel’ et sa conception didactique que dans son contenu événementiel. Les dernières nouvelles sont déjà connues du spectateur par la radio ou la presse écrite. Le public désire alors ‘voir’ les images de l’évènement. Si ces images filmées permettent, en effet, de visualiser l’information reçue par d’autres médias, elles en modifient son contenu et sa signification par un montage et un commentaire induits et permettent de façonner l’opinion publique. Lors du second conflit mondial, tous les protagonistes optent pour un contrôle strict de l’information et un encadrement de l’opinion publique. Les journaux filmés, au vu de leurs potentialités supposées, vont constituer une arme redoutable de cette propagande. Le gouvernement belge en exil à Londres s’inscrit dans cette mouvance. Dès 1941, il met en place une politique d’information et de propagande via le média cinéma et lui octroie d’importants moyens financiers, techniques et humains. Les journaux filmés auront pour objectif de mettre en évidence l’effort de guerre du pays et de légitimer l’existence, l’autorité et l’action du gouvernement belge en exil auprès de l’opinion publique nationale et internationale. À la libération, cette politique propagandiste se poursuit mais elle est désormais cadenassée par l’autorité militaire alliée qui impose un monopole des actualités filmées sur les écrans belges. Les images filmées diffusent alors une propagande de vainqueurs où la victoire et l’unité alliée est proclamée haut et fort et où l’armée belge, en pleine reconstruction, devient un leitmotiv chargé de rétablir la cohésion nationale. Mais, pour le monde cinématographique belge, monopole et contrôle gouvernemental sont inacceptables. Les acteurs de la presse filmée belge veulent récupérer leurs prérogatives. Ils prônent un retour à la liberté d’expression et à la libre concurrence commerciale. On assiste dès lors jusque décembre 1945 à un chassé-croisé entre sociétés commerciales, associations corporatives et l’institution politico-militaire. Cette recherche doctorale s’est ancrée sur un corpus filmique déterminé : d’une part, les 77 actualités filmées produites à Londres dès 1942 par le gouvernement belge en exil en collaboration avec la British Paramount News ; d’autre part, les 78 éditions belges du journal interallié d’actualités filmées Le Monde Libre disposant d’un monopole des écrans belges du 15 septembre 1944 au 28 décembre 1945. Avant d’entrer dans une analyse fine du corpus filmé, il a fallu procéder à une reconstitution de ce corpus dispersé dans trois cinémathèques. Cette identification préalable a permis d’établir pour chaque actualité filmée les métadonnées nécessaires à la valorisation documentaire de la source mais également à son indexation, démarche inhérente à sa conservation. Au-delà de la problématique historique, cette thèse a mis en lumière les apports de la source audiovisuelle pour la discipline historique. Elle a permis de mettre au point des protocoles méthodologiques qui allient sources audiovisuelles et sources non-filmiques et qui permettent d’appréhender au mieux l’historicité de la source audiovisuelle, de comprendre le fait cinématographique dans son ensemble et de le replacer dans son contexte historique. Enfin, elle a mis évidence la problématique d’accès et de droits du patrimoine audiovisuel et ses conséquences sur l’historiographie belge où le champ de recherche ‘Histoire et cinéma’ reste lacunaire. Cette analyse de la production, de la distribution et de la réception des actualités filmées belges entre 1940 et 1945 permet de comprendre les réactions et les attitudes successives de l’opinion/des opinions en période de guerre. Au travers des images diffusées sur les écrans de Londres et de Bruxelles à la libération, la représentation mentale du conflit et les mécanismes d’encadrement de l’opinion publique par l’image se sont dévoilés.(DOCFILO02) -- FUNDP, 201
A parallelized micro-simulation platform for population and mobility behaviour - Application to Belgium
Abstract: This thesis aims at developing an agent-based micro-simulation framework for (large) population evolution and mobility behaviour. More specifically we focus on the agents generation and the traffic simulation parts of the platform, and its application to Belgium. Hence we firstly develop a synthetic population generator whose main characteristics are its sample-free nature, its ability to cope with moderate data inconsistencies and different levels of aggregation. We then generate the traffic demand forecasting with a stochastic and flexible activity-based model relying on weak data requirements. Finally, a traffic simulation is completed by considering the assignment of the generated demand on the road network. We give the initial developments of a strategic agent-based alternative to the conventional simulation-based dynamic traffic assignment models.(DOCSC00) -- FUNDP, 201